FuNGI

S3CQH1

Protein Details

Accession

S3CQH1

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
69-91	GEGVSKPAAKRARKNRNVIEEDE	Hydrophilic
167-186	AKTTKKPKATAKARKAIQKL	Hydrophilic
562-581	GYEPSKRSRNWLKIKKDYLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
78-80	KRA
126-132	KRAASPK
171-181	KKPKATAKARK

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, mito 9, cyto_nucl 8, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000977 DNA_ligase_ATP-dep IPR012309 DNA_ligase_ATP-dep_C IPR012310 DNA_ligase_ATP-dep_cent IPR016059 DNA_ligase_ATP-dep_CS IPR012308 DNA_ligase_ATP-dep_N IPR036599 DNA_ligase_N_sf IPR012340 NA-bd_OB-fold
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0003677 F:DNA binding GO:0003910 F:DNA ligase (ATP) activity GO:0071897 P:DNA biosynthetic process GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0006260 P:DNA replication
Pfam	View protein in Pfam PF04679 DNA_ligase_A_C PF01068 DNA_ligase_A_M PF04675 DNA_ligase_A_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00333 DNA_LIGASE_A2 PS50160 DNA_LIGASE_A3
CDD	cd07900 Adenylation_DNA_ligase_I_Euk cd07969 OBF_DNA_ligase_I

Amino Acid Sequences

MAPPSKQSTLGKFFGAPGNARPAPQQQTKLSFATKSNGSSSSKENVAPEKDKKKRSSDDEAEIKDESDGEGVSKPAAKRARKNRNVIEEDEDETDSSPAPAIKKETAVAKPKDTAMAEAPAPPSPKRAASPKKAAIKTEEDDDKAETSAAESSSETDDSDEDIDEEAKTTKKPKATAKARKAIQKLLSTPTTDAYPDWKAGEPVPYEALCRTFSLIELTTKRLIIMEYCSLFLRQVLRLTPGDLLPTVLLMINRLAPDYAGIELGIGESLIMKAIGETTGRSLAVIKQDQKEIGDLGLVAVKSRSTQPTMFKPKPLTIQGVHKGLMGIATVSGNGAQQRKVDGIKKLLSSADAQGSQGRVDISKDKGGPSEAKFLVRFLEGKLRLGLAEKTVLVSLAQAIIQHEARIAGKPATPADVEKAEAMLKTYPDILAKLHTWVKPETKSFVLDCETVAWDVDERKVLPFQQLMTRKRKDVKIEDVKVKVCVFAFDLLYLNGAAIVEKPLRSRRDLLSEAFFPVEGEFAFATHMDGQELESIQTFLDESMKASCEGLMVKMLDGAESGYEPSKRSRNWLKIKKDYLSGVGDSLDLVVLGAYFGKGKRTSVYGAFLLACRNAQNDTYETICNIGTGFSEAVLDELHEQLGKTVIDRAKPFYAHSAGGQHQPDVWFEPRYVWEVRTADLTLSPRYKAGNHEGVDNSGEQRGISLRFPRFIRIRDDKKPDEATTSRQVAEMYRKQESVTKSKGPAVDDDYEY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.39
3	0.32
4	0.29
5	0.36
6	0.35
7	0.34
8	0.36
9	0.37
10	0.42
11	0.47
12	0.51
13	0.49
14	0.54
15	0.58
16	0.58
17	0.54
18	0.49
19	0.45
20	0.44
21	0.41
22	0.37
23	0.36
24	0.37
25	0.37
26	0.36
27	0.38
28	0.37
29	0.36
30	0.36
31	0.36
32	0.39
33	0.42
34	0.47
35	0.52
36	0.58
37	0.64
38	0.71
39	0.74
40	0.76
41	0.78
42	0.79
43	0.8
44	0.77
45	0.77
46	0.77
47	0.72
48	0.65
49	0.56
50	0.49
51	0.38
52	0.3
53	0.21
54	0.13
55	0.1
56	0.09
57	0.1
58	0.1
59	0.11
60	0.15
61	0.15
62	0.22
63	0.31
64	0.37
65	0.46
66	0.57
67	0.67
68	0.72
69	0.82
70	0.83
71	0.85
72	0.82
73	0.76
74	0.72
75	0.63
76	0.57
77	0.49
78	0.4
79	0.3
80	0.26
81	0.22
82	0.16
83	0.13
84	0.11
85	0.11
86	0.12
87	0.14
88	0.18
89	0.2
90	0.22
91	0.24
92	0.3
93	0.35
94	0.43
95	0.45
96	0.44
97	0.44
98	0.44
99	0.46
100	0.4
101	0.35
102	0.28
103	0.27
104	0.24
105	0.24
106	0.25
107	0.23
108	0.25
109	0.23
110	0.24
111	0.24
112	0.26
113	0.28
114	0.37
115	0.44
116	0.5
117	0.6
118	0.64
119	0.71
120	0.71
121	0.69
122	0.64
123	0.61
124	0.54
125	0.51
126	0.47
127	0.38
128	0.36
129	0.35
130	0.31
131	0.24
132	0.22
133	0.14
134	0.11
135	0.12
136	0.11
137	0.1
138	0.09
139	0.11
140	0.13
141	0.13
142	0.12
143	0.11
144	0.11
145	0.11
146	0.12
147	0.1
148	0.08
149	0.09
150	0.09
151	0.08
152	0.09
153	0.1
154	0.1
155	0.13
156	0.17
157	0.21
158	0.25
159	0.32
160	0.4
161	0.49
162	0.59
163	0.68
164	0.73
165	0.78
166	0.78
167	0.8
168	0.75
169	0.71
170	0.67
171	0.62
172	0.55
173	0.52
174	0.49
175	0.43
176	0.39
177	0.33
178	0.27
179	0.22
180	0.19
181	0.17
182	0.17
183	0.16
184	0.17
185	0.17
186	0.17
187	0.18
188	0.22
189	0.19
190	0.19
191	0.2
192	0.18
193	0.19
194	0.18
195	0.19
196	0.15
197	0.15
198	0.15
199	0.12
200	0.12
201	0.15
202	0.15
203	0.18
204	0.19
205	0.22
206	0.22
207	0.21
208	0.21
209	0.18
210	0.17
211	0.13
212	0.15
213	0.16
214	0.15
215	0.16
216	0.17
217	0.16
218	0.16
219	0.16
220	0.15
221	0.13
222	0.15
223	0.15
224	0.18
225	0.18
226	0.19
227	0.19
228	0.17
229	0.16
230	0.13
231	0.13
232	0.09
233	0.08
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.06
238	0.07
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.06
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.04
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.03
262	0.04
263	0.04
264	0.05
265	0.06
266	0.07
267	0.07
268	0.08
269	0.08
270	0.1
271	0.16
272	0.2
273	0.23
274	0.23
275	0.25
276	0.26
277	0.25
278	0.24
279	0.18
280	0.14
281	0.1
282	0.08
283	0.06
284	0.08
285	0.07
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.07
290	0.09
291	0.11
292	0.13
293	0.16
294	0.21
295	0.31
296	0.41
297	0.41
298	0.43
299	0.44
300	0.44
301	0.46
302	0.44
303	0.39
304	0.31
305	0.38
306	0.38
307	0.37
308	0.34
309	0.29
310	0.26
311	0.22
312	0.19
313	0.11
314	0.06
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.07
322	0.08
323	0.09
324	0.1
325	0.11
326	0.13
327	0.16
328	0.19
329	0.19
330	0.23
331	0.25
332	0.25
333	0.25
334	0.23
335	0.21
336	0.19
337	0.17
338	0.15
339	0.12
340	0.12
341	0.12
342	0.12
343	0.11
344	0.1
345	0.09
346	0.07
347	0.08
348	0.11
349	0.12
350	0.15
351	0.16
352	0.15
353	0.16
354	0.17
355	0.2
356	0.19
357	0.24
358	0.21
359	0.22
360	0.22
361	0.21
362	0.21
363	0.17
364	0.16
365	0.1
366	0.18
367	0.16
368	0.17
369	0.17
370	0.16
371	0.15
372	0.16
373	0.16
374	0.08
375	0.09
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.07
380	0.06
381	0.05
382	0.05
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.05
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.07
393	0.08
394	0.09
395	0.08
396	0.09
397	0.1
398	0.11
399	0.11
400	0.11
401	0.11
402	0.12
403	0.12
404	0.11
405	0.1
406	0.1
407	0.09
408	0.09
409	0.1
410	0.08
411	0.08
412	0.08
413	0.08
414	0.08
415	0.08
416	0.09
417	0.08
418	0.09
419	0.09
420	0.12
421	0.17
422	0.17
423	0.19
424	0.22
425	0.26
426	0.27
427	0.28
428	0.28
429	0.25
430	0.26
431	0.24
432	0.23
433	0.21
434	0.18
435	0.16
436	0.14
437	0.14
438	0.11
439	0.11
440	0.09
441	0.07
442	0.08
443	0.09
444	0.09
445	0.09
446	0.1
447	0.11
448	0.12
449	0.13
450	0.14
451	0.14
452	0.21
453	0.29
454	0.35
455	0.42
456	0.45
457	0.47
458	0.53
459	0.56
460	0.56
461	0.55
462	0.59
463	0.6
464	0.64
465	0.65
466	0.62
467	0.58
468	0.53
469	0.46
470	0.37
471	0.26
472	0.2
473	0.15
474	0.14
475	0.13
476	0.11
477	0.11
478	0.1
479	0.1
480	0.09
481	0.07
482	0.05
483	0.05
484	0.04
485	0.04
486	0.07
487	0.07
488	0.08
489	0.12
490	0.18
491	0.21
492	0.24
493	0.28
494	0.29
495	0.35
496	0.37
497	0.37
498	0.35
499	0.33
500	0.31
501	0.27
502	0.24
503	0.16
504	0.14
505	0.11
506	0.07
507	0.07
508	0.06
509	0.06
510	0.06
511	0.06
512	0.07
513	0.08
514	0.08
515	0.07
516	0.07
517	0.08
518	0.09
519	0.09
520	0.08
521	0.08
522	0.08
523	0.07
524	0.07
525	0.07
526	0.05
527	0.07
528	0.07
529	0.07
530	0.09
531	0.1
532	0.1
533	0.1
534	0.1
535	0.09
536	0.1
537	0.09
538	0.1
539	0.1
540	0.09
541	0.1
542	0.1
543	0.09
544	0.09
545	0.08
546	0.06
547	0.06
548	0.07
549	0.08
550	0.09
551	0.11
552	0.16
553	0.22
554	0.22
555	0.31
556	0.4
557	0.48
558	0.58
559	0.67
560	0.72
561	0.75
562	0.82
563	0.76
564	0.71
565	0.62
566	0.56
567	0.49
568	0.4
569	0.31
570	0.24
571	0.21
572	0.16
573	0.14
574	0.09
575	0.05
576	0.04
577	0.03
578	0.03
579	0.03
580	0.03
581	0.03
582	0.05
583	0.06
584	0.11
585	0.12
586	0.13
587	0.16
588	0.19
589	0.22
590	0.23
591	0.27
592	0.22
593	0.23
594	0.23
595	0.22
596	0.2
597	0.17
598	0.15
599	0.12
600	0.13
601	0.13
602	0.13
603	0.15
604	0.16
605	0.18
606	0.19
607	0.19
608	0.18
609	0.18
610	0.16
611	0.13
612	0.12
613	0.09
614	0.07
615	0.09
616	0.09
617	0.07
618	0.08
619	0.07
620	0.08
621	0.07
622	0.08
623	0.07
624	0.07
625	0.07
626	0.08
627	0.08
628	0.08
629	0.11
630	0.1
631	0.1
632	0.17
633	0.19
634	0.24
635	0.26
636	0.31
637	0.33
638	0.34
639	0.35
640	0.34
641	0.34
642	0.3
643	0.3
644	0.31
645	0.29
646	0.35
647	0.34
648	0.28
649	0.27
650	0.27
651	0.27
652	0.26
653	0.26
654	0.21
655	0.2
656	0.23
657	0.23
658	0.26
659	0.27
660	0.23
661	0.27
662	0.27
663	0.27
664	0.27
665	0.25
666	0.22
667	0.24
668	0.26
669	0.25
670	0.27
671	0.27
672	0.25
673	0.26
674	0.28
675	0.3
676	0.36
677	0.38
678	0.36
679	0.41
680	0.41
681	0.41
682	0.4
683	0.35
684	0.28
685	0.21
686	0.2
687	0.14
688	0.14
689	0.15
690	0.16
691	0.2
692	0.26
693	0.28
694	0.34
695	0.36
696	0.43
697	0.47
698	0.48
699	0.53
700	0.56
701	0.61
702	0.65
703	0.73
704	0.7
705	0.71
706	0.74
707	0.66
708	0.63
709	0.58
710	0.55
711	0.54
712	0.53
713	0.46
714	0.4
715	0.39
716	0.36
717	0.43
718	0.43
719	0.4
720	0.4
721	0.4
722	0.41
723	0.46
724	0.48
725	0.47
726	0.47
727	0.49
728	0.48
729	0.53
730	0.55
731	0.52
732	0.5
733	0.47

S3CQH1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer