FuNGI

S3C2R1

Protein Details

Accession

S3C2R1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
139-162	NVSAKNTPKSRQQRQHGRQQQSWG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, cyto 6.5, pero 3, mito 2, extr 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR033370 COG1
Gene Ontology	GO:0017119 C:Golgi transport complex GO:0016020 C:membrane GO:0006891 P:intra-Golgi vesicle-mediated transport GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF08700 Vps51

Amino Acid Sequences

MVAPEPDVGLLTSSAQIFASNHTLPQIRQIHKALHVQVDDKAARLRTQVGGSYRELLGTADTIVQMRSDMQGAQATLAGMGGRCGRAVVGGKVSALASFVDNEQEQSSLSLAARAKLLEACARTVGRLLSRKASDPSDNVSAKNTPKSRQQRQHGRQQQSWGERLVLASKVLVLSRLLVSSIDETTGKSKDGSRVKSIPRKGGLQDSAVLASIEASKRTLGSLRRRLREIIEIVERTVPPAAPAHQPAVNFNRAEEDDSASDDEGRLRGQNASAFTAATALDDLLRALCAHSLATTSGARDLLWQLLHVRSQAMALAFELDEGDYESQHQNRQEKDGGATWKSDSVIRGLALYTKTLLDVQALLPHKLPEALLGLKRRALLDDNELCQIEGLRLDVYSRWCGEDVQYFKPYIRHDDLDAAQARDMLSNWAERGSDVLLAGLQRALDQQQPERHQQQQQPLRARRQLDLDAIVSLRTRVLQLWIRDSSKARGFDSSELLQKMRDVFNKQMLHVLGTKVSKLRLVGSEVAATLASWQDGVTDRHPSLWGGGLNTDLQDGAVSFVRDVTTRLLGRSDAVAKGIASYATWRHVVDDVNAIVDQLRRQRWDNDVDDIVEDEETIAERQQLLSRQDPQTLHDHLEATLETAFKELNTQIVSEWTKVAESRSSDATKGEIAMYLVRVLREIRSNRPSAQDQRAGPSRISTPAANSSGASPSSSSKAINELGLEIIPALHTAIARVIVANPLEQLTSRVLTRTTVAGRLLWEEPGQQLPLPSTPSPGVFKFLRDLSASMGDAGMDLWSPAALAQLKQQAAGSLSEQWASLLETADYLQESKPNEDTDTKTDKNGEKDEEEASETSENGEKDDGSEEKASKPEPVSSETALSDSKRRDLLTQWLFDIAWLRCGLDVSVAPGNKQAPQSLAELEDTVYERTGLESEAADSSSGKTPRQRVNKSAQEYWKKTGLLFGLLAPPTHYSLCRFSPMASLRNSSWGTPVMNRSRPANTSLTFCWSSFSSSGLRISRLMPSIESPIKWLPSLSSISRRTRLWNALSDAASSPSKMALTKPVCSSSSLEMRLLMSSASLALARPRRCTRPMEAPPSATRPSELKGVSRNVDGVQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.11
3	0.12
4	0.11
5	0.15
6	0.2
7	0.18
8	0.19
9	0.22
10	0.25
11	0.24
12	0.33
13	0.39
14	0.36
15	0.42
16	0.46
17	0.47
18	0.51
19	0.58
20	0.53
21	0.5
22	0.49
23	0.44
24	0.43
25	0.46
26	0.4
27	0.35
28	0.35
29	0.3
30	0.29
31	0.3
32	0.3
33	0.27
34	0.29
35	0.33
36	0.32
37	0.34
38	0.34
39	0.36
40	0.32
41	0.28
42	0.25
43	0.2
44	0.17
45	0.13
46	0.12
47	0.09
48	0.1
49	0.1
50	0.1
51	0.1
52	0.09
53	0.1
54	0.1
55	0.1
56	0.1
57	0.12
58	0.14
59	0.15
60	0.15
61	0.15
62	0.13
63	0.12
64	0.12
65	0.1
66	0.07
67	0.08
68	0.1
69	0.1
70	0.09
71	0.1
72	0.09
73	0.13
74	0.16
75	0.18
76	0.19
77	0.19
78	0.19
79	0.2
80	0.2
81	0.16
82	0.14
83	0.11
84	0.08
85	0.09
86	0.1
87	0.12
88	0.12
89	0.14
90	0.14
91	0.13
92	0.13
93	0.12
94	0.13
95	0.11
96	0.11
97	0.15
98	0.15
99	0.16
100	0.17
101	0.16
102	0.17
103	0.16
104	0.19
105	0.19
106	0.19
107	0.2
108	0.23
109	0.23
110	0.22
111	0.23
112	0.23
113	0.25
114	0.3
115	0.32
116	0.36
117	0.38
118	0.41
119	0.43
120	0.45
121	0.42
122	0.39
123	0.41
124	0.42
125	0.41
126	0.38
127	0.37
128	0.38
129	0.37
130	0.44
131	0.43
132	0.38
133	0.47
134	0.57
135	0.65
136	0.7
137	0.76
138	0.79
139	0.82
140	0.89
141	0.89
142	0.87
143	0.8
144	0.79
145	0.77
146	0.72
147	0.67
148	0.57
149	0.49
150	0.4
151	0.37
152	0.31
153	0.23
154	0.17
155	0.13
156	0.12
157	0.12
158	0.12
159	0.12
160	0.09
161	0.1
162	0.11
163	0.11
164	0.1
165	0.09
166	0.11
167	0.12
168	0.12
169	0.11
170	0.11
171	0.12
172	0.15
173	0.16
174	0.15
175	0.15
176	0.18
177	0.25
178	0.33
179	0.37
180	0.41
181	0.48
182	0.57
183	0.65
184	0.67
185	0.67
186	0.62
187	0.62
188	0.58
189	0.59
190	0.52
191	0.44
192	0.4
193	0.33
194	0.3
195	0.25
196	0.22
197	0.13
198	0.11
199	0.12
200	0.11
201	0.11
202	0.11
203	0.11
204	0.11
205	0.13
206	0.17
207	0.22
208	0.32
209	0.42
210	0.5
211	0.54
212	0.57
213	0.58
214	0.56
215	0.56
216	0.48
217	0.43
218	0.42
219	0.37
220	0.36
221	0.37
222	0.33
223	0.27
224	0.26
225	0.19
226	0.14
227	0.15
228	0.17
229	0.17
230	0.2
231	0.22
232	0.22
233	0.23
234	0.27
235	0.3
236	0.32
237	0.28
238	0.26
239	0.27
240	0.26
241	0.29
242	0.24
243	0.22
244	0.18
245	0.2
246	0.21
247	0.16
248	0.16
249	0.13
250	0.13
251	0.1
252	0.11
253	0.1
254	0.1
255	0.11
256	0.12
257	0.15
258	0.16
259	0.18
260	0.17
261	0.16
262	0.15
263	0.14
264	0.13
265	0.1
266	0.08
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.05
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.07
280	0.07
281	0.09
282	0.1
283	0.1
284	0.11
285	0.11
286	0.11
287	0.11
288	0.12
289	0.12
290	0.11
291	0.12
292	0.12
293	0.14
294	0.15
295	0.14
296	0.13
297	0.11
298	0.11
299	0.12
300	0.1
301	0.09
302	0.08
303	0.08
304	0.08
305	0.07
306	0.07
307	0.05
308	0.05
309	0.06
310	0.07
311	0.05
312	0.08
313	0.11
314	0.13
315	0.17
316	0.22
317	0.25
318	0.27
319	0.32
320	0.34
321	0.32
322	0.33
323	0.34
324	0.34
325	0.3
326	0.29
327	0.25
328	0.23
329	0.22
330	0.21
331	0.17
332	0.14
333	0.14
334	0.13
335	0.13
336	0.11
337	0.13
338	0.12
339	0.12
340	0.11
341	0.1
342	0.1
343	0.1
344	0.1
345	0.07
346	0.08
347	0.08
348	0.13
349	0.14
350	0.15
351	0.15
352	0.15
353	0.15
354	0.14
355	0.14
356	0.09
357	0.11
358	0.13
359	0.16
360	0.19
361	0.2
362	0.21
363	0.23
364	0.22
365	0.2
366	0.2
367	0.18
368	0.23
369	0.25
370	0.25
371	0.26
372	0.26
373	0.24
374	0.21
375	0.19
376	0.11
377	0.08
378	0.07
379	0.05
380	0.05
381	0.06
382	0.08
383	0.1
384	0.12
385	0.13
386	0.13
387	0.13
388	0.14
389	0.15
390	0.2
391	0.21
392	0.23
393	0.25
394	0.24
395	0.24
396	0.28
397	0.28
398	0.28
399	0.28
400	0.25
401	0.25
402	0.29
403	0.29
404	0.31
405	0.31
406	0.25
407	0.21
408	0.2
409	0.19
410	0.15
411	0.14
412	0.1
413	0.09
414	0.09
415	0.09
416	0.09
417	0.09
418	0.08
419	0.09
420	0.08
421	0.08
422	0.07
423	0.06
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.05
429	0.04
430	0.05
431	0.07
432	0.08
433	0.1
434	0.15
435	0.21
436	0.25
437	0.3
438	0.34
439	0.38
440	0.43
441	0.46
442	0.51
443	0.52
444	0.56
445	0.61
446	0.63
447	0.64
448	0.62
449	0.6
450	0.52
451	0.48
452	0.43
453	0.35
454	0.31
455	0.24
456	0.2
457	0.18
458	0.16
459	0.11
460	0.09
461	0.07
462	0.06
463	0.06
464	0.05
465	0.1
466	0.14
467	0.15
468	0.2
469	0.23
470	0.24
471	0.26
472	0.27
473	0.27
474	0.28
475	0.29
476	0.25
477	0.24
478	0.25
479	0.24
480	0.26
481	0.24
482	0.22
483	0.21
484	0.2
485	0.18
486	0.17
487	0.17
488	0.17
489	0.19
490	0.19
491	0.21
492	0.29
493	0.3
494	0.29
495	0.3
496	0.27
497	0.25
498	0.23
499	0.21
500	0.16
501	0.15
502	0.16
503	0.13
504	0.13
505	0.13
506	0.12
507	0.13
508	0.11
509	0.14
510	0.14
511	0.14
512	0.14
513	0.12
514	0.12
515	0.1
516	0.09
517	0.06
518	0.05
519	0.04
520	0.03
521	0.03
522	0.04
523	0.06
524	0.08
525	0.09
526	0.12
527	0.13
528	0.13
529	0.14
530	0.13
531	0.12
532	0.12
533	0.11
534	0.08
535	0.09
536	0.09
537	0.08
538	0.08
539	0.08
540	0.05
541	0.04
542	0.04
543	0.04
544	0.04
545	0.05
546	0.05
547	0.05
548	0.05
549	0.06
550	0.06
551	0.07
552	0.08
553	0.1
554	0.11
555	0.11
556	0.11
557	0.11
558	0.11
559	0.12
560	0.12
561	0.09
562	0.09
563	0.09
564	0.08
565	0.08
566	0.08
567	0.06
568	0.05
569	0.06
570	0.06
571	0.08
572	0.09
573	0.09
574	0.09
575	0.11
576	0.12
577	0.11
578	0.13
579	0.11
580	0.11
581	0.11
582	0.1
583	0.09
584	0.09
585	0.1
586	0.12
587	0.15
588	0.16
589	0.18
590	0.22
591	0.25
592	0.31
593	0.31
594	0.29
595	0.27
596	0.25
597	0.23
598	0.21
599	0.17
600	0.1
601	0.08
602	0.05
603	0.04
604	0.04
605	0.04
606	0.04
607	0.04
608	0.04
609	0.05
610	0.07
611	0.12
612	0.15
613	0.18
614	0.23
615	0.24
616	0.29
617	0.28
618	0.29
619	0.29
620	0.28
621	0.27
622	0.22
623	0.22
624	0.17
625	0.18
626	0.15
627	0.11
628	0.1
629	0.08
630	0.07
631	0.07
632	0.07
633	0.05
634	0.07
635	0.06
636	0.08
637	0.08
638	0.08
639	0.08
640	0.13
641	0.14
642	0.13
643	0.13
644	0.11
645	0.11
646	0.11
647	0.13
648	0.11
649	0.12
650	0.13
651	0.17
652	0.18
653	0.18
654	0.18
655	0.18
656	0.15
657	0.14
658	0.12
659	0.08
660	0.07
661	0.07
662	0.07
663	0.08
664	0.08
665	0.08
666	0.08
667	0.08
668	0.1
669	0.16
670	0.19
671	0.25
672	0.3
673	0.32
674	0.34
675	0.38
676	0.42
677	0.42
678	0.46
679	0.44
680	0.4
681	0.43
682	0.47
683	0.44
684	0.38
685	0.33
686	0.28
687	0.25
688	0.26
689	0.21
690	0.17
691	0.2
692	0.22
693	0.2
694	0.18
695	0.17
696	0.17
697	0.16
698	0.14
699	0.11
700	0.1
701	0.12
702	0.13
703	0.12
704	0.11
705	0.14
706	0.14
707	0.14
708	0.13
709	0.11
710	0.1
711	0.1
712	0.09
713	0.06
714	0.05
715	0.04
716	0.04
717	0.04
718	0.04
719	0.04
720	0.04
721	0.05
722	0.05
723	0.05
724	0.05
725	0.06
726	0.07
727	0.08
728	0.08
729	0.07
730	0.07
731	0.08
732	0.07
733	0.09
734	0.09
735	0.1
736	0.1
737	0.1
738	0.1
739	0.11
740	0.12
741	0.14
742	0.14
743	0.15
744	0.15
745	0.15
746	0.16
747	0.18
748	0.17
749	0.15
750	0.14
751	0.12
752	0.13
753	0.13
754	0.13
755	0.11
756	0.1
757	0.11
758	0.12
759	0.15
760	0.14
761	0.15
762	0.16
763	0.17
764	0.2
765	0.19
766	0.22
767	0.19
768	0.2
769	0.21
770	0.21
771	0.21
772	0.19
773	0.19
774	0.17
775	0.19
776	0.17
777	0.14
778	0.13
779	0.11
780	0.09
781	0.09
782	0.06
783	0.04
784	0.03
785	0.03
786	0.03
787	0.03
788	0.03
789	0.06
790	0.07
791	0.07
792	0.11
793	0.17
794	0.17
795	0.18
796	0.18
797	0.16
798	0.17
799	0.17
800	0.15
801	0.12
802	0.12
803	0.12
804	0.12
805	0.11
806	0.1
807	0.1
808	0.1
809	0.07
810	0.07
811	0.07
812	0.07
813	0.08
814	0.08
815	0.08
816	0.07
817	0.1
818	0.12
819	0.14
820	0.17
821	0.17
822	0.2
823	0.23
824	0.26
825	0.3
826	0.36
827	0.34
828	0.34
829	0.39
830	0.41
831	0.43
832	0.44
833	0.4
834	0.34
835	0.35
836	0.34
837	0.29
838	0.28
839	0.22
840	0.19
841	0.16
842	0.14
843	0.14
844	0.16
845	0.14
846	0.13
847	0.13
848	0.11
849	0.12
850	0.15
851	0.14
852	0.14
853	0.17
854	0.18
855	0.19
856	0.22
857	0.21
858	0.22
859	0.23
860	0.24
861	0.23
862	0.27
863	0.28
864	0.27
865	0.28
866	0.25
867	0.25
868	0.23
869	0.21
870	0.23
871	0.21
872	0.24
873	0.24
874	0.25
875	0.26
876	0.27
877	0.36
878	0.37
879	0.36
880	0.34
881	0.32
882	0.31
883	0.29
884	0.32
885	0.21
886	0.18
887	0.16
888	0.16
889	0.15
890	0.15
891	0.15
892	0.11
893	0.11
894	0.11
895	0.16
896	0.16
897	0.16
898	0.18
899	0.2
900	0.21
901	0.22
902	0.2
903	0.17
904	0.19
905	0.21
906	0.2
907	0.2
908	0.17
909	0.16
910	0.15
911	0.15
912	0.14
913	0.13
914	0.11
915	0.1
916	0.09
917	0.1
918	0.1
919	0.09
920	0.08
921	0.08
922	0.09
923	0.1
924	0.1
925	0.1
926	0.09
927	0.12
928	0.18
929	0.19
930	0.21
931	0.26
932	0.34
933	0.43
934	0.53
935	0.58
936	0.58
937	0.67
938	0.73
939	0.74
940	0.74
941	0.75
942	0.75
943	0.73
944	0.71
945	0.66
946	0.57
947	0.51
948	0.47
949	0.38
950	0.31
951	0.26
952	0.23
953	0.23
954	0.22
955	0.22
956	0.19
957	0.19
958	0.18
959	0.19
960	0.19
961	0.17
962	0.22
963	0.24
964	0.27
965	0.26
966	0.25
967	0.32
968	0.36
969	0.38
970	0.36
971	0.37
972	0.34
973	0.4
974	0.41
975	0.32
976	0.3
977	0.28
978	0.27
979	0.28
980	0.36
981	0.37
982	0.42
983	0.44
984	0.45
985	0.47
986	0.46
987	0.47
988	0.44
989	0.37
990	0.36
991	0.36
992	0.39
993	0.36
994	0.34
995	0.32
996	0.26
997	0.29
998	0.24
999	0.25
1000	0.2
1001	0.21
1002	0.27
1003	0.27
1004	0.27
1005	0.25
1006	0.26
1007	0.28
1008	0.29
1009	0.27
1010	0.23
1011	0.23
1012	0.29
1013	0.32
1014	0.3
1015	0.3
1016	0.31
1017	0.32
1018	0.3
1019	0.28
1020	0.22
1021	0.23
1022	0.28
1023	0.29
1024	0.33
1025	0.39
1026	0.46
1027	0.5
1028	0.5
1029	0.52
1030	0.56
1031	0.59
1032	0.55
1033	0.54
1034	0.53
1035	0.54
1036	0.52
1037	0.48
1038	0.41
1039	0.36
1040	0.32
1041	0.25
1042	0.2
1043	0.16
1044	0.16
1045	0.15
1046	0.16
1047	0.22
1048	0.26
1049	0.3
1050	0.34
1051	0.37
1052	0.37
1053	0.39
1054	0.4
1055	0.37
1056	0.41
1057	0.39
1058	0.35
1059	0.32
1060	0.32
1061	0.3
1062	0.27
1063	0.19
1064	0.11
1065	0.09
1066	0.09
1067	0.08
1068	0.07
1069	0.07
1070	0.15
1071	0.23
1072	0.26
1073	0.34
1074	0.41
1075	0.47
1076	0.52
1077	0.58
1078	0.58
1079	0.61
1080	0.68
1081	0.69
1082	0.68
1083	0.67
1084	0.67
1085	0.67
1086	0.63
1087	0.52
1088	0.45
1089	0.38
1090	0.36
1091	0.38
1092	0.34
1093	0.33
1094	0.37
1095	0.43
1096	0.44
1097	0.43

S3C2R1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer