Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CPD4

Protein Details
Accession S3CPD4    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
800-819KHTGGRNKTAWKRARKSSGHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
803-826GGRNKTAWKRARKSSGHVAHFGKR
Subcellular Location(s) extr 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024535  Pectate_lyase_SF_prot  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
IPR039279  QRT3-like  
Gene Ontology GO:0004650  F:polygalacturonase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12708  Pectate_lyase_3  
Amino Acid Sequences MHLLRGIGLLAICFKATLVQAQAAASTPYWMEGIAHNGIASFNTDKSYTVFRNVKDYGAVGDGVTDDTNAINAAIAAGSRCGGISGCAGSTTTPAVIYFPSGTYMISGSIVNYYYTQIIGDPRTMPTIKATANFIPSIIGMIDGDVYSNGKLKYTSTNVFFRQIRNIRFDTTLVPGIVTAVHWPSAQATSIQNCVFVLSPDPSRQHTGIFMEEGSGGLLNDLVFYGGTYGCQLGNQQYTMRNLTFFNSHTAILQIWNWAWTYKSIYVYDCQVGLNMSGPIIGSVTLVDSLFHNTPTGIISGRSPTTQSNPGAGSLIMENVIFRQVDVAVMGPQGTVVAGDQSGTVVKKGFAYGNIYVPNGPNVYQAFDDAYFPELADLRLGNKYFERSKPQYDNVPVANFITARQFGAKGDGVTDDTVALNNLFRKASDDFTDAVAFVDAGFYLVTDTIRIPPNVRIVGEAMASVILGSGTKFQDMNAPYPVVQVGHPGEKGYVEWSDMIVSTQGPTAGAVAIEYNLETPTGPCTASNPPSGMWDVHVRVGGFAGSQLQVSQCSKTPELANYVNPACVALYTGLHITKDASNLYMENNWVWVADHDIEDPESAQVSVFGGRGILIESAKGRIWLVASCAEHFVKYQYQLANTHNIWMGLIQSETPYYQPNPPAPAPFYPVNASIHDPDFAADCSAAPGANATQLAGNPPCAMAWGLRMVNSHNHAARLDAFFRINAVMRQQQPGDGSGPQDGFYNQGSLGMDFEVGNTSIQSESEVEGESEGERETERESGYICFGNWQELCSGKMGSSKHTGGRNKTAWKRARKSSGHVAHFGKRENRARIVQRAAVSVNSTTTFTTTSMQSTQSPTMTTSMLPTLGTSFPLPVPSQTDCNFDYIW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.1
3 0.11
4 0.14
5 0.15
6 0.16
7 0.17
8 0.18
9 0.18
10 0.17
11 0.17
12 0.14
13 0.12
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.15
21 0.15
22 0.15
23 0.14
24 0.14
25 0.14
26 0.14
27 0.15
28 0.12
29 0.12
30 0.14
31 0.15
32 0.15
33 0.18
34 0.25
35 0.24
36 0.31
37 0.36
38 0.35
39 0.43
40 0.43
41 0.42
42 0.36
43 0.34
44 0.27
45 0.23
46 0.22
47 0.14
48 0.13
49 0.12
50 0.12
51 0.11
52 0.09
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.11
79 0.1
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.12
85 0.11
86 0.1
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.08
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.1
105 0.14
106 0.15
107 0.17
108 0.17
109 0.17
110 0.23
111 0.23
112 0.22
113 0.22
114 0.25
115 0.24
116 0.25
117 0.28
118 0.26
119 0.29
120 0.28
121 0.24
122 0.2
123 0.18
124 0.17
125 0.12
126 0.1
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.14
140 0.2
141 0.26
142 0.3
143 0.31
144 0.38
145 0.39
146 0.46
147 0.46
148 0.42
149 0.46
150 0.49
151 0.48
152 0.48
153 0.48
154 0.44
155 0.44
156 0.42
157 0.34
158 0.31
159 0.3
160 0.23
161 0.2
162 0.17
163 0.15
164 0.14
165 0.12
166 0.1
167 0.08
168 0.09
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.12
175 0.14
176 0.15
177 0.2
178 0.2
179 0.18
180 0.17
181 0.18
182 0.16
183 0.13
184 0.14
185 0.12
186 0.15
187 0.19
188 0.21
189 0.23
190 0.28
191 0.28
192 0.26
193 0.26
194 0.26
195 0.23
196 0.22
197 0.18
198 0.15
199 0.14
200 0.13
201 0.1
202 0.08
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.11
221 0.13
222 0.14
223 0.15
224 0.18
225 0.21
226 0.25
227 0.24
228 0.21
229 0.2
230 0.21
231 0.21
232 0.19
233 0.21
234 0.18
235 0.18
236 0.17
237 0.17
238 0.16
239 0.14
240 0.14
241 0.11
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.15
249 0.16
250 0.19
251 0.19
252 0.2
253 0.22
254 0.24
255 0.23
256 0.19
257 0.16
258 0.13
259 0.12
260 0.11
261 0.11
262 0.08
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.1
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.11
288 0.12
289 0.12
290 0.13
291 0.14
292 0.17
293 0.23
294 0.22
295 0.22
296 0.22
297 0.22
298 0.21
299 0.19
300 0.15
301 0.1
302 0.09
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.05
307 0.07
308 0.06
309 0.05
310 0.06
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.14
339 0.15
340 0.17
341 0.18
342 0.18
343 0.17
344 0.17
345 0.17
346 0.13
347 0.12
348 0.11
349 0.1
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.09
357 0.1
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.1
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.15
371 0.18
372 0.22
373 0.28
374 0.3
375 0.36
376 0.4
377 0.42
378 0.45
379 0.43
380 0.44
381 0.37
382 0.34
383 0.27
384 0.23
385 0.21
386 0.14
387 0.12
388 0.11
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.09
394 0.12
395 0.12
396 0.09
397 0.1
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.05
407 0.05
408 0.06
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.1
413 0.11
414 0.13
415 0.14
416 0.15
417 0.15
418 0.16
419 0.16
420 0.13
421 0.12
422 0.1
423 0.07
424 0.05
425 0.04
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.04
434 0.04
435 0.07
436 0.09
437 0.1
438 0.11
439 0.13
440 0.17
441 0.18
442 0.17
443 0.15
444 0.14
445 0.15
446 0.13
447 0.11
448 0.07
449 0.06
450 0.05
451 0.04
452 0.03
453 0.02
454 0.02
455 0.03
456 0.05
457 0.05
458 0.06
459 0.06
460 0.07
461 0.12
462 0.14
463 0.16
464 0.15
465 0.16
466 0.15
467 0.16
468 0.16
469 0.11
470 0.09
471 0.1
472 0.1
473 0.11
474 0.11
475 0.11
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.09
480 0.08
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.06
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.06
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.1
512 0.15
513 0.18
514 0.19
515 0.18
516 0.17
517 0.19
518 0.21
519 0.18
520 0.14
521 0.15
522 0.15
523 0.15
524 0.16
525 0.14
526 0.13
527 0.13
528 0.11
529 0.07
530 0.06
531 0.06
532 0.05
533 0.05
534 0.06
535 0.06
536 0.08
537 0.09
538 0.11
539 0.12
540 0.16
541 0.16
542 0.19
543 0.2
544 0.19
545 0.24
546 0.25
547 0.23
548 0.24
549 0.24
550 0.21
551 0.19
552 0.17
553 0.12
554 0.1
555 0.09
556 0.06
557 0.05
558 0.06
559 0.08
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.09
564 0.1
565 0.11
566 0.11
567 0.1
568 0.1
569 0.11
570 0.12
571 0.11
572 0.11
573 0.09
574 0.1
575 0.09
576 0.08
577 0.08
578 0.07
579 0.09
580 0.09
581 0.1
582 0.1
583 0.1
584 0.1
585 0.1
586 0.1
587 0.07
588 0.07
589 0.06
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.06
594 0.06
595 0.06
596 0.05
597 0.05
598 0.06
599 0.06
600 0.07
601 0.06
602 0.07
603 0.07
604 0.09
605 0.09
606 0.1
607 0.09
608 0.09
609 0.1
610 0.09
611 0.11
612 0.14
613 0.15
614 0.15
615 0.18
616 0.18
617 0.17
618 0.17
619 0.17
620 0.16
621 0.17
622 0.21
623 0.19
624 0.22
625 0.25
626 0.27
627 0.31
628 0.28
629 0.28
630 0.25
631 0.23
632 0.2
633 0.17
634 0.15
635 0.09
636 0.09
637 0.07
638 0.06
639 0.07
640 0.08
641 0.08
642 0.11
643 0.12
644 0.16
645 0.21
646 0.23
647 0.28
648 0.3
649 0.32
650 0.32
651 0.32
652 0.33
653 0.3
654 0.29
655 0.26
656 0.27
657 0.25
658 0.24
659 0.25
660 0.22
661 0.21
662 0.2
663 0.17
664 0.15
665 0.15
666 0.13
667 0.11
668 0.09
669 0.08
670 0.08
671 0.09
672 0.08
673 0.06
674 0.07
675 0.06
676 0.08
677 0.08
678 0.07
679 0.08
680 0.08
681 0.12
682 0.12
683 0.13
684 0.11
685 0.11
686 0.11
687 0.11
688 0.11
689 0.08
690 0.09
691 0.13
692 0.13
693 0.15
694 0.16
695 0.17
696 0.22
697 0.24
698 0.28
699 0.24
700 0.26
701 0.25
702 0.26
703 0.27
704 0.25
705 0.23
706 0.2
707 0.2
708 0.18
709 0.19
710 0.19
711 0.17
712 0.15
713 0.18
714 0.23
715 0.24
716 0.29
717 0.28
718 0.29
719 0.28
720 0.29
721 0.27
722 0.21
723 0.2
724 0.2
725 0.2
726 0.17
727 0.17
728 0.15
729 0.15
730 0.15
731 0.14
732 0.11
733 0.13
734 0.13
735 0.12
736 0.13
737 0.11
738 0.11
739 0.09
740 0.1
741 0.09
742 0.09
743 0.09
744 0.08
745 0.09
746 0.08
747 0.08
748 0.09
749 0.09
750 0.09
751 0.1
752 0.11
753 0.1
754 0.1
755 0.11
756 0.1
757 0.09
758 0.08
759 0.08
760 0.07
761 0.08
762 0.1
763 0.12
764 0.12
765 0.12
766 0.14
767 0.14
768 0.17
769 0.17
770 0.15
771 0.17
772 0.17
773 0.23
774 0.22
775 0.21
776 0.2
777 0.21
778 0.22
779 0.19
780 0.2
781 0.14
782 0.19
783 0.19
784 0.21
785 0.27
786 0.29
787 0.33
788 0.41
789 0.47
790 0.5
791 0.58
792 0.61
793 0.64
794 0.69
795 0.74
796 0.74
797 0.78
798 0.79
799 0.8
800 0.83
801 0.78
802 0.77
803 0.78
804 0.79
805 0.74
806 0.73
807 0.68
808 0.65
809 0.64
810 0.63
811 0.59
812 0.58
813 0.62
814 0.61
815 0.63
816 0.64
817 0.67
818 0.69
819 0.69
820 0.65
821 0.58
822 0.54
823 0.49
824 0.42
825 0.37
826 0.29
827 0.25
828 0.21
829 0.2
830 0.17
831 0.16
832 0.16
833 0.15
834 0.17
835 0.16
836 0.18
837 0.2
838 0.22
839 0.23
840 0.27
841 0.29
842 0.28
843 0.28
844 0.26
845 0.26
846 0.24
847 0.22
848 0.19
849 0.18
850 0.17
851 0.16
852 0.15
853 0.16
854 0.15
855 0.17
856 0.15
857 0.15
858 0.15
859 0.19
860 0.19
861 0.18
862 0.23
863 0.24
864 0.3
865 0.3
866 0.34
867 0.31