FuNGI

S3BSE6

Protein Details

Accession

S3BSE6

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
362-381	SSSRRRARSRSDSRSRSRSR	Hydrophilic
413-433	REEARRERRREEERKMRQSRM	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
233-250	PPKFKHKKIPRGPPSPPP
361-386	ASSSRRRARSRSDSRSRSRSRSDSRS
414-433	EEARRERRREEERKMRQSRM

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MASIASSLARALPKPKYTGEDEEARSTTAQRGPRVVTRAELAAATGDTQVVLKRAGPPPYGKRQGWRPRSAEDFGDGGAFPEIPFAQYPLDMGRSGSGSTKSNALAIQVDGEGKVKYDAIARQGHSEGRVIHTSFKDLIPLRQRAEAGTLNLDRPDVETVAETTERTKNALALLVSGAVAASKPKTLAHMAGNQNREATYVRYTPASNQMGDSSKRQDRVMKIVERQRDPLEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAADQEAWKIPPPISNWKNPKGYTVPLDKRLAAAGKGLEDVSINDKFAQFSEALFMADRHAREDVRKRAQMQQLLAEKEKEKKEDHLRQLAQQARAERAEASSSRRRARSRSDSRSRSRSRSDSRSSRSDSRSHSRSRSYDSRDSEDEAVREREEARRERRREEERKMRQSRMGGERRMQVLAREQNRDISERVALGLAKPTASTEGMYDSRLFNQTSGFDSGYNEDNIYDKPMFAAQDAITSIYRARGGNGADDDDFDEAAGDAEMAKIQKSSRFGEALGRGTFKGARDAEAREGPVQFEKESAGLSVGGGAPEADPFNVDQFLSEVGQGSGGGGSGEASGGSSSKRGYGLQEGGSSRQSKRARVEEDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.4
3	0.42
4	0.46
5	0.51
6	0.51
7	0.51
8	0.51
9	0.52
10	0.49
11	0.45
12	0.4
13	0.33
14	0.34
15	0.31
16	0.33
17	0.32
18	0.36
19	0.39
20	0.45
21	0.48
22	0.43
23	0.4
24	0.36
25	0.34
26	0.3
27	0.25
28	0.19
29	0.15
30	0.14
31	0.13
32	0.1
33	0.08
34	0.08
35	0.08
36	0.09
37	0.1
38	0.1
39	0.11
40	0.18
41	0.24
42	0.29
43	0.32
44	0.39
45	0.46
46	0.56
47	0.63
48	0.58
49	0.6
50	0.66
51	0.73
52	0.75
53	0.76
54	0.69
55	0.67
56	0.71
57	0.66
58	0.57
59	0.49
60	0.4
61	0.31
62	0.28
63	0.22
64	0.16
65	0.14
66	0.12
67	0.08
68	0.1
69	0.09
70	0.09
71	0.1
72	0.1
73	0.1
74	0.1
75	0.12
76	0.12
77	0.14
78	0.13
79	0.13
80	0.13
81	0.13
82	0.14
83	0.16
84	0.17
85	0.17
86	0.18
87	0.2
88	0.19
89	0.19
90	0.19
91	0.17
92	0.16
93	0.14
94	0.14
95	0.12
96	0.12
97	0.11
98	0.12
99	0.1
100	0.09
101	0.1
102	0.09
103	0.09
104	0.13
105	0.15
106	0.2
107	0.25
108	0.26
109	0.29
110	0.3
111	0.31
112	0.28
113	0.29
114	0.24
115	0.23
116	0.26
117	0.23
118	0.27
119	0.26
120	0.28
121	0.27
122	0.25
123	0.27
124	0.25
125	0.31
126	0.34
127	0.38
128	0.37
129	0.38
130	0.39
131	0.33
132	0.36
133	0.32
134	0.25
135	0.26
136	0.25
137	0.23
138	0.23
139	0.22
140	0.17
141	0.16
142	0.17
143	0.11
144	0.1
145	0.1
146	0.1
147	0.13
148	0.13
149	0.12
150	0.13
151	0.16
152	0.16
153	0.17
154	0.17
155	0.16
156	0.16
157	0.19
158	0.15
159	0.12
160	0.12
161	0.11
162	0.1
163	0.09
164	0.07
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.05
169	0.06
170	0.07
171	0.07
172	0.1
173	0.12
174	0.15
175	0.18
176	0.26
177	0.33
178	0.38
179	0.4
180	0.38
181	0.37
182	0.33
183	0.31
184	0.24
185	0.19
186	0.17
187	0.16
188	0.17
189	0.18
190	0.19
191	0.2
192	0.27
193	0.27
194	0.23
195	0.22
196	0.24
197	0.26
198	0.28
199	0.28
200	0.26
201	0.28
202	0.3
203	0.31
204	0.34
205	0.33
206	0.39
207	0.44
208	0.42
209	0.45
210	0.49
211	0.55
212	0.51
213	0.51
214	0.46
215	0.41
216	0.4
217	0.43
218	0.46
219	0.44
220	0.44
221	0.52
222	0.56
223	0.55
224	0.62
225	0.62
226	0.64
227	0.68
228	0.77
229	0.75
230	0.77
231	0.8
232	0.78
233	0.76
234	0.72
235	0.66
236	0.56
237	0.53
238	0.49
239	0.5
240	0.5
241	0.5
242	0.48
243	0.49
244	0.5
245	0.45
246	0.41
247	0.39
248	0.39
249	0.36
250	0.33
251	0.3
252	0.28
253	0.29
254	0.29
255	0.26
256	0.18
257	0.14
258	0.15
259	0.18
260	0.27
261	0.29
262	0.37
263	0.43
264	0.48
265	0.53
266	0.5
267	0.5
268	0.43
269	0.42
270	0.38
271	0.41
272	0.39
273	0.39
274	0.4
275	0.36
276	0.33
277	0.32
278	0.28
279	0.18
280	0.16
281	0.1
282	0.09
283	0.1
284	0.09
285	0.08
286	0.07
287	0.07
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.09
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.1
296	0.07
297	0.06
298	0.08
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.09
305	0.09
306	0.09
307	0.1
308	0.11
309	0.15
310	0.24
311	0.31
312	0.36
313	0.38
314	0.4
315	0.46
316	0.51
317	0.5
318	0.43
319	0.41
320	0.39
321	0.38
322	0.37
323	0.31
324	0.27
325	0.3
326	0.31
327	0.28
328	0.24
329	0.29
330	0.39
331	0.46
332	0.51
333	0.53
334	0.52
335	0.52
336	0.58
337	0.56
338	0.49
339	0.42
340	0.37
341	0.31
342	0.3
343	0.27
344	0.2
345	0.16
346	0.15
347	0.14
348	0.19
349	0.23
350	0.29
351	0.33
352	0.38
353	0.4
354	0.42
355	0.5
356	0.55
357	0.59
358	0.64
359	0.69
360	0.72
361	0.77
362	0.82
363	0.79
364	0.74
365	0.7
366	0.69
367	0.67
368	0.66
369	0.68
370	0.67
371	0.67
372	0.68
373	0.67
374	0.65
375	0.61
376	0.58
377	0.56
378	0.55
379	0.55
380	0.54
381	0.53
382	0.52
383	0.51
384	0.53
385	0.55
386	0.55
387	0.56
388	0.55
389	0.55
390	0.5
391	0.5
392	0.45
393	0.39
394	0.32
395	0.27
396	0.25
397	0.2
398	0.19
399	0.17
400	0.19
401	0.24
402	0.31
403	0.38
404	0.46
405	0.5
406	0.55
407	0.63
408	0.68
409	0.71
410	0.73
411	0.75
412	0.75
413	0.83
414	0.83
415	0.78
416	0.73
417	0.67
418	0.65
419	0.64
420	0.62
421	0.55
422	0.53
423	0.53
424	0.5
425	0.48
426	0.4
427	0.31
428	0.32
429	0.36
430	0.36
431	0.36
432	0.35
433	0.38
434	0.39
435	0.4
436	0.33
437	0.26
438	0.22
439	0.18
440	0.18
441	0.14
442	0.13
443	0.11
444	0.13
445	0.12
446	0.11
447	0.1
448	0.1
449	0.12
450	0.12
451	0.12
452	0.09
453	0.13
454	0.14
455	0.15
456	0.16
457	0.15
458	0.17
459	0.19
460	0.19
461	0.15
462	0.16
463	0.16
464	0.18
465	0.2
466	0.18
467	0.15
468	0.16
469	0.18
470	0.19
471	0.18
472	0.15
473	0.12
474	0.13
475	0.13
476	0.17
477	0.15
478	0.12
479	0.12
480	0.14
481	0.14
482	0.13
483	0.16
484	0.11
485	0.13
486	0.14
487	0.15
488	0.13
489	0.13
490	0.13
491	0.12
492	0.15
493	0.13
494	0.14
495	0.15
496	0.16
497	0.2
498	0.21
499	0.21
500	0.19
501	0.2
502	0.19
503	0.16
504	0.15
505	0.1
506	0.09
507	0.07
508	0.07
509	0.06
510	0.05
511	0.04
512	0.04
513	0.06
514	0.06
515	0.07
516	0.08
517	0.09
518	0.14
519	0.18
520	0.21
521	0.24
522	0.25
523	0.26
524	0.32
525	0.36
526	0.36
527	0.34
528	0.33
529	0.29
530	0.29
531	0.31
532	0.24
533	0.27
534	0.23
535	0.24
536	0.26
537	0.29
538	0.33
539	0.34
540	0.35
541	0.3
542	0.3
543	0.28
544	0.3
545	0.29
546	0.23
547	0.2
548	0.19
549	0.17
550	0.17
551	0.15
552	0.12
553	0.09
554	0.09
555	0.1
556	0.09
557	0.09
558	0.08
559	0.08
560	0.07
561	0.08
562	0.09
563	0.07
564	0.07
565	0.08
566	0.1
567	0.11
568	0.11
569	0.1
570	0.1
571	0.12
572	0.12
573	0.12
574	0.11
575	0.1
576	0.1
577	0.1
578	0.09
579	0.07
580	0.06
581	0.06
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.04
587	0.05
588	0.05
589	0.06
590	0.07
591	0.08
592	0.09
593	0.11
594	0.14
595	0.14
596	0.18
597	0.25
598	0.29
599	0.3
600	0.35
601	0.35
602	0.36
603	0.41
604	0.41
605	0.35
606	0.4
607	0.42
608	0.43
609	0.5
610	0.56

S3BSE6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer