Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3D225

Protein Details
Accession S3D225    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1226-1246GNGGRRGRQGRNRDISPRQFHBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, extr 7, cyto_nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR033133  PUM-HD  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MANPSRSDLTLNSFPILGGQQARSTSPATSNPSPIDPTAASAASRTAFGLPPPGLGVGSKIGASRSSAGSPSHEMGGSSRLYKRAREIQAQEGIPSNSVNLWPGPPTSGNSTPLRETIPESPTDGFPEFPQLPSTSDFFPAGRRARAGTVPSRFSPGGAGIPPLAAQAVPGALPKSSRPTPSQTPYQSASPGLDSMDGGVSSAASSSSALLSRLRAGSMPQRSPFVQTPSSMSPFGPSIFSSWNPTTRERGSTLASIASLGSNGPSSPAQSAFSREGTGEDGAHMRTLDYLGLAETPQPVRATLATPYIPNYQEFPGLASRFRSYSVNNKDKYQDDEDDYEDDAYASYPADYAAVQGHLQEQFNATQAAIHHHNLAVQAFATQAISRPRARTAGVLDAPGSRLRGGYIPTPSRLDSTMTAADIQLPEEKDFDEQLSMAVAGMSLGRSNSRNNNTAAGGAAAGLLSADEPGLEGPTSALWLGSIPTSTTTSTLTEIFKSHGPILSARVLTLKNCGFVNFERVESAISAKNSLNGKEIFPGAGPVRINFAKPPSSSNTPGHDGAFPSPSPDPFAASEGRVPGIGAVPGAPSSAGPTTPGVEAASAGAPAGADAATSVGAAGLNVIPPAVSSPASLNEISNDIMKIVVQFGASDEDAYRISSSLNRAIQFTNFVDEIPTVPEPSSSRVYDAPKLRDIRKRIDNQSLSQADIERIAIEMLPEIAELASDYLGNTVVQKLFEHCSDDLRDAMLAEIAPHIAEIGVHKNGTWAAQKIIDVCKTPQQMTLIAESVRPYTLPLFLDQYGNYVLQGCLKFGAPYTDYIFETMMSRLWEVAQGRFGARAMRACLESHHATKDQQRMLAAVIALNSVQLATNANGALLLTWFLDTCTFPQRRTVLAPQLVPYLVHLCTHKVAYLTVLKVVNQKAEPEARDTILQALFSPQNDSVLEAILNDSASGSTLIYKVITTPFFEESFRGEIVDSVKNVLVRIKAQPSQGYKRLMDEVGLSTRGSGGNSGDRNGGGGGSSVRDHSTSNEKQRPSSRQANGHHHQNQGQQPGQSQQSLQHQQQAAQQPQQRTPPHSNQAPFNNGGPGPYFNASPNAPGYDAGYAMPRGDGGVDTSLPPPHFPPYNGQGQMYGAPPMQMPPYQQMGRGYYPPAMQASGFNYNGSGASVPPADAYRNGTGGALPPVGGLAGQASYGYNNMGGAPYGYGGPGGPPPYMGGDGSGAGGNGGRRGRQGRNRDISPRQFH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.24
4 0.2
5 0.18
6 0.18
7 0.2
8 0.21
9 0.23
10 0.23
11 0.24
12 0.23
13 0.24
14 0.28
15 0.33
16 0.35
17 0.39
18 0.4
19 0.41
20 0.42
21 0.38
22 0.36
23 0.28
24 0.27
25 0.26
26 0.24
27 0.21
28 0.18
29 0.2
30 0.15
31 0.16
32 0.14
33 0.13
34 0.13
35 0.14
36 0.2
37 0.18
38 0.18
39 0.19
40 0.18
41 0.16
42 0.15
43 0.17
44 0.12
45 0.13
46 0.13
47 0.12
48 0.13
49 0.13
50 0.16
51 0.17
52 0.17
53 0.19
54 0.21
55 0.21
56 0.24
57 0.28
58 0.27
59 0.27
60 0.24
61 0.22
62 0.21
63 0.24
64 0.22
65 0.22
66 0.23
67 0.29
68 0.31
69 0.34
70 0.4
71 0.46
72 0.51
73 0.56
74 0.58
75 0.58
76 0.64
77 0.61
78 0.55
79 0.49
80 0.43
81 0.34
82 0.29
83 0.22
84 0.15
85 0.15
86 0.16
87 0.12
88 0.13
89 0.14
90 0.15
91 0.17
92 0.17
93 0.2
94 0.26
95 0.28
96 0.32
97 0.34
98 0.37
99 0.36
100 0.36
101 0.35
102 0.29
103 0.3
104 0.31
105 0.3
106 0.28
107 0.29
108 0.29
109 0.28
110 0.31
111 0.27
112 0.22
113 0.2
114 0.26
115 0.24
116 0.23
117 0.24
118 0.21
119 0.23
120 0.24
121 0.26
122 0.2
123 0.22
124 0.22
125 0.2
126 0.23
127 0.28
128 0.3
129 0.3
130 0.3
131 0.3
132 0.33
133 0.37
134 0.39
135 0.39
136 0.41
137 0.43
138 0.43
139 0.46
140 0.42
141 0.38
142 0.34
143 0.27
144 0.24
145 0.21
146 0.21
147 0.15
148 0.15
149 0.15
150 0.13
151 0.11
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.1
161 0.12
162 0.19
163 0.23
164 0.27
165 0.3
166 0.37
167 0.46
168 0.51
169 0.58
170 0.55
171 0.56
172 0.54
173 0.53
174 0.47
175 0.4
176 0.35
177 0.27
178 0.23
179 0.18
180 0.15
181 0.12
182 0.11
183 0.11
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.07
195 0.07
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.14
200 0.15
201 0.15
202 0.14
203 0.16
204 0.24
205 0.31
206 0.35
207 0.34
208 0.37
209 0.37
210 0.43
211 0.44
212 0.41
213 0.35
214 0.31
215 0.35
216 0.36
217 0.39
218 0.34
219 0.29
220 0.25
221 0.24
222 0.24
223 0.2
224 0.15
225 0.14
226 0.16
227 0.17
228 0.22
229 0.24
230 0.29
231 0.31
232 0.33
233 0.37
234 0.37
235 0.39
236 0.35
237 0.35
238 0.33
239 0.31
240 0.29
241 0.24
242 0.2
243 0.17
244 0.14
245 0.11
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.09
254 0.11
255 0.12
256 0.14
257 0.14
258 0.19
259 0.2
260 0.21
261 0.2
262 0.19
263 0.19
264 0.19
265 0.19
266 0.14
267 0.12
268 0.13
269 0.12
270 0.13
271 0.12
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.09
283 0.1
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.13
288 0.14
289 0.15
290 0.14
291 0.17
292 0.16
293 0.16
294 0.19
295 0.22
296 0.22
297 0.21
298 0.22
299 0.19
300 0.2
301 0.19
302 0.18
303 0.2
304 0.2
305 0.2
306 0.2
307 0.2
308 0.19
309 0.21
310 0.21
311 0.19
312 0.28
313 0.37
314 0.43
315 0.43
316 0.46
317 0.49
318 0.49
319 0.52
320 0.47
321 0.41
322 0.36
323 0.37
324 0.35
325 0.32
326 0.31
327 0.25
328 0.19
329 0.15
330 0.11
331 0.09
332 0.07
333 0.06
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.1
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.13
351 0.13
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.15
356 0.16
357 0.17
358 0.16
359 0.16
360 0.17
361 0.17
362 0.16
363 0.12
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.05
370 0.09
371 0.12
372 0.17
373 0.19
374 0.21
375 0.23
376 0.24
377 0.25
378 0.25
379 0.24
380 0.27
381 0.26
382 0.24
383 0.23
384 0.21
385 0.22
386 0.2
387 0.17
388 0.1
389 0.09
390 0.09
391 0.11
392 0.12
393 0.15
394 0.2
395 0.22
396 0.24
397 0.26
398 0.26
399 0.25
400 0.24
401 0.23
402 0.17
403 0.19
404 0.18
405 0.16
406 0.16
407 0.14
408 0.15
409 0.12
410 0.12
411 0.11
412 0.11
413 0.12
414 0.12
415 0.12
416 0.12
417 0.12
418 0.12
419 0.09
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.05
425 0.05
426 0.04
427 0.03
428 0.04
429 0.04
430 0.03
431 0.04
432 0.06
433 0.07
434 0.11
435 0.18
436 0.23
437 0.26
438 0.27
439 0.29
440 0.28
441 0.27
442 0.24
443 0.16
444 0.12
445 0.08
446 0.07
447 0.04
448 0.04
449 0.03
450 0.03
451 0.02
452 0.02
453 0.02
454 0.02
455 0.02
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.03
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.06
472 0.07
473 0.08
474 0.08
475 0.09
476 0.1
477 0.11
478 0.13
479 0.13
480 0.12
481 0.13
482 0.14
483 0.14
484 0.15
485 0.14
486 0.14
487 0.14
488 0.14
489 0.16
490 0.18
491 0.17
492 0.15
493 0.16
494 0.15
495 0.15
496 0.19
497 0.16
498 0.14
499 0.15
500 0.15
501 0.15
502 0.15
503 0.21
504 0.17
505 0.17
506 0.15
507 0.15
508 0.15
509 0.13
510 0.14
511 0.11
512 0.11
513 0.13
514 0.12
515 0.17
516 0.18
517 0.18
518 0.19
519 0.17
520 0.18
521 0.17
522 0.18
523 0.13
524 0.12
525 0.13
526 0.1
527 0.12
528 0.12
529 0.1
530 0.14
531 0.14
532 0.15
533 0.14
534 0.16
535 0.17
536 0.17
537 0.2
538 0.22
539 0.26
540 0.3
541 0.32
542 0.33
543 0.33
544 0.33
545 0.31
546 0.27
547 0.23
548 0.2
549 0.19
550 0.15
551 0.14
552 0.13
553 0.12
554 0.14
555 0.13
556 0.13
557 0.12
558 0.14
559 0.13
560 0.12
561 0.13
562 0.11
563 0.12
564 0.1
565 0.09
566 0.07
567 0.06
568 0.06
569 0.05
570 0.04
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.03
576 0.05
577 0.05
578 0.05
579 0.06
580 0.06
581 0.08
582 0.08
583 0.08
584 0.07
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.04
590 0.04
591 0.03
592 0.03
593 0.03
594 0.03
595 0.02
596 0.02
597 0.02
598 0.03
599 0.03
600 0.03
601 0.03
602 0.02
603 0.02
604 0.02
605 0.03
606 0.03
607 0.03
608 0.03
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.03
613 0.04
614 0.04
615 0.05
616 0.06
617 0.07
618 0.09
619 0.1
620 0.09
621 0.09
622 0.1
623 0.1
624 0.09
625 0.08
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.05
630 0.05
631 0.05
632 0.04
633 0.04
634 0.05
635 0.07
636 0.07
637 0.07
638 0.06
639 0.07
640 0.07
641 0.08
642 0.07
643 0.05
644 0.06
645 0.08
646 0.1
647 0.14
648 0.16
649 0.16
650 0.18
651 0.18
652 0.18
653 0.19
654 0.17
655 0.15
656 0.12
657 0.11
658 0.11
659 0.1
660 0.1
661 0.1
662 0.1
663 0.08
664 0.08
665 0.09
666 0.1
667 0.13
668 0.16
669 0.14
670 0.15
671 0.19
672 0.22
673 0.26
674 0.31
675 0.3
676 0.33
677 0.36
678 0.4
679 0.43
680 0.45
681 0.46
682 0.5
683 0.54
684 0.54
685 0.59
686 0.56
687 0.51
688 0.56
689 0.49
690 0.41
691 0.34
692 0.29
693 0.2
694 0.18
695 0.16
696 0.07
697 0.07
698 0.06
699 0.05
700 0.04
701 0.04
702 0.04
703 0.04
704 0.03
705 0.03
706 0.03
707 0.03
708 0.03
709 0.03
710 0.03
711 0.03
712 0.03
713 0.04
714 0.04
715 0.04
716 0.05
717 0.06
718 0.06
719 0.07
720 0.07
721 0.09
722 0.11
723 0.11
724 0.15
725 0.13
726 0.16
727 0.17
728 0.17
729 0.15
730 0.14
731 0.13
732 0.1
733 0.1
734 0.07
735 0.05
736 0.05
737 0.05
738 0.04
739 0.04
740 0.04
741 0.04
742 0.03
743 0.03
744 0.04
745 0.08
746 0.09
747 0.09
748 0.09
749 0.1
750 0.1
751 0.12
752 0.13
753 0.11
754 0.11
755 0.13
756 0.13
757 0.15
758 0.18
759 0.18
760 0.17
761 0.17
762 0.22
763 0.24
764 0.24
765 0.24
766 0.22
767 0.23
768 0.23
769 0.23
770 0.19
771 0.16
772 0.16
773 0.14
774 0.14
775 0.11
776 0.1
777 0.09
778 0.08
779 0.1
780 0.1
781 0.11
782 0.13
783 0.14
784 0.15
785 0.14
786 0.15
787 0.14
788 0.13
789 0.12
790 0.1
791 0.09
792 0.12
793 0.12
794 0.11
795 0.11
796 0.11
797 0.11
798 0.1
799 0.14
800 0.1
801 0.12
802 0.15
803 0.16
804 0.16
805 0.17
806 0.16
807 0.13
808 0.14
809 0.12
810 0.11
811 0.09
812 0.09
813 0.08
814 0.08
815 0.12
816 0.12
817 0.12
818 0.13
819 0.13
820 0.13
821 0.14
822 0.14
823 0.13
824 0.13
825 0.14
826 0.14
827 0.15
828 0.16
829 0.16
830 0.17
831 0.2
832 0.22
833 0.22
834 0.23
835 0.23
836 0.25
837 0.31
838 0.38
839 0.34
840 0.32
841 0.3
842 0.28
843 0.27
844 0.26
845 0.19
846 0.12
847 0.1
848 0.08
849 0.08
850 0.07
851 0.06
852 0.04
853 0.04
854 0.04
855 0.05
856 0.06
857 0.07
858 0.07
859 0.07
860 0.07
861 0.07
862 0.06
863 0.05
864 0.05
865 0.04
866 0.04
867 0.04
868 0.05
869 0.06
870 0.07
871 0.09
872 0.17
873 0.18
874 0.19
875 0.25
876 0.27
877 0.28
878 0.33
879 0.37
880 0.36
881 0.39
882 0.4
883 0.35
884 0.35
885 0.33
886 0.27
887 0.22
888 0.16
889 0.13
890 0.13
891 0.13
892 0.13
893 0.15
894 0.15
895 0.15
896 0.13
897 0.13
898 0.15
899 0.18
900 0.17
901 0.19
902 0.2
903 0.2
904 0.25
905 0.26
906 0.26
907 0.22
908 0.23
909 0.23
910 0.27
911 0.27
912 0.26
913 0.27
914 0.24
915 0.24
916 0.23
917 0.23
918 0.19
919 0.18
920 0.13
921 0.15
922 0.15
923 0.15
924 0.18
925 0.14
926 0.15
927 0.15
928 0.16
929 0.13
930 0.12
931 0.11
932 0.08
933 0.09
934 0.07
935 0.07
936 0.06
937 0.06
938 0.05
939 0.06
940 0.06
941 0.05
942 0.06
943 0.06
944 0.07
945 0.07
946 0.07
947 0.08
948 0.11
949 0.12
950 0.13
951 0.15
952 0.18
953 0.18
954 0.19
955 0.19
956 0.18
957 0.2
958 0.18
959 0.16
960 0.13
961 0.14
962 0.17
963 0.19
964 0.16
965 0.15
966 0.17
967 0.17
968 0.17
969 0.18
970 0.17
971 0.16
972 0.22
973 0.26
974 0.28
975 0.31
976 0.37
977 0.41
978 0.47
979 0.51
980 0.51
981 0.46
982 0.46
983 0.46
984 0.4
985 0.33
986 0.27
987 0.24
988 0.21
989 0.21
990 0.18
991 0.15
992 0.15
993 0.15
994 0.13
995 0.11
996 0.11
997 0.16
998 0.18
999 0.19
1000 0.19
1001 0.18
1002 0.19
1003 0.18
1004 0.15
1005 0.09
1006 0.08
1007 0.08
1008 0.08
1009 0.09
1010 0.09
1011 0.1
1012 0.11
1013 0.11
1014 0.14
1015 0.23
1016 0.29
1017 0.39
1018 0.46
1019 0.47
1020 0.53
1021 0.6
1022 0.64
1023 0.63
1024 0.65
1025 0.62
1026 0.64
1027 0.7
1028 0.74
1029 0.71
1030 0.74
1031 0.72
1032 0.66
1033 0.64
1034 0.62
1035 0.6
1036 0.58
1037 0.55
1038 0.46
1039 0.42
1040 0.43
1041 0.41
1042 0.34
1043 0.29
1044 0.27
1045 0.34
1046 0.39
1047 0.38
1048 0.41
1049 0.39
1050 0.4
1051 0.47
1052 0.51
1053 0.46
1054 0.46
1055 0.5
1056 0.48
1057 0.52
1058 0.58
1059 0.55
1060 0.54
1061 0.58
1062 0.59
1063 0.63
1064 0.66
1065 0.64
1066 0.63
1067 0.65
1068 0.63
1069 0.56
1070 0.48
1071 0.44
1072 0.37
1073 0.34
1074 0.29
1075 0.23
1076 0.22
1077 0.21
1078 0.2
1079 0.17
1080 0.21
1081 0.2
1082 0.21
1083 0.21
1084 0.19
1085 0.19
1086 0.18
1087 0.18
1088 0.15
1089 0.15
1090 0.13
1091 0.14
1092 0.12
1093 0.12
1094 0.11
1095 0.09
1096 0.09
1097 0.09
1098 0.09
1099 0.08
1100 0.1
1101 0.1
1102 0.12
1103 0.14
1104 0.18
1105 0.18
1106 0.19
1107 0.19
1108 0.22
1109 0.25
1110 0.25
1111 0.31
1112 0.33
1113 0.41
1114 0.42
1115 0.4
1116 0.36
1117 0.34
1118 0.35
1119 0.29
1120 0.26
1121 0.16
1122 0.15
1123 0.15
1124 0.16
1125 0.17
1126 0.16
1127 0.18
1128 0.2
1129 0.27
1130 0.28
1131 0.31
1132 0.34
1133 0.36
1134 0.38
1135 0.38
1136 0.36
1137 0.32
1138 0.32
1139 0.31
1140 0.28
1141 0.24
1142 0.2
1143 0.2
1144 0.23
1145 0.26
1146 0.26
1147 0.23
1148 0.22
1149 0.21
1150 0.21
1151 0.19
1152 0.15
1153 0.08
1154 0.1
1155 0.11
1156 0.11
1157 0.12
1158 0.13
1159 0.13
1160 0.15
1161 0.2
1162 0.2
1163 0.2
1164 0.2
1165 0.19
1166 0.19
1167 0.2
1168 0.21
1169 0.16
1170 0.13
1171 0.12
1172 0.12
1173 0.11
1174 0.1
1175 0.07
1176 0.05
1177 0.05
1178 0.05
1179 0.05
1180 0.06
1181 0.07
1182 0.08
1183 0.08
1184 0.07
1185 0.07
1186 0.08
1187 0.08
1188 0.08
1189 0.08
1190 0.08
1191 0.08
1192 0.08
1193 0.08
1194 0.08
1195 0.07
1196 0.09
1197 0.12
1198 0.13
1199 0.13
1200 0.13
1201 0.14
1202 0.17
1203 0.18
1204 0.17
1205 0.14
1206 0.13
1207 0.14
1208 0.14
1209 0.13
1210 0.1
1211 0.09
1212 0.1
1213 0.1
1214 0.14
1215 0.15
1216 0.16
1217 0.21
1218 0.28
1219 0.38
1220 0.46
1221 0.55
1222 0.61
1223 0.68
1224 0.74
1225 0.77
1226 0.81