Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PQR5

Protein Details
Accession A0A1D8PQR5    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-188DNAPLARRKRRRTSPHELNILHydrophilic
219-238IWFQNKRQSIRKQSNSEKEIHydrophilic
306-329SMKFKFMPSKSKVTRKLQECKALGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-178RRKRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017970  Homeobox_CS  
IPR001356  Homeobox_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0030154  P:cell differentiation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG cal:CAALFM_C700970CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00027  HOMEOBOX_1  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MMMHLQQTPTKRSILPPITPLTNSNNGSKLSLPPLSSILPTAPSSHYRDHPLTTSTPYKAPLPSINTSAAYQSPSMTYGSYIPTPESATSSVTSSNKRSFSVLDDSSIMDTSILEERKLKASTSSSVASTSSSSPTLSSPASTPTDNKAYAFISHSLATFPSQEPSIDNAPLARRKRRRTSPHELNILNQEFALGTTPNKSRRIQIAKKVSMTEKAVQIWFQNKRQSIRKQSNSEKEITVLPPTSNYPPFQQHQPEQISTLPPPPPAQVQPVQPVQSVQLPIQAQSTPLPKPASISPLPITNSYTSMKFKFMPSKSKVTRKLQECKALGDITNLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.46
3 0.46
4 0.48
5 0.48
6 0.47
7 0.45
8 0.41
9 0.42
10 0.41
11 0.39
12 0.38
13 0.36
14 0.36
15 0.35
16 0.32
17 0.29
18 0.3
19 0.27
20 0.25
21 0.27
22 0.26
23 0.25
24 0.23
25 0.18
26 0.18
27 0.18
28 0.19
29 0.19
30 0.22
31 0.27
32 0.31
33 0.33
34 0.37
35 0.39
36 0.39
37 0.39
38 0.38
39 0.36
40 0.37
41 0.38
42 0.34
43 0.33
44 0.32
45 0.33
46 0.3
47 0.31
48 0.31
49 0.32
50 0.32
51 0.33
52 0.34
53 0.32
54 0.31
55 0.29
56 0.24
57 0.2
58 0.17
59 0.15
60 0.13
61 0.13
62 0.13
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.13
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.15
72 0.14
73 0.15
74 0.13
75 0.14
76 0.14
77 0.14
78 0.18
79 0.19
80 0.22
81 0.25
82 0.29
83 0.29
84 0.29
85 0.3
86 0.26
87 0.28
88 0.31
89 0.27
90 0.23
91 0.22
92 0.22
93 0.21
94 0.2
95 0.15
96 0.08
97 0.07
98 0.08
99 0.12
100 0.11
101 0.11
102 0.13
103 0.15
104 0.19
105 0.2
106 0.19
107 0.17
108 0.2
109 0.22
110 0.23
111 0.23
112 0.19
113 0.19
114 0.19
115 0.16
116 0.15
117 0.13
118 0.11
119 0.11
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.12
128 0.14
129 0.14
130 0.15
131 0.17
132 0.2
133 0.2
134 0.19
135 0.17
136 0.16
137 0.17
138 0.17
139 0.15
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.12
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.12
153 0.13
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.14
158 0.21
159 0.24
160 0.3
161 0.36
162 0.44
163 0.54
164 0.63
165 0.7
166 0.72
167 0.79
168 0.81
169 0.8
170 0.79
171 0.7
172 0.62
173 0.59
174 0.51
175 0.4
176 0.29
177 0.21
178 0.14
179 0.14
180 0.13
181 0.06
182 0.05
183 0.09
184 0.13
185 0.18
186 0.23
187 0.24
188 0.26
189 0.35
190 0.45
191 0.48
192 0.54
193 0.59
194 0.59
195 0.6
196 0.6
197 0.52
198 0.46
199 0.43
200 0.37
201 0.29
202 0.27
203 0.25
204 0.23
205 0.24
206 0.27
207 0.29
208 0.31
209 0.35
210 0.37
211 0.42
212 0.5
213 0.57
214 0.6
215 0.65
216 0.69
217 0.72
218 0.78
219 0.81
220 0.76
221 0.7
222 0.59
223 0.5
224 0.44
225 0.36
226 0.3
227 0.21
228 0.18
229 0.17
230 0.19
231 0.22
232 0.22
233 0.22
234 0.23
235 0.27
236 0.3
237 0.35
238 0.4
239 0.39
240 0.44
241 0.47
242 0.44
243 0.41
244 0.4
245 0.36
246 0.31
247 0.32
248 0.26
249 0.23
250 0.24
251 0.23
252 0.26
253 0.25
254 0.3
255 0.29
256 0.31
257 0.35
258 0.39
259 0.39
260 0.35
261 0.33
262 0.29
263 0.29
264 0.27
265 0.21
266 0.22
267 0.2
268 0.21
269 0.22
270 0.2
271 0.17
272 0.19
273 0.23
274 0.19
275 0.23
276 0.25
277 0.23
278 0.26
279 0.28
280 0.31
281 0.29
282 0.32
283 0.29
284 0.32
285 0.35
286 0.33
287 0.33
288 0.27
289 0.29
290 0.27
291 0.29
292 0.28
293 0.28
294 0.3
295 0.29
296 0.34
297 0.4
298 0.44
299 0.5
300 0.51
301 0.6
302 0.65
303 0.74
304 0.77
305 0.77
306 0.81
307 0.8
308 0.84
309 0.82
310 0.83
311 0.75
312 0.7
313 0.65
314 0.58
315 0.5