Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CA70

Protein Details
Accession S3CA70    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
294-320NGIRHRRSSISKATKKRRGNLPKEYTDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
298-312HRRSSISKATKKRRG
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001356  Homeobox_dom  
IPR008422  Homeobox_KN_domain  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF05920  Homeobox_KN  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MIVLEMSRPMHPFGFDGGRPLSHSHSHSLSHSPDSSPFAGSVNSAGFESRRCTTTTAAADDEGSTRTHSHSQIPRVYSDLPPATSGASVSSSRRSSSGYGSTVAADRVPDYGSHSDRGRSFDSPGRDQHALAAGQPYHPGFHNYSPRHSSSTAPSSASSAAPPSVAAQQPLPYHQSSRPSQGQSQGHPAGTHLPFAPGPSPYQQHPSRVQSRSSDSTRSYQPQHPHAHPHQPQHQPQLQHPQQPMAHPQAHHTYHADYSPDYYGARYRSHEQQPHHSVLGMNGMNGMNGINGINGIRHRRSSISKATKKRRGNLPKEYTDMFQEWLYKHINHPYPSDEEKHDFIRRTGLDMISNWFINARRRKLPDMVRNLDGDAHSASLGPSDME
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.24
3 0.27
4 0.27
5 0.26
6 0.28
7 0.29
8 0.29
9 0.28
10 0.31
11 0.31
12 0.32
13 0.34
14 0.34
15 0.38
16 0.36
17 0.36
18 0.35
19 0.32
20 0.32
21 0.35
22 0.33
23 0.28
24 0.25
25 0.21
26 0.19
27 0.18
28 0.17
29 0.12
30 0.12
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.12
35 0.16
36 0.17
37 0.17
38 0.18
39 0.21
40 0.22
41 0.29
42 0.31
43 0.31
44 0.29
45 0.28
46 0.27
47 0.25
48 0.24
49 0.17
50 0.14
51 0.12
52 0.12
53 0.15
54 0.19
55 0.2
56 0.28
57 0.34
58 0.41
59 0.46
60 0.47
61 0.45
62 0.44
63 0.45
64 0.37
65 0.37
66 0.32
67 0.26
68 0.25
69 0.24
70 0.21
71 0.19
72 0.17
73 0.11
74 0.11
75 0.12
76 0.13
77 0.18
78 0.19
79 0.2
80 0.21
81 0.22
82 0.21
83 0.25
84 0.28
85 0.24
86 0.24
87 0.24
88 0.24
89 0.22
90 0.21
91 0.16
92 0.11
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.12
98 0.17
99 0.18
100 0.21
101 0.22
102 0.25
103 0.27
104 0.31
105 0.29
106 0.25
107 0.27
108 0.29
109 0.33
110 0.33
111 0.34
112 0.35
113 0.33
114 0.31
115 0.3
116 0.28
117 0.23
118 0.2
119 0.2
120 0.16
121 0.15
122 0.17
123 0.15
124 0.12
125 0.12
126 0.15
127 0.14
128 0.2
129 0.29
130 0.3
131 0.35
132 0.38
133 0.39
134 0.4
135 0.38
136 0.34
137 0.31
138 0.34
139 0.31
140 0.27
141 0.26
142 0.23
143 0.23
144 0.21
145 0.16
146 0.11
147 0.1
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.14
156 0.14
157 0.16
158 0.18
159 0.15
160 0.17
161 0.19
162 0.25
163 0.23
164 0.29
165 0.33
166 0.33
167 0.34
168 0.39
169 0.39
170 0.35
171 0.4
172 0.35
173 0.31
174 0.28
175 0.26
176 0.24
177 0.22
178 0.21
179 0.14
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.14
184 0.09
185 0.1
186 0.11
187 0.13
188 0.13
189 0.2
190 0.21
191 0.25
192 0.3
193 0.35
194 0.41
195 0.42
196 0.43
197 0.39
198 0.43
199 0.44
200 0.41
201 0.38
202 0.32
203 0.34
204 0.35
205 0.36
206 0.35
207 0.36
208 0.38
209 0.42
210 0.46
211 0.45
212 0.49
213 0.49
214 0.55
215 0.54
216 0.56
217 0.57
218 0.59
219 0.61
220 0.61
221 0.6
222 0.52
223 0.51
224 0.55
225 0.5
226 0.49
227 0.45
228 0.43
229 0.4
230 0.4
231 0.41
232 0.36
233 0.35
234 0.29
235 0.32
236 0.34
237 0.34
238 0.33
239 0.3
240 0.26
241 0.24
242 0.25
243 0.23
244 0.15
245 0.16
246 0.15
247 0.14
248 0.13
249 0.12
250 0.14
251 0.16
252 0.18
253 0.19
254 0.23
255 0.3
256 0.39
257 0.44
258 0.45
259 0.52
260 0.56
261 0.56
262 0.52
263 0.45
264 0.36
265 0.31
266 0.34
267 0.24
268 0.18
269 0.16
270 0.15
271 0.14
272 0.14
273 0.13
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.06
281 0.09
282 0.15
283 0.17
284 0.19
285 0.21
286 0.26
287 0.32
288 0.37
289 0.45
290 0.51
291 0.58
292 0.67
293 0.75
294 0.81
295 0.83
296 0.84
297 0.84
298 0.84
299 0.84
300 0.85
301 0.83
302 0.79
303 0.76
304 0.69
305 0.59
306 0.53
307 0.45
308 0.35
309 0.27
310 0.27
311 0.22
312 0.24
313 0.26
314 0.23
315 0.25
316 0.33
317 0.38
318 0.37
319 0.39
320 0.39
321 0.42
322 0.45
323 0.46
324 0.42
325 0.4
326 0.41
327 0.44
328 0.46
329 0.42
330 0.39
331 0.43
332 0.38
333 0.38
334 0.39
335 0.34
336 0.31
337 0.3
338 0.33
339 0.28
340 0.27
341 0.23
342 0.21
343 0.23
344 0.3
345 0.38
346 0.4
347 0.46
348 0.52
349 0.58
350 0.65
351 0.71
352 0.72
353 0.73
354 0.72
355 0.67
356 0.62
357 0.57
358 0.51
359 0.41
360 0.33
361 0.24
362 0.18
363 0.15
364 0.14
365 0.13
366 0.11