Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CQI2

Protein Details
Accession S3CQI2    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-24DAGTKRKRDAGDKGKKKSKDGBasic
310-332ARPGKERGTKRQLPRDKLKERMDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-22KRKRDAGDKGKKKSK
314-324KERGTKRQLPR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MAGDAGTKRKRDAGDKGKKKSKDGAEVIQVSGITKPQLSAPVIATTPGIVVPDSVQFDSFTKPSKSAKRQRTADAELLLHASNHRSLDFTGKEEKALKNGAPMQHYIGIYDPKTGKLEIVPAKKMEIRGTVRARDATEDQMTGVPVSKTNIDLRNTLGQTFGTKKARKAIASITENAIGTRKRKEDGTWESMEMGAGDRVLMETMVEATSSMATREELQAVVEKAKPVPRSNPDAEEIQDVYVPSQMVGADVLASIPVRDWQQAARANDAIDVYSRFVAQRVSHVAMRDDPEHLRLLRYMYWLILYWQAARPGKERGTKRQLPRDKLKERMDGAPEPIIESIRRTFTDSGTIRKFHADLLATHCCAFACILDNYETDMLDLREDMKFEQKQMSQYFMEIGARIKVVKSEDKTKHVAKLALPLVFPNAMRQRQRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.7
3 0.78
4 0.82
5 0.81
6 0.79
7 0.78
8 0.75
9 0.74
10 0.71
11 0.68
12 0.67
13 0.65
14 0.59
15 0.51
16 0.42
17 0.33
18 0.27
19 0.21
20 0.13
21 0.11
22 0.12
23 0.12
24 0.18
25 0.19
26 0.2
27 0.21
28 0.23
29 0.23
30 0.23
31 0.21
32 0.15
33 0.14
34 0.12
35 0.1
36 0.07
37 0.07
38 0.08
39 0.12
40 0.14
41 0.14
42 0.14
43 0.15
44 0.17
45 0.2
46 0.21
47 0.22
48 0.22
49 0.25
50 0.33
51 0.42
52 0.52
53 0.58
54 0.67
55 0.72
56 0.75
57 0.79
58 0.79
59 0.75
60 0.69
61 0.62
62 0.52
63 0.43
64 0.39
65 0.31
66 0.23
67 0.18
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.13
73 0.14
74 0.21
75 0.22
76 0.23
77 0.28
78 0.27
79 0.3
80 0.34
81 0.34
82 0.31
83 0.33
84 0.29
85 0.28
86 0.33
87 0.33
88 0.31
89 0.31
90 0.3
91 0.32
92 0.31
93 0.25
94 0.23
95 0.24
96 0.21
97 0.25
98 0.23
99 0.2
100 0.22
101 0.22
102 0.2
103 0.17
104 0.24
105 0.26
106 0.31
107 0.32
108 0.3
109 0.33
110 0.34
111 0.35
112 0.3
113 0.3
114 0.29
115 0.35
116 0.4
117 0.4
118 0.4
119 0.41
120 0.38
121 0.34
122 0.32
123 0.28
124 0.25
125 0.21
126 0.2
127 0.18
128 0.18
129 0.14
130 0.14
131 0.1
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.11
136 0.16
137 0.21
138 0.21
139 0.22
140 0.24
141 0.3
142 0.3
143 0.28
144 0.23
145 0.18
146 0.19
147 0.22
148 0.26
149 0.27
150 0.29
151 0.31
152 0.38
153 0.42
154 0.39
155 0.39
156 0.38
157 0.38
158 0.39
159 0.39
160 0.32
161 0.3
162 0.29
163 0.26
164 0.23
165 0.17
166 0.16
167 0.2
168 0.2
169 0.2
170 0.21
171 0.23
172 0.29
173 0.35
174 0.38
175 0.35
176 0.34
177 0.32
178 0.31
179 0.29
180 0.2
181 0.13
182 0.07
183 0.05
184 0.04
185 0.03
186 0.04
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.02
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.04
200 0.05
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.07
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.15
213 0.18
214 0.18
215 0.24
216 0.26
217 0.33
218 0.34
219 0.35
220 0.33
221 0.32
222 0.31
223 0.26
224 0.22
225 0.16
226 0.14
227 0.12
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.05
245 0.06
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.15
250 0.21
251 0.22
252 0.23
253 0.23
254 0.23
255 0.23
256 0.22
257 0.16
258 0.11
259 0.11
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.11
266 0.1
267 0.13
268 0.17
269 0.19
270 0.21
271 0.22
272 0.23
273 0.23
274 0.25
275 0.22
276 0.2
277 0.18
278 0.18
279 0.2
280 0.19
281 0.18
282 0.16
283 0.17
284 0.17
285 0.18
286 0.17
287 0.14
288 0.15
289 0.14
290 0.14
291 0.15
292 0.13
293 0.13
294 0.15
295 0.21
296 0.23
297 0.25
298 0.26
299 0.29
300 0.35
301 0.4
302 0.44
303 0.48
304 0.55
305 0.62
306 0.68
307 0.73
308 0.76
309 0.77
310 0.82
311 0.82
312 0.79
313 0.8
314 0.78
315 0.75
316 0.69
317 0.66
318 0.61
319 0.53
320 0.49
321 0.43
322 0.36
323 0.29
324 0.27
325 0.22
326 0.17
327 0.17
328 0.17
329 0.17
330 0.18
331 0.21
332 0.22
333 0.22
334 0.31
335 0.31
336 0.36
337 0.37
338 0.38
339 0.34
340 0.36
341 0.35
342 0.27
343 0.29
344 0.23
345 0.21
346 0.27
347 0.31
348 0.3
349 0.29
350 0.28
351 0.23
352 0.22
353 0.19
354 0.13
355 0.12
356 0.12
357 0.13
358 0.15
359 0.15
360 0.17
361 0.18
362 0.17
363 0.13
364 0.14
365 0.13
366 0.11
367 0.12
368 0.11
369 0.11
370 0.12
371 0.13
372 0.2
373 0.22
374 0.24
375 0.31
376 0.32
377 0.39
378 0.4
379 0.43
380 0.35
381 0.34
382 0.33
383 0.28
384 0.26
385 0.2
386 0.19
387 0.16
388 0.16
389 0.16
390 0.15
391 0.17
392 0.2
393 0.28
394 0.32
395 0.4
396 0.46
397 0.52
398 0.58
399 0.59
400 0.61
401 0.59
402 0.57
403 0.49
404 0.52
405 0.51
406 0.46
407 0.42
408 0.36
409 0.33
410 0.31
411 0.29
412 0.29
413 0.33
414 0.38