Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3D978

Protein Details
Accession S3D978    Localization Confidence Low Confidence Score 7.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21QTCPCVRLRLWRQYGRDWHRHydrophilic
717-743DHEPLPGQRKDRKRWNKAEPNKEQAQSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 12, cyto 3.5, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF12854  PPR_1  
PF13041  PPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MQTCPCVRLRLWRQYGRDWHRLRNASPATLARAASTMYQHSPNANPVDLLDNKSKTGTSWDATRSDPELLTGRPPRITFYKSKNTLPTRKPWSSAGSPEDSRSSAHPTADEIAAWSLVDWRFFISGPRNGTPMDRPTHLFAGQLHFLKKEYPPNEHKEVVRRFNQWKEAVATTWCMLENKQLPCELNKEHSSILRRILEQEQVHASSDEAWLAGAEGEAHGRAERIRKLWSTLTQEEREAQWPHLLISTFRTYPELILDIFHATFETSAAPLYVIEDTLSYIVRSNESANVALKLSFDDIFSIVKLSMEKGRLNAPLHLRQHTLYALLRATKTPHDASSLFNLLQGHGQPIHANTLIQFTARLAKSPEHKAQAVDMVRLMVSEHSLDINSVKGSALCTTILSSGWGRVLGNNNITPAVGPANGAGTISAASSSEQEHSGPTPAQLFEQLLGIGLEPNLITYTAIIRELCSKGELTSAQEVLQIMLNTQTGLDAYVYSILMNGAKAAGHYPLIRQVAEAAASNRILHPYVWNDFLQAIHVMALSEARSDPAYKRPRMIPAFPLMLETYRKTFSPAPLLELLPFVSRLGNSYGNAGIGMNSSAATRRRWEFVEELGPTLSLLPQLSPADMIAPTGVTLSTMVLGYIQGLSNPYDVIEFYSHFHRLLKTGHPVAISVVEETGSMVYDIVIMALCEYDGMLRVALDVVSDMLRDASLGLDDHEPLPGQRKDRKRWNKAEPNKEQAQSQEQQSPVPAPDTTDMAHAVMPGVHSPPSVHTWSILLNGFMFHRHTMQGERILKMMAKRGIEPNEVTWNTLISGYARLQFARKTGNALLRRELAGYEPNDFTFRAFSYLGDKAIVIKYLERHREVKQNTPAPSSSGSVSATTARNRHPAIARELRSLKEDIDGIAQMMNEDEELPKQPKQKRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.81
3 0.78
4 0.79
5 0.74
6 0.73
7 0.75
8 0.76
9 0.68
10 0.68
11 0.63
12 0.56
13 0.55
14 0.48
15 0.44
16 0.42
17 0.4
18 0.3
19 0.27
20 0.25
21 0.23
22 0.23
23 0.21
24 0.21
25 0.24
26 0.25
27 0.28
28 0.3
29 0.34
30 0.35
31 0.31
32 0.28
33 0.25
34 0.3
35 0.29
36 0.32
37 0.32
38 0.3
39 0.31
40 0.32
41 0.31
42 0.25
43 0.29
44 0.29
45 0.25
46 0.3
47 0.33
48 0.35
49 0.36
50 0.39
51 0.34
52 0.32
53 0.29
54 0.26
55 0.25
56 0.23
57 0.3
58 0.33
59 0.33
60 0.34
61 0.35
62 0.37
63 0.4
64 0.45
65 0.45
66 0.48
67 0.56
68 0.57
69 0.63
70 0.68
71 0.71
72 0.75
73 0.73
74 0.74
75 0.73
76 0.72
77 0.69
78 0.64
79 0.61
80 0.57
81 0.58
82 0.54
83 0.51
84 0.48
85 0.47
86 0.45
87 0.39
88 0.34
89 0.3
90 0.32
91 0.28
92 0.27
93 0.25
94 0.25
95 0.27
96 0.26
97 0.23
98 0.17
99 0.15
100 0.14
101 0.13
102 0.1
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.12
107 0.12
108 0.13
109 0.14
110 0.19
111 0.21
112 0.26
113 0.31
114 0.32
115 0.33
116 0.32
117 0.35
118 0.36
119 0.36
120 0.34
121 0.31
122 0.33
123 0.36
124 0.39
125 0.36
126 0.32
127 0.28
128 0.29
129 0.31
130 0.32
131 0.29
132 0.26
133 0.26
134 0.27
135 0.3
136 0.33
137 0.33
138 0.38
139 0.45
140 0.51
141 0.57
142 0.58
143 0.57
144 0.58
145 0.62
146 0.61
147 0.6
148 0.6
149 0.6
150 0.63
151 0.67
152 0.59
153 0.54
154 0.51
155 0.46
156 0.41
157 0.35
158 0.3
159 0.23
160 0.22
161 0.19
162 0.16
163 0.14
164 0.2
165 0.26
166 0.26
167 0.28
168 0.29
169 0.3
170 0.31
171 0.36
172 0.32
173 0.32
174 0.31
175 0.32
176 0.31
177 0.35
178 0.37
179 0.35
180 0.38
181 0.35
182 0.33
183 0.35
184 0.36
185 0.39
186 0.34
187 0.34
188 0.31
189 0.28
190 0.29
191 0.25
192 0.22
193 0.16
194 0.16
195 0.13
196 0.09
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.08
210 0.14
211 0.18
212 0.2
213 0.24
214 0.26
215 0.3
216 0.34
217 0.38
218 0.4
219 0.43
220 0.47
221 0.44
222 0.44
223 0.42
224 0.39
225 0.38
226 0.32
227 0.27
228 0.23
229 0.22
230 0.21
231 0.22
232 0.2
233 0.15
234 0.18
235 0.21
236 0.19
237 0.19
238 0.2
239 0.18
240 0.18
241 0.19
242 0.15
243 0.11
244 0.11
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.12
274 0.14
275 0.15
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.13
280 0.12
281 0.1
282 0.11
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.12
295 0.14
296 0.15
297 0.16
298 0.19
299 0.24
300 0.25
301 0.28
302 0.3
303 0.35
304 0.37
305 0.38
306 0.36
307 0.31
308 0.32
309 0.28
310 0.25
311 0.18
312 0.16
313 0.15
314 0.16
315 0.16
316 0.15
317 0.17
318 0.16
319 0.2
320 0.19
321 0.19
322 0.21
323 0.21
324 0.22
325 0.24
326 0.24
327 0.2
328 0.2
329 0.19
330 0.16
331 0.17
332 0.15
333 0.12
334 0.1
335 0.11
336 0.1
337 0.1
338 0.12
339 0.11
340 0.11
341 0.09
342 0.11
343 0.11
344 0.1
345 0.1
346 0.08
347 0.14
348 0.14
349 0.15
350 0.15
351 0.18
352 0.23
353 0.3
354 0.35
355 0.31
356 0.32
357 0.32
358 0.31
359 0.34
360 0.29
361 0.23
362 0.18
363 0.15
364 0.13
365 0.13
366 0.12
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.08
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.08
393 0.07
394 0.09
395 0.13
396 0.14
397 0.16
398 0.16
399 0.16
400 0.15
401 0.15
402 0.13
403 0.1
404 0.08
405 0.06
406 0.06
407 0.05
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.05
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.03
417 0.04
418 0.05
419 0.06
420 0.06
421 0.07
422 0.07
423 0.08
424 0.08
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.09
433 0.08
434 0.08
435 0.07
436 0.06
437 0.05
438 0.05
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.04
446 0.03
447 0.03
448 0.04
449 0.05
450 0.06
451 0.05
452 0.06
453 0.09
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.1
458 0.09
459 0.11
460 0.11
461 0.1
462 0.11
463 0.11
464 0.11
465 0.11
466 0.11
467 0.1
468 0.11
469 0.08
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.06
474 0.06
475 0.05
476 0.04
477 0.04
478 0.04
479 0.03
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.03
490 0.03
491 0.04
492 0.04
493 0.05
494 0.06
495 0.06
496 0.07
497 0.12
498 0.13
499 0.13
500 0.12
501 0.12
502 0.11
503 0.12
504 0.12
505 0.08
506 0.08
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.09
512 0.08
513 0.1
514 0.12
515 0.13
516 0.16
517 0.15
518 0.15
519 0.15
520 0.14
521 0.13
522 0.1
523 0.08
524 0.06
525 0.06
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.04
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.06
534 0.07
535 0.09
536 0.18
537 0.26
538 0.27
539 0.3
540 0.32
541 0.41
542 0.44
543 0.45
544 0.39
545 0.36
546 0.36
547 0.33
548 0.31
549 0.23
550 0.2
551 0.19
552 0.17
553 0.15
554 0.14
555 0.14
556 0.16
557 0.19
558 0.19
559 0.26
560 0.25
561 0.26
562 0.27
563 0.28
564 0.24
565 0.22
566 0.2
567 0.12
568 0.12
569 0.09
570 0.07
571 0.07
572 0.08
573 0.11
574 0.12
575 0.12
576 0.13
577 0.13
578 0.12
579 0.13
580 0.11
581 0.08
582 0.06
583 0.06
584 0.05
585 0.05
586 0.05
587 0.08
588 0.1
589 0.12
590 0.15
591 0.17
592 0.2
593 0.21
594 0.24
595 0.23
596 0.24
597 0.29
598 0.26
599 0.25
600 0.22
601 0.2
602 0.17
603 0.15
604 0.12
605 0.07
606 0.06
607 0.05
608 0.08
609 0.09
610 0.09
611 0.08
612 0.08
613 0.08
614 0.08
615 0.08
616 0.06
617 0.05
618 0.05
619 0.05
620 0.05
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.05
625 0.05
626 0.04
627 0.04
628 0.04
629 0.05
630 0.05
631 0.05
632 0.05
633 0.06
634 0.07
635 0.07
636 0.07
637 0.07
638 0.07
639 0.07
640 0.09
641 0.09
642 0.09
643 0.1
644 0.14
645 0.15
646 0.15
647 0.17
648 0.16
649 0.17
650 0.2
651 0.23
652 0.27
653 0.28
654 0.3
655 0.28
656 0.27
657 0.25
658 0.24
659 0.19
660 0.13
661 0.1
662 0.08
663 0.08
664 0.08
665 0.07
666 0.05
667 0.05
668 0.04
669 0.04
670 0.04
671 0.04
672 0.04
673 0.04
674 0.03
675 0.03
676 0.03
677 0.03
678 0.03
679 0.03
680 0.03
681 0.04
682 0.05
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.06
687 0.06
688 0.05
689 0.04
690 0.05
691 0.05
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.05
696 0.05
697 0.05
698 0.04
699 0.05
700 0.05
701 0.07
702 0.08
703 0.09
704 0.09
705 0.1
706 0.1
707 0.1
708 0.18
709 0.19
710 0.25
711 0.32
712 0.42
713 0.51
714 0.62
715 0.73
716 0.75
717 0.82
718 0.87
719 0.9
720 0.9
721 0.92
722 0.89
723 0.86
724 0.82
725 0.74
726 0.64
727 0.57
728 0.55
729 0.48
730 0.43
731 0.41
732 0.34
733 0.34
734 0.33
735 0.31
736 0.25
737 0.23
738 0.19
739 0.15
740 0.16
741 0.17
742 0.17
743 0.16
744 0.15
745 0.14
746 0.14
747 0.11
748 0.1
749 0.09
750 0.09
751 0.09
752 0.09
753 0.09
754 0.09
755 0.1
756 0.12
757 0.17
758 0.19
759 0.18
760 0.17
761 0.18
762 0.19
763 0.22
764 0.19
765 0.15
766 0.13
767 0.14
768 0.13
769 0.14
770 0.15
771 0.13
772 0.14
773 0.15
774 0.17
775 0.2
776 0.24
777 0.31
778 0.33
779 0.33
780 0.32
781 0.32
782 0.32
783 0.31
784 0.34
785 0.29
786 0.27
787 0.3
788 0.36
789 0.4
790 0.41
791 0.41
792 0.37
793 0.42
794 0.4
795 0.38
796 0.31
797 0.27
798 0.23
799 0.22
800 0.19
801 0.1
802 0.13
803 0.14
804 0.17
805 0.18
806 0.18
807 0.2
808 0.22
809 0.24
810 0.28
811 0.27
812 0.29
813 0.33
814 0.42
815 0.45
816 0.47
817 0.48
818 0.44
819 0.44
820 0.39
821 0.34
822 0.27
823 0.28
824 0.26
825 0.25
826 0.23
827 0.23
828 0.24
829 0.24
830 0.22
831 0.18
832 0.17
833 0.17
834 0.16
835 0.16
836 0.2
837 0.22
838 0.22
839 0.2
840 0.19
841 0.18
842 0.2
843 0.21
844 0.17
845 0.18
846 0.24
847 0.32
848 0.4
849 0.41
850 0.44
851 0.47
852 0.56
853 0.57
854 0.6
855 0.61
856 0.62
857 0.61
858 0.62
859 0.57
860 0.51
861 0.49
862 0.41
863 0.32
864 0.28
865 0.25
866 0.2
867 0.21
868 0.22
869 0.24
870 0.27
871 0.31
872 0.33
873 0.39
874 0.4
875 0.45
876 0.48
877 0.49
878 0.54
879 0.58
880 0.57
881 0.59
882 0.61
883 0.56
884 0.53
885 0.48
886 0.39
887 0.33
888 0.3
889 0.23
890 0.22
891 0.21
892 0.17
893 0.17
894 0.16
895 0.12
896 0.12
897 0.11
898 0.08
899 0.08
900 0.09
901 0.1
902 0.16
903 0.2
904 0.24
905 0.32