Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3BYG4

Protein Details
Accession S3BYG4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-41LAERQDRLAKQQKQNRRRGPGNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR006590  RNA_pol_Rpb4/RPC9_core  
IPR005574  Rpb4/RPC9  
IPR038324  Rpb4/RPC9_sf  
IPR038846  RPC9  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0006384  P:transcription initiation at RNA polymerase III promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF03874  RNA_pol_Rpb4  
Amino Acid Sequences MKILEAQNALLSNYEVYEFLAERQDRLAKQQKQNRRRGPGNLETLIREYFRSPPGPLSEQPVKYSADAVTSLVERLSSYDLAKGELIMILNMRPATPAQLHACIEEVESRLSEEQHSEILDIVADVLGHPPAQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.08
3 0.08
4 0.09
5 0.09
6 0.1
7 0.17
8 0.17
9 0.17
10 0.2
11 0.24
12 0.23
13 0.32
14 0.41
15 0.42
16 0.51
17 0.6
18 0.67
19 0.73
20 0.83
21 0.83
22 0.82
23 0.79
24 0.78
25 0.77
26 0.74
27 0.71
28 0.63
29 0.54
30 0.46
31 0.42
32 0.36
33 0.28
34 0.2
35 0.15
36 0.16
37 0.17
38 0.18
39 0.17
40 0.18
41 0.22
42 0.25
43 0.24
44 0.28
45 0.31
46 0.3
47 0.3
48 0.29
49 0.26
50 0.23
51 0.23
52 0.17
53 0.11
54 0.1
55 0.1
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.05
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.06
75 0.06
76 0.05
77 0.07
78 0.07
79 0.06
80 0.07
81 0.07
82 0.1
83 0.1
84 0.14
85 0.16
86 0.2
87 0.2
88 0.2
89 0.21
90 0.18
91 0.18
92 0.16
93 0.14
94 0.12
95 0.11
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.13
101 0.13
102 0.14
103 0.14
104 0.13
105 0.12
106 0.11
107 0.1
108 0.08
109 0.07
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.06