FuNGI

S3CP31

Protein Details

Accession

S3CP31

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1161-1185	SYFHNRPDKGGKDRSQRVRKLQLSD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto_nucl 10.5, mito 8, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR003890 MIF4G-like_typ-3 IPR039762 Nmd2/UPF2 IPR007193 Upf2/Nmd2_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF02854 MIF4G PF04050 Upf2

Amino Acid Sequences

MDRLKKHLFEVNKSLDSSLKKNTAFIRRLRTAISAANLNSFLQEIASLSLSKYLSEIIPACYEGLCRLKTPADIEAGVEIVSTLHQRFGPADFTEYLGWLLGKGMAAPDKSQFKTLSAEARERDEKDRITLQRVLLRIVTELWLAGVLRTLEDVNRPDDTTKGAAGKAADVKFRTSPSAKPGAADPFPLAVLKDLLGHDREHANLPLLVTFVKTFSVDILGVSGSPGEGARKLGDEDGGSAAPRPANDKPISNPETAADTEAIGGPFSPDSALAPSSAGSDGDSITPPELQAKFRNILSRYFDDVKGHLLRDQKAISAQSRRNAEAYVKSGEVFEDRQSNFEKQVKAQERLVSNAQVIADAIGAEMPDLKDGDDAQITTSSSAIGIVKAGDYLRGQGESSGIWEDEEERRFYENLVDLKGKVPAILLEDGKKKKADSDDQVGSKKTESPDDPEAGKAPLADAANANTSTPAATITTTDEQSTSIINKSVGAQVDTLLLRLPDLTNKEIIDQTAIDFCFLNSKASRNRLIKSLTEVPKGRSDLLPCWSRLVATLGQYMPDIPKGLVEYLDAEFRSLQRRKEKDFLGQVRLSNIRYLAELTKFGIVPEHVVFHCLKVSLDDFSRMNIEIISNLLENCGRYLLRNPDTSPRMTSFLETLQRKKAMQHIGQAERMLIENAVYYVDPPERPAIQQKERTPMDLFVRKLVYVDLCKRNANKILRQIQRLHWEEKEVVEILHKVFSRPGKAKYGNIHLLAGLLSALYRHHSSFVIGIVDGMVESITFGLELNDFRMNQKRLAEAKYLGEFYTYRLLEHPVIFDIMYKILTLGHGGAPVPGRINPIDLPDEYFRIRLVSTILETTGSYFSKGASGKKLDFFLAFFQFYIFTKNPLPMDIEFIVQDTFALIRPQWKLATDLEEAAKVFQVAVVKDLEDKAAASGAGKGASAVSAAGEAEGEQHDGPASDDESSDDEIGHGDDLAGGDVEVNIIDDELLSDEDGDDDDDEDDDGGRDSDRSGSESEDEEIVVTREEEQIDPEDEADFEREYARMMAESLESRKFERKPMFDLALPVRPKTTSQGQTNAEPGPNGHDNGREDGTPTMAFSLLTKRGNRQQTRTLELPSDSEFAVAMRNQQLAEREEQQRIKNLVLNLDLQSDEGEVPERATSYFHNRPDKGGKDRSQRVRKLQLSDVDWT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.48
3	0.46
4	0.43
5	0.42
6	0.42
7	0.39
8	0.43
9	0.5
10	0.55
11	0.57
12	0.6
13	0.61
14	0.58
15	0.6
16	0.57
17	0.53
18	0.46
19	0.44
20	0.4
21	0.35
22	0.31
23	0.32
24	0.3
25	0.27
26	0.24
27	0.2
28	0.16
29	0.11
30	0.1
31	0.08
32	0.09
33	0.1
34	0.1
35	0.1
36	0.15
37	0.15
38	0.14
39	0.14
40	0.14
41	0.13
42	0.17
43	0.19
44	0.17
45	0.18
46	0.19
47	0.19
48	0.17
49	0.18
50	0.18
51	0.23
52	0.22
53	0.21
54	0.24
55	0.26
56	0.29
57	0.31
58	0.29
59	0.27
60	0.26
61	0.25
62	0.23
63	0.21
64	0.17
65	0.14
66	0.1
67	0.06
68	0.07
69	0.09
70	0.09
71	0.11
72	0.12
73	0.13
74	0.15
75	0.17
76	0.21
77	0.19
78	0.22
79	0.21
80	0.23
81	0.22
82	0.21
83	0.19
84	0.15
85	0.14
86	0.1
87	0.1
88	0.08
89	0.08
90	0.07
91	0.1
92	0.13
93	0.14
94	0.15
95	0.21
96	0.27
97	0.29
98	0.33
99	0.31
100	0.3
101	0.33
102	0.35
103	0.38
104	0.35
105	0.4
106	0.38
107	0.44
108	0.47
109	0.46
110	0.48
111	0.46
112	0.43
113	0.42
114	0.48
115	0.45
116	0.46
117	0.47
118	0.46
119	0.45
120	0.44
121	0.41
122	0.34
123	0.31
124	0.26
125	0.22
126	0.19
127	0.14
128	0.13
129	0.1
130	0.1
131	0.09
132	0.08
133	0.09
134	0.08
135	0.08
136	0.09
137	0.1
138	0.1
139	0.15
140	0.17
141	0.18
142	0.2
143	0.21
144	0.21
145	0.21
146	0.23
147	0.21
148	0.21
149	0.21
150	0.19
151	0.2
152	0.19
153	0.22
154	0.26
155	0.26
156	0.27
157	0.26
158	0.29
159	0.3
160	0.32
161	0.34
162	0.3
163	0.31
164	0.34
165	0.41
166	0.38
167	0.36
168	0.38
169	0.39
170	0.37
171	0.35
172	0.29
173	0.21
174	0.22
175	0.21
176	0.17
177	0.11
178	0.11
179	0.1
180	0.11
181	0.11
182	0.14
183	0.15
184	0.15
185	0.17
186	0.18
187	0.19
188	0.2
189	0.2
190	0.19
191	0.19
192	0.19
193	0.17
194	0.15
195	0.14
196	0.12
197	0.11
198	0.09
199	0.09
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.11
204	0.09
205	0.09
206	0.09
207	0.08
208	0.08
209	0.08
210	0.07
211	0.04
212	0.05
213	0.05
214	0.06
215	0.07
216	0.08
217	0.09
218	0.1
219	0.12
220	0.12
221	0.13
222	0.12
223	0.13
224	0.13
225	0.13
226	0.12
227	0.11
228	0.12
229	0.12
230	0.12
231	0.16
232	0.16
233	0.23
234	0.25
235	0.27
236	0.3
237	0.39
238	0.43
239	0.39
240	0.37
241	0.31
242	0.32
243	0.29
244	0.27
245	0.17
246	0.13
247	0.13
248	0.13
249	0.12
250	0.09
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.05
257	0.06
258	0.08
259	0.08
260	0.08
261	0.08
262	0.08
263	0.09
264	0.1
265	0.09
266	0.07
267	0.08
268	0.08
269	0.09
270	0.09
271	0.09
272	0.09
273	0.09
274	0.09
275	0.14
276	0.15
277	0.18
278	0.22
279	0.26
280	0.28
281	0.3
282	0.37
283	0.33
284	0.36
285	0.39
286	0.39
287	0.4
288	0.41
289	0.4
290	0.35
291	0.34
292	0.35
293	0.31
294	0.28
295	0.25
296	0.27
297	0.27
298	0.3
299	0.3
300	0.25
301	0.25
302	0.28
303	0.3
304	0.33
305	0.35
306	0.36
307	0.4
308	0.4
309	0.38
310	0.36
311	0.34
312	0.3
313	0.3
314	0.26
315	0.23
316	0.22
317	0.21
318	0.2
319	0.19
320	0.15
321	0.14
322	0.18
323	0.18
324	0.21
325	0.24
326	0.25
327	0.29
328	0.33
329	0.33
330	0.28
331	0.38
332	0.42
333	0.42
334	0.44
335	0.43
336	0.4
337	0.42
338	0.42
339	0.33
340	0.26
341	0.24
342	0.2
343	0.15
344	0.14
345	0.1
346	0.07
347	0.06
348	0.05
349	0.04
350	0.04
351	0.03
352	0.05
353	0.04
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.06
358	0.07
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.07
368	0.06
369	0.07
370	0.07
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.06
376	0.06
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.09
381	0.09
382	0.09
383	0.08
384	0.09
385	0.08
386	0.09
387	0.08
388	0.08
389	0.07
390	0.07
391	0.09
392	0.13
393	0.15
394	0.15
395	0.15
396	0.17
397	0.17
398	0.17
399	0.18
400	0.19
401	0.18
402	0.2
403	0.2
404	0.19
405	0.2
406	0.22
407	0.18
408	0.13
409	0.11
410	0.09
411	0.11
412	0.13
413	0.13
414	0.15
415	0.23
416	0.24
417	0.26
418	0.27
419	0.24
420	0.26
421	0.31
422	0.34
423	0.33
424	0.39
425	0.42
426	0.45
427	0.48
428	0.44
429	0.39
430	0.32
431	0.3
432	0.24
433	0.22
434	0.2
435	0.23
436	0.26
437	0.28
438	0.28
439	0.25
440	0.25
441	0.21
442	0.19
443	0.13
444	0.1
445	0.11
446	0.1
447	0.1
448	0.09
449	0.09
450	0.11
451	0.11
452	0.11
453	0.08
454	0.08
455	0.07
456	0.07
457	0.06
458	0.05
459	0.05
460	0.06
461	0.09
462	0.11
463	0.12
464	0.12
465	0.11
466	0.11
467	0.12
468	0.12
469	0.09
470	0.08
471	0.09
472	0.09
473	0.09
474	0.1
475	0.12
476	0.12
477	0.11
478	0.11
479	0.1
480	0.12
481	0.12
482	0.1
483	0.08
484	0.07
485	0.06
486	0.07
487	0.07
488	0.08
489	0.11
490	0.12
491	0.13
492	0.13
493	0.15
494	0.14
495	0.14
496	0.12
497	0.09
498	0.09
499	0.1
500	0.1
501	0.09
502	0.09
503	0.08
504	0.11
505	0.12
506	0.14
507	0.12
508	0.16
509	0.21
510	0.25
511	0.33
512	0.32
513	0.33
514	0.35
515	0.37
516	0.34
517	0.35
518	0.4
519	0.36
520	0.38
521	0.39
522	0.36
523	0.38
524	0.38
525	0.33
526	0.26
527	0.25
528	0.22
529	0.26
530	0.26
531	0.22
532	0.23
533	0.21
534	0.19
535	0.18
536	0.18
537	0.14
538	0.13
539	0.15
540	0.13
541	0.13
542	0.13
543	0.13
544	0.1
545	0.09
546	0.09
547	0.06
548	0.06
549	0.07
550	0.07
551	0.07
552	0.06
553	0.08
554	0.08
555	0.09
556	0.08
557	0.08
558	0.08
559	0.09
560	0.17
561	0.19
562	0.24
563	0.31
564	0.36
565	0.4
566	0.46
567	0.47
568	0.45
569	0.51
570	0.5
571	0.47
572	0.45
573	0.4
574	0.37
575	0.37
576	0.31
577	0.22
578	0.19
579	0.13
580	0.11
581	0.12
582	0.11
583	0.1
584	0.1
585	0.1
586	0.11
587	0.11
588	0.1
589	0.1
590	0.08
591	0.09
592	0.09
593	0.1
594	0.08
595	0.1
596	0.1
597	0.1
598	0.11
599	0.09
600	0.08
601	0.08
602	0.09
603	0.09
604	0.09
605	0.11
606	0.1
607	0.11
608	0.12
609	0.11
610	0.1
611	0.09
612	0.08
613	0.06
614	0.06
615	0.07
616	0.06
617	0.05
618	0.06
619	0.06
620	0.06
621	0.06
622	0.07
623	0.06
624	0.06
625	0.11
626	0.18
627	0.21
628	0.23
629	0.24
630	0.3
631	0.33
632	0.33
633	0.31
634	0.26
635	0.26
636	0.24
637	0.23
638	0.17
639	0.19
640	0.25
641	0.25
642	0.26
643	0.27
644	0.29
645	0.28
646	0.29
647	0.32
648	0.33
649	0.33
650	0.36
651	0.39
652	0.4
653	0.41
654	0.39
655	0.32
656	0.24
657	0.22
658	0.16
659	0.09
660	0.06
661	0.05
662	0.05
663	0.05
664	0.04
665	0.04
666	0.06
667	0.07
668	0.07
669	0.09
670	0.11
671	0.11
672	0.12
673	0.2
674	0.26
675	0.31
676	0.38
677	0.4
678	0.47
679	0.47
680	0.48
681	0.42
682	0.38
683	0.38
684	0.36
685	0.33
686	0.28
687	0.28
688	0.25
689	0.24
690	0.22
691	0.17
692	0.17
693	0.23
694	0.26
695	0.28
696	0.31
697	0.32
698	0.36
699	0.41
700	0.42
701	0.4
702	0.44
703	0.51
704	0.53
705	0.57
706	0.56
707	0.54
708	0.57
709	0.56
710	0.5
711	0.41
712	0.38
713	0.34
714	0.31
715	0.27
716	0.18
717	0.14
718	0.12
719	0.13
720	0.11
721	0.14
722	0.13
723	0.12
724	0.15
725	0.18
726	0.23
727	0.26
728	0.3
729	0.34
730	0.37
731	0.41
732	0.42
733	0.47
734	0.45
735	0.42
736	0.38
737	0.29
738	0.27
739	0.22
740	0.17
741	0.09
742	0.05
743	0.03
744	0.03
745	0.04
746	0.05
747	0.07
748	0.07
749	0.09
750	0.09
751	0.1
752	0.11
753	0.12
754	0.1
755	0.09
756	0.09
757	0.07
758	0.07
759	0.06
760	0.05
761	0.03
762	0.02
763	0.02
764	0.02
765	0.02
766	0.02
767	0.03
768	0.03
769	0.04
770	0.05
771	0.07
772	0.09
773	0.1
774	0.12
775	0.2
776	0.22
777	0.24
778	0.25
779	0.29
780	0.31
781	0.34
782	0.36
783	0.29
784	0.31
785	0.3
786	0.29
787	0.23
788	0.21
789	0.17
790	0.16
791	0.21
792	0.18
793	0.16
794	0.17
795	0.2
796	0.2
797	0.21
798	0.2
799	0.13
800	0.14
801	0.13
802	0.13
803	0.11
804	0.09
805	0.09
806	0.07
807	0.07
808	0.06
809	0.07
810	0.06
811	0.07
812	0.06
813	0.07
814	0.07
815	0.09
816	0.09
817	0.1
818	0.1
819	0.1
820	0.12
821	0.12
822	0.14
823	0.13
824	0.15
825	0.17
826	0.16
827	0.19
828	0.18
829	0.21
830	0.19
831	0.19
832	0.16
833	0.15
834	0.14
835	0.11
836	0.11
837	0.1
838	0.1
839	0.11
840	0.11
841	0.1
842	0.1
843	0.11
844	0.13
845	0.11
846	0.11
847	0.1
848	0.1
849	0.15
850	0.17
851	0.18
852	0.21
853	0.25
854	0.27
855	0.3
856	0.31
857	0.27
858	0.26
859	0.24
860	0.22
861	0.21
862	0.19
863	0.16
864	0.15
865	0.15
866	0.15
867	0.2
868	0.16
869	0.16
870	0.17
871	0.2
872	0.21
873	0.21
874	0.24
875	0.18
876	0.23
877	0.21
878	0.2
879	0.17
880	0.17
881	0.16
882	0.12
883	0.11
884	0.06
885	0.06
886	0.06
887	0.08
888	0.07
889	0.12
890	0.14
891	0.17
892	0.18
893	0.18
894	0.2
895	0.21
896	0.25
897	0.21
898	0.22
899	0.2
900	0.2
901	0.2
902	0.17
903	0.16
904	0.11
905	0.09
906	0.08
907	0.1
908	0.09
909	0.11
910	0.11
911	0.11
912	0.12
913	0.13
914	0.12
915	0.09
916	0.09
917	0.08
918	0.08
919	0.08
920	0.07
921	0.08
922	0.08
923	0.08
924	0.08
925	0.07
926	0.07
927	0.07
928	0.06
929	0.05
930	0.04
931	0.04
932	0.04
933	0.04
934	0.04
935	0.04
936	0.05
937	0.06
938	0.07
939	0.07
940	0.07
941	0.07
942	0.08
943	0.09
944	0.09
945	0.09
946	0.08
947	0.08
948	0.1
949	0.12
950	0.13
951	0.12
952	0.11
953	0.1
954	0.1
955	0.1
956	0.09
957	0.07
958	0.05
959	0.05
960	0.06
961	0.06
962	0.05
963	0.05
964	0.05
965	0.04
966	0.05
967	0.04
968	0.04
969	0.04
970	0.04
971	0.04
972	0.03
973	0.04
974	0.05
975	0.06
976	0.05
977	0.05
978	0.05
979	0.06
980	0.06
981	0.07
982	0.06
983	0.06
984	0.07
985	0.07
986	0.07
987	0.07
988	0.07
989	0.06
990	0.07
991	0.06
992	0.07
993	0.07
994	0.07
995	0.11
996	0.11
997	0.13
998	0.14
999	0.15
1000	0.17
1001	0.18
1002	0.19
1003	0.16
1004	0.15
1005	0.13
1006	0.13
1007	0.11
1008	0.1
1009	0.09
1010	0.09
1011	0.1
1012	0.12
1013	0.12
1014	0.13
1015	0.16
1016	0.17
1017	0.17
1018	0.16
1019	0.14
1020	0.13
1021	0.14
1022	0.14
1023	0.11
1024	0.1
1025	0.1
1026	0.1
1027	0.11
1028	0.11
1029	0.11
1030	0.09
1031	0.09
1032	0.1
1033	0.11
1034	0.15
1035	0.17
1036	0.21
1037	0.22
1038	0.25
1039	0.32
1040	0.33
1041	0.4
1042	0.45
1043	0.46
1044	0.48
1045	0.54
1046	0.55
1047	0.49
1048	0.53
1049	0.49
1050	0.48
1051	0.45
1052	0.4
1053	0.35
1054	0.32
1055	0.32
1056	0.31
1057	0.36
1058	0.36
1059	0.4
1060	0.48
1061	0.5
1062	0.52
1063	0.54
1064	0.51
1065	0.42
1066	0.34
1067	0.29
1068	0.27
1069	0.27
1070	0.25
1071	0.24
1072	0.26
1073	0.27
1074	0.31
1075	0.33
1076	0.26
1077	0.25
1078	0.24
1079	0.25
1080	0.2
1081	0.18
1082	0.14
1083	0.13
1084	0.12
1085	0.12
1086	0.18
1087	0.22
1088	0.27
1089	0.29
1090	0.35
1091	0.44
1092	0.55
1093	0.61
1094	0.61
1095	0.64
1096	0.66
1097	0.7
1098	0.67
1099	0.62
1100	0.55
1101	0.49
1102	0.45
1103	0.38
1104	0.33
1105	0.25
1106	0.22
1107	0.18
1108	0.14
1109	0.17
1110	0.14
1111	0.16
1112	0.17
1113	0.19
1114	0.19
1115	0.22
1116	0.26
1117	0.26
1118	0.31
1119	0.33
1120	0.35
1121	0.42
1122	0.48
1123	0.48
1124	0.52
1125	0.52
1126	0.49
1127	0.47
1128	0.44
1129	0.41
1130	0.38
1131	0.37
1132	0.3
1133	0.29
1134	0.26
1135	0.21
1136	0.19
1137	0.16
1138	0.13
1139	0.11
1140	0.12
1141	0.1
1142	0.11
1143	0.12
1144	0.12
1145	0.11
1146	0.13
1147	0.17
1148	0.24
1149	0.32
1150	0.4
1151	0.49
1152	0.49
1153	0.56
1154	0.63
1155	0.67
1156	0.67
1157	0.69
1158	0.69
1159	0.7
1160	0.79
1161	0.83
1162	0.84
1163	0.85
1164	0.86
1165	0.86
1166	0.84
1167	0.8
1168	0.77
1169	0.74

S3CP31

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer