FuNGI

S3CT52

Protein Details

Accession

S3CT52

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
553-587	IPEGIKFKAEVKKNKNKNKSKKRKRSDHAAGPAAG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
559-580	FKAEVKKNKNKNKSKKRKRSDH

Subcellular Location(s)

mito 14, cyto 8, mito_nucl 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR026832 Asteroid IPR039436 Asteroid_dom IPR029060 PIN-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0003743 F:translation initiation factor activity
Pfam	View protein in Pfam PF12813 XPG_I_2

Amino Acid Sequences

MGVPKLLSTLTPHGERKPLNGARVIIDGPALAYYVVGLCMADPVMSAGRNHPLDQPSYGQLGEAAIGWLDELRSHDIKIEALYFDGYLPKAKRPVRLERSYRTSAQLKDVCSFYQRDNLPGFDVKGPRTGSLLPAPPFAVPAVLDALRESSVYGPLTIVVPGEADTFCAEHARTKGGGTVITSDSDLLVQDLGPDAEVVLFRDLADVRNATAGKPLIVPTYALSTIRRRLSLPGDDEGIMVDFAFELSMDPHLSATELADQTKKGYAKTKYAQEYTEFAEQYAYPSSLAAGAKQYDITGLDPRVSELALQSLFPHEGQNPDPKKSADEIFAFEPPLLDNCTRTNAWEPSAPIRACAFSLLQILAGRRIKKVREYTRMASMATRGSELDLVPVAKLVQTIDTLATLLRRVRKSVANSPVLQWATLASYYDMQWSKANGKASVCLEVMYEETSVGGMLDRVTWDAVHWLAETQATLYSLRVLKQTVQFVLEACKDQNDSLDAALSTSLGSLKELLLLPSTVPPLKDYPTLRILRDLPAKLKGAGALKLLAELADIPEGIKFKAEVKKNKNKNKSKKRKRSDHAAGPAAGGKATTNPFSVLGVE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.46
3	0.45
4	0.49
5	0.49
6	0.47
7	0.48
8	0.46
9	0.41
10	0.43
11	0.38
12	0.28
13	0.23
14	0.18
15	0.14
16	0.12
17	0.09
18	0.06
19	0.05
20	0.05
21	0.05
22	0.06
23	0.05
24	0.05
25	0.05
26	0.06
27	0.06
28	0.05
29	0.05
30	0.07
31	0.09
32	0.1
33	0.11
34	0.13
35	0.21
36	0.23
37	0.25
38	0.29
39	0.31
40	0.32
41	0.34
42	0.35
43	0.3
44	0.3
45	0.28
46	0.22
47	0.19
48	0.17
49	0.14
50	0.11
51	0.08
52	0.05
53	0.05
54	0.05
55	0.05
56	0.05
57	0.06
58	0.08
59	0.14
60	0.15
61	0.16
62	0.18
63	0.19
64	0.2
65	0.2
66	0.2
67	0.14
68	0.14
69	0.14
70	0.12
71	0.12
72	0.13
73	0.12
74	0.17
75	0.18
76	0.22
77	0.3
78	0.34
79	0.42
80	0.47
81	0.57
82	0.61
83	0.69
84	0.72
85	0.72
86	0.76
87	0.73
88	0.69
89	0.64
90	0.6
91	0.53
92	0.54
93	0.49
94	0.44
95	0.42
96	0.41
97	0.35
98	0.32
99	0.32
100	0.25
101	0.29
102	0.27
103	0.29
104	0.29
105	0.29
106	0.29
107	0.29
108	0.3
109	0.27
110	0.3
111	0.26
112	0.3
113	0.3
114	0.27
115	0.27
116	0.26
117	0.24
118	0.26
119	0.31
120	0.26
121	0.27
122	0.27
123	0.24
124	0.24
125	0.2
126	0.15
127	0.09
128	0.09
129	0.1
130	0.1
131	0.1
132	0.09
133	0.1
134	0.1
135	0.1
136	0.09
137	0.07
138	0.1
139	0.1
140	0.1
141	0.09
142	0.09
143	0.1
144	0.09
145	0.08
146	0.06
147	0.05
148	0.06
149	0.07
150	0.06
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.07
155	0.09
156	0.08
157	0.11
158	0.12
159	0.15
160	0.14
161	0.15
162	0.17
163	0.16
164	0.17
165	0.14
166	0.16
167	0.14
168	0.14
169	0.14
170	0.11
171	0.11
172	0.1
173	0.09
174	0.06
175	0.05
176	0.04
177	0.04
178	0.05
179	0.05
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.05
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.1
193	0.09
194	0.09
195	0.13
196	0.13
197	0.12
198	0.15
199	0.14
200	0.13
201	0.14
202	0.14
203	0.11
204	0.11
205	0.12
206	0.09
207	0.12
208	0.12
209	0.11
210	0.13
211	0.16
212	0.22
213	0.24
214	0.24
215	0.22
216	0.25
217	0.29
218	0.32
219	0.31
220	0.26
221	0.26
222	0.25
223	0.24
224	0.21
225	0.16
226	0.1
227	0.07
228	0.05
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.08
244	0.09
245	0.1
246	0.1
247	0.11
248	0.11
249	0.15
250	0.16
251	0.14
252	0.2
253	0.23
254	0.29
255	0.34
256	0.41
257	0.42
258	0.43
259	0.42
260	0.37
261	0.36
262	0.31
263	0.3
264	0.23
265	0.18
266	0.17
267	0.16
268	0.15
269	0.14
270	0.11
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.09
275	0.09
276	0.08
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.09
281	0.08
282	0.06
283	0.07
284	0.07
285	0.09
286	0.08
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.09
292	0.08
293	0.05
294	0.07
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.07
299	0.08
300	0.08
301	0.09
302	0.07
303	0.1
304	0.12
305	0.21
306	0.22
307	0.24
308	0.26
309	0.25
310	0.26
311	0.27
312	0.26
313	0.21
314	0.2
315	0.2
316	0.19
317	0.2
318	0.18
319	0.15
320	0.13
321	0.1
322	0.1
323	0.1
324	0.09
325	0.09
326	0.1
327	0.14
328	0.14
329	0.15
330	0.19
331	0.18
332	0.19
333	0.2
334	0.21
335	0.22
336	0.29
337	0.27
338	0.23
339	0.22
340	0.21
341	0.19
342	0.18
343	0.15
344	0.09
345	0.1
346	0.09
347	0.09
348	0.1
349	0.1
350	0.15
351	0.18
352	0.18
353	0.2
354	0.24
355	0.25
356	0.32
357	0.41
358	0.45
359	0.5
360	0.55
361	0.55
362	0.58
363	0.58
364	0.5
365	0.41
366	0.34
367	0.28
368	0.21
369	0.19
370	0.12
371	0.11
372	0.11
373	0.1
374	0.1
375	0.08
376	0.08
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.08
392	0.11
393	0.17
394	0.18
395	0.2
396	0.24
397	0.29
398	0.35
399	0.42
400	0.47
401	0.45
402	0.45
403	0.45
404	0.48
405	0.42
406	0.36
407	0.27
408	0.19
409	0.15
410	0.15
411	0.14
412	0.08
413	0.09
414	0.09
415	0.15
416	0.15
417	0.15
418	0.16
419	0.18
420	0.2
421	0.23
422	0.26
423	0.23
424	0.23
425	0.26
426	0.26
427	0.27
428	0.24
429	0.2
430	0.17
431	0.16
432	0.16
433	0.12
434	0.11
435	0.07
436	0.07
437	0.06
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.04
443	0.05
444	0.05
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.08
450	0.09
451	0.09
452	0.09
453	0.08
454	0.08
455	0.09
456	0.08
457	0.07
458	0.08
459	0.08
460	0.08
461	0.08
462	0.12
463	0.14
464	0.15
465	0.16
466	0.17
467	0.21
468	0.25
469	0.29
470	0.26
471	0.26
472	0.25
473	0.24
474	0.28
475	0.25
476	0.22
477	0.18
478	0.19
479	0.19
480	0.18
481	0.2
482	0.16
483	0.15
484	0.13
485	0.15
486	0.12
487	0.11
488	0.11
489	0.09
490	0.07
491	0.07
492	0.08
493	0.06
494	0.07
495	0.07
496	0.07
497	0.1
498	0.11
499	0.11
500	0.12
501	0.12
502	0.12
503	0.14
504	0.17
505	0.16
506	0.16
507	0.18
508	0.19
509	0.22
510	0.28
511	0.28
512	0.3
513	0.38
514	0.41
515	0.4
516	0.43
517	0.42
518	0.42
519	0.48
520	0.46
521	0.41
522	0.43
523	0.44
524	0.39
525	0.37
526	0.34
527	0.3
528	0.28
529	0.26
530	0.22
531	0.2
532	0.2
533	0.19
534	0.14
535	0.11
536	0.09
537	0.09
538	0.07
539	0.07
540	0.07
541	0.09
542	0.11
543	0.1
544	0.11
545	0.11
546	0.17
547	0.25
548	0.34
549	0.43
550	0.52
551	0.63
552	0.72
553	0.83
554	0.87
555	0.9
556	0.92
557	0.93
558	0.94
559	0.95
560	0.96
561	0.96
562	0.97
563	0.94
564	0.94
565	0.94
566	0.93
567	0.91
568	0.86
569	0.75
570	0.66
571	0.6
572	0.49
573	0.38
574	0.27
575	0.18
576	0.17
577	0.2
578	0.2
579	0.18
580	0.19
581	0.2

S3CT52

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer