Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CCQ9

Protein Details
Accession S3CCQ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-53ISHQKAKHFKCERCGRRLNTHydrophilic
268-292DKDKTEKTEKSEKKKEKSSMRMVYAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
281-281K
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003656  Znf_BED  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00096  zf-C2H2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50808  ZF_BED  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd20908  SUF4-like  
Amino Acid Sequences MGKKRRNYPNLDELLGRAWCYYCERDFEDLKLLISHQKAKHFKCERCGRRLNTAGGLSVHMNQVHKETLTHVENTLEGRDGLEVEIFGMEGIPEEAAVAHNSKIIDDFHKNRAERQAVTGNPPPGLPGSNQPPHKKLKIETPAELKARLAAFRAGGGAAAAPLPNAPTGPAAGAAPTPMAGLPSRPPAGQFAAGQFSGQIPGQYPGQIPGQFPPGAPGDLPQRPAAFGGASTLDDLVSGAAGVAAPSGDDIDRMIRAAEAGVRPGGDDKDKTEKTEKSEKKKEKSSMRMVYADGDFSLEEKMAQMPRYAVAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.39
3 0.31
4 0.21
5 0.17
6 0.17
7 0.21
8 0.24
9 0.22
10 0.26
11 0.3
12 0.34
13 0.36
14 0.36
15 0.37
16 0.33
17 0.32
18 0.28
19 0.25
20 0.25
21 0.27
22 0.33
23 0.31
24 0.4
25 0.48
26 0.5
27 0.6
28 0.64
29 0.65
30 0.67
31 0.75
32 0.73
33 0.74
34 0.8
35 0.74
36 0.74
37 0.75
38 0.69
39 0.63
40 0.56
41 0.48
42 0.39
43 0.36
44 0.27
45 0.22
46 0.21
47 0.17
48 0.17
49 0.15
50 0.17
51 0.17
52 0.16
53 0.15
54 0.16
55 0.2
56 0.22
57 0.22
58 0.21
59 0.2
60 0.2
61 0.21
62 0.19
63 0.13
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.04
75 0.04
76 0.03
77 0.03
78 0.04
79 0.03
80 0.03
81 0.03
82 0.03
83 0.04
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.11
92 0.14
93 0.19
94 0.23
95 0.28
96 0.35
97 0.35
98 0.37
99 0.43
100 0.43
101 0.37
102 0.38
103 0.38
104 0.32
105 0.38
106 0.39
107 0.32
108 0.29
109 0.28
110 0.24
111 0.18
112 0.18
113 0.13
114 0.13
115 0.19
116 0.25
117 0.31
118 0.33
119 0.37
120 0.41
121 0.44
122 0.43
123 0.37
124 0.41
125 0.45
126 0.45
127 0.44
128 0.44
129 0.46
130 0.44
131 0.42
132 0.32
133 0.26
134 0.23
135 0.2
136 0.15
137 0.11
138 0.1
139 0.09
140 0.1
141 0.07
142 0.06
143 0.05
144 0.04
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.03
166 0.05
167 0.04
168 0.05
169 0.07
170 0.11
171 0.12
172 0.12
173 0.13
174 0.14
175 0.16
176 0.17
177 0.16
178 0.14
179 0.15
180 0.15
181 0.14
182 0.12
183 0.1
184 0.1
185 0.09
186 0.08
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.14
194 0.16
195 0.15
196 0.15
197 0.19
198 0.18
199 0.18
200 0.18
201 0.16
202 0.15
203 0.14
204 0.15
205 0.18
206 0.2
207 0.22
208 0.21
209 0.2
210 0.2
211 0.2
212 0.19
213 0.12
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.05
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.11
246 0.1
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.15
252 0.17
253 0.17
254 0.17
255 0.2
256 0.3
257 0.31
258 0.36
259 0.41
260 0.43
261 0.46
262 0.56
263 0.6
264 0.61
265 0.7
266 0.75
267 0.77
268 0.83
269 0.85
270 0.85
271 0.86
272 0.86
273 0.84
274 0.8
275 0.73
276 0.64
277 0.59
278 0.49
279 0.4
280 0.29
281 0.21
282 0.16
283 0.14
284 0.14
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.13
289 0.16
290 0.17
291 0.18
292 0.19