Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3C5T6

Protein Details
Accession S3C5T6    Localization Confidence High Confidence Score 25.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MRAKRSKQYKKLVQQYQLHHGFHydrophilic
239-261AKGPNPLSVKKKKAKPTAPSGDAHydrophilic
264-293DPKTTPDDGEPKKKRKRKHKARPEGEADAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
181-198RNKSGQKAGEKAGEKRKR
231-258EKKKKGYGAKGPNPLSVKKKKAKPTAPS
272-286GEPKKKRKRKHKARP
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MRAKRSKQYKKLVQQYQLHHGFREPYQVLVDGEIVRDAQRFTMDLQAGLERTLHGKVKIMITQCCIRHLYESPKEPGLNQAIDLAKTFERRRCGHRPEDFDKALTALDCLKHVVDEKGRGENKHRYVVATQDQNVRRFMRGVSGVPLIYINRSVMIMEPMSEMTAKVGASAEHAKFRSELRNKSGQKAGEKAGEKRKRGEDDGGDDASGDDSDDKSASASTGRTLGNKTDEKKKKGYGAKGPNPLSVKKKKAKPTAPSGDAAADPKTTPDDGEPKKKRKRKHKARPEGEADAADAADAAPAPAAPAAASEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.82
3 0.81
4 0.79
5 0.7
6 0.6
7 0.54
8 0.48
9 0.41
10 0.44
11 0.35
12 0.27
13 0.27
14 0.28
15 0.26
16 0.23
17 0.24
18 0.15
19 0.15
20 0.14
21 0.12
22 0.11
23 0.12
24 0.11
25 0.1
26 0.11
27 0.11
28 0.12
29 0.19
30 0.19
31 0.18
32 0.19
33 0.2
34 0.19
35 0.19
36 0.17
37 0.1
38 0.12
39 0.15
40 0.17
41 0.15
42 0.18
43 0.21
44 0.25
45 0.28
46 0.3
47 0.29
48 0.3
49 0.36
50 0.34
51 0.34
52 0.32
53 0.29
54 0.29
55 0.32
56 0.37
57 0.38
58 0.42
59 0.42
60 0.44
61 0.44
62 0.4
63 0.41
64 0.36
65 0.29
66 0.23
67 0.25
68 0.22
69 0.22
70 0.22
71 0.19
72 0.16
73 0.21
74 0.24
75 0.24
76 0.3
77 0.33
78 0.4
79 0.48
80 0.53
81 0.58
82 0.62
83 0.66
84 0.64
85 0.69
86 0.62
87 0.52
88 0.45
89 0.36
90 0.29
91 0.2
92 0.16
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.13
101 0.14
102 0.19
103 0.2
104 0.27
105 0.3
106 0.31
107 0.35
108 0.4
109 0.41
110 0.42
111 0.41
112 0.34
113 0.33
114 0.37
115 0.36
116 0.32
117 0.3
118 0.32
119 0.36
120 0.36
121 0.38
122 0.34
123 0.29
124 0.26
125 0.24
126 0.2
127 0.18
128 0.17
129 0.16
130 0.16
131 0.15
132 0.14
133 0.15
134 0.11
135 0.09
136 0.09
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.07
157 0.12
158 0.12
159 0.15
160 0.16
161 0.16
162 0.17
163 0.19
164 0.26
165 0.28
166 0.32
167 0.34
168 0.44
169 0.45
170 0.48
171 0.51
172 0.45
173 0.42
174 0.41
175 0.38
176 0.34
177 0.35
178 0.37
179 0.44
180 0.47
181 0.46
182 0.48
183 0.52
184 0.5
185 0.51
186 0.5
187 0.43
188 0.41
189 0.43
190 0.37
191 0.3
192 0.26
193 0.22
194 0.17
195 0.13
196 0.08
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.11
209 0.12
210 0.14
211 0.15
212 0.18
213 0.23
214 0.28
215 0.32
216 0.38
217 0.47
218 0.5
219 0.55
220 0.57
221 0.59
222 0.62
223 0.66
224 0.66
225 0.68
226 0.71
227 0.75
228 0.72
229 0.68
230 0.64
231 0.61
232 0.6
233 0.58
234 0.59
235 0.59
236 0.65
237 0.7
238 0.77
239 0.8
240 0.79
241 0.81
242 0.81
243 0.76
244 0.69
245 0.6
246 0.51
247 0.43
248 0.37
249 0.28
250 0.19
251 0.15
252 0.15
253 0.16
254 0.14
255 0.14
256 0.17
257 0.25
258 0.32
259 0.43
260 0.52
261 0.59
262 0.7
263 0.76
264 0.81
265 0.83
266 0.87
267 0.88
268 0.9
269 0.91
270 0.91
271 0.94
272 0.94
273 0.9
274 0.85
275 0.76
276 0.65
277 0.55
278 0.44
279 0.34
280 0.24
281 0.16
282 0.09
283 0.07
284 0.06
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05