Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DB93

Protein Details
Accession S3DB93    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-213KMRNGGKSRLAPKKKNKRRELGTSLPSHydrophilic
398-418IPVLLRTKRSKRCPLCRHIISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-205RNGGKSRLAPKKKNKRR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 13, cyto 9.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008603  DCTN4  
Gene Ontology GO:0005869  C:dynactin complex  
GO:0005815  C:microtubule organizing center  
GO:0030017  C:sarcomere  
Pfam View protein in Pfam  
PF05502  Dynactin_p62  
Amino Acid Sequences METAAFTPYTYFQCPCSDHASSPTHESSSRPSSSHLTPGDQPGGETEHGDDHTFDPRSPRANYSLYPLEYLLYCEDCHQIRCPRCVAEEIVTYYCPSCLFEVPTTSIKSDGNRCTRSCFQCPICIAPLTVSTHTPGNEGRAVGAEPEPKVTTAATTFSLYCGFCDWKSDEVGIVFSKANSLHLQLAKMRNGGKSRLAPKKKNKRRELGTSLPSAGPSLLSSSSLSAALDADDPTLSSSIAGTGSAKVAEEGLDLERQFSYLRQFYQKQLSEHAGITSGLSPFGDVGFGSPASFSRILNMYTGIPGASNSADFSKKNTTRLRGMREARDETEGFLVAQLDESEAIARLHEGISSCNHENEKFNGWDATTSCEQRAAQPEFVGEDHPHRHPRFLDELRPIPVLLRTKRSKRCPLCRHIISKPEAKSTNSRFRIRLVAGSYIPSISIRPLLQPAAAPPPAAKSSRSAALAPPPPTNILEPMKPVQYILTFKNPIFESVKVTLATPSTTPGRFASKVTVLCPQFEIDSNTDVWDDALRDSATDAGSGAGGSRSSNRRDEGGQQQAVAGKIWERGRNWVSIVVEVVPPSLSLDLLAMTSKPIGKEAEGQSKKIDLSPLREDEDIVEIPMFVRIEWETDAAQDGVGAASSKDKDVKEKRELAYWCVLGIGRIRHD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.33
3 0.37
4 0.36
5 0.34
6 0.4
7 0.43
8 0.39
9 0.43
10 0.41
11 0.37
12 0.35
13 0.35
14 0.35
15 0.38
16 0.39
17 0.34
18 0.35
19 0.38
20 0.4
21 0.46
22 0.41
23 0.37
24 0.38
25 0.43
26 0.44
27 0.39
28 0.35
29 0.29
30 0.3
31 0.26
32 0.23
33 0.19
34 0.18
35 0.19
36 0.2
37 0.19
38 0.17
39 0.24
40 0.24
41 0.24
42 0.26
43 0.29
44 0.34
45 0.36
46 0.38
47 0.37
48 0.4
49 0.4
50 0.41
51 0.45
52 0.4
53 0.38
54 0.34
55 0.29
56 0.25
57 0.26
58 0.21
59 0.15
60 0.14
61 0.15
62 0.19
63 0.2
64 0.22
65 0.27
66 0.34
67 0.39
68 0.43
69 0.45
70 0.43
71 0.44
72 0.45
73 0.41
74 0.37
75 0.36
76 0.35
77 0.33
78 0.3
79 0.29
80 0.25
81 0.22
82 0.18
83 0.15
84 0.13
85 0.14
86 0.17
87 0.18
88 0.22
89 0.25
90 0.29
91 0.3
92 0.28
93 0.27
94 0.25
95 0.28
96 0.33
97 0.38
98 0.43
99 0.46
100 0.46
101 0.52
102 0.59
103 0.61
104 0.59
105 0.58
106 0.52
107 0.54
108 0.55
109 0.52
110 0.47
111 0.41
112 0.35
113 0.28
114 0.29
115 0.26
116 0.24
117 0.21
118 0.19
119 0.2
120 0.2
121 0.21
122 0.18
123 0.18
124 0.19
125 0.18
126 0.17
127 0.16
128 0.16
129 0.15
130 0.17
131 0.16
132 0.14
133 0.17
134 0.17
135 0.16
136 0.17
137 0.15
138 0.14
139 0.12
140 0.14
141 0.13
142 0.14
143 0.13
144 0.13
145 0.16
146 0.14
147 0.14
148 0.15
149 0.15
150 0.14
151 0.18
152 0.19
153 0.19
154 0.2
155 0.2
156 0.18
157 0.16
158 0.18
159 0.14
160 0.13
161 0.12
162 0.1
163 0.12
164 0.11
165 0.13
166 0.12
167 0.13
168 0.17
169 0.18
170 0.2
171 0.24
172 0.29
173 0.29
174 0.31
175 0.32
176 0.31
177 0.33
178 0.34
179 0.34
180 0.37
181 0.43
182 0.51
183 0.57
184 0.62
185 0.7
186 0.79
187 0.83
188 0.87
189 0.87
190 0.87
191 0.85
192 0.85
193 0.83
194 0.8
195 0.74
196 0.66
197 0.59
198 0.49
199 0.42
200 0.32
201 0.23
202 0.14
203 0.1
204 0.09
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.08
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.13
247 0.14
248 0.16
249 0.21
250 0.24
251 0.27
252 0.36
253 0.39
254 0.35
255 0.36
256 0.37
257 0.33
258 0.31
259 0.28
260 0.19
261 0.15
262 0.14
263 0.12
264 0.09
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.03
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.09
279 0.1
280 0.09
281 0.1
282 0.11
283 0.12
284 0.12
285 0.13
286 0.1
287 0.09
288 0.1
289 0.08
290 0.06
291 0.05
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.07
297 0.09
298 0.09
299 0.12
300 0.2
301 0.22
302 0.29
303 0.33
304 0.36
305 0.42
306 0.48
307 0.52
308 0.51
309 0.53
310 0.52
311 0.52
312 0.51
313 0.44
314 0.42
315 0.35
316 0.28
317 0.24
318 0.18
319 0.13
320 0.1
321 0.09
322 0.05
323 0.05
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.08
339 0.12
340 0.13
341 0.14
342 0.15
343 0.15
344 0.17
345 0.19
346 0.21
347 0.18
348 0.18
349 0.17
350 0.16
351 0.16
352 0.15
353 0.16
354 0.14
355 0.15
356 0.14
357 0.16
358 0.16
359 0.17
360 0.24
361 0.24
362 0.22
363 0.21
364 0.21
365 0.2
366 0.2
367 0.19
368 0.12
369 0.12
370 0.15
371 0.18
372 0.26
373 0.25
374 0.28
375 0.27
376 0.31
377 0.36
378 0.36
379 0.39
380 0.37
381 0.39
382 0.38
383 0.38
384 0.33
385 0.25
386 0.26
387 0.27
388 0.24
389 0.3
390 0.34
391 0.43
392 0.52
393 0.6
394 0.66
395 0.69
396 0.78
397 0.79
398 0.8
399 0.81
400 0.79
401 0.77
402 0.72
403 0.7
404 0.63
405 0.6
406 0.55
407 0.51
408 0.47
409 0.43
410 0.46
411 0.46
412 0.52
413 0.52
414 0.54
415 0.48
416 0.48
417 0.52
418 0.45
419 0.41
420 0.33
421 0.29
422 0.26
423 0.26
424 0.24
425 0.18
426 0.17
427 0.13
428 0.1
429 0.08
430 0.1
431 0.09
432 0.1
433 0.12
434 0.12
435 0.12
436 0.12
437 0.14
438 0.17
439 0.17
440 0.16
441 0.14
442 0.17
443 0.2
444 0.2
445 0.19
446 0.16
447 0.19
448 0.22
449 0.24
450 0.21
451 0.2
452 0.27
453 0.32
454 0.32
455 0.3
456 0.28
457 0.28
458 0.28
459 0.27
460 0.25
461 0.22
462 0.21
463 0.23
464 0.24
465 0.24
466 0.23
467 0.22
468 0.18
469 0.19
470 0.21
471 0.21
472 0.26
473 0.27
474 0.27
475 0.32
476 0.31
477 0.31
478 0.31
479 0.28
480 0.26
481 0.26
482 0.28
483 0.23
484 0.23
485 0.21
486 0.18
487 0.18
488 0.13
489 0.14
490 0.16
491 0.16
492 0.17
493 0.18
494 0.23
495 0.23
496 0.24
497 0.26
498 0.28
499 0.29
500 0.29
501 0.35
502 0.3
503 0.3
504 0.29
505 0.25
506 0.21
507 0.21
508 0.23
509 0.17
510 0.19
511 0.18
512 0.17
513 0.17
514 0.15
515 0.14
516 0.11
517 0.1
518 0.08
519 0.11
520 0.1
521 0.1
522 0.1
523 0.12
524 0.11
525 0.1
526 0.09
527 0.07
528 0.07
529 0.07
530 0.07
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.12
535 0.17
536 0.21
537 0.26
538 0.27
539 0.29
540 0.32
541 0.38
542 0.41
543 0.46
544 0.43
545 0.38
546 0.38
547 0.38
548 0.36
549 0.29
550 0.21
551 0.13
552 0.18
553 0.22
554 0.26
555 0.24
556 0.32
557 0.34
558 0.36
559 0.36
560 0.35
561 0.32
562 0.28
563 0.28
564 0.21
565 0.19
566 0.17
567 0.16
568 0.11
569 0.1
570 0.1
571 0.09
572 0.07
573 0.06
574 0.07
575 0.06
576 0.07
577 0.07
578 0.06
579 0.07
580 0.09
581 0.11
582 0.11
583 0.13
584 0.14
585 0.16
586 0.24
587 0.3
588 0.39
589 0.4
590 0.41
591 0.4
592 0.42
593 0.41
594 0.35
595 0.36
596 0.29
597 0.34
598 0.4
599 0.42
600 0.43
601 0.42
602 0.4
603 0.34
604 0.34
605 0.28
606 0.21
607 0.17
608 0.13
609 0.13
610 0.16
611 0.14
612 0.09
613 0.11
614 0.11
615 0.13
616 0.15
617 0.16
618 0.13
619 0.14
620 0.17
621 0.14
622 0.13
623 0.11
624 0.09
625 0.08
626 0.08
627 0.08
628 0.05
629 0.1
630 0.12
631 0.14
632 0.2
633 0.21
634 0.31
635 0.4
636 0.49
637 0.54
638 0.62
639 0.61
640 0.64
641 0.66
642 0.61
643 0.59
644 0.51
645 0.41
646 0.34
647 0.32
648 0.26
649 0.28