FuNGI

S3C6N1

Protein Details

Accession

S3C6N1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
988-1007	ASKKDSSKAKSKPLTIKLFQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito_nucl 9.833, mito 9.5, cyto_nucl 9.333, nucl 9, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR041505 Dis3_CSD2 IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR029060 PIN-like_dom_sf IPR002716 PIN_dom IPR001900 RNase_II/R IPR022966 RNase_II/R_CS IPR033771 Rrp44_CSD1 IPR033770 RRP44_S1
Gene Ontology	GO:0000178 C:exosome (RNase complex) GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0004540 F:RNA nuclease activity
Pfam	View protein in Pfam PF17849 OB_Dis3 PF13638 PIN_4 PF00773 RNB PF17216 Rrp44_CSD1 PF17215 Rrp44_S1
PROSITE	View protein in PROSITE PS01175 RIBONUCLEASE_II
CDD	cd09862 PIN_Rrp44-like

Amino Acid Sequences

MATLKRSEPSDGFAPNLSSKTFVRTTKSGKVQKIVREVYLRQDIPCSSQLCVACQDSAPRDAGGHVVPSVLSNRPAGTKAYPKGHYLVPDTNAFLTAMDLFEQTSAFYDVIVLQIVLEEVRNRSLPLYNRLIGLTRSDEKRFYVFFNEFRLETYVPRDAGETINDRNDRAVRRAVQWYSEHISAAAAHAAQPAPTVVMLSNDRDNLSKARKAGLAACSLPEYVSGLDNADELLDMIPESQDPSVTDSKKATLAKSNTHLYPEYLTMSKLTTGVKAGLLHQGNFNVSPYNYLEGSVRVPAFPKALLILGRENINRAVDGDTVVVEVLPRDQWKQPSTKIIDEETVTKNESAENGDGDGDSAGGARSNDLISAKERKALQEEVKRTQVQAGAVPSSGKANKDDAPSHVEPTARVVGIIRRNWRQYVGHIDQTSVSKSSGQGRKQETVFVIPMDKKIPKIRLRTRQASELLGKRILVAMDAWDRDSRHPVGHFIRSLGELETKAAETEALLLEYDVQYRPFPKTVLDCLPAEGHDWRVPASKEDPGWIDREDLRDLLICSIDPIGCQDIDDALHARPLPNGNYEVGVHIADVSHFVRPNNAMDLEASVRGTTVYLVDKRIDMLPMLLGTDLCSLKPYVERYAFSVLWEMDPDANVVDVRFTKSVIRSREAFSYEQAQLRIDDTSEQGDLTKGIRTLLQLSKKLKQKRLDAGALSLSSPEVKVQMESETSDPIDVQTKALLDTNSLVEEFMLLANIAVATKVYEAFPQTALLRRHAPPPKTNFDELSRQLRAAGPVGDDGGAFILSTESSKALADSLDDCVDPQEPFFNTLIRILATRCMTAAEYFTAGSLAYPEFRHYGLASPIYTHFTSPIRRYADLQVHRQLASAIGYSSSATATRGRLSAICRNINMRHRNAQLAGRASIAYYVGQAVRGKETTAEGFVMRVFSNGFVVLVPRFGIESAIRLRDLATPEPEATFDADTYTLETTMDVASKKDSSKAKSKPLTIKLFQKVMVRITDHKDETTGKRSARMELVTA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.29
3	0.3
4	0.25
5	0.23
6	0.22
7	0.27
8	0.31
9	0.32
10	0.36
11	0.41
12	0.48
13	0.54
14	0.64
15	0.66
16	0.66
17	0.7
18	0.7
19	0.71
20	0.74
21	0.67
22	0.63
23	0.61
24	0.57
25	0.57
26	0.59
27	0.52
28	0.43
29	0.44
30	0.4
31	0.38
32	0.42
33	0.35
34	0.27
35	0.31
36	0.31
37	0.29
38	0.33
39	0.29
40	0.25
41	0.25
42	0.29
43	0.27
44	0.29
45	0.28
46	0.24
47	0.22
48	0.21
49	0.23
50	0.18
51	0.16
52	0.13
53	0.12
54	0.12
55	0.13
56	0.15
57	0.15
58	0.16
59	0.15
60	0.17
61	0.19
62	0.21
63	0.23
64	0.26
65	0.32
66	0.38
67	0.45
68	0.46
69	0.46
70	0.48
71	0.47
72	0.46
73	0.43
74	0.42
75	0.37
76	0.37
77	0.36
78	0.33
79	0.3
80	0.26
81	0.2
82	0.15
83	0.12
84	0.1
85	0.09
86	0.09
87	0.08
88	0.08
89	0.08
90	0.07
91	0.09
92	0.1
93	0.09
94	0.09
95	0.09
96	0.09
97	0.1
98	0.1
99	0.08
100	0.05
101	0.06
102	0.06
103	0.06
104	0.06
105	0.08
106	0.09
107	0.12
108	0.13
109	0.14
110	0.16
111	0.21
112	0.26
113	0.31
114	0.36
115	0.35
116	0.36
117	0.36
118	0.36
119	0.31
120	0.29
121	0.28
122	0.28
123	0.31
124	0.33
125	0.33
126	0.34
127	0.37
128	0.35
129	0.32
130	0.33
131	0.32
132	0.32
133	0.37
134	0.37
135	0.33
136	0.33
137	0.35
138	0.28
139	0.26
140	0.28
141	0.27
142	0.24
143	0.25
144	0.24
145	0.21
146	0.21
147	0.24
148	0.22
149	0.21
150	0.28
151	0.28
152	0.28
153	0.3
154	0.34
155	0.33
156	0.34
157	0.38
158	0.34
159	0.38
160	0.46
161	0.44
162	0.43
163	0.42
164	0.43
165	0.41
166	0.38
167	0.33
168	0.25
169	0.24
170	0.19
171	0.18
172	0.13
173	0.08
174	0.08
175	0.1
176	0.1
177	0.09
178	0.09
179	0.08
180	0.08
181	0.08
182	0.08
183	0.06
184	0.1
185	0.12
186	0.14
187	0.17
188	0.17
189	0.18
190	0.19
191	0.21
192	0.24
193	0.28
194	0.29
195	0.28
196	0.3
197	0.31
198	0.31
199	0.34
200	0.31
201	0.3
202	0.27
203	0.27
204	0.24
205	0.23
206	0.21
207	0.16
208	0.13
209	0.1
210	0.1
211	0.09
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.08
216	0.06
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.05
224	0.05
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.07
229	0.12
230	0.19
231	0.2
232	0.23
233	0.23
234	0.24
235	0.29
236	0.31
237	0.28
238	0.3
239	0.33
240	0.37
241	0.41
242	0.44
243	0.39
244	0.4
245	0.38
246	0.31
247	0.29
248	0.25
249	0.22
250	0.18
251	0.17
252	0.15
253	0.15
254	0.14
255	0.14
256	0.13
257	0.11
258	0.12
259	0.12
260	0.13
261	0.13
262	0.14
263	0.2
264	0.2
265	0.2
266	0.2
267	0.2
268	0.19
269	0.19
270	0.18
271	0.13
272	0.12
273	0.14
274	0.14
275	0.15
276	0.14
277	0.14
278	0.14
279	0.13
280	0.15
281	0.15
282	0.14
283	0.12
284	0.13
285	0.14
286	0.14
287	0.13
288	0.12
289	0.1
290	0.11
291	0.12
292	0.12
293	0.13
294	0.14
295	0.17
296	0.17
297	0.17
298	0.17
299	0.17
300	0.15
301	0.14
302	0.14
303	0.11
304	0.12
305	0.1
306	0.09
307	0.08
308	0.08
309	0.07
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.06
314	0.07
315	0.1
316	0.14
317	0.19
318	0.23
319	0.28
320	0.3
321	0.38
322	0.41
323	0.42
324	0.41
325	0.37
326	0.36
327	0.32
328	0.33
329	0.27
330	0.24
331	0.21
332	0.19
333	0.17
334	0.16
335	0.16
336	0.14
337	0.12
338	0.11
339	0.1
340	0.1
341	0.1
342	0.1
343	0.08
344	0.05
345	0.05
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.05
352	0.05
353	0.07
354	0.07
355	0.08
356	0.11
357	0.17
358	0.17
359	0.21
360	0.22
361	0.22
362	0.26
363	0.3
364	0.35
365	0.37
366	0.42
367	0.42
368	0.47
369	0.46
370	0.42
371	0.39
372	0.33
373	0.26
374	0.23
375	0.2
376	0.16
377	0.15
378	0.15
379	0.13
380	0.14
381	0.14
382	0.13
383	0.13
384	0.15
385	0.18
386	0.22
387	0.23
388	0.22
389	0.29
390	0.28
391	0.28
392	0.27
393	0.24
394	0.2
395	0.23
396	0.23
397	0.14
398	0.13
399	0.13
400	0.16
401	0.22
402	0.26
403	0.27
404	0.3
405	0.32
406	0.33
407	0.36
408	0.32
409	0.29
410	0.34
411	0.33
412	0.34
413	0.32
414	0.31
415	0.29
416	0.29
417	0.27
418	0.19
419	0.15
420	0.1
421	0.12
422	0.2
423	0.25
424	0.27
425	0.33
426	0.36
427	0.4
428	0.4
429	0.41
430	0.33
431	0.3
432	0.27
433	0.2
434	0.19
435	0.16
436	0.17
437	0.17
438	0.17
439	0.17
440	0.22
441	0.3
442	0.33
443	0.43
444	0.51
445	0.58
446	0.65
447	0.7
448	0.68
449	0.65
450	0.6
451	0.54
452	0.5
453	0.44
454	0.38
455	0.3
456	0.28
457	0.22
458	0.21
459	0.17
460	0.12
461	0.08
462	0.07
463	0.09
464	0.09
465	0.1
466	0.11
467	0.12
468	0.12
469	0.16
470	0.15
471	0.15
472	0.16
473	0.2
474	0.22
475	0.24
476	0.24
477	0.2
478	0.2
479	0.19
480	0.19
481	0.15
482	0.12
483	0.09
484	0.09
485	0.09
486	0.08
487	0.07
488	0.06
489	0.06
490	0.04
491	0.05
492	0.05
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.05
497	0.05
498	0.06
499	0.05
500	0.06
501	0.06
502	0.08
503	0.1
504	0.1
505	0.1
506	0.11
507	0.13
508	0.17
509	0.2
510	0.21
511	0.2
512	0.2
513	0.2
514	0.18
515	0.17
516	0.13
517	0.12
518	0.11
519	0.11
520	0.11
521	0.14
522	0.14
523	0.14
524	0.16
525	0.16
526	0.15
527	0.17
528	0.18
529	0.15
530	0.17
531	0.15
532	0.16
533	0.14
534	0.16
535	0.16
536	0.14
537	0.13
538	0.13
539	0.12
540	0.11
541	0.1
542	0.07
543	0.06
544	0.07
545	0.07
546	0.05
547	0.06
548	0.07
549	0.06
550	0.07
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.07
555	0.07
556	0.06
557	0.08
558	0.08
559	0.08
560	0.09
561	0.11
562	0.12
563	0.12
564	0.13
565	0.12
566	0.13
567	0.13
568	0.12
569	0.11
570	0.1
571	0.08
572	0.06
573	0.06
574	0.05
575	0.07
576	0.07
577	0.08
578	0.09
579	0.09
580	0.11
581	0.12
582	0.14
583	0.14
584	0.13
585	0.12
586	0.11
587	0.13
588	0.12
589	0.11
590	0.1
591	0.07
592	0.07
593	0.06
594	0.06
595	0.05
596	0.05
597	0.08
598	0.1
599	0.11
600	0.12
601	0.12
602	0.13
603	0.14
604	0.13
605	0.09
606	0.08
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.06
611	0.05
612	0.05
613	0.08
614	0.08
615	0.07
616	0.08
617	0.08
618	0.09
619	0.12
620	0.14
621	0.17
622	0.19
623	0.2
624	0.22
625	0.27
626	0.26
627	0.23
628	0.23
629	0.18
630	0.16
631	0.16
632	0.14
633	0.09
634	0.09
635	0.09
636	0.06
637	0.06
638	0.06
639	0.05
640	0.06
641	0.06
642	0.09
643	0.09
644	0.1
645	0.12
646	0.17
647	0.24
648	0.26
649	0.29
650	0.29
651	0.31
652	0.35
653	0.35
654	0.31
655	0.26
656	0.27
657	0.27
658	0.27
659	0.25
660	0.21
661	0.19
662	0.19
663	0.17
664	0.12
665	0.11
666	0.09
667	0.1
668	0.1
669	0.09
670	0.08
671	0.08
672	0.09
673	0.08
674	0.1
675	0.08
676	0.09
677	0.1
678	0.1
679	0.15
680	0.21
681	0.26
682	0.3
683	0.34
684	0.41
685	0.48
686	0.56
687	0.58
688	0.59
689	0.61
690	0.64
691	0.67
692	0.65
693	0.58
694	0.52
695	0.46
696	0.39
697	0.31
698	0.22
699	0.15
700	0.1
701	0.09
702	0.08
703	0.07
704	0.07
705	0.07
706	0.08
707	0.1
708	0.1
709	0.12
710	0.12
711	0.12
712	0.12
713	0.12
714	0.11
715	0.1
716	0.13
717	0.12
718	0.11
719	0.11
720	0.11
721	0.12
722	0.14
723	0.13
724	0.1
725	0.11
726	0.12
727	0.11
728	0.11
729	0.1
730	0.07
731	0.07
732	0.07
733	0.05
734	0.05
735	0.04
736	0.04
737	0.04
738	0.04
739	0.04
740	0.03
741	0.03
742	0.04
743	0.04
744	0.05
745	0.06
746	0.07
747	0.09
748	0.1
749	0.11
750	0.12
751	0.13
752	0.2
753	0.21
754	0.23
755	0.27
756	0.27
757	0.36
758	0.42
759	0.46
760	0.47
761	0.52
762	0.57
763	0.58
764	0.59
765	0.53
766	0.5
767	0.53
768	0.49
769	0.49
770	0.42
771	0.36
772	0.35
773	0.33
774	0.31
775	0.25
776	0.21
777	0.15
778	0.14
779	0.14
780	0.13
781	0.11
782	0.09
783	0.07
784	0.06
785	0.05
786	0.04
787	0.04
788	0.04
789	0.05
790	0.06
791	0.06
792	0.06
793	0.07
794	0.07
795	0.07
796	0.07
797	0.08
798	0.08
799	0.1
800	0.11
801	0.1
802	0.1
803	0.11
804	0.13
805	0.11
806	0.11
807	0.12
808	0.12
809	0.16
810	0.16
811	0.16
812	0.15
813	0.17
814	0.17
815	0.14
816	0.14
817	0.12
818	0.17
819	0.17
820	0.16
821	0.15
822	0.15
823	0.16
824	0.15
825	0.16
826	0.12
827	0.12
828	0.11
829	0.11
830	0.1
831	0.09
832	0.08
833	0.08
834	0.07
835	0.08
836	0.09
837	0.11
838	0.13
839	0.13
840	0.15
841	0.14
842	0.17
843	0.19
844	0.21
845	0.19
846	0.2
847	0.21
848	0.24
849	0.24
850	0.2
851	0.19
852	0.21
853	0.28
854	0.29
855	0.35
856	0.35
857	0.36
858	0.39
859	0.44
860	0.5
861	0.49
862	0.53
863	0.52
864	0.51
865	0.5
866	0.46
867	0.38
868	0.3
869	0.25
870	0.19
871	0.12
872	0.1
873	0.1
874	0.1
875	0.1
876	0.09
877	0.08
878	0.09
879	0.12
880	0.13
881	0.15
882	0.15
883	0.17
884	0.19
885	0.24
886	0.31
887	0.36
888	0.38
889	0.37
890	0.43
891	0.49
892	0.55
893	0.58
894	0.56
895	0.57
896	0.56
897	0.59
898	0.57
899	0.55
900	0.51
901	0.47
902	0.42
903	0.35
904	0.31
905	0.26
906	0.24
907	0.19
908	0.13
909	0.09
910	0.1
911	0.1
912	0.13
913	0.15
914	0.16
915	0.19
916	0.2
917	0.2
918	0.19
919	0.22
920	0.2
921	0.2
922	0.2
923	0.15
924	0.16
925	0.16
926	0.16
927	0.13
928	0.12
929	0.11
930	0.1
931	0.11
932	0.11
933	0.1
934	0.08
935	0.1
936	0.1
937	0.1
938	0.1
939	0.09
940	0.09
941	0.09
942	0.12
943	0.1
944	0.15
945	0.19
946	0.21
947	0.21
948	0.21
949	0.22
950	0.24
951	0.28
952	0.28
953	0.27
954	0.27
955	0.28
956	0.29
957	0.28
958	0.25
959	0.22
960	0.19
961	0.15
962	0.13
963	0.13
964	0.12
965	0.13
966	0.13
967	0.11
968	0.1
969	0.1
970	0.1
971	0.1
972	0.13
973	0.12
974	0.12
975	0.15
976	0.19
977	0.2
978	0.26
979	0.32
980	0.36
981	0.45
982	0.53
983	0.6
984	0.64
985	0.72
986	0.75
987	0.78
988	0.81
989	0.77
990	0.79
991	0.76
992	0.72
993	0.67
994	0.63
995	0.58
996	0.53
997	0.51
998	0.46
999	0.45
1000	0.47
1001	0.52
1002	0.47
1003	0.44
1004	0.43
1005	0.45
1006	0.47
1007	0.47
1008	0.48
1009	0.4
1010	0.46
1011	0.47
1012	0.48
1013	0.48

S3C6N1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer