Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CDE1

Protein Details
Accession S3CDE1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-89SSAGPPIRRSQPRAKSRPVVSCLLCRSRKQKCDRLLPCGTCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 4, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007219  Transcription_factor_dom_fun  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04082  Fungal_trans  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd12148  fungal_TF_MHR  
cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MPGPPVMSKLSNFTSVFRVQLGDEKTASSINGENSTQGPLNQNQPAASSSAGPPIRRSQPRAKSRPVVSCLLCRSRKQKCDRLLPCGTCSRRGDGALCRYGNEGGVSSVSQRATGTTSAPGGGPTRASSGGSFAGAPELPVDERGVSAYRRGLSTARDGLESLTAGAVAAGHAHGVRHEAQVRLQKLEEMVNRMITVPDPAESDAEALTKAAEERRKDINTRPFRLAFGDPEPGGSNTATDARYEWIMPIGVGGAQPSSTGRVASLIGEAPFVGATNWAAVLDSIRDIQSYLGEAPAGDGSDEHGDDVDGGEEDEGAEYGISDEDMEELSTDFEGIDASLQAQLPNPNLTSFNNGTISSISHSRSLVATTAASSGSGPPTTNASMPTSTRDLIVAPSLLENVEADGIFAAVAATPGLADSSPSNPPNTSAMAQNPRMPKHMAEAVSCLPSRQDCDRLLTVYFQSSYMTGPFVHMDEFQRAYSRFWRSGNPTSAHAASPLLWVSMLASVLNIGAMISGGRQQSWMAERARDASNITEGGPNISGSDRTGENHTGLGNKAAQEPNGESHNEDLILASRLRKLSTRCLLAGDYLSGRTLAIEALLLNAHVRLMQKRDHDATLWATFSVAVRLAQRMGYQQVDAPTGGAYSVGGKMLTPFEKEMRRRAWYFVESFDMLYSFQFGMPTMIHEDETSTDPPNNLRDDDFDENSAELPPSRPVTDYTPALYFSVKLNLIRLLRKVLRFAVWRSDKLKRNDGPANKATITKLADELKKSYETVPSRLRMPTHIRDCPFSDASHDIMHRIAIELINHKATCILFRESLSRDISRIEEDGGVDAYGFTAAETRAQRQVCLVSALRILDVHTEFEYETRPASTAASATAGSPPDDFEISKGGGTASRGAGRLAADRHMLSTLALHDFLLAATILCLDLIEEGRSKSSRTKSSNGPSPGAASAADSATEAGSATSTSTRGSHLPAYRPFLGGGEPSLEERAADRGAKLDALRRAYALWHEQRLTSRDAAHAARVLGAIVTKLSSESGGGAACLYGNNNASYTATLSDKTGDWGITAQLAHREQIVQEMRQQERAQRAETASQAEQTHRDEREQAATIASGGGVSTSMLNNIPLSFVNSQDLQHIADIPIQSAVYGQQPIQQQDDQQMHRLSAMTQPPPAHLNYAYEWAEPGPFGAALNDPMNVDWNMVDAFLLDRQLDTEVGGNVWSADLMGLEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.33
3 0.33
4 0.28
5 0.26
6 0.21
7 0.27
8 0.28
9 0.26
10 0.25
11 0.24
12 0.25
13 0.24
14 0.23
15 0.18
16 0.18
17 0.18
18 0.22
19 0.21
20 0.21
21 0.22
22 0.25
23 0.24
24 0.22
25 0.24
26 0.24
27 0.31
28 0.33
29 0.34
30 0.3
31 0.31
32 0.3
33 0.26
34 0.23
35 0.19
36 0.17
37 0.24
38 0.27
39 0.26
40 0.29
41 0.35
42 0.45
43 0.5
44 0.56
45 0.58
46 0.65
47 0.75
48 0.8
49 0.81
50 0.8
51 0.81
52 0.82
53 0.77
54 0.74
55 0.66
56 0.65
57 0.64
58 0.64
59 0.62
60 0.6
61 0.64
62 0.67
63 0.73
64 0.75
65 0.77
66 0.77
67 0.82
68 0.82
69 0.81
70 0.81
71 0.75
72 0.7
73 0.71
74 0.64
75 0.61
76 0.58
77 0.54
78 0.48
79 0.46
80 0.46
81 0.44
82 0.49
83 0.49
84 0.46
85 0.42
86 0.4
87 0.39
88 0.35
89 0.28
90 0.2
91 0.13
92 0.14
93 0.13
94 0.13
95 0.16
96 0.15
97 0.14
98 0.14
99 0.14
100 0.16
101 0.16
102 0.16
103 0.15
104 0.16
105 0.16
106 0.16
107 0.16
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.14
112 0.16
113 0.16
114 0.17
115 0.16
116 0.17
117 0.17
118 0.16
119 0.15
120 0.12
121 0.13
122 0.12
123 0.12
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.12
129 0.09
130 0.1
131 0.12
132 0.14
133 0.13
134 0.16
135 0.19
136 0.2
137 0.2
138 0.22
139 0.22
140 0.23
141 0.29
142 0.32
143 0.29
144 0.28
145 0.27
146 0.26
147 0.25
148 0.22
149 0.15
150 0.1
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.09
163 0.11
164 0.15
165 0.19
166 0.2
167 0.25
168 0.33
169 0.35
170 0.35
171 0.34
172 0.3
173 0.29
174 0.35
175 0.32
176 0.3
177 0.29
178 0.27
179 0.27
180 0.26
181 0.25
182 0.18
183 0.17
184 0.12
185 0.11
186 0.12
187 0.13
188 0.13
189 0.12
190 0.13
191 0.11
192 0.1
193 0.09
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.13
199 0.19
200 0.21
201 0.25
202 0.33
203 0.37
204 0.41
205 0.48
206 0.53
207 0.58
208 0.6
209 0.63
210 0.56
211 0.53
212 0.54
213 0.47
214 0.41
215 0.34
216 0.34
217 0.27
218 0.28
219 0.28
220 0.24
221 0.23
222 0.19
223 0.15
224 0.12
225 0.16
226 0.14
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.13
233 0.11
234 0.11
235 0.1
236 0.09
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.06
286 0.05
287 0.07
288 0.09
289 0.09
290 0.08
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.06
296 0.04
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.03
305 0.03
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.05
313 0.05
314 0.04
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.09
330 0.11
331 0.12
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.16
337 0.21
338 0.2
339 0.21
340 0.21
341 0.21
342 0.2
343 0.19
344 0.19
345 0.14
346 0.16
347 0.15
348 0.15
349 0.15
350 0.15
351 0.15
352 0.15
353 0.13
354 0.11
355 0.1
356 0.09
357 0.1
358 0.09
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.08
366 0.12
367 0.13
368 0.13
369 0.14
370 0.15
371 0.16
372 0.17
373 0.2
374 0.19
375 0.18
376 0.18
377 0.16
378 0.14
379 0.13
380 0.14
381 0.1
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.02
401 0.02
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.04
406 0.05
407 0.08
408 0.12
409 0.13
410 0.15
411 0.15
412 0.17
413 0.18
414 0.19
415 0.18
416 0.16
417 0.21
418 0.26
419 0.28
420 0.32
421 0.34
422 0.33
423 0.35
424 0.34
425 0.28
426 0.26
427 0.3
428 0.26
429 0.22
430 0.24
431 0.23
432 0.24
433 0.24
434 0.19
435 0.15
436 0.14
437 0.17
438 0.17
439 0.2
440 0.18
441 0.23
442 0.24
443 0.25
444 0.25
445 0.23
446 0.21
447 0.17
448 0.17
449 0.12
450 0.11
451 0.1
452 0.1
453 0.09
454 0.09
455 0.07
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.09
460 0.1
461 0.11
462 0.13
463 0.14
464 0.13
465 0.16
466 0.16
467 0.18
468 0.22
469 0.26
470 0.26
471 0.27
472 0.31
473 0.35
474 0.42
475 0.46
476 0.41
477 0.38
478 0.38
479 0.38
480 0.33
481 0.26
482 0.19
483 0.14
484 0.13
485 0.11
486 0.08
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.03
498 0.02
499 0.02
500 0.02
501 0.02
502 0.02
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.07
507 0.07
508 0.09
509 0.11
510 0.16
511 0.14
512 0.15
513 0.15
514 0.18
515 0.2
516 0.18
517 0.17
518 0.13
519 0.13
520 0.13
521 0.13
522 0.11
523 0.1
524 0.1
525 0.1
526 0.09
527 0.08
528 0.08
529 0.07
530 0.06
531 0.08
532 0.08
533 0.08
534 0.11
535 0.12
536 0.12
537 0.13
538 0.13
539 0.12
540 0.12
541 0.12
542 0.1
543 0.1
544 0.13
545 0.13
546 0.13
547 0.13
548 0.14
549 0.14
550 0.15
551 0.15
552 0.11
553 0.12
554 0.12
555 0.1
556 0.09
557 0.07
558 0.07
559 0.08
560 0.08
561 0.08
562 0.1
563 0.1
564 0.11
565 0.15
566 0.16
567 0.23
568 0.27
569 0.29
570 0.27
571 0.28
572 0.28
573 0.25
574 0.23
575 0.15
576 0.11
577 0.08
578 0.08
579 0.06
580 0.06
581 0.05
582 0.05
583 0.04
584 0.03
585 0.03
586 0.03
587 0.03
588 0.03
589 0.03
590 0.03
591 0.03
592 0.03
593 0.05
594 0.06
595 0.07
596 0.1
597 0.14
598 0.16
599 0.2
600 0.22
601 0.21
602 0.21
603 0.21
604 0.21
605 0.19
606 0.17
607 0.13
608 0.11
609 0.1
610 0.1
611 0.09
612 0.06
613 0.06
614 0.06
615 0.07
616 0.07
617 0.08
618 0.08
619 0.09
620 0.1
621 0.1
622 0.1
623 0.11
624 0.11
625 0.12
626 0.11
627 0.1
628 0.08
629 0.07
630 0.07
631 0.05
632 0.04
633 0.04
634 0.04
635 0.04
636 0.04
637 0.04
638 0.05
639 0.07
640 0.08
641 0.08
642 0.09
643 0.13
644 0.2
645 0.23
646 0.29
647 0.31
648 0.35
649 0.35
650 0.37
651 0.37
652 0.34
653 0.33
654 0.28
655 0.26
656 0.22
657 0.21
658 0.18
659 0.13
660 0.1
661 0.09
662 0.09
663 0.06
664 0.06
665 0.06
666 0.06
667 0.07
668 0.07
669 0.08
670 0.08
671 0.09
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.09
676 0.12
677 0.12
678 0.11
679 0.11
680 0.12
681 0.13
682 0.16
683 0.16
684 0.14
685 0.13
686 0.14
687 0.19
688 0.23
689 0.22
690 0.2
691 0.19
692 0.18
693 0.18
694 0.16
695 0.11
696 0.07
697 0.08
698 0.09
699 0.1
700 0.1
701 0.11
702 0.12
703 0.17
704 0.2
705 0.2
706 0.2
707 0.19
708 0.19
709 0.19
710 0.17
711 0.13
712 0.11
713 0.13
714 0.13
715 0.12
716 0.12
717 0.16
718 0.18
719 0.2
720 0.2
721 0.22
722 0.25
723 0.26
724 0.27
725 0.25
726 0.27
727 0.28
728 0.28
729 0.32
730 0.32
731 0.34
732 0.37
733 0.44
734 0.47
735 0.49
736 0.56
737 0.49
738 0.52
739 0.56
740 0.57
741 0.56
742 0.51
743 0.5
744 0.42
745 0.41
746 0.34
747 0.31
748 0.27
749 0.2
750 0.21
751 0.22
752 0.23
753 0.24
754 0.25
755 0.23
756 0.23
757 0.23
758 0.21
759 0.24
760 0.24
761 0.29
762 0.32
763 0.32
764 0.33
765 0.34
766 0.34
767 0.32
768 0.37
769 0.4
770 0.41
771 0.46
772 0.44
773 0.45
774 0.47
775 0.46
776 0.4
777 0.31
778 0.27
779 0.23
780 0.24
781 0.23
782 0.21
783 0.16
784 0.15
785 0.15
786 0.12
787 0.1
788 0.09
789 0.08
790 0.09
791 0.11
792 0.13
793 0.15
794 0.15
795 0.14
796 0.15
797 0.14
798 0.15
799 0.16
800 0.17
801 0.16
802 0.17
803 0.21
804 0.21
805 0.26
806 0.27
807 0.24
808 0.21
809 0.21
810 0.22
811 0.19
812 0.18
813 0.15
814 0.12
815 0.12
816 0.12
817 0.11
818 0.09
819 0.07
820 0.06
821 0.05
822 0.05
823 0.04
824 0.03
825 0.04
826 0.04
827 0.1
828 0.11
829 0.14
830 0.2
831 0.2
832 0.2
833 0.21
834 0.22
835 0.18
836 0.21
837 0.19
838 0.15
839 0.16
840 0.16
841 0.15
842 0.13
843 0.13
844 0.12
845 0.12
846 0.12
847 0.11
848 0.11
849 0.11
850 0.12
851 0.13
852 0.1
853 0.1
854 0.09
855 0.1
856 0.1
857 0.1
858 0.1
859 0.09
860 0.09
861 0.09
862 0.09
863 0.09
864 0.1
865 0.1
866 0.1
867 0.1
868 0.1
869 0.1
870 0.11
871 0.11
872 0.09
873 0.12
874 0.11
875 0.11
876 0.11
877 0.1
878 0.1
879 0.11
880 0.12
881 0.12
882 0.13
883 0.14
884 0.14
885 0.15
886 0.14
887 0.17
888 0.16
889 0.16
890 0.16
891 0.16
892 0.16
893 0.16
894 0.15
895 0.11
896 0.11
897 0.11
898 0.11
899 0.11
900 0.1
901 0.09
902 0.09
903 0.09
904 0.08
905 0.06
906 0.04
907 0.04
908 0.04
909 0.04
910 0.04
911 0.04
912 0.03
913 0.04
914 0.05
915 0.07
916 0.08
917 0.09
918 0.12
919 0.13
920 0.14
921 0.21
922 0.27
923 0.35
924 0.4
925 0.45
926 0.51
927 0.59
928 0.67
929 0.63
930 0.58
931 0.49
932 0.46
933 0.41
934 0.33
935 0.24
936 0.16
937 0.13
938 0.11
939 0.1
940 0.08
941 0.08
942 0.07
943 0.07
944 0.06
945 0.04
946 0.04
947 0.04
948 0.05
949 0.06
950 0.07
951 0.08
952 0.08
953 0.11
954 0.12
955 0.15
956 0.21
957 0.25
958 0.31
959 0.35
960 0.41
961 0.4
962 0.4
963 0.37
964 0.31
965 0.27
966 0.21
967 0.17
968 0.13
969 0.12
970 0.12
971 0.13
972 0.12
973 0.11
974 0.11
975 0.13
976 0.12
977 0.13
978 0.12
979 0.13
980 0.14
981 0.16
982 0.16
983 0.19
984 0.23
985 0.26
986 0.26
987 0.25
988 0.25
989 0.24
990 0.28
991 0.3
992 0.31
993 0.32
994 0.32
995 0.34
996 0.39
997 0.4
998 0.4
999 0.33
1000 0.29
1001 0.26
1002 0.3
1003 0.29
1004 0.26
1005 0.25
1006 0.21
1007 0.19
1008 0.18
1009 0.16
1010 0.12
1011 0.11
1012 0.09
1013 0.06
1014 0.06
1015 0.06
1016 0.06
1017 0.06
1018 0.06
1019 0.06
1020 0.07
1021 0.08
1022 0.07
1023 0.07
1024 0.07
1025 0.06
1026 0.06
1027 0.06
1028 0.07
1029 0.08
1030 0.1
1031 0.11
1032 0.11
1033 0.12
1034 0.12
1035 0.13
1036 0.13
1037 0.13
1038 0.12
1039 0.12
1040 0.13
1041 0.14
1042 0.14
1043 0.16
1044 0.16
1045 0.14
1046 0.13
1047 0.13
1048 0.13
1049 0.13
1050 0.13
1051 0.12
1052 0.17
1053 0.18
1054 0.18
1055 0.18
1056 0.18
1057 0.16
1058 0.25
1059 0.28
1060 0.22
1061 0.27
1062 0.34
1063 0.35
1064 0.41
1065 0.42
1066 0.39
1067 0.44
1068 0.46
1069 0.44
1070 0.4
1071 0.42
1072 0.39
1073 0.4
1074 0.4
1075 0.32
1076 0.32
1077 0.32
1078 0.3
1079 0.31
1080 0.31
1081 0.36
1082 0.32
1083 0.33
1084 0.33
1085 0.34
1086 0.37
1087 0.36
1088 0.31
1089 0.26
1090 0.24
1091 0.22
1092 0.18
1093 0.15
1094 0.09
1095 0.06
1096 0.05
1097 0.04
1098 0.05
1099 0.05
1100 0.06
1101 0.07
1102 0.08
1103 0.09
1104 0.1
1105 0.1
1106 0.11
1107 0.1
1108 0.15
1109 0.14
1110 0.15
1111 0.18
1112 0.18
1113 0.19
1114 0.2
1115 0.21
1116 0.17
1117 0.17
1118 0.17
1119 0.15
1120 0.17
1121 0.17
1122 0.15
1123 0.15
1124 0.14
1125 0.13
1126 0.11
1127 0.12
1128 0.12
1129 0.13
1130 0.13
1131 0.16
1132 0.22
1133 0.24
1134 0.29
1135 0.29
1136 0.27
1137 0.34
1138 0.42
1139 0.39
1140 0.42
1141 0.41
1142 0.36
1143 0.36
1144 0.35
1145 0.27
1146 0.27
1147 0.32
1148 0.28
1149 0.31
1150 0.32
1151 0.33
1152 0.35
1153 0.35
1154 0.31
1155 0.26
1156 0.27
1157 0.24
1158 0.3
1159 0.29
1160 0.26
1161 0.26
1162 0.22
1163 0.22
1164 0.18
1165 0.16
1166 0.11
1167 0.09
1168 0.09
1169 0.1
1170 0.11
1171 0.13
1172 0.15
1173 0.15
1174 0.14
1175 0.14
1176 0.17
1177 0.16
1178 0.15
1179 0.11
1180 0.12
1181 0.11
1182 0.11
1183 0.1
1184 0.07
1185 0.09
1186 0.09
1187 0.11
1188 0.09
1189 0.09
1190 0.1
1191 0.12
1192 0.12
1193 0.11
1194 0.13
1195 0.12
1196 0.12
1197 0.12
1198 0.11
1199 0.1
1200 0.09
1201 0.08
1202 0.06
1203 0.05