Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CHF6

Protein Details
Accession S3CHF6    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-39DFDPSALTKRRNKKQKEGPNVQTVRLHydrophilic
262-286AAQSLKVQARRPKKKTDFAAKLGIKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-289ARRPKKKTDFAAKLGIKIKK
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
IPR043701  Yju2  
Gene Ontology GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000349  P:generation of catalytic spliceosome for first transesterification step  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MSERKVLSKYYPPDFDPSALTKRRNKKQKEGPNVQTVRLMSPMSMRCTRCGEFIYKGRKFNARKEKPESENYLGIQIYRFYIRCTRCSGEIIFRTDPKNQDYAIVSGAKRNVEPWRQTIDETDEQRLDRLEAEQAEEAGDAAAEQNRMEELEAKTLEAKREMDVADALDEIRTRNARIARADHREHLETVALARPTSEEELLRQQDEEDAKAAREAFAAARADVEAEVEDATEPEPAPAPAVLDKVATIEHIPLEEDAPRPAAQSLKVQARRPKKKTDFAAKLGIKIKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.46
3 0.41
4 0.4
5 0.41
6 0.43
7 0.48
8 0.52
9 0.6
10 0.69
11 0.74
12 0.78
13 0.79
14 0.84
15 0.87
16 0.89
17 0.89
18 0.86
19 0.87
20 0.81
21 0.71
22 0.65
23 0.55
24 0.46
25 0.38
26 0.3
27 0.2
28 0.24
29 0.27
30 0.28
31 0.34
32 0.33
33 0.34
34 0.4
35 0.41
36 0.37
37 0.36
38 0.35
39 0.34
40 0.41
41 0.48
42 0.47
43 0.5
44 0.51
45 0.57
46 0.57
47 0.61
48 0.64
49 0.63
50 0.67
51 0.72
52 0.76
53 0.73
54 0.76
55 0.74
56 0.67
57 0.61
58 0.53
59 0.47
60 0.38
61 0.32
62 0.25
63 0.18
64 0.15
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.21
69 0.24
70 0.26
71 0.31
72 0.32
73 0.31
74 0.34
75 0.34
76 0.34
77 0.36
78 0.39
79 0.35
80 0.35
81 0.36
82 0.37
83 0.37
84 0.32
85 0.3
86 0.24
87 0.25
88 0.24
89 0.22
90 0.2
91 0.2
92 0.18
93 0.18
94 0.2
95 0.18
96 0.16
97 0.18
98 0.22
99 0.25
100 0.27
101 0.28
102 0.31
103 0.31
104 0.32
105 0.31
106 0.31
107 0.31
108 0.3
109 0.29
110 0.25
111 0.24
112 0.24
113 0.23
114 0.17
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.07
125 0.05
126 0.05
127 0.03
128 0.03
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.08
137 0.08
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.15
142 0.16
143 0.17
144 0.15
145 0.15
146 0.12
147 0.14
148 0.14
149 0.12
150 0.11
151 0.11
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.13
162 0.16
163 0.19
164 0.22
165 0.27
166 0.32
167 0.39
168 0.41
169 0.4
170 0.41
171 0.39
172 0.37
173 0.31
174 0.25
175 0.18
176 0.16
177 0.17
178 0.13
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.12
183 0.14
184 0.13
185 0.1
186 0.12
187 0.2
188 0.21
189 0.21
190 0.19
191 0.18
192 0.21
193 0.21
194 0.2
195 0.15
196 0.14
197 0.13
198 0.15
199 0.15
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.12
205 0.13
206 0.11
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.06
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.12
229 0.12
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.12
243 0.13
244 0.13
245 0.15
246 0.15
247 0.15
248 0.16
249 0.18
250 0.18
251 0.24
252 0.3
253 0.37
254 0.44
255 0.5
256 0.58
257 0.66
258 0.75
259 0.75
260 0.79
261 0.78
262 0.81
263 0.84
264 0.86
265 0.84
266 0.78
267 0.82
268 0.73
269 0.71