Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3C8C3

Protein Details
Accession S3C8C3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-198LAFWLLRRRKSQKNQQYHQAEQHydrophilic
491-516LETLAAKHRKKPRKDKDAGKKKDKTGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
496-539AKHRKKPRKDKDAGKKKDKTGRISKASSSSSSSRKPLKELRHNK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR023486  TFIIB_CS  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
IPR013137  Znf_TFIIB  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF08271  TF_Zn_Ribbon  
PF00382  TFIIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00782  TFIIB  
PS51134  ZF_TFIIB  
CDD cd20551  CYCLIN_TFIIB_rpt1  
cd12087  TM_EGFR-like  
Amino Acid Sequences MASPASMSGAVNDQTAVAASTLPQTQSLLPQTQSLPQTQDAIQSTSLATTDTLPTTTAASWEQTTTPTMSTWSPPAETTTPWEQTTAWATSTPTLSASTPYTSATSPVSSIISTATPSVSTTSSSSSATAASATASSSASSASTASTTSASSSSSTPKWIPGVIVGSIAFVAILAGLAFWLLRRRKSQKNQQYHQAEQFDQGGAPLASPDIFGYRRPLMRQSNADDAERQRRALIRKSIISRSSWSASQIDIAAAAAPTRRDESVSLRDDWKEWEAQMQQQKADLANQHPSMQVEEVEGADVERDGRGLRDARDERNVSPPPTAHGHEEVFPVSPVSTVSVLPPVPARSRQRPLSADSVQSDQTVTNHNRDSTADLLPTQTADPLLPRRPTIKSIRSITHRNPHTRHMSEAESPTSIYSVDLQDGRQNRAPSASPRRRPQTATTHSPLFRRLALTLLSAKDSSHFSSSSSSRSHGSHGSHGSQVQVELRILETLAAKHRKKPRKDKDAGKKKDKTGRISKASSSSSSSRKPLKELRHNKRTPSLTQTTLGGSITKASKPQAKTQAQTQVQTQTQVHTQTQTTAPTMEAPRDAYKENLDNILMCNECKEFPPNLVEEFSSGDMVCGSCGLVVGSRIIDNRSEWRTFANDDQGNDDPSRVGESANSLANDEGLRTQVDMRAANGKLAGKLNSINKKSQSEKLNNDLQEGFRAISGLVDVMQTSTIVGQTAMHIYKLAYEHGQLKGKQREAVIAGCIFIACRQCGVPRTFREIYSITHVQKKEIGRVFKSLESFLSKIQEKNPQASAAQGVKDYKASSSTSAEELCTRYCSLLAFRNTPRMEKISKALARKTTGIPDLAGRSPLSVAAACIYFASQYLEDPRASKDIANVAGVSDGTIKTAYKFLYNTRDTLVEDDWNGNVASLPTN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.11
4 0.07
5 0.06
6 0.07
7 0.1
8 0.12
9 0.13
10 0.13
11 0.14
12 0.15
13 0.21
14 0.26
15 0.27
16 0.26
17 0.29
18 0.3
19 0.34
20 0.36
21 0.33
22 0.32
23 0.29
24 0.32
25 0.29
26 0.34
27 0.3
28 0.3
29 0.27
30 0.24
31 0.23
32 0.2
33 0.19
34 0.13
35 0.11
36 0.11
37 0.13
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.14
42 0.15
43 0.15
44 0.15
45 0.14
46 0.15
47 0.16
48 0.17
49 0.17
50 0.17
51 0.19
52 0.18
53 0.18
54 0.16
55 0.17
56 0.17
57 0.19
58 0.22
59 0.22
60 0.22
61 0.22
62 0.27
63 0.26
64 0.26
65 0.29
66 0.32
67 0.33
68 0.32
69 0.33
70 0.27
71 0.29
72 0.32
73 0.28
74 0.22
75 0.19
76 0.2
77 0.22
78 0.23
79 0.2
80 0.16
81 0.16
82 0.16
83 0.17
84 0.18
85 0.17
86 0.17
87 0.18
88 0.19
89 0.17
90 0.18
91 0.18
92 0.16
93 0.15
94 0.16
95 0.15
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.09
104 0.1
105 0.12
106 0.11
107 0.12
108 0.13
109 0.16
110 0.17
111 0.17
112 0.17
113 0.16
114 0.15
115 0.14
116 0.12
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.11
139 0.13
140 0.17
141 0.17
142 0.21
143 0.21
144 0.23
145 0.24
146 0.24
147 0.22
148 0.2
149 0.22
150 0.18
151 0.18
152 0.15
153 0.14
154 0.13
155 0.12
156 0.08
157 0.05
158 0.04
159 0.03
160 0.03
161 0.02
162 0.02
163 0.02
164 0.02
165 0.02
166 0.03
167 0.11
168 0.15
169 0.19
170 0.29
171 0.36
172 0.47
173 0.58
174 0.69
175 0.72
176 0.79
177 0.82
178 0.83
179 0.84
180 0.79
181 0.76
182 0.7
183 0.6
184 0.51
185 0.46
186 0.36
187 0.28
188 0.22
189 0.17
190 0.12
191 0.11
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.09
198 0.09
199 0.11
200 0.16
201 0.2
202 0.23
203 0.25
204 0.33
205 0.36
206 0.42
207 0.47
208 0.47
209 0.5
210 0.5
211 0.49
212 0.45
213 0.44
214 0.47
215 0.42
216 0.38
217 0.32
218 0.35
219 0.39
220 0.43
221 0.46
222 0.43
223 0.48
224 0.53
225 0.57
226 0.54
227 0.51
228 0.46
229 0.42
230 0.39
231 0.33
232 0.31
233 0.25
234 0.23
235 0.22
236 0.18
237 0.13
238 0.1
239 0.1
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.08
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.13
250 0.19
251 0.26
252 0.29
253 0.3
254 0.31
255 0.31
256 0.31
257 0.32
258 0.28
259 0.21
260 0.18
261 0.21
262 0.2
263 0.26
264 0.31
265 0.31
266 0.29
267 0.28
268 0.3
269 0.25
270 0.26
271 0.23
272 0.2
273 0.24
274 0.25
275 0.24
276 0.24
277 0.24
278 0.22
279 0.19
280 0.16
281 0.11
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.08
295 0.11
296 0.12
297 0.21
298 0.25
299 0.28
300 0.35
301 0.37
302 0.35
303 0.41
304 0.43
305 0.35
306 0.34
307 0.31
308 0.27
309 0.29
310 0.29
311 0.23
312 0.23
313 0.22
314 0.22
315 0.23
316 0.2
317 0.17
318 0.15
319 0.12
320 0.09
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.07
326 0.08
327 0.1
328 0.1
329 0.1
330 0.12
331 0.13
332 0.14
333 0.21
334 0.27
335 0.32
336 0.39
337 0.42
338 0.47
339 0.47
340 0.48
341 0.49
342 0.45
343 0.4
344 0.35
345 0.33
346 0.27
347 0.25
348 0.21
349 0.14
350 0.13
351 0.17
352 0.18
353 0.2
354 0.21
355 0.21
356 0.21
357 0.22
358 0.24
359 0.19
360 0.18
361 0.15
362 0.13
363 0.14
364 0.13
365 0.13
366 0.1
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.08
371 0.12
372 0.17
373 0.18
374 0.19
375 0.22
376 0.24
377 0.29
378 0.35
379 0.37
380 0.39
381 0.42
382 0.46
383 0.48
384 0.53
385 0.53
386 0.54
387 0.54
388 0.55
389 0.53
390 0.55
391 0.57
392 0.52
393 0.48
394 0.42
395 0.39
396 0.35
397 0.35
398 0.29
399 0.21
400 0.2
401 0.17
402 0.14
403 0.11
404 0.08
405 0.07
406 0.07
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.12
411 0.14
412 0.17
413 0.2
414 0.2
415 0.19
416 0.2
417 0.22
418 0.26
419 0.35
420 0.4
421 0.43
422 0.5
423 0.55
424 0.56
425 0.58
426 0.56
427 0.56
428 0.54
429 0.54
430 0.5
431 0.5
432 0.49
433 0.47
434 0.42
435 0.33
436 0.27
437 0.21
438 0.18
439 0.14
440 0.13
441 0.14
442 0.14
443 0.13
444 0.13
445 0.12
446 0.11
447 0.11
448 0.12
449 0.12
450 0.11
451 0.11
452 0.1
453 0.14
454 0.15
455 0.17
456 0.17
457 0.17
458 0.17
459 0.17
460 0.19
461 0.2
462 0.2
463 0.21
464 0.23
465 0.23
466 0.22
467 0.22
468 0.2
469 0.16
470 0.15
471 0.11
472 0.1
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.13
482 0.21
483 0.22
484 0.29
485 0.39
486 0.47
487 0.56
488 0.66
489 0.71
490 0.74
491 0.82
492 0.85
493 0.87
494 0.89
495 0.89
496 0.87
497 0.83
498 0.79
499 0.79
500 0.75
501 0.71
502 0.71
503 0.7
504 0.66
505 0.62
506 0.57
507 0.54
508 0.5
509 0.43
510 0.37
511 0.32
512 0.31
513 0.31
514 0.34
515 0.36
516 0.35
517 0.39
518 0.43
519 0.48
520 0.54
521 0.62
522 0.68
523 0.72
524 0.74
525 0.72
526 0.72
527 0.66
528 0.59
529 0.56
530 0.5
531 0.41
532 0.39
533 0.37
534 0.29
535 0.26
536 0.22
537 0.15
538 0.1
539 0.1
540 0.11
541 0.1
542 0.11
543 0.13
544 0.19
545 0.21
546 0.29
547 0.37
548 0.4
549 0.41
550 0.45
551 0.52
552 0.48
553 0.47
554 0.42
555 0.38
556 0.34
557 0.35
558 0.3
559 0.22
560 0.22
561 0.24
562 0.22
563 0.18
564 0.18
565 0.17
566 0.19
567 0.19
568 0.17
569 0.14
570 0.14
571 0.16
572 0.16
573 0.15
574 0.14
575 0.15
576 0.17
577 0.18
578 0.19
579 0.16
580 0.18
581 0.2
582 0.2
583 0.19
584 0.17
585 0.15
586 0.15
587 0.17
588 0.14
589 0.11
590 0.11
591 0.11
592 0.11
593 0.12
594 0.15
595 0.13
596 0.15
597 0.18
598 0.18
599 0.18
600 0.19
601 0.17
602 0.14
603 0.15
604 0.14
605 0.12
606 0.1
607 0.09
608 0.08
609 0.08
610 0.07
611 0.05
612 0.04
613 0.04
614 0.04
615 0.04
616 0.04
617 0.05
618 0.05
619 0.06
620 0.07
621 0.08
622 0.09
623 0.1
624 0.11
625 0.16
626 0.2
627 0.2
628 0.2
629 0.21
630 0.23
631 0.24
632 0.26
633 0.29
634 0.26
635 0.26
636 0.3
637 0.3
638 0.29
639 0.27
640 0.25
641 0.16
642 0.14
643 0.16
644 0.12
645 0.11
646 0.08
647 0.11
648 0.13
649 0.15
650 0.15
651 0.13
652 0.12
653 0.13
654 0.13
655 0.1
656 0.09
657 0.07
658 0.08
659 0.08
660 0.09
661 0.1
662 0.13
663 0.13
664 0.14
665 0.19
666 0.19
667 0.19
668 0.21
669 0.2
670 0.2
671 0.22
672 0.21
673 0.16
674 0.21
675 0.29
676 0.35
677 0.37
678 0.39
679 0.42
680 0.46
681 0.49
682 0.52
683 0.53
684 0.53
685 0.55
686 0.57
687 0.6
688 0.54
689 0.53
690 0.47
691 0.39
692 0.33
693 0.28
694 0.22
695 0.14
696 0.14
697 0.11
698 0.09
699 0.09
700 0.06
701 0.05
702 0.05
703 0.05
704 0.05
705 0.05
706 0.05
707 0.05
708 0.05
709 0.05
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.06
714 0.11
715 0.11
716 0.1
717 0.11
718 0.1
719 0.14
720 0.15
721 0.15
722 0.12
723 0.15
724 0.19
725 0.24
726 0.3
727 0.3
728 0.38
729 0.44
730 0.46
731 0.47
732 0.44
733 0.42
734 0.39
735 0.38
736 0.31
737 0.24
738 0.21
739 0.17
740 0.17
741 0.13
742 0.12
743 0.13
744 0.1
745 0.11
746 0.12
747 0.16
748 0.23
749 0.27
750 0.33
751 0.35
752 0.43
753 0.44
754 0.44
755 0.45
756 0.4
757 0.38
758 0.38
759 0.41
760 0.35
761 0.41
762 0.41
763 0.38
764 0.42
765 0.42
766 0.43
767 0.43
768 0.46
769 0.41
770 0.47
771 0.48
772 0.46
773 0.45
774 0.37
775 0.34
776 0.32
777 0.31
778 0.27
779 0.31
780 0.3
781 0.31
782 0.35
783 0.42
784 0.39
785 0.43
786 0.43
787 0.39
788 0.36
789 0.35
790 0.36
791 0.3
792 0.28
793 0.26
794 0.25
795 0.23
796 0.25
797 0.24
798 0.19
799 0.19
800 0.19
801 0.19
802 0.21
803 0.22
804 0.23
805 0.23
806 0.23
807 0.23
808 0.23
809 0.22
810 0.21
811 0.2
812 0.18
813 0.17
814 0.18
815 0.2
816 0.26
817 0.3
818 0.34
819 0.36
820 0.45
821 0.47
822 0.48
823 0.48
824 0.46
825 0.44
826 0.41
827 0.42
828 0.43
829 0.47
830 0.5
831 0.52
832 0.53
833 0.54
834 0.54
835 0.53
836 0.49
837 0.47
838 0.42
839 0.36
840 0.34
841 0.34
842 0.32
843 0.3
844 0.23
845 0.21
846 0.2
847 0.19
848 0.17
849 0.13
850 0.12
851 0.12
852 0.12
853 0.11
854 0.11
855 0.1
856 0.08
857 0.09
858 0.12
859 0.1
860 0.13
861 0.17
862 0.2
863 0.21
864 0.22
865 0.25
866 0.24
867 0.25
868 0.24
869 0.23
870 0.27
871 0.28
872 0.28
873 0.24
874 0.21
875 0.21
876 0.2
877 0.16
878 0.13
879 0.11
880 0.1
881 0.11
882 0.12
883 0.12
884 0.16
885 0.16
886 0.18
887 0.21
888 0.26
889 0.35
890 0.38
891 0.38
892 0.37
893 0.39
894 0.36
895 0.37
896 0.33
897 0.26
898 0.26
899 0.26
900 0.23
901 0.22
902 0.2
903 0.16
904 0.15