FuNGI

S3CVJ6

Protein Details

Accession

S3CVJ6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
407-439	PEVVLVKKHYPNRRKNRTRKWKLKRMAKEEGDL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
414-434	KHYPNRRKNRTRKWKLKRMAK

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MSTIEMDMDSDHVPMQMEERRPATILCYRCGAAIDGTTAAGAICYDCIKMTVDITQGIPREAHIQFCRDCDRWMVPPNVWMVAQPESREMLSMCLKRLRGINKVRVIDARFIWTEPNSRRIRVKITVQDTIGEGMLLNQSFEVIYVVGTHQCPECAKSYTHNVWRATVQVRQKVPHKRTFLFLEQLILKHGAHRDTLNIKEARDGLDFFFSQRNQAVKFLDFLKSVVPITAKTSDEMISEDIHTGSKSMKFAYSVELVPICKDDLVALPIQMANKVGHIHPIALCHRIGTSINLLDPTTLQTAEISAPVYWREKFPFQPLADSKDMVEFIVLEIEPTGPRKGRWVPAEVTVTRASDAGSSSYFTRTHLGGLLNAGDSVMGYLLTGSNYNNAQFDEIQDSHAYGSTVPEVVLVKKHYPNRRKNRTRKWKLKRMAKEEGDLLPKKADQDRMENEYEEFLRDIEEDEELRAALTLYKNPKQQAELEAARKLQAASSTAMDVEEGEAAAEEGEGSDIDEGEDGPQINLDELVDELDELNIAEVAE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.15
3	0.2
4	0.23
5	0.28
6	0.29
7	0.3
8	0.3
9	0.3
10	0.32
11	0.32
12	0.31
13	0.29
14	0.3
15	0.29
16	0.29
17	0.3
18	0.26
19	0.2
20	0.18
21	0.17
22	0.14
23	0.14
24	0.13
25	0.11
26	0.09
27	0.07
28	0.06
29	0.05
30	0.05
31	0.06
32	0.07
33	0.07
34	0.08
35	0.11
36	0.11
37	0.12
38	0.14
39	0.16
40	0.17
41	0.18
42	0.21
43	0.2
44	0.21
45	0.19
46	0.17
47	0.22
48	0.21
49	0.27
50	0.26
51	0.3
52	0.31
53	0.35
54	0.41
55	0.36
56	0.36
57	0.34
58	0.36
59	0.37
60	0.42
61	0.42
62	0.36
63	0.38
64	0.39
65	0.35
66	0.31
67	0.25
68	0.21
69	0.22
70	0.24
71	0.21
72	0.21
73	0.21
74	0.21
75	0.21
76	0.18
77	0.17
78	0.23
79	0.25
80	0.26
81	0.29
82	0.3
83	0.32
84	0.38
85	0.39
86	0.41
87	0.48
88	0.53
89	0.56
90	0.58
91	0.58
92	0.57
93	0.54
94	0.49
95	0.41
96	0.36
97	0.29
98	0.28
99	0.28
100	0.24
101	0.3
102	0.28
103	0.37
104	0.35
105	0.38
106	0.42
107	0.44
108	0.48
109	0.46
110	0.52
111	0.51
112	0.54
113	0.54
114	0.49
115	0.46
116	0.4
117	0.35
118	0.26
119	0.17
120	0.11
121	0.08
122	0.1
123	0.09
124	0.08
125	0.06
126	0.07
127	0.06
128	0.07
129	0.06
130	0.04
131	0.04
132	0.05
133	0.06
134	0.08
135	0.09
136	0.1
137	0.09
138	0.11
139	0.12
140	0.13
141	0.16
142	0.16
143	0.17
144	0.21
145	0.29
146	0.35
147	0.42
148	0.46
149	0.44
150	0.43
151	0.42
152	0.42
153	0.37
154	0.35
155	0.34
156	0.34
157	0.36
158	0.39
159	0.46
160	0.52
161	0.57
162	0.59
163	0.59
164	0.53
165	0.55
166	0.57
167	0.53
168	0.47
169	0.4
170	0.35
171	0.3
172	0.28
173	0.25
174	0.21
175	0.16
176	0.16
177	0.18
178	0.15
179	0.15
180	0.16
181	0.18
182	0.21
183	0.23
184	0.27
185	0.26
186	0.25
187	0.26
188	0.26
189	0.25
190	0.21
191	0.21
192	0.14
193	0.16
194	0.16
195	0.14
196	0.18
197	0.15
198	0.16
199	0.18
200	0.19
201	0.17
202	0.2
203	0.2
204	0.17
205	0.19
206	0.19
207	0.18
208	0.16
209	0.15
210	0.14
211	0.13
212	0.12
213	0.12
214	0.1
215	0.08
216	0.11
217	0.14
218	0.14
219	0.13
220	0.14
221	0.14
222	0.14
223	0.14
224	0.12
225	0.09
226	0.09
227	0.1
228	0.08
229	0.08
230	0.08
231	0.07
232	0.08
233	0.09
234	0.09
235	0.09
236	0.1
237	0.1
238	0.11
239	0.14
240	0.14
241	0.12
242	0.13
243	0.13
244	0.12
245	0.12
246	0.12
247	0.09
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.07
253	0.07
254	0.06
255	0.06
256	0.07
257	0.08
258	0.07
259	0.08
260	0.06
261	0.07
262	0.08
263	0.08
264	0.1
265	0.1
266	0.11
267	0.11
268	0.14
269	0.15
270	0.16
271	0.15
272	0.13
273	0.12
274	0.12
275	0.12
276	0.1
277	0.11
278	0.09
279	0.1
280	0.1
281	0.1
282	0.09
283	0.09
284	0.09
285	0.08
286	0.07
287	0.07
288	0.06
289	0.07
290	0.08
291	0.08
292	0.07
293	0.06
294	0.06
295	0.08
296	0.1
297	0.1
298	0.12
299	0.15
300	0.17
301	0.19
302	0.24
303	0.3
304	0.28
305	0.35
306	0.35
307	0.38
308	0.36
309	0.34
310	0.29
311	0.23
312	0.23
313	0.15
314	0.13
315	0.07
316	0.06
317	0.07
318	0.07
319	0.05
320	0.05
321	0.06
322	0.06
323	0.08
324	0.11
325	0.1
326	0.1
327	0.16
328	0.21
329	0.27
330	0.29
331	0.32
332	0.32
333	0.37
334	0.42
335	0.36
336	0.35
337	0.3
338	0.27
339	0.22
340	0.21
341	0.15
342	0.11
343	0.11
344	0.09
345	0.08
346	0.09
347	0.1
348	0.12
349	0.12
350	0.12
351	0.14
352	0.13
353	0.13
354	0.15
355	0.15
356	0.13
357	0.13
358	0.13
359	0.11
360	0.1
361	0.09
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.04
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.04
370	0.04
371	0.05
372	0.05
373	0.08
374	0.09
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.12
379	0.12
380	0.13
381	0.17
382	0.16
383	0.17
384	0.17
385	0.17
386	0.15
387	0.16
388	0.14
389	0.08
390	0.09
391	0.08
392	0.09
393	0.08
394	0.09
395	0.09
396	0.1
397	0.14
398	0.16
399	0.2
400	0.26
401	0.34
402	0.43
403	0.52
404	0.62
405	0.7
406	0.78
407	0.84
408	0.89
409	0.93
410	0.94
411	0.95
412	0.96
413	0.96
414	0.95
415	0.94
416	0.94
417	0.92
418	0.9
419	0.89
420	0.81
421	0.74
422	0.67
423	0.61
424	0.59
425	0.5
426	0.43
427	0.35
428	0.32
429	0.32
430	0.33
431	0.36
432	0.31
433	0.38
434	0.42
435	0.46
436	0.47
437	0.44
438	0.4
439	0.36
440	0.33
441	0.26
442	0.2
443	0.14
444	0.13
445	0.12
446	0.13
447	0.11
448	0.12
449	0.11
450	0.11
451	0.11
452	0.1
453	0.1
454	0.09
455	0.08
456	0.1
457	0.12
458	0.17
459	0.25
460	0.31
461	0.36
462	0.39
463	0.42
464	0.42
465	0.43
466	0.41
467	0.42
468	0.44
469	0.43
470	0.43
471	0.41
472	0.39
473	0.36
474	0.32
475	0.25
476	0.21
477	0.19
478	0.17
479	0.18
480	0.18
481	0.17
482	0.17
483	0.15
484	0.12
485	0.1
486	0.08
487	0.07
488	0.06
489	0.06
490	0.06
491	0.06
492	0.05
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.05
498	0.05
499	0.05
500	0.06
501	0.06
502	0.06
503	0.07
504	0.09
505	0.09
506	0.09
507	0.1
508	0.1
509	0.11
510	0.11
511	0.1
512	0.08
513	0.08
514	0.08
515	0.07
516	0.07
517	0.07
518	0.06
519	0.07
520	0.06
521	0.06

S3CVJ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer