Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3C726

Protein Details
Accession S3C726    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-74HPRNGVPKAQLQKRPKKPKAENRLASVIRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-65AQLQKRPKKPKA
289-307KGGKETKETKGTKGTKEKK
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_nucl 12, nucl 7, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030382  MeTrfase_TRM5/TYW2  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR026274  tRNA_wybutosine_synth_prot_2  
Gene Ontology GO:0008757  F:S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity  
GO:0102522  F:tRNA 4-demethylwyosine alpha-amino-alpha-carboxypropyltransferase activity  
GO:0031591  P:wybutosine biosynthetic process  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51684  SAM_MT_TRM5_TYW2  
Amino Acid Sequences MVFDTDGAGQAVTSKIEVGGDVEHKVDGDMKAETSLQTHTQLPSGHPRNGVPKAQLQKRPKKPKAENRLASVIRRWLNDVLPALDGQAATVETIDTLVSQAPKRWVIYEPMVLLPTGSFGFTCVPGQAAASSEDLANVTWQSVLSSASEEQKSLLWTETLAVLSPGTGPSSQLTHLAVNEGIPLHVAGGHDASKDAASTEENILRSPTGLRPLHGDFGPATAALPGREDDPSDEDLAAAFWVSTKQNGLYQTWAPRWSMFSRGNIKEKARLLAWPGNDLAGSRLAIGGKGGKETKETKGTKGTKEKKVEKATAVDLYAGIGYFVFSYAQRGLRVLGWELNPWSTEALRRGAVRNGWSVKIVRGTDLALPTTEVIGDESIVIFVEDNQRAAQRLAELRGAEMAPLRVTHVNGGLLPTSRPIWRTAWDAVVDSARDAREARDSKDARDAKEADADKNGEKYTGWLHLHDNVGVDELDSRKAEIQALVDAWGAAAGDGLEAVSVVEHTELVKTFAPGVWHCVFDVRVECSLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.09
4 0.09
5 0.09
6 0.12
7 0.13
8 0.14
9 0.14
10 0.14
11 0.14
12 0.14
13 0.17
14 0.14
15 0.14
16 0.14
17 0.14
18 0.15
19 0.16
20 0.16
21 0.14
22 0.16
23 0.17
24 0.18
25 0.21
26 0.2
27 0.23
28 0.25
29 0.27
30 0.35
31 0.39
32 0.4
33 0.4
34 0.42
35 0.47
36 0.52
37 0.52
38 0.45
39 0.48
40 0.53
41 0.6
42 0.66
43 0.68
44 0.72
45 0.79
46 0.86
47 0.86
48 0.87
49 0.89
50 0.91
51 0.91
52 0.92
53 0.87
54 0.82
55 0.84
56 0.76
57 0.68
58 0.62
59 0.58
60 0.51
61 0.46
62 0.43
63 0.36
64 0.34
65 0.35
66 0.33
67 0.26
68 0.23
69 0.22
70 0.18
71 0.16
72 0.15
73 0.1
74 0.09
75 0.07
76 0.06
77 0.07
78 0.06
79 0.04
80 0.05
81 0.05
82 0.04
83 0.05
84 0.07
85 0.1
86 0.12
87 0.15
88 0.2
89 0.23
90 0.24
91 0.25
92 0.25
93 0.28
94 0.31
95 0.31
96 0.28
97 0.27
98 0.26
99 0.24
100 0.21
101 0.16
102 0.13
103 0.09
104 0.08
105 0.06
106 0.07
107 0.08
108 0.09
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.06
132 0.08
133 0.1
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.15
138 0.16
139 0.16
140 0.15
141 0.14
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.08
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.09
158 0.1
159 0.11
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.08
186 0.1
187 0.13
188 0.13
189 0.13
190 0.14
191 0.13
192 0.13
193 0.13
194 0.12
195 0.17
196 0.18
197 0.18
198 0.22
199 0.23
200 0.26
201 0.23
202 0.23
203 0.14
204 0.15
205 0.15
206 0.1
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.07
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.08
225 0.05
226 0.03
227 0.03
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.07
233 0.1
234 0.12
235 0.12
236 0.14
237 0.16
238 0.2
239 0.21
240 0.22
241 0.19
242 0.18
243 0.21
244 0.19
245 0.23
246 0.22
247 0.25
248 0.32
249 0.36
250 0.4
251 0.41
252 0.41
253 0.4
254 0.39
255 0.35
256 0.27
257 0.24
258 0.24
259 0.24
260 0.23
261 0.19
262 0.18
263 0.16
264 0.15
265 0.14
266 0.1
267 0.07
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.08
275 0.07
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.13
280 0.16
281 0.2
282 0.27
283 0.28
284 0.29
285 0.38
286 0.42
287 0.46
288 0.54
289 0.59
290 0.58
291 0.66
292 0.7
293 0.7
294 0.72
295 0.68
296 0.6
297 0.55
298 0.49
299 0.41
300 0.34
301 0.25
302 0.18
303 0.15
304 0.12
305 0.08
306 0.06
307 0.04
308 0.03
309 0.03
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.07
314 0.09
315 0.11
316 0.11
317 0.12
318 0.12
319 0.13
320 0.15
321 0.14
322 0.15
323 0.14
324 0.15
325 0.15
326 0.15
327 0.13
328 0.13
329 0.12
330 0.1
331 0.12
332 0.13
333 0.15
334 0.16
335 0.17
336 0.19
337 0.22
338 0.24
339 0.23
340 0.27
341 0.27
342 0.26
343 0.27
344 0.26
345 0.24
346 0.27
347 0.25
348 0.2
349 0.18
350 0.18
351 0.19
352 0.19
353 0.18
354 0.13
355 0.13
356 0.12
357 0.11
358 0.1
359 0.07
360 0.06
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.04
369 0.05
370 0.12
371 0.12
372 0.13
373 0.14
374 0.15
375 0.16
376 0.16
377 0.16
378 0.14
379 0.17
380 0.18
381 0.2
382 0.19
383 0.18
384 0.2
385 0.19
386 0.15
387 0.14
388 0.12
389 0.1
390 0.1
391 0.12
392 0.12
393 0.13
394 0.14
395 0.14
396 0.14
397 0.14
398 0.15
399 0.13
400 0.13
401 0.12
402 0.13
403 0.13
404 0.14
405 0.15
406 0.17
407 0.18
408 0.2
409 0.25
410 0.26
411 0.27
412 0.26
413 0.26
414 0.25
415 0.24
416 0.21
417 0.17
418 0.17
419 0.14
420 0.14
421 0.14
422 0.14
423 0.21
424 0.24
425 0.27
426 0.34
427 0.36
428 0.37
429 0.47
430 0.49
431 0.42
432 0.47
433 0.46
434 0.38
435 0.45
436 0.44
437 0.36
438 0.37
439 0.37
440 0.31
441 0.33
442 0.31
443 0.23
444 0.21
445 0.21
446 0.2
447 0.26
448 0.25
449 0.23
450 0.26
451 0.3
452 0.32
453 0.3
454 0.28
455 0.2
456 0.2
457 0.18
458 0.15
459 0.14
460 0.13
461 0.15
462 0.14
463 0.15
464 0.16
465 0.18
466 0.19
467 0.18
468 0.18
469 0.18
470 0.18
471 0.18
472 0.15
473 0.14
474 0.12
475 0.1
476 0.08
477 0.05
478 0.05
479 0.04
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.04
489 0.04
490 0.05
491 0.05
492 0.08
493 0.09
494 0.12
495 0.13
496 0.14
497 0.15
498 0.16
499 0.21
500 0.19
501 0.26
502 0.25
503 0.25
504 0.24
505 0.26
506 0.25
507 0.24
508 0.27
509 0.24