Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CHP4

Protein Details
Accession S3CHP4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-267ADAKKKAQADEKEKKRKQKEEEDQRKADEKEKKRREKEDEERKVQEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
154-274PAKRKKLTPAEREEKAKADLARKQEKEKAEAAKKLEKEKAEAARKLEKEKKEKAEAAKKQERDEQKALADAKKKAQADEKEKKRKQKEEEDQRKADEKEKKRREKEDEERKVQEAKNKKER
645-657AKAAKAAKAAKAA
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 11.333, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022043  CAF1A  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF12253  CAF1A  
Amino Acid Sequences MPLLAMSPNVQDGGGAETPSRKRTLQDFLSAGKQSKLPNKPATPSKLRLVTDADDMVIDAKENTAAHTTDLPPDSPPDSPLSDISDMSDRPMSLMTDAGSNSSMPATPGKPGSDAGLPQLVITIDGTPPAGSKLLSTTTTSTTSSPSSTNGQPPAKRKKLTPAEREEKAKADLARKQEKEKAEAAKKLEKEKAEAARKLEKEKKEKAEAAKKQERDEQKALADAKKKAQADEKEKKRKQKEEEDQRKADEKEKKRREKEDEERKVQEAKNKKERSQLRLNSFFKTGNTSASASATSTTSTTPSTSNSAATSTSASGLLLTSPHKNASPSPVKTSVSPQKGASAAVEGSASDAATTAAAVAEVSEYDRIFKPFFIKENVIMATHLYGMDDETKEAKSRILDEHLSGARGDFAPRKPFSSASAVDYFHLPCDKQQRPLPRGQSAATRPSVRKIMNAMHDSGHGAGSSNAQTKMALDLLKKVSMKYLFFREDVRPAYLGTITSQPPQARMSKLARNPLIKTVLPLNYDYDSEAEWVDDGDGEDVDDLDDDEEDMNDDDGEMSDFLDDSEEGGMPLRPAFSGGMEPDSTGICWENLESSSRRGALPRPELSNFRMEFILDHSGPIDPLSTKYWDEPEPVEAVESKAAPAKAAKAAKAAKAAKAASQPPATPADAFAALNGSVAAGTNPTTPTTTTPAPAPPADPKKAGVAAEFVPDLKKGILQYAKMTKLGIVEILSVEFVGKCTKAQIKNSIDALAERTGTGQHKTWKLKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.15
4 0.22
5 0.26
6 0.3
7 0.33
8 0.28
9 0.31
10 0.36
11 0.45
12 0.43
13 0.47
14 0.47
15 0.47
16 0.52
17 0.51
18 0.47
19 0.4
20 0.38
21 0.37
22 0.44
23 0.48
24 0.5
25 0.57
26 0.6
27 0.66
28 0.72
29 0.74
30 0.73
31 0.7
32 0.69
33 0.67
34 0.62
35 0.58
36 0.54
37 0.47
38 0.43
39 0.38
40 0.3
41 0.22
42 0.21
43 0.19
44 0.13
45 0.11
46 0.07
47 0.07
48 0.09
49 0.09
50 0.11
51 0.13
52 0.13
53 0.15
54 0.19
55 0.2
56 0.24
57 0.26
58 0.25
59 0.23
60 0.26
61 0.26
62 0.23
63 0.23
64 0.21
65 0.21
66 0.22
67 0.23
68 0.25
69 0.24
70 0.23
71 0.23
72 0.24
73 0.22
74 0.23
75 0.23
76 0.18
77 0.17
78 0.19
79 0.17
80 0.13
81 0.15
82 0.12
83 0.12
84 0.13
85 0.13
86 0.12
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.09
92 0.13
93 0.13
94 0.16
95 0.19
96 0.2
97 0.2
98 0.21
99 0.22
100 0.21
101 0.21
102 0.2
103 0.2
104 0.19
105 0.17
106 0.18
107 0.15
108 0.12
109 0.12
110 0.1
111 0.07
112 0.08
113 0.09
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.11
121 0.13
122 0.15
123 0.17
124 0.18
125 0.2
126 0.22
127 0.23
128 0.21
129 0.21
130 0.21
131 0.2
132 0.19
133 0.18
134 0.21
135 0.24
136 0.29
137 0.34
138 0.4
139 0.44
140 0.52
141 0.6
142 0.64
143 0.63
144 0.6
145 0.63
146 0.67
147 0.72
148 0.72
149 0.72
150 0.71
151 0.73
152 0.76
153 0.67
154 0.59
155 0.52
156 0.47
157 0.4
158 0.39
159 0.39
160 0.42
161 0.5
162 0.5
163 0.53
164 0.55
165 0.54
166 0.52
167 0.53
168 0.54
169 0.51
170 0.53
171 0.53
172 0.54
173 0.54
174 0.56
175 0.55
176 0.47
177 0.44
178 0.46
179 0.5
180 0.51
181 0.51
182 0.49
183 0.53
184 0.54
185 0.59
186 0.59
187 0.58
188 0.59
189 0.64
190 0.67
191 0.65
192 0.69
193 0.7
194 0.72
195 0.71
196 0.73
197 0.73
198 0.68
199 0.64
200 0.66
201 0.64
202 0.61
203 0.57
204 0.5
205 0.43
206 0.45
207 0.45
208 0.42
209 0.41
210 0.35
211 0.36
212 0.39
213 0.39
214 0.36
215 0.41
216 0.45
217 0.49
218 0.57
219 0.63
220 0.68
221 0.73
222 0.8
223 0.81
224 0.82
225 0.8
226 0.81
227 0.81
228 0.82
229 0.87
230 0.86
231 0.79
232 0.74
233 0.71
234 0.62
235 0.59
236 0.57
237 0.56
238 0.58
239 0.66
240 0.73
241 0.75
242 0.82
243 0.83
244 0.84
245 0.85
246 0.85
247 0.84
248 0.8
249 0.75
250 0.69
251 0.66
252 0.57
253 0.54
254 0.53
255 0.52
256 0.56
257 0.59
258 0.6
259 0.62
260 0.67
261 0.67
262 0.68
263 0.67
264 0.64
265 0.69
266 0.68
267 0.61
268 0.56
269 0.49
270 0.39
271 0.37
272 0.29
273 0.21
274 0.21
275 0.2
276 0.18
277 0.18
278 0.18
279 0.12
280 0.12
281 0.1
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.11
290 0.13
291 0.13
292 0.14
293 0.13
294 0.13
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.08
308 0.09
309 0.1
310 0.11
311 0.12
312 0.13
313 0.2
314 0.27
315 0.27
316 0.31
317 0.34
318 0.34
319 0.34
320 0.41
321 0.41
322 0.37
323 0.37
324 0.32
325 0.31
326 0.3
327 0.3
328 0.22
329 0.15
330 0.11
331 0.09
332 0.09
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.02
347 0.02
348 0.02
349 0.03
350 0.04
351 0.04
352 0.06
353 0.07
354 0.09
355 0.09
356 0.1
357 0.13
358 0.15
359 0.17
360 0.19
361 0.2
362 0.19
363 0.21
364 0.21
365 0.18
366 0.16
367 0.14
368 0.1
369 0.09
370 0.08
371 0.05
372 0.04
373 0.05
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.08
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.09
383 0.11
384 0.13
385 0.15
386 0.15
387 0.15
388 0.19
389 0.18
390 0.18
391 0.15
392 0.13
393 0.11
394 0.1
395 0.11
396 0.11
397 0.14
398 0.2
399 0.21
400 0.23
401 0.23
402 0.24
403 0.25
404 0.27
405 0.25
406 0.22
407 0.25
408 0.23
409 0.22
410 0.23
411 0.2
412 0.15
413 0.15
414 0.11
415 0.11
416 0.2
417 0.22
418 0.26
419 0.31
420 0.4
421 0.43
422 0.5
423 0.52
424 0.47
425 0.47
426 0.42
427 0.44
428 0.38
429 0.39
430 0.35
431 0.33
432 0.3
433 0.31
434 0.36
435 0.29
436 0.28
437 0.26
438 0.28
439 0.31
440 0.32
441 0.3
442 0.25
443 0.25
444 0.24
445 0.21
446 0.16
447 0.09
448 0.08
449 0.07
450 0.08
451 0.1
452 0.12
453 0.12
454 0.11
455 0.12
456 0.11
457 0.12
458 0.13
459 0.12
460 0.1
461 0.15
462 0.16
463 0.2
464 0.2
465 0.19
466 0.21
467 0.22
468 0.24
469 0.22
470 0.27
471 0.26
472 0.27
473 0.3
474 0.28
475 0.3
476 0.31
477 0.29
478 0.23
479 0.21
480 0.21
481 0.18
482 0.16
483 0.12
484 0.14
485 0.13
486 0.14
487 0.18
488 0.17
489 0.19
490 0.21
491 0.23
492 0.21
493 0.26
494 0.3
495 0.34
496 0.38
497 0.44
498 0.47
499 0.47
500 0.47
501 0.46
502 0.45
503 0.37
504 0.35
505 0.32
506 0.3
507 0.28
508 0.27
509 0.24
510 0.21
511 0.21
512 0.2
513 0.15
514 0.12
515 0.11
516 0.1
517 0.08
518 0.07
519 0.06
520 0.06
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.05
537 0.06
538 0.06
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.06
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.06
550 0.05
551 0.05
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.07
560 0.06
561 0.07
562 0.08
563 0.08
564 0.1
565 0.1
566 0.13
567 0.12
568 0.13
569 0.12
570 0.12
571 0.11
572 0.1
573 0.1
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.08
578 0.09
579 0.13
580 0.14
581 0.15
582 0.18
583 0.19
584 0.2
585 0.21
586 0.26
587 0.31
588 0.38
589 0.39
590 0.41
591 0.43
592 0.46
593 0.46
594 0.49
595 0.4
596 0.34
597 0.3
598 0.25
599 0.23
600 0.23
601 0.27
602 0.18
603 0.18
604 0.17
605 0.17
606 0.16
607 0.16
608 0.14
609 0.08
610 0.1
611 0.13
612 0.15
613 0.16
614 0.18
615 0.22
616 0.22
617 0.25
618 0.24
619 0.23
620 0.22
621 0.21
622 0.19
623 0.16
624 0.16
625 0.15
626 0.13
627 0.12
628 0.15
629 0.15
630 0.15
631 0.15
632 0.17
633 0.23
634 0.26
635 0.26
636 0.3
637 0.33
638 0.36
639 0.43
640 0.43
641 0.38
642 0.41
643 0.41
644 0.37
645 0.4
646 0.4
647 0.38
648 0.38
649 0.35
650 0.32
651 0.36
652 0.32
653 0.26
654 0.24
655 0.21
656 0.19
657 0.19
658 0.16
659 0.14
660 0.12
661 0.12
662 0.1
663 0.07
664 0.06
665 0.06
666 0.06
667 0.05
668 0.06
669 0.08
670 0.09
671 0.11
672 0.12
673 0.13
674 0.16
675 0.22
676 0.22
677 0.22
678 0.24
679 0.26
680 0.29
681 0.29
682 0.3
683 0.34
684 0.4
685 0.42
686 0.41
687 0.39
688 0.4
689 0.42
690 0.4
691 0.31
692 0.27
693 0.23
694 0.24
695 0.23
696 0.19
697 0.17
698 0.16
699 0.16
700 0.13
701 0.15
702 0.12
703 0.2
704 0.25
705 0.25
706 0.33
707 0.4
708 0.42
709 0.41
710 0.41
711 0.34
712 0.31
713 0.29
714 0.23
715 0.16
716 0.14
717 0.13
718 0.13
719 0.12
720 0.1
721 0.1
722 0.08
723 0.08
724 0.1
725 0.1
726 0.1
727 0.17
728 0.26
729 0.32
730 0.39
731 0.49
732 0.52
733 0.58
734 0.59
735 0.55
736 0.48
737 0.42
738 0.39
739 0.31
740 0.25
741 0.19
742 0.18
743 0.2
744 0.22
745 0.24
746 0.26
747 0.32
748 0.41