Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3C8D9

Protein Details
Accession S3C8D9    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-67ISLPEPPSKRAKRALKKGKVLPAKPRPALHydrophilic
84-103SSSSKGKGGKKEKEERSQFGHydrophilic
351-377AKESKEAKKTRTRKWWVNQFKGRPLKVHydrophilic
381-425EDDVSRYKKRFGKGRPRDGDEQTGSRPPNREERRGKPFKQREIGIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-64PSKRAKRALKKGKVLPAKPR
89-94GKGGKK
388-419KKRFGKGRPRDGDEQTGSRPPNREERRGKPFK
Subcellular Location(s) cyto 17.5, cyto_nucl 13, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MATEGSVPPSADVAPATADSADKKRKTANADVAELEVDISLPEPPSKRAKRALKKGKVLPAKPRPALDGDENDDEAAAAGVPGSSSSKGKGGKKEKEERSQFGIWIGNLPFTVTRLQLFKWFVDNSGGAIAESDITRINLPLGKRAASHVNTLRPHNVHADSDGKALPPNKGFAYVDFLTLEAQIAASALSETEIDGRRVLIKDSKSFEGRPASTPQTGDDAAAAAKAPRNKAGEANEDENAAPQGTTSTKVFVGNLGFETSEEDIRRHFAPCGPIAWVKVATFPDNTEKCRGYGWVQFGGKTDEGVNITPEAASEAAVNAVRGYVRLQEKIDTEEDFVAEAEGAADDAEAKESKEAKKTRTRKWWVNQFKGRPLKVQFAEDDVSRYKKRFGKGRPRDGDEQTGSRPPNREERRGKPFKQREIGIAALTGGIVESTGTKTVFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.11
4 0.1
5 0.11
6 0.14
7 0.23
8 0.32
9 0.32
10 0.35
11 0.41
12 0.46
13 0.53
14 0.58
15 0.6
16 0.57
17 0.58
18 0.56
19 0.5
20 0.44
21 0.36
22 0.27
23 0.16
24 0.1
25 0.07
26 0.06
27 0.06
28 0.07
29 0.11
30 0.13
31 0.17
32 0.28
33 0.35
34 0.41
35 0.5
36 0.6
37 0.67
38 0.77
39 0.83
40 0.83
41 0.86
42 0.87
43 0.87
44 0.86
45 0.82
46 0.82
47 0.81
48 0.8
49 0.75
50 0.68
51 0.61
52 0.55
53 0.53
54 0.48
55 0.43
56 0.38
57 0.37
58 0.36
59 0.32
60 0.28
61 0.23
62 0.18
63 0.12
64 0.07
65 0.04
66 0.03
67 0.03
68 0.03
69 0.04
70 0.06
71 0.07
72 0.08
73 0.1
74 0.16
75 0.22
76 0.29
77 0.38
78 0.46
79 0.54
80 0.63
81 0.72
82 0.76
83 0.8
84 0.81
85 0.75
86 0.72
87 0.65
88 0.56
89 0.48
90 0.42
91 0.32
92 0.3
93 0.25
94 0.19
95 0.16
96 0.17
97 0.14
98 0.13
99 0.14
100 0.1
101 0.12
102 0.13
103 0.14
104 0.19
105 0.21
106 0.21
107 0.24
108 0.24
109 0.23
110 0.24
111 0.23
112 0.18
113 0.16
114 0.15
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.1
127 0.11
128 0.16
129 0.17
130 0.17
131 0.18
132 0.2
133 0.26
134 0.25
135 0.31
136 0.3
137 0.35
138 0.37
139 0.39
140 0.42
141 0.35
142 0.35
143 0.34
144 0.31
145 0.24
146 0.24
147 0.25
148 0.21
149 0.22
150 0.2
151 0.16
152 0.17
153 0.18
154 0.18
155 0.16
156 0.17
157 0.16
158 0.18
159 0.18
160 0.16
161 0.21
162 0.19
163 0.18
164 0.16
165 0.16
166 0.13
167 0.13
168 0.12
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.11
186 0.12
187 0.13
188 0.15
189 0.16
190 0.2
191 0.24
192 0.26
193 0.26
194 0.26
195 0.29
196 0.29
197 0.28
198 0.26
199 0.27
200 0.28
201 0.27
202 0.26
203 0.23
204 0.21
205 0.19
206 0.17
207 0.12
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.04
213 0.06
214 0.08
215 0.09
216 0.13
217 0.15
218 0.16
219 0.2
220 0.23
221 0.27
222 0.28
223 0.3
224 0.26
225 0.25
226 0.24
227 0.2
228 0.17
229 0.11
230 0.07
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.08
235 0.07
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.1
248 0.09
249 0.11
250 0.11
251 0.1
252 0.1
253 0.13
254 0.14
255 0.13
256 0.13
257 0.14
258 0.17
259 0.18
260 0.18
261 0.19
262 0.19
263 0.19
264 0.19
265 0.18
266 0.14
267 0.16
268 0.17
269 0.15
270 0.15
271 0.16
272 0.23
273 0.25
274 0.27
275 0.28
276 0.28
277 0.26
278 0.27
279 0.27
280 0.22
281 0.25
282 0.26
283 0.28
284 0.28
285 0.28
286 0.29
287 0.31
288 0.27
289 0.22
290 0.19
291 0.14
292 0.15
293 0.15
294 0.14
295 0.11
296 0.11
297 0.1
298 0.09
299 0.08
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.05
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.12
313 0.15
314 0.18
315 0.19
316 0.22
317 0.23
318 0.27
319 0.27
320 0.22
321 0.21
322 0.19
323 0.18
324 0.15
325 0.14
326 0.1
327 0.08
328 0.07
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.03
334 0.04
335 0.04
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.11
340 0.15
341 0.19
342 0.28
343 0.32
344 0.38
345 0.49
346 0.57
347 0.64
348 0.71
349 0.77
350 0.78
351 0.84
352 0.87
353 0.88
354 0.89
355 0.89
356 0.85
357 0.86
358 0.85
359 0.77
360 0.74
361 0.67
362 0.66
363 0.59
364 0.55
365 0.46
366 0.41
367 0.41
368 0.34
369 0.34
370 0.28
371 0.32
372 0.31
373 0.32
374 0.35
375 0.39
376 0.46
377 0.51
378 0.58
379 0.64
380 0.72
381 0.81
382 0.82
383 0.83
384 0.83
385 0.79
386 0.76
387 0.7
388 0.63
389 0.56
390 0.55
391 0.5
392 0.48
393 0.48
394 0.43
395 0.49
396 0.52
397 0.58
398 0.61
399 0.68
400 0.74
401 0.79
402 0.82
403 0.83
404 0.85
405 0.85
406 0.84
407 0.77
408 0.72
409 0.68
410 0.63
411 0.52
412 0.42
413 0.32
414 0.23
415 0.2
416 0.14
417 0.08
418 0.05
419 0.04
420 0.04
421 0.05
422 0.07
423 0.1