Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CXE0

Protein Details
Accession S3CXE0    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-122ARGLKATKRKRDDKAAPGTAVRKPKEGRREKKRRPANASGAGSBasic
190-210DLAIRNPNKRRRKQDEDDLEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-116GLKATKRKRDDKAAPGTAVRKPKEGRREKKRRPAN
152-165ARRVRPEASRRKKS
180-187RRKRALNR
192-202AIRNPNKRRRK
452-461QRSKMRNKKK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDAEAGAVSPAQARDDAAATPERLSSPAAGPKARASDDEGNASEEEELLSDVDEDELEDYDPATAYIEERPITIDEEAARGLKATKRKRDDKAAPGTAVRKPKEGRREKKRRPANASGAGSRSDGAAAAGGGDHDDDDMADNFGDASENRARRVRPEASRRKKSASPEIDEESLTPEERRKRALNRAIDLAIRNPNKRRRKQDEDDLEKMADEEIAQLKIRMEKACMADIEARDAKRPAVSKLQLLPQVLSVLNRSDIRETVLDPETNFLQSVKFFLEPLNDGSLPSYAIQRDIFTCLTQLPIEKDALLSSGIGKVVLFYTRSKRAELTIKRMAERLVGEWSRPILKKTDDYKKRYVETRDYDYMAAKAAEQGGGANMSSQYTLTERPMSRFELDKEMQLAPPVVNPNRAIPVGLPQSYSIAPNSTFEGHRGNDYKPIGASSVEAFRRMAQRSKMRNKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.14
4 0.14
5 0.15
6 0.18
7 0.17
8 0.18
9 0.19
10 0.18
11 0.18
12 0.19
13 0.18
14 0.2
15 0.26
16 0.29
17 0.29
18 0.3
19 0.34
20 0.38
21 0.36
22 0.33
23 0.34
24 0.37
25 0.39
26 0.42
27 0.38
28 0.35
29 0.34
30 0.33
31 0.25
32 0.17
33 0.14
34 0.09
35 0.08
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.08
54 0.1
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.15
59 0.15
60 0.17
61 0.16
62 0.15
63 0.13
64 0.14
65 0.15
66 0.14
67 0.12
68 0.11
69 0.13
70 0.16
71 0.25
72 0.33
73 0.42
74 0.51
75 0.6
76 0.67
77 0.75
78 0.8
79 0.8
80 0.81
81 0.76
82 0.69
83 0.64
84 0.61
85 0.56
86 0.55
87 0.47
88 0.44
89 0.42
90 0.48
91 0.55
92 0.62
93 0.67
94 0.69
95 0.79
96 0.83
97 0.9
98 0.92
99 0.91
100 0.89
101 0.88
102 0.86
103 0.84
104 0.78
105 0.7
106 0.62
107 0.53
108 0.44
109 0.34
110 0.25
111 0.15
112 0.11
113 0.08
114 0.06
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.05
134 0.09
135 0.15
136 0.17
137 0.19
138 0.23
139 0.24
140 0.27
141 0.34
142 0.37
143 0.4
144 0.5
145 0.59
146 0.66
147 0.75
148 0.75
149 0.74
150 0.7
151 0.68
152 0.68
153 0.64
154 0.58
155 0.53
156 0.53
157 0.48
158 0.43
159 0.36
160 0.29
161 0.22
162 0.18
163 0.14
164 0.16
165 0.21
166 0.23
167 0.27
168 0.29
169 0.35
170 0.45
171 0.52
172 0.54
173 0.5
174 0.52
175 0.48
176 0.44
177 0.39
178 0.32
179 0.31
180 0.28
181 0.3
182 0.34
183 0.43
184 0.51
185 0.59
186 0.66
187 0.68
188 0.74
189 0.77
190 0.8
191 0.81
192 0.78
193 0.73
194 0.64
195 0.55
196 0.45
197 0.38
198 0.27
199 0.16
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.11
208 0.13
209 0.12
210 0.12
211 0.15
212 0.17
213 0.18
214 0.17
215 0.16
216 0.17
217 0.16
218 0.19
219 0.18
220 0.17
221 0.17
222 0.17
223 0.16
224 0.16
225 0.17
226 0.16
227 0.21
228 0.22
229 0.24
230 0.26
231 0.3
232 0.3
233 0.29
234 0.27
235 0.19
236 0.2
237 0.17
238 0.15
239 0.11
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.14
250 0.15
251 0.15
252 0.14
253 0.15
254 0.14
255 0.13
256 0.13
257 0.09
258 0.08
259 0.07
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.09
265 0.11
266 0.11
267 0.13
268 0.15
269 0.14
270 0.13
271 0.14
272 0.13
273 0.12
274 0.11
275 0.12
276 0.08
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.11
281 0.14
282 0.14
283 0.12
284 0.13
285 0.11
286 0.12
287 0.12
288 0.12
289 0.11
290 0.12
291 0.13
292 0.12
293 0.12
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.07
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.07
305 0.08
306 0.09
307 0.11
308 0.17
309 0.25
310 0.27
311 0.28
312 0.28
313 0.32
314 0.41
315 0.43
316 0.46
317 0.46
318 0.47
319 0.47
320 0.47
321 0.42
322 0.35
323 0.31
324 0.24
325 0.24
326 0.22
327 0.21
328 0.21
329 0.23
330 0.26
331 0.26
332 0.25
333 0.22
334 0.25
335 0.33
336 0.4
337 0.49
338 0.53
339 0.58
340 0.65
341 0.67
342 0.69
343 0.68
344 0.67
345 0.65
346 0.63
347 0.64
348 0.59
349 0.54
350 0.5
351 0.44
352 0.38
353 0.29
354 0.23
355 0.15
356 0.13
357 0.12
358 0.11
359 0.09
360 0.09
361 0.08
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.09
371 0.11
372 0.14
373 0.21
374 0.22
375 0.26
376 0.29
377 0.32
378 0.32
379 0.35
380 0.35
381 0.36
382 0.36
383 0.35
384 0.35
385 0.33
386 0.31
387 0.28
388 0.27
389 0.18
390 0.21
391 0.26
392 0.25
393 0.27
394 0.28
395 0.29
396 0.32
397 0.32
398 0.28
399 0.21
400 0.27
401 0.29
402 0.29
403 0.27
404 0.24
405 0.26
406 0.26
407 0.27
408 0.2
409 0.17
410 0.17
411 0.17
412 0.2
413 0.21
414 0.21
415 0.21
416 0.26
417 0.24
418 0.31
419 0.33
420 0.31
421 0.36
422 0.37
423 0.37
424 0.32
425 0.32
426 0.26
427 0.23
428 0.23
429 0.18
430 0.25
431 0.23
432 0.24
433 0.23
434 0.27
435 0.33
436 0.36
437 0.41
438 0.42
439 0.52
440 0.61
441 0.72