FuNGI

S3C528

Protein Details

Accession

S3C528

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
35-57	IDSILFKRRPKNRAHASAAAKKC	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
576-598	RGGVRGGGRGGGGRGGTGPPRAS

Subcellular Location(s)

mito 11, cyto 11, cyto_mito 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006401 P:RNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF00271 Helicase_C PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MLMSLQTSPKLGAQQRLHNMDVIHSRVEDKSFRGIDSILFKRRPKNRAHASAAAKKCQLETAFLQPPKQLPAKLVEKTQQRWDLQVDKSLLFEIDPPDIGTQTLFYRGGRNFRIVNYEEVPAPKEANGDAQAVAPSNLTAGLALAGRGHGIEDAAAEAEEEWLQRSILARENAKSDASGLQRVIQAGTGGLLEVAPGLQRGIRFMGDRPKPKPKLGKVTSDELDTAEIVQNDLEMSSQEEPSAIRSPTETDDNNNEEGAEDTSAKAAEFDGDVDDLLPVEFPSLQAGQFGPTVSKKKRREWAHMVDLNSESSNYRNLVPGEMARQWPFELDAFQKEAIYHLECGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAQKHQTKAIYTSPIKALSNQKFRDFKSTFDDVGILTGDVQINQEAKCLIMTTEILRSKLYNQSDLLREVEFVIFDEVHYVSDSERGVVWEEVIIMLPEHVSLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKRDVYVINTPKRPVPLEHYMWSGKTVQKIVSADRKWLEKGYQEAKILVAGDGKPPSAGTSVTGGGSRGGSGGGRGVPMRGGNNQQRGGVRGGGRGGGGRGGTGPPRASHNPGHMGRGGRATGGSSLAQEKTVWSDVVRYLRKSSLLPACIFVFSRMRCEEYAMSLSNLDFCDAGEKTRIHSIYSKSITRLTKEDQELPQITRLRDMATRGIAVHHGGLLPIVKEIVELLFAQSLVKVLFATETFAVGLNLPTRTVVFSDHRKFDGTKRRILSPGEYTQMAGRAGRRGLDLVGTAIIVPMSENKDVPPAETLKGLILGVPTRLTSQFRLTYNMILSLHRVETLKVEDMMKRSFSEHATQNGRSDHEEKMLELEEELAKLAHARSHCEACGDTMAACHIAAETYRQDTAQMYQKLFKMPAVATSIFCPGRLVIFINEKGVHAIGVLADDPFRSVPESGTPTLSMVEVQPPRVAPDDTDMMSFVPALRGFWRSSVPAKIRLREVKVPLAKVEHLAGYIVPIGRRSSDLTPVEEQMGSLDLSWGSDIWAEVNLDKVRDVDAVWYIDDRKAKAHAVSVSPALGCPEFSEHFAARHKEWLVRDKLAEMRRAVDDSSLALLPEYENRVAVLKHLGFVNDSSVVMLKGRVACEVRTADELVLTEVILDNLLAGLEPAEIAALLSIFIYQGKDDMEIESAPFISNGLSKAIKEVYRIWKDTIRTQEQFHVISAGDESERSSKLHFGLMEVVYEWASGSPFKNIAVMTTEQEGTIVRTITRLEDTCREVRNIGRIIGDTTLETKMGGVKEAIMRNITTVPSLYL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.57
3	0.61
4	0.59
5	0.54
6	0.49
7	0.45
8	0.45
9	0.38
10	0.31
11	0.27
12	0.28
13	0.27
14	0.31
15	0.29
16	0.25
17	0.32
18	0.31
19	0.31
20	0.31
21	0.29
22	0.29
23	0.35
24	0.39
25	0.39
26	0.44
27	0.49
28	0.56
29	0.65
30	0.68
31	0.69
32	0.72
33	0.74
34	0.77
35	0.8
36	0.8
37	0.8
38	0.83
39	0.79
40	0.75
41	0.67
42	0.58
43	0.51
44	0.48
45	0.4
46	0.35
47	0.33
48	0.36
49	0.42
50	0.43
51	0.44
52	0.41
53	0.42
54	0.43
55	0.44
56	0.37
57	0.3
58	0.37
59	0.43
60	0.44
61	0.47
62	0.48
63	0.52
64	0.56
65	0.62
66	0.62
67	0.55
68	0.55
69	0.56
70	0.56
71	0.5
72	0.52
73	0.46
74	0.38
75	0.37
76	0.34
77	0.28
78	0.21
79	0.21
80	0.16
81	0.15
82	0.15
83	0.16
84	0.16
85	0.16
86	0.16
87	0.13
88	0.12
89	0.11
90	0.15
91	0.15
92	0.15
93	0.21
94	0.25
95	0.33
96	0.34
97	0.38
98	0.36
99	0.37
100	0.43
101	0.39
102	0.4
103	0.35
104	0.34
105	0.32
106	0.31
107	0.31
108	0.25
109	0.24
110	0.19
111	0.19
112	0.17
113	0.19
114	0.2
115	0.19
116	0.18
117	0.18
118	0.18
119	0.17
120	0.17
121	0.12
122	0.1
123	0.08
124	0.08
125	0.07
126	0.06
127	0.05
128	0.06
129	0.06
130	0.06
131	0.06
132	0.06
133	0.06
134	0.06
135	0.06
136	0.05
137	0.05
138	0.05
139	0.05
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.05
145	0.06
146	0.07
147	0.07
148	0.08
149	0.08
150	0.09
151	0.09
152	0.12
153	0.13
154	0.2
155	0.25
156	0.27
157	0.28
158	0.32
159	0.32
160	0.31
161	0.28
162	0.23
163	0.24
164	0.23
165	0.25
166	0.22
167	0.24
168	0.25
169	0.25
170	0.24
171	0.18
172	0.15
173	0.12
174	0.11
175	0.08
176	0.06
177	0.06
178	0.05
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.06
186	0.06
187	0.09
188	0.11
189	0.13
190	0.14
191	0.18
192	0.28
193	0.35
194	0.42
195	0.48
196	0.56
197	0.59
198	0.66
199	0.72
200	0.72
201	0.74
202	0.72
203	0.76
204	0.69
205	0.72
206	0.65
207	0.57
208	0.48
209	0.37
210	0.33
211	0.22
212	0.19
213	0.14
214	0.13
215	0.11
216	0.1
217	0.09
218	0.08
219	0.08
220	0.07
221	0.05
222	0.08
223	0.09
224	0.1
225	0.1
226	0.1
227	0.1
228	0.14
229	0.19
230	0.16
231	0.14
232	0.15
233	0.18
234	0.21
235	0.26
236	0.23
237	0.23
238	0.29
239	0.32
240	0.32
241	0.29
242	0.26
243	0.2
244	0.21
245	0.18
246	0.13
247	0.1
248	0.09
249	0.1
250	0.1
251	0.1
252	0.08
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.06
263	0.06
264	0.05
265	0.04
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.09
273	0.1
274	0.11
275	0.11
276	0.12
277	0.12
278	0.16
279	0.24
280	0.31
281	0.41
282	0.46
283	0.54
284	0.63
285	0.68
286	0.73
287	0.75
288	0.77
289	0.77
290	0.74
291	0.67
292	0.61
293	0.54
294	0.45
295	0.36
296	0.27
297	0.17
298	0.14
299	0.15
300	0.13
301	0.13
302	0.15
303	0.16
304	0.16
305	0.17
306	0.18
307	0.19
308	0.21
309	0.23
310	0.21
311	0.21
312	0.2
313	0.19
314	0.19
315	0.15
316	0.15
317	0.15
318	0.16
319	0.17
320	0.18
321	0.17
322	0.16
323	0.17
324	0.17
325	0.16
326	0.14
327	0.12
328	0.13
329	0.12
330	0.13
331	0.12
332	0.08
333	0.07
334	0.06
335	0.05
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.07
343	0.07
344	0.06
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.13
356	0.16
357	0.16
358	0.17
359	0.18
360	0.19
361	0.23
362	0.26
363	0.3
364	0.28
365	0.31
366	0.31
367	0.34
368	0.32
369	0.34
370	0.39
371	0.39
372	0.47
373	0.47
374	0.51
375	0.53
376	0.54
377	0.59
378	0.51
379	0.45
380	0.42
381	0.43
382	0.36
383	0.32
384	0.31
385	0.2
386	0.2
387	0.18
388	0.11
389	0.07
390	0.08
391	0.07
392	0.07
393	0.07
394	0.08
395	0.09
396	0.09
397	0.1
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.07
403	0.06
404	0.07
405	0.08
406	0.15
407	0.17
408	0.17
409	0.17
410	0.18
411	0.2
412	0.26
413	0.26
414	0.22
415	0.22
416	0.25
417	0.27
418	0.28
419	0.27
420	0.2
421	0.18
422	0.17
423	0.16
424	0.11
425	0.1
426	0.09
427	0.08
428	0.07
429	0.09
430	0.08
431	0.08
432	0.08
433	0.08
434	0.06
435	0.09
436	0.09
437	0.08
438	0.08
439	0.09
440	0.1
441	0.1
442	0.1
443	0.07
444	0.07
445	0.07
446	0.07
447	0.06
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.03
453	0.03
454	0.03
455	0.03
456	0.03
457	0.03
458	0.03
459	0.04
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.06
464	0.06
465	0.07
466	0.07
467	0.07
468	0.07
469	0.09
470	0.1
471	0.1
472	0.16
473	0.22
474	0.26
475	0.29
476	0.34
477	0.38
478	0.39
479	0.44
480	0.4
481	0.4
482	0.46
483	0.53
484	0.54
485	0.5
486	0.49
487	0.46
488	0.46
489	0.41
490	0.33
491	0.29
492	0.31
493	0.32
494	0.33
495	0.35
496	0.33
497	0.31
498	0.31
499	0.27
500	0.21
501	0.2
502	0.2
503	0.17
504	0.2
505	0.21
506	0.23
507	0.29
508	0.28
509	0.29
510	0.3
511	0.31
512	0.29
513	0.29
514	0.26
515	0.2
516	0.25
517	0.26
518	0.28
519	0.26
520	0.25
521	0.24
522	0.23
523	0.2
524	0.15
525	0.13
526	0.09
527	0.11
528	0.11
529	0.11
530	0.1
531	0.09
532	0.1
533	0.09
534	0.08
535	0.07
536	0.08
537	0.09
538	0.09
539	0.1
540	0.09
541	0.08
542	0.08
543	0.07
544	0.05
545	0.05
546	0.04
547	0.04
548	0.05
549	0.05
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.08
555	0.09
556	0.1
557	0.17
558	0.21
559	0.27
560	0.28
561	0.29
562	0.29
563	0.3
564	0.29
565	0.26
566	0.21
567	0.17
568	0.16
569	0.14
570	0.14
571	0.12
572	0.1
573	0.08
574	0.07
575	0.06
576	0.06
577	0.06
578	0.07
579	0.09
580	0.09
581	0.09
582	0.14
583	0.16
584	0.2
585	0.21
586	0.24
587	0.3
588	0.31
589	0.32
590	0.29
591	0.28
592	0.25
593	0.25
594	0.21
595	0.14
596	0.13
597	0.11
598	0.09
599	0.09
600	0.08
601	0.07
602	0.09
603	0.09
604	0.09
605	0.08
606	0.08
607	0.09
608	0.1
609	0.09
610	0.08
611	0.09
612	0.12
613	0.19
614	0.21
615	0.2
616	0.21
617	0.22
618	0.23
619	0.22
620	0.25
621	0.23
622	0.23
623	0.22
624	0.22
625	0.22
626	0.21
627	0.2
628	0.16
629	0.15
630	0.13
631	0.17
632	0.16
633	0.17
634	0.17
635	0.19
636	0.18
637	0.15
638	0.17
639	0.14
640	0.13
641	0.12
642	0.11
643	0.11
644	0.1
645	0.09
646	0.06
647	0.05
648	0.08
649	0.08
650	0.09
651	0.11
652	0.11
653	0.12
654	0.16
655	0.17
656	0.15
657	0.19
658	0.22
659	0.25
660	0.29
661	0.29
662	0.26
663	0.31
664	0.31
665	0.29
666	0.3
667	0.26
668	0.29
669	0.3
670	0.33
671	0.28
672	0.32
673	0.32
674	0.29
675	0.32
676	0.29
677	0.27
678	0.23
679	0.23
680	0.19
681	0.19
682	0.2
683	0.17
684	0.14
685	0.14
686	0.13
687	0.13
688	0.12
689	0.11
690	0.09
691	0.07
692	0.06
693	0.05
694	0.05
695	0.05
696	0.05
697	0.04
698	0.04
699	0.04
700	0.04
701	0.04
702	0.04
703	0.04
704	0.04
705	0.04
706	0.05
707	0.05
708	0.05
709	0.05
710	0.05
711	0.04
712	0.05
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.04
717	0.06
718	0.06
719	0.06
720	0.06
721	0.06
722	0.06
723	0.06
724	0.07
725	0.07
726	0.07
727	0.07
728	0.07
729	0.07
730	0.07
731	0.07
732	0.1
733	0.12
734	0.21
735	0.26
736	0.28
737	0.29
738	0.3
739	0.31
740	0.36
741	0.43
742	0.38
743	0.4
744	0.4
745	0.42
746	0.44
747	0.44
748	0.4
749	0.35
750	0.34
751	0.29
752	0.27
753	0.25
754	0.22
755	0.22
756	0.19
757	0.13
758	0.12
759	0.12
760	0.12
761	0.13
762	0.13
763	0.11
764	0.11
765	0.11
766	0.1
767	0.07
768	0.07
769	0.06
770	0.05
771	0.05
772	0.04
773	0.03
774	0.03
775	0.05
776	0.08
777	0.08
778	0.09
779	0.09
780	0.14
781	0.14
782	0.14
783	0.15
784	0.14
785	0.15
786	0.15
787	0.15
788	0.11
789	0.12
790	0.11
791	0.09
792	0.07
793	0.07
794	0.07
795	0.07
796	0.07
797	0.08
798	0.1
799	0.11
800	0.13
801	0.17
802	0.21
803	0.22
804	0.26
805	0.26
806	0.26
807	0.25
808	0.26
809	0.22
810	0.17
811	0.18
812	0.15
813	0.14
814	0.13
815	0.13
816	0.11
817	0.12
818	0.14
819	0.14
820	0.14
821	0.15
822	0.16
823	0.19
824	0.2
825	0.19
826	0.17
827	0.17
828	0.18
829	0.19
830	0.22
831	0.22
832	0.27
833	0.31
834	0.32
835	0.33
836	0.33
837	0.32
838	0.31
839	0.29
840	0.24
841	0.23
842	0.23
843	0.19
844	0.2
845	0.19
846	0.16
847	0.13
848	0.13
849	0.09
850	0.09
851	0.09
852	0.07
853	0.06
854	0.07
855	0.07
856	0.08
857	0.08
858	0.13
859	0.16
860	0.18
861	0.18
862	0.19
863	0.19
864	0.17
865	0.18
866	0.14
867	0.11
868	0.09
869	0.09
870	0.08
871	0.08
872	0.06
873	0.05
874	0.05
875	0.05
876	0.07
877	0.08
878	0.1
879	0.1
880	0.1
881	0.11
882	0.12
883	0.16
884	0.22
885	0.24
886	0.24
887	0.27
888	0.29
889	0.31
890	0.31
891	0.28
892	0.22
893	0.19
894	0.2
895	0.22
896	0.21
897	0.19
898	0.2
899	0.24
900	0.21
901	0.21
902	0.18
903	0.13
904	0.13
905	0.13
906	0.13
907	0.11
908	0.16
909	0.17
910	0.19
911	0.2
912	0.19
913	0.19
914	0.17
915	0.14
916	0.09
917	0.08
918	0.05
919	0.05
920	0.05
921	0.05
922	0.05
923	0.05
924	0.06
925	0.06
926	0.06
927	0.07
928	0.07
929	0.08
930	0.13
931	0.18
932	0.18
933	0.19
934	0.19
935	0.18
936	0.18
937	0.17
938	0.13
939	0.09
940	0.15
941	0.15
942	0.16
943	0.17
944	0.17
945	0.19
946	0.21
947	0.2
948	0.14
949	0.16
950	0.19
951	0.18
952	0.18
953	0.16
954	0.14
955	0.14
956	0.13
957	0.09
958	0.09
959	0.08
960	0.09
961	0.1
962	0.12
963	0.13
964	0.15
965	0.17
966	0.17
967	0.21
968	0.28
969	0.3
970	0.37
971	0.41
972	0.43
973	0.49
974	0.53
975	0.55
976	0.54
977	0.55
978	0.55
979	0.54
980	0.52
981	0.47
982	0.43
983	0.38
984	0.32
985	0.29
986	0.2
987	0.16
988	0.14
989	0.12
990	0.09
991	0.11
992	0.11
993	0.1
994	0.11
995	0.11
996	0.12
997	0.14
998	0.17
999	0.17
1000	0.24
1001	0.26
1002	0.28
1003	0.3
1004	0.3
1005	0.3
1006	0.26
1007	0.24
1008	0.16
1009	0.15
1010	0.11
1011	0.09
1012	0.08
1013	0.06
1014	0.07
1015	0.07
1016	0.06
1017	0.05
1018	0.06
1019	0.06
1020	0.05
1021	0.07
1022	0.08
1023	0.07
1024	0.13
1025	0.14
1026	0.14
1027	0.14
1028	0.14
1029	0.14
1030	0.14
1031	0.14
1032	0.1
1033	0.13
1034	0.13
1035	0.14
1036	0.15
1037	0.15
1038	0.18
1039	0.21
1040	0.19
1041	0.19
1042	0.21
1043	0.23
1044	0.23
1045	0.26
1046	0.27
1047	0.27
1048	0.28
1049	0.27
1050	0.25
1051	0.22
1052	0.21
1053	0.18
1054	0.14
1055	0.11
1056	0.1
1057	0.13
1058	0.13
1059	0.15
1060	0.2
1061	0.18
1062	0.22
1063	0.28
1064	0.31
1065	0.27
1066	0.32
1067	0.32
1068	0.33
1069	0.38
1070	0.43
1071	0.43
1072	0.43
1073	0.42
1074	0.4
1075	0.46
1076	0.45
1077	0.45
1078	0.37
1079	0.35
1080	0.33
1081	0.34
1082	0.31
1083	0.24
1084	0.2
1085	0.16
1086	0.17
1087	0.14
1088	0.12
1089	0.1
1090	0.1
1091	0.1
1092	0.13
1093	0.15
1094	0.13
1095	0.13
1096	0.14
1097	0.16
1098	0.16
1099	0.17
1100	0.2
1101	0.17
1102	0.18
1103	0.19
1104	0.19
1105	0.19
1106	0.19
1107	0.2
1108	0.14
1109	0.13
1110	0.12
1111	0.12
1112	0.12
1113	0.11
1114	0.11
1115	0.11
1116	0.13
1117	0.14
1118	0.18
1119	0.19
1120	0.19
1121	0.24
1122	0.26
1123	0.25
1124	0.24
1125	0.25
1126	0.21
1127	0.2
1128	0.2
1129	0.16
1130	0.14
1131	0.11
1132	0.09
1133	0.08
1134	0.08
1135	0.06
1136	0.06
1137	0.04
1138	0.04
1139	0.04
1140	0.03
1141	0.03
1142	0.03
1143	0.03
1144	0.04
1145	0.03
1146	0.03
1147	0.03
1148	0.03
1149	0.04
1150	0.03
1151	0.03
1152	0.03
1153	0.04
1154	0.04
1155	0.05
1156	0.06
1157	0.06
1158	0.07
1159	0.08
1160	0.1
1161	0.1
1162	0.11
1163	0.12
1164	0.12
1165	0.12
1166	0.12
1167	0.12
1168	0.11
1169	0.1
1170	0.09
1171	0.08
1172	0.09
1173	0.1
1174	0.13
1175	0.14
1176	0.14
1177	0.17
1178	0.22
1179	0.23
1180	0.24
1181	0.31
1182	0.38
1183	0.44
1184	0.47
1185	0.48
1186	0.48
1187	0.51
1188	0.56
1189	0.58
1190	0.56
1191	0.51
1192	0.51
1193	0.55
1194	0.54
1195	0.51
1196	0.44
1197	0.36
1198	0.27
1199	0.25
1200	0.22
1201	0.16
1202	0.12
1203	0.11
1204	0.13
1205	0.14
1206	0.16
1207	0.16
1208	0.17
1209	0.19
1210	0.2
1211	0.24
1212	0.22
1213	0.2
1214	0.25
1215	0.25
1216	0.24
1217	0.21
1218	0.21
1219	0.16
1220	0.16
1221	0.14
1222	0.08
1223	0.08
1224	0.1
1225	0.11
1226	0.14
1227	0.14
1228	0.15
1229	0.17
1230	0.17
1231	0.17
1232	0.2
1233	0.21
1234	0.19
1235	0.22
1236	0.22
1237	0.19
1238	0.19
1239	0.18
1240	0.16
1241	0.17
1242	0.16
1243	0.12
1244	0.14
1245	0.15
1246	0.17
1247	0.22
1248	0.22
1249	0.24
1250	0.29
1251	0.35
1252	0.4
1253	0.43
1254	0.42
1255	0.4
1256	0.42
1257	0.45
1258	0.43
1259	0.39
1260	0.35
1261	0.32
1262	0.32
1263	0.31
1264	0.27
1265	0.2
1266	0.19
1267	0.18
1268	0.16
1269	0.14
1270	0.13
1271	0.16
1272	0.16
1273	0.16
1274	0.14
1275	0.17
1276	0.23
1277	0.27
1278	0.29
1279	0.26
1280	0.26
1281	0.26
1282	0.29
1283	0.26
1284	0.2

S3C528

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer