Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3BZM3

Protein Details
Accession S3BZM3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-42DSEDGHKTTRQKSSKKNNTGAPPPLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:1990838  F:poly(U)-specific exoribonuclease activity, producing 3' uridine cyclic phosphate ends  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MALVDYSSEGSGSDSGLDSEDGHKTTRQKSSKKNNTGAPPPLPRAFHDLYAATVRTAPVDHPSLHNGRQRAIPHVAGQWPSHLYIEWHPSKLEYERLSELVLALRGRLDGAAADLHSFLTSDLGVPLPLHISFSRPFVLQTAGKADFLRQLTAKIKSASVGPFSVVFSDLFWYCGPDSARAFLVLRAQVEGSPGSASSSSSTHNGSLVTLLDRCNAQVTAAGQPALYSGDASSTARSFHVSIAWTLADIEAWREPTSEVYERWRNSMDASEDDEGKERLRIDVESIKAKIGNVVTDIPLGKTASSTLRPGTKRSRGESHDGGDNTTNGSNKSVKSNDTRRKGKSLFGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.12
7 0.16
8 0.16
9 0.17
10 0.21
11 0.26
12 0.34
13 0.43
14 0.49
15 0.55
16 0.65
17 0.74
18 0.81
19 0.85
20 0.85
21 0.83
22 0.82
23 0.82
24 0.78
25 0.74
26 0.7
27 0.66
28 0.63
29 0.57
30 0.51
31 0.5
32 0.45
33 0.39
34 0.35
35 0.3
36 0.27
37 0.29
38 0.27
39 0.2
40 0.19
41 0.17
42 0.15
43 0.15
44 0.13
45 0.14
46 0.17
47 0.17
48 0.19
49 0.25
50 0.29
51 0.34
52 0.38
53 0.35
54 0.34
55 0.39
56 0.38
57 0.38
58 0.38
59 0.33
60 0.31
61 0.33
62 0.35
63 0.32
64 0.3
65 0.27
66 0.24
67 0.23
68 0.21
69 0.17
70 0.16
71 0.18
72 0.26
73 0.26
74 0.26
75 0.25
76 0.25
77 0.28
78 0.28
79 0.3
80 0.23
81 0.24
82 0.25
83 0.25
84 0.25
85 0.22
86 0.2
87 0.15
88 0.15
89 0.11
90 0.09
91 0.09
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.06
96 0.04
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.06
116 0.08
117 0.07
118 0.1
119 0.11
120 0.13
121 0.14
122 0.13
123 0.14
124 0.13
125 0.16
126 0.14
127 0.14
128 0.17
129 0.17
130 0.17
131 0.17
132 0.16
133 0.18
134 0.18
135 0.18
136 0.13
137 0.16
138 0.19
139 0.22
140 0.24
141 0.2
142 0.19
143 0.18
144 0.2
145 0.18
146 0.16
147 0.14
148 0.12
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.09
153 0.08
154 0.06
155 0.08
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.08
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.13
169 0.11
170 0.13
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.08
187 0.1
188 0.11
189 0.1
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.12
207 0.13
208 0.13
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.09
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.13
230 0.12
231 0.11
232 0.1
233 0.09
234 0.07
235 0.06
236 0.08
237 0.08
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.12
243 0.18
244 0.19
245 0.19
246 0.25
247 0.32
248 0.32
249 0.35
250 0.35
251 0.3
252 0.29
253 0.32
254 0.28
255 0.23
256 0.26
257 0.25
258 0.24
259 0.24
260 0.25
261 0.21
262 0.18
263 0.18
264 0.14
265 0.14
266 0.15
267 0.15
268 0.18
269 0.23
270 0.26
271 0.28
272 0.29
273 0.28
274 0.28
275 0.27
276 0.26
277 0.21
278 0.19
279 0.16
280 0.17
281 0.16
282 0.18
283 0.18
284 0.15
285 0.16
286 0.15
287 0.13
288 0.11
289 0.13
290 0.16
291 0.18
292 0.2
293 0.22
294 0.3
295 0.32
296 0.39
297 0.47
298 0.51
299 0.56
300 0.6
301 0.65
302 0.62
303 0.68
304 0.67
305 0.6
306 0.59
307 0.53
308 0.49
309 0.42
310 0.37
311 0.31
312 0.28
313 0.26
314 0.19
315 0.23
316 0.24
317 0.23
318 0.31
319 0.32
320 0.35
321 0.43
322 0.53
323 0.6
324 0.66
325 0.73
326 0.71
327 0.78
328 0.74