Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3D872

Protein Details
Accession S3D872    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
525-546ATASKKSSKKKASKGAKKENVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
528-542SKKSSKKKASKGAKK
Subcellular Location(s) cyto 14.5, nucl 10, cyto_mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MSADADATGAGAGPGAGAPVATSALEQGPFVLRSLLDSVPLSADGTEEDIQINCVEYHDGNLYVGTSASEILHFVQIPPDPSDPTSTSAFILASRLSPPFSEPTNPPGPVRPGVQQIVLLPPVGKACVLCNWTVTFYSLPELTPVFREVKNCNWIGGIDLSEEIATGPSPRVTILLSLNRKVQVVRIGDEARAVKNIEFATSIRSTRRDAIACVADVRRYTLVHIERQLKIPLMPISSLDQSQHNISLGQVQNLQVSSIDGGLSRSSSLAHSHTRSTSSITQGGHSRSTSLGSFITGNLKGQAALPPPPPPKGDSDEDSNSQDATTKPSTVVSRSSAANSDEAPPAQSTSPPPPPPKTGAPLMKPLVASPTPDEFLVVTGTGPEDPGIGMFVNVDGDPTRPTLEFERYPTEIVVDGGVSDSSSSHPSPGDGGLGDEDEDGYVLASISKDFSDGIHYGLEIQRWDLNMGEDEVSKYWLEIPGENITSPLGIHSLLGTNETVVQEVIDKLAQKRFSLPQATRSEGPATASKKSSKKKASKGAKKENVDSENDEDASRNRAEAVFATRLAKTAGRIAVWAGDRIWWAMRNHMVLQLEAGLDAALSGGKVAPETAEDRIELFTVLSSFRGRDAKTELEFVTFSYIRQRAGALLFMSLLHATGGNTYSEPEMRALEEVLMDSGLDPRVVLALLPELRDEIVQSQKGIWVFGGVKDAIEQYLAREAATAKPKSTVGSLNPKLLQFLRRFLIAFRRKKGFGSVADENDVFRTVDASLLSILLELDKGTAKGILVPKPDSARSDLNDLVDKGVDCFDRAVQLLEKNHRLFVLSRLYQSRKQASDVLATWRRIVDGERDDGGELVDGELRIRDYLSKVSNQALVQEYGLWLANRNPKLGVQIFADDKAKAPKFNPKQVVPLLREKAPGAVRYYLEYLVFTKGQSTYVEELISYYLDVVTGDLRSSEAARDTIAASYESYRALQPPKPTFHQFLTDNAAPGDEAWQNRLRLLELLGGPHPYDVADIRSRLAESLPAEYPAERLLVPETIILNGREHRHEDALRLLVHGLGDYDTAIKYCMRGGSSLYGTVRSTAKSSSDKAPKRRESLPPTAEVQAKLFRSLLIEFLALEDVSDRVEQTGSLLARFAGCFDVLDVLNLLPDSWAVDVAAGFLVHSLRELVQDRNQSTFARALSGAENLRVHDQAIKKMDEIGPQVDSEPQEAQAEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.04
3 0.04
4 0.03
5 0.04
6 0.04
7 0.05
8 0.05
9 0.05
10 0.07
11 0.1
12 0.1
13 0.1
14 0.11
15 0.14
16 0.14
17 0.15
18 0.15
19 0.12
20 0.15
21 0.19
22 0.17
23 0.16
24 0.16
25 0.17
26 0.16
27 0.17
28 0.15
29 0.11
30 0.11
31 0.09
32 0.13
33 0.13
34 0.12
35 0.13
36 0.13
37 0.14
38 0.14
39 0.15
40 0.1
41 0.1
42 0.12
43 0.11
44 0.14
45 0.15
46 0.16
47 0.14
48 0.14
49 0.14
50 0.12
51 0.12
52 0.09
53 0.07
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.15
63 0.17
64 0.2
65 0.23
66 0.24
67 0.24
68 0.25
69 0.3
70 0.28
71 0.29
72 0.28
73 0.25
74 0.24
75 0.22
76 0.21
77 0.16
78 0.16
79 0.14
80 0.12
81 0.13
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.17
86 0.19
87 0.21
88 0.25
89 0.26
90 0.32
91 0.38
92 0.39
93 0.38
94 0.4
95 0.42
96 0.4
97 0.41
98 0.38
99 0.37
100 0.38
101 0.37
102 0.32
103 0.29
104 0.3
105 0.27
106 0.23
107 0.17
108 0.16
109 0.16
110 0.15
111 0.14
112 0.1
113 0.11
114 0.17
115 0.19
116 0.18
117 0.19
118 0.2
119 0.22
120 0.23
121 0.22
122 0.17
123 0.16
124 0.19
125 0.17
126 0.16
127 0.15
128 0.16
129 0.15
130 0.16
131 0.18
132 0.18
133 0.2
134 0.24
135 0.27
136 0.33
137 0.4
138 0.38
139 0.36
140 0.33
141 0.31
142 0.3
143 0.27
144 0.2
145 0.13
146 0.12
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.08
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.09
159 0.1
160 0.12
161 0.18
162 0.26
163 0.3
164 0.32
165 0.36
166 0.37
167 0.37
168 0.34
169 0.32
170 0.3
171 0.28
172 0.28
173 0.3
174 0.3
175 0.29
176 0.33
177 0.31
178 0.25
179 0.24
180 0.23
181 0.17
182 0.21
183 0.21
184 0.17
185 0.17
186 0.16
187 0.2
188 0.21
189 0.23
190 0.22
191 0.25
192 0.27
193 0.3
194 0.36
195 0.33
196 0.31
197 0.35
198 0.35
199 0.33
200 0.33
201 0.3
202 0.26
203 0.24
204 0.25
205 0.21
206 0.18
207 0.19
208 0.23
209 0.26
210 0.29
211 0.36
212 0.4
213 0.4
214 0.43
215 0.44
216 0.37
217 0.33
218 0.32
219 0.28
220 0.23
221 0.22
222 0.2
223 0.21
224 0.22
225 0.22
226 0.19
227 0.18
228 0.18
229 0.2
230 0.19
231 0.16
232 0.15
233 0.14
234 0.21
235 0.2
236 0.2
237 0.2
238 0.2
239 0.21
240 0.21
241 0.21
242 0.12
243 0.12
244 0.1
245 0.09
246 0.08
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.11
256 0.14
257 0.19
258 0.21
259 0.24
260 0.25
261 0.28
262 0.27
263 0.3
264 0.3
265 0.29
266 0.31
267 0.29
268 0.29
269 0.32
270 0.33
271 0.3
272 0.27
273 0.24
274 0.2
275 0.21
276 0.19
277 0.16
278 0.13
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.16
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.14
287 0.13
288 0.13
289 0.16
290 0.14
291 0.18
292 0.19
293 0.26
294 0.28
295 0.3
296 0.31
297 0.29
298 0.32
299 0.33
300 0.36
301 0.31
302 0.36
303 0.37
304 0.38
305 0.38
306 0.34
307 0.28
308 0.23
309 0.22
310 0.16
311 0.18
312 0.17
313 0.16
314 0.16
315 0.19
316 0.21
317 0.21
318 0.24
319 0.21
320 0.21
321 0.22
322 0.23
323 0.22
324 0.21
325 0.2
326 0.18
327 0.18
328 0.17
329 0.16
330 0.16
331 0.14
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.2
337 0.28
338 0.33
339 0.38
340 0.4
341 0.44
342 0.47
343 0.48
344 0.45
345 0.45
346 0.46
347 0.44
348 0.47
349 0.45
350 0.42
351 0.37
352 0.33
353 0.3
354 0.24
355 0.23
356 0.19
357 0.2
358 0.18
359 0.18
360 0.18
361 0.13
362 0.13
363 0.12
364 0.09
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.05
371 0.05
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.05
383 0.06
384 0.07
385 0.08
386 0.09
387 0.09
388 0.11
389 0.14
390 0.19
391 0.21
392 0.23
393 0.27
394 0.27
395 0.27
396 0.25
397 0.22
398 0.17
399 0.15
400 0.12
401 0.07
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.05
409 0.08
410 0.08
411 0.09
412 0.09
413 0.1
414 0.11
415 0.11
416 0.1
417 0.07
418 0.08
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.05
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.09
439 0.09
440 0.1
441 0.1
442 0.09
443 0.11
444 0.12
445 0.13
446 0.09
447 0.1
448 0.1
449 0.1
450 0.11
451 0.1
452 0.09
453 0.09
454 0.1
455 0.09
456 0.08
457 0.09
458 0.09
459 0.1
460 0.09
461 0.08
462 0.08
463 0.1
464 0.1
465 0.1
466 0.12
467 0.14
468 0.15
469 0.15
470 0.14
471 0.11
472 0.1
473 0.1
474 0.07
475 0.05
476 0.04
477 0.04
478 0.05
479 0.06
480 0.06
481 0.07
482 0.07
483 0.06
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.07
492 0.06
493 0.07
494 0.09
495 0.13
496 0.14
497 0.14
498 0.18
499 0.2
500 0.24
501 0.3
502 0.29
503 0.34
504 0.37
505 0.4
506 0.37
507 0.36
508 0.32
509 0.25
510 0.27
511 0.23
512 0.21
513 0.21
514 0.22
515 0.27
516 0.33
517 0.38
518 0.45
519 0.5
520 0.56
521 0.63
522 0.71
523 0.76
524 0.78
525 0.83
526 0.85
527 0.83
528 0.78
529 0.73
530 0.69
531 0.61
532 0.53
533 0.45
534 0.38
535 0.3
536 0.28
537 0.24
538 0.17
539 0.15
540 0.17
541 0.14
542 0.1
543 0.1
544 0.09
545 0.09
546 0.1
547 0.14
548 0.11
549 0.12
550 0.14
551 0.13
552 0.14
553 0.14
554 0.14
555 0.1
556 0.12
557 0.12
558 0.11
559 0.11
560 0.11
561 0.13
562 0.13
563 0.13
564 0.09
565 0.09
566 0.09
567 0.1
568 0.1
569 0.1
570 0.1
571 0.13
572 0.14
573 0.15
574 0.15
575 0.18
576 0.18
577 0.14
578 0.14
579 0.12
580 0.1
581 0.08
582 0.07
583 0.04
584 0.03
585 0.03
586 0.03
587 0.02
588 0.02
589 0.02
590 0.02
591 0.02
592 0.03
593 0.03
594 0.03
595 0.04
596 0.06
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.08
601 0.08
602 0.09
603 0.07
604 0.06
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.05
609 0.06
610 0.06
611 0.08
612 0.11
613 0.11
614 0.13
615 0.16
616 0.19
617 0.2
618 0.22
619 0.2
620 0.18
621 0.18
622 0.16
623 0.17
624 0.13
625 0.12
626 0.16
627 0.16
628 0.16
629 0.16
630 0.16
631 0.13
632 0.13
633 0.15
634 0.09
635 0.08
636 0.08
637 0.07
638 0.08
639 0.06
640 0.05
641 0.04
642 0.04
643 0.04
644 0.04
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.06
649 0.07
650 0.07
651 0.07
652 0.08
653 0.07
654 0.07
655 0.08
656 0.07
657 0.07
658 0.06
659 0.06
660 0.05
661 0.04
662 0.04
663 0.04
664 0.05
665 0.05
666 0.04
667 0.04
668 0.04
669 0.04
670 0.04
671 0.04
672 0.03
673 0.06
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.08
680 0.08
681 0.08
682 0.11
683 0.11
684 0.12
685 0.12
686 0.14
687 0.14
688 0.14
689 0.11
690 0.09
691 0.09
692 0.09
693 0.12
694 0.09
695 0.09
696 0.09
697 0.1
698 0.07
699 0.08
700 0.07
701 0.05
702 0.09
703 0.09
704 0.08
705 0.09
706 0.1
707 0.14
708 0.22
709 0.22
710 0.19
711 0.21
712 0.21
713 0.21
714 0.23
715 0.21
716 0.18
717 0.28
718 0.3
719 0.32
720 0.33
721 0.32
722 0.32
723 0.3
724 0.31
725 0.23
726 0.24
727 0.22
728 0.21
729 0.21
730 0.21
731 0.3
732 0.33
733 0.38
734 0.39
735 0.43
736 0.43
737 0.44
738 0.47
739 0.42
740 0.36
741 0.37
742 0.36
743 0.33
744 0.34
745 0.33
746 0.29
747 0.24
748 0.21
749 0.14
750 0.09
751 0.08
752 0.06
753 0.07
754 0.07
755 0.07
756 0.06
757 0.06
758 0.06
759 0.05
760 0.05
761 0.04
762 0.04
763 0.03
764 0.04
765 0.04
766 0.05
767 0.05
768 0.06
769 0.05
770 0.1
771 0.14
772 0.17
773 0.19
774 0.21
775 0.23
776 0.25
777 0.27
778 0.24
779 0.24
780 0.24
781 0.23
782 0.26
783 0.25
784 0.24
785 0.25
786 0.23
787 0.2
788 0.17
789 0.15
790 0.11
791 0.12
792 0.11
793 0.09
794 0.09
795 0.09
796 0.1
797 0.1
798 0.11
799 0.11
800 0.15
801 0.2
802 0.25
803 0.31
804 0.3
805 0.3
806 0.28
807 0.28
808 0.25
809 0.25
810 0.29
811 0.24
812 0.27
813 0.32
814 0.37
815 0.39
816 0.44
817 0.46
818 0.39
819 0.4
820 0.4
821 0.36
822 0.36
823 0.34
824 0.36
825 0.35
826 0.34
827 0.32
828 0.28
829 0.26
830 0.23
831 0.23
832 0.21
833 0.19
834 0.21
835 0.21
836 0.21
837 0.21
838 0.2
839 0.19
840 0.12
841 0.08
842 0.06
843 0.06
844 0.06
845 0.06
846 0.06
847 0.07
848 0.06
849 0.07
850 0.08
851 0.09
852 0.14
853 0.16
854 0.19
855 0.2
856 0.22
857 0.25
858 0.24
859 0.25
860 0.23
861 0.21
862 0.18
863 0.16
864 0.15
865 0.12
866 0.13
867 0.1
868 0.09
869 0.13
870 0.21
871 0.22
872 0.23
873 0.23
874 0.22
875 0.28
876 0.29
877 0.26
878 0.2
879 0.22
880 0.22
881 0.24
882 0.25
883 0.19
884 0.19
885 0.25
886 0.25
887 0.24
888 0.25
889 0.33
890 0.4
891 0.49
892 0.54
893 0.48
894 0.53
895 0.58
896 0.63
897 0.57
898 0.58
899 0.52
900 0.47
901 0.47
902 0.4
903 0.39
904 0.35
905 0.33
906 0.28
907 0.28
908 0.26
909 0.27
910 0.28
911 0.23
912 0.2
913 0.19
914 0.16
915 0.16
916 0.16
917 0.13
918 0.13
919 0.13
920 0.14
921 0.14
922 0.17
923 0.17
924 0.17
925 0.17
926 0.15
927 0.15
928 0.14
929 0.13
930 0.09
931 0.07
932 0.05
933 0.05
934 0.05
935 0.05
936 0.06
937 0.06
938 0.06
939 0.06
940 0.06
941 0.07
942 0.08
943 0.09
944 0.09
945 0.09
946 0.1
947 0.11
948 0.11
949 0.11
950 0.11
951 0.11
952 0.1
953 0.11
954 0.12
955 0.12
956 0.12
957 0.13
958 0.16
959 0.2
960 0.23
961 0.3
962 0.37
963 0.41
964 0.46
965 0.51
966 0.51
967 0.49
968 0.52
969 0.44
970 0.41
971 0.43
972 0.39
973 0.34
974 0.29
975 0.27
976 0.2
977 0.18
978 0.18
979 0.13
980 0.13
981 0.16
982 0.21
983 0.22
984 0.23
985 0.23
986 0.21
987 0.19
988 0.2
989 0.21
990 0.17
991 0.19
992 0.19
993 0.19
994 0.18
995 0.17
996 0.15
997 0.1
998 0.11
999 0.09
1000 0.13
1001 0.15
1002 0.16
1003 0.17
1004 0.18
1005 0.19
1006 0.18
1007 0.17
1008 0.17
1009 0.14
1010 0.18
1011 0.18
1012 0.18
1013 0.19
1014 0.18
1015 0.19
1016 0.15
1017 0.15
1018 0.11
1019 0.11
1020 0.11
1021 0.11
1022 0.12
1023 0.13
1024 0.13
1025 0.13
1026 0.15
1027 0.15
1028 0.16
1029 0.19
1030 0.22
1031 0.24
1032 0.26
1033 0.29
1034 0.33
1035 0.33
1036 0.33
1037 0.34
1038 0.35
1039 0.32
1040 0.29
1041 0.26
1042 0.2
1043 0.19
1044 0.16
1045 0.12
1046 0.08
1047 0.08
1048 0.07
1049 0.08
1050 0.07
1051 0.08
1052 0.09
1053 0.08
1054 0.08
1055 0.11
1056 0.13
1057 0.13
1058 0.14
1059 0.16
1060 0.21
1061 0.23
1062 0.26
1063 0.25
1064 0.24
1065 0.24
1066 0.26
1067 0.25
1068 0.2
1069 0.2
1070 0.18
1071 0.23
1072 0.25
1073 0.29
1074 0.36
1075 0.45
1076 0.52
1077 0.6
1078 0.69
1079 0.72
1080 0.72
1081 0.76
1082 0.77
1083 0.75
1084 0.77
1085 0.72
1086 0.65
1087 0.6
1088 0.6
1089 0.56
1090 0.47
1091 0.41
1092 0.37
1093 0.34
1094 0.32
1095 0.28
1096 0.24
1097 0.23
1098 0.22
1099 0.21
1100 0.15
1101 0.14
1102 0.12
1103 0.13
1104 0.14
1105 0.11
1106 0.1
1107 0.09
1108 0.07
1109 0.08
1110 0.09
1111 0.08
1112 0.08
1113 0.08
1114 0.08
1115 0.09
1116 0.15
1117 0.14
1118 0.14
1119 0.14
1120 0.13
1121 0.15
1122 0.15
1123 0.14
1124 0.1
1125 0.1
1126 0.1
1127 0.1
1128 0.13
1129 0.12
1130 0.13
1131 0.12
1132 0.11
1133 0.11
1134 0.11
1135 0.1
1136 0.07
1137 0.07
1138 0.07
1139 0.07
1140 0.07
1141 0.06
1142 0.07
1143 0.07
1144 0.07
1145 0.08
1146 0.07
1147 0.06
1148 0.07
1149 0.07
1150 0.06
1151 0.07
1152 0.08
1153 0.08
1154 0.14
1155 0.17
1156 0.21
1157 0.27
1158 0.35
1159 0.37
1160 0.39
1161 0.41
1162 0.37
1163 0.37
1164 0.37
1165 0.3
1166 0.26
1167 0.24
1168 0.22
1169 0.22
1170 0.26
1171 0.24
1172 0.24
1173 0.25
1174 0.23
1175 0.26
1176 0.24
1177 0.24
1178 0.25
1179 0.27
1180 0.31
1181 0.36
1182 0.36
1183 0.33
1184 0.38
1185 0.4
1186 0.39
1187 0.39
1188 0.34
1189 0.3
1190 0.28
1191 0.29
1192 0.27
1193 0.25
1194 0.23
1195 0.2
1196 0.19