Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3D4L9

Protein Details
Accession S3D4L9    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-158EPEPAPKEKAKPRGRPGRKPAAANBasic
173-192TVAAPKKRGRGRPKASDENNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-87AKRGRPAAATAAANKVTKPAQKKAAAKPRAGGRGG
139-154APKEKAKPRGRPGRKP
177-188PKKRGRGRPKAS
198-205AKPAKKGR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040349  Csm1/Pcs1  
IPR020981  Csm1/Pcs1_C  
IPR038608  Csm1/Pcs1_C_sf  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0033551  C:monopolin complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF12539  Csm1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MARTKAPSNLLGLVDSDSEDDLGGFKNTATNAKVTAKPTKPTTSSSIRDMPAAKRGRPAAATAAANKVTKPAQKKAAAKPRAGGRGGAAAAAALKAAEAEEDNDDDDAANTTTSSADSRGRPALADRTNELAEAEPEPAPKEKAKPRGRPGRKPAAANTATETDDSIMEEAPTVAAPKKRGRGRPKASDENNDPVAAAKPAKKGRAAAVAKETTEDVSMEEEGDEPQKDTTVEPAVEMEAETAEKRDTATDDTAHNTFQSPLRRNKTQLLAAAASPARPRGSTAATATDDASVRRRLGELTKKYDTLEARYRDLKEIGVKEAERNFDRLKKQGEERAKTSNDLIASLKAELATYRDLAKEGARAKREWDASEARAVDLQAQLCELKTALGNAKAESKTLSTKLAAARTTNDASLSAGVIPGSAMKSSIAGKSSSAPANASTRAAVEAMHASTQISQLKEDLYGDLTGLLVRSAKRDGSREMYDCIQTGRNGSLHFKLCIDDEASTDGEDAQFVYTPQLDPSRDAALVEMLPDYLVEEISFPRMQAAKFYKRVMQSLTEEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.15
4 0.11
5 0.1
6 0.1
7 0.08
8 0.08
9 0.09
10 0.09
11 0.09
12 0.08
13 0.11
14 0.13
15 0.18
16 0.18
17 0.19
18 0.22
19 0.28
20 0.33
21 0.35
22 0.43
23 0.44
24 0.49
25 0.54
26 0.57
27 0.55
28 0.55
29 0.57
30 0.56
31 0.54
32 0.54
33 0.55
34 0.47
35 0.49
36 0.48
37 0.44
38 0.44
39 0.47
40 0.42
41 0.42
42 0.44
43 0.44
44 0.41
45 0.4
46 0.37
47 0.36
48 0.36
49 0.32
50 0.34
51 0.34
52 0.33
53 0.3
54 0.28
55 0.28
56 0.32
57 0.36
58 0.39
59 0.44
60 0.52
61 0.6
62 0.67
63 0.73
64 0.73
65 0.69
66 0.67
67 0.66
68 0.65
69 0.58
70 0.48
71 0.39
72 0.38
73 0.36
74 0.29
75 0.21
76 0.13
77 0.12
78 0.11
79 0.09
80 0.04
81 0.03
82 0.03
83 0.03
84 0.04
85 0.04
86 0.06
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.14
104 0.15
105 0.19
106 0.22
107 0.22
108 0.22
109 0.24
110 0.31
111 0.31
112 0.32
113 0.3
114 0.31
115 0.31
116 0.3
117 0.28
118 0.19
119 0.16
120 0.14
121 0.15
122 0.11
123 0.12
124 0.14
125 0.15
126 0.17
127 0.18
128 0.26
129 0.31
130 0.41
131 0.51
132 0.59
133 0.67
134 0.76
135 0.82
136 0.85
137 0.86
138 0.87
139 0.82
140 0.76
141 0.7
142 0.69
143 0.61
144 0.51
145 0.45
146 0.36
147 0.32
148 0.28
149 0.24
150 0.14
151 0.13
152 0.12
153 0.1
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.09
162 0.11
163 0.16
164 0.21
165 0.3
166 0.37
167 0.46
168 0.55
169 0.63
170 0.69
171 0.75
172 0.78
173 0.8
174 0.77
175 0.76
176 0.71
177 0.65
178 0.58
179 0.47
180 0.38
181 0.29
182 0.26
183 0.19
184 0.17
185 0.15
186 0.21
187 0.25
188 0.27
189 0.28
190 0.29
191 0.3
192 0.38
193 0.36
194 0.32
195 0.35
196 0.33
197 0.32
198 0.3
199 0.27
200 0.18
201 0.17
202 0.14
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.11
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.07
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.13
239 0.15
240 0.16
241 0.15
242 0.14
243 0.12
244 0.11
245 0.14
246 0.2
247 0.24
248 0.32
249 0.38
250 0.4
251 0.43
252 0.46
253 0.47
254 0.43
255 0.39
256 0.34
257 0.29
258 0.25
259 0.25
260 0.2
261 0.17
262 0.14
263 0.13
264 0.1
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.12
269 0.13
270 0.14
271 0.16
272 0.16
273 0.17
274 0.16
275 0.15
276 0.13
277 0.12
278 0.14
279 0.12
280 0.12
281 0.11
282 0.11
283 0.12
284 0.18
285 0.27
286 0.3
287 0.35
288 0.37
289 0.37
290 0.37
291 0.4
292 0.35
293 0.31
294 0.33
295 0.29
296 0.3
297 0.33
298 0.34
299 0.32
300 0.31
301 0.27
302 0.24
303 0.23
304 0.22
305 0.21
306 0.2
307 0.21
308 0.23
309 0.26
310 0.21
311 0.23
312 0.24
313 0.27
314 0.3
315 0.32
316 0.33
317 0.34
318 0.37
319 0.42
320 0.48
321 0.46
322 0.47
323 0.49
324 0.46
325 0.43
326 0.39
327 0.34
328 0.25
329 0.22
330 0.19
331 0.13
332 0.13
333 0.12
334 0.11
335 0.09
336 0.09
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.09
342 0.09
343 0.1
344 0.11
345 0.12
346 0.15
347 0.19
348 0.24
349 0.26
350 0.26
351 0.28
352 0.33
353 0.35
354 0.31
355 0.3
356 0.29
357 0.28
358 0.31
359 0.29
360 0.23
361 0.22
362 0.21
363 0.17
364 0.16
365 0.15
366 0.1
367 0.11
368 0.11
369 0.1
370 0.1
371 0.08
372 0.06
373 0.06
374 0.08
375 0.1
376 0.14
377 0.14
378 0.15
379 0.21
380 0.21
381 0.21
382 0.2
383 0.19
384 0.2
385 0.2
386 0.22
387 0.16
388 0.2
389 0.23
390 0.26
391 0.25
392 0.23
393 0.24
394 0.26
395 0.27
396 0.24
397 0.2
398 0.17
399 0.16
400 0.15
401 0.13
402 0.08
403 0.07
404 0.07
405 0.06
406 0.05
407 0.06
408 0.06
409 0.05
410 0.06
411 0.06
412 0.08
413 0.09
414 0.12
415 0.12
416 0.12
417 0.13
418 0.15
419 0.19
420 0.2
421 0.19
422 0.18
423 0.19
424 0.22
425 0.23
426 0.21
427 0.17
428 0.15
429 0.15
430 0.15
431 0.12
432 0.1
433 0.11
434 0.11
435 0.11
436 0.11
437 0.1
438 0.11
439 0.15
440 0.17
441 0.15
442 0.15
443 0.16
444 0.16
445 0.17
446 0.17
447 0.14
448 0.12
449 0.11
450 0.11
451 0.1
452 0.09
453 0.08
454 0.08
455 0.07
456 0.08
457 0.08
458 0.11
459 0.13
460 0.17
461 0.21
462 0.25
463 0.3
464 0.34
465 0.4
466 0.4
467 0.41
468 0.4
469 0.38
470 0.34
471 0.32
472 0.28
473 0.23
474 0.23
475 0.23
476 0.22
477 0.22
478 0.26
479 0.3
480 0.29
481 0.3
482 0.28
483 0.26
484 0.25
485 0.26
486 0.24
487 0.18
488 0.16
489 0.18
490 0.18
491 0.16
492 0.15
493 0.13
494 0.11
495 0.1
496 0.1
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.1
501 0.11
502 0.11
503 0.15
504 0.2
505 0.2
506 0.23
507 0.25
508 0.27
509 0.25
510 0.25
511 0.22
512 0.19
513 0.18
514 0.16
515 0.13
516 0.09
517 0.09
518 0.09
519 0.08
520 0.06
521 0.06
522 0.05
523 0.07
524 0.08
525 0.13
526 0.13
527 0.13
528 0.17
529 0.21
530 0.21
531 0.29
532 0.37
533 0.42
534 0.47
535 0.51
536 0.53
537 0.54
538 0.58
539 0.53
540 0.5