Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DHX1

Protein Details
Accession B0DHX1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-95THGKSHPTTKSKPKTQLQHPQKHKTNGKSHPMTKPKPKTQLQQPQKKSKPKDPSPQPAKKSNTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-92SKTNGKSQHANKAKPNTHGKSHPTTKSKPKTQLQHPQKHKTNGKSHPMTKPKPKTQLQQPQKKSKPKDPSPQPAKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006073  GTP-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005525  F:GTP binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_294772  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01926  MMR_HSR1  
CDD cd00882  Ras_like_GTPase  
Amino Acid Sequences MPATTKKKAQLHPTTKSKTNGKSQHANKAKPNTHGKSHPTTKSKPKTQLQHPQKHKTNGKSHPMTKPKPKTQLQQPQKKSKPKDPSPQPAKKSNTKTQPAQAQQPTALIVVLGRIGVGKSSFINTLAGNDALRVGHSTERETRRPLLVEVSPPHSDSKATIALLDTPGIDGDRPDSANKILKYVDAWLKRNRKGNVYFGGFLVLEESQAIDRPEPLSLLASVRCQSSLVLTKLGYGPHNNGHLHNSTNGIVFDPPTRERAWQIVNEILGRSTGAASVRLHTGLVFKNILREIKKRTPSAMSRILALFCIGEEEARKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.78
3 0.79
4 0.77
5 0.73
6 0.74
7 0.74
8 0.71
9 0.75
10 0.74
11 0.77
12 0.78
13 0.77
14 0.75
15 0.76
16 0.74
17 0.72
18 0.76
19 0.71
20 0.69
21 0.71
22 0.69
23 0.68
24 0.72
25 0.72
26 0.69
27 0.72
28 0.75
29 0.78
30 0.8
31 0.8
32 0.79
33 0.8
34 0.82
35 0.85
36 0.85
37 0.86
38 0.86
39 0.87
40 0.87
41 0.87
42 0.86
43 0.84
44 0.83
45 0.82
46 0.82
47 0.8
48 0.78
49 0.78
50 0.8
51 0.79
52 0.8
53 0.81
54 0.79
55 0.8
56 0.8
57 0.79
58 0.8
59 0.83
60 0.83
61 0.83
62 0.83
63 0.85
64 0.87
65 0.88
66 0.84
67 0.82
68 0.83
69 0.82
70 0.83
71 0.82
72 0.84
73 0.85
74 0.87
75 0.83
76 0.81
77 0.78
78 0.76
79 0.75
80 0.73
81 0.72
82 0.69
83 0.68
84 0.66
85 0.68
86 0.63
87 0.63
88 0.57
89 0.49
90 0.43
91 0.39
92 0.33
93 0.24
94 0.2
95 0.11
96 0.07
97 0.06
98 0.05
99 0.04
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.08
123 0.09
124 0.12
125 0.19
126 0.24
127 0.27
128 0.29
129 0.3
130 0.3
131 0.3
132 0.28
133 0.24
134 0.2
135 0.22
136 0.21
137 0.23
138 0.22
139 0.22
140 0.22
141 0.18
142 0.17
143 0.13
144 0.15
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.1
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.07
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.05
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.11
164 0.16
165 0.16
166 0.17
167 0.16
168 0.15
169 0.16
170 0.19
171 0.24
172 0.23
173 0.27
174 0.34
175 0.42
176 0.47
177 0.54
178 0.52
179 0.53
180 0.52
181 0.54
182 0.52
183 0.48
184 0.44
185 0.36
186 0.35
187 0.27
188 0.23
189 0.18
190 0.11
191 0.07
192 0.06
193 0.07
194 0.05
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.09
201 0.08
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.13
214 0.19
215 0.18
216 0.19
217 0.19
218 0.2
219 0.22
220 0.24
221 0.21
222 0.17
223 0.19
224 0.21
225 0.26
226 0.25
227 0.25
228 0.27
229 0.27
230 0.27
231 0.25
232 0.24
233 0.2
234 0.2
235 0.19
236 0.16
237 0.14
238 0.14
239 0.16
240 0.17
241 0.18
242 0.19
243 0.21
244 0.21
245 0.23
246 0.28
247 0.3
248 0.28
249 0.31
250 0.31
251 0.31
252 0.3
253 0.28
254 0.22
255 0.18
256 0.15
257 0.12
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.12
262 0.12
263 0.14
264 0.16
265 0.16
266 0.15
267 0.14
268 0.18
269 0.17
270 0.21
271 0.21
272 0.19
273 0.24
274 0.28
275 0.34
276 0.34
277 0.37
278 0.43
279 0.5
280 0.58
281 0.56
282 0.58
283 0.61
284 0.63
285 0.65
286 0.65
287 0.56
288 0.51
289 0.5
290 0.46
291 0.37
292 0.31
293 0.22
294 0.13
295 0.15
296 0.11
297 0.11