Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3C5A7

Protein Details
Accession S3C5A7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-262TPAATTTPAKKRGRKPKDPSQPTTLRKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-298AKKRGRKPKDPSQPTTLRKTPAKGTASARKNATPKAATPNGDAPIKRGRGRPRKH
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, cyto 6.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041664  AAA_16  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR016527  ORC4  
IPR032705  ORC4_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000808  C:origin recognition complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF13191  AAA_16  
PF14629  ORC4_C  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15492  PHD_BRPF_JADE_like  
Amino Acid Sequences MSGINGSRKRARSDADDVDADATTADTATSVSTTTTGIKRQRLANEPPSIVVNGGSHGAADTTHGAGRLSALATTPKTPRTVHAMASAITGALAYGVGSLVGGGRMRGKSVSNQHGATLVPRSLASSHNETGTPETGAQMLNDIMGGDVDAEGFLDPDATDTEMPETPTSKKPASVARRSSQQPKGRRNVTDANPAQDDDKEENATLVGSASPTSDTPSKNPLRAPLLAEAGTTETPAATTTPAKKRGRKPKDPSQPTTLRKTPAKGTASARKNATPKAATPNGDAPIKRGRGRPRKHPIVEEDPILKLAQAKARSLAKQQLLQQQKAVDEDDGSGEVCLICSKPDSEPPNEIILCETCDLAVHQQCYNVPVIPEGDWFCKNCVRKQEHEKQLQKRASETPAGDETEEETGTDRQPLEPPTAHEKDDLAAELVAATPPRDLAPDIANFESHLSKTKRILLGRCTGRHRVRLHGQDEAYDKVYQVVEQTVVAGEGNSMMVIGARGTGKTTMVETILDDLAAEHGGAFHVVRLNGFIHTDDKLALREIWRQLGKEMAVDDDVVSKTNNYADTLASLLALLSHPSEIQAAAVGSGAETATSAPAVTSTSVVFIMDEFDLFATHARQTLLYNLFDIAQARKAPIAVLGLTTKIDVVESLEKRVKSRFSHRYVYLSLPRSLPAFWDVCRYGLVVEEPSDTKDGVMAVDIVQEEGHAAFQQWWKHMIDTAKDDSTFQEQLEFHFYSNKSIPAFWTTCVMPLVAVSSAAPRLRLPPVGCNNTAATTEVVRSVGRPSLAAAAASSAAIANAGKSFEEVPPLPLAAPDSKLHLLASLSELELSLLITAARLDIVLSTDTVNFAMAYDEYVSLMGKQRVQSSLASSGVVGIGGAGAMGGGLVIGGGARVWGRGVASRAWERLAALGLLIPAGMGANSRGRPGALITSGLEGRSMWRSEVSLEEIPAAPGVKLGAVLGRWCKEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.54
3 0.51
4 0.46
5 0.42
6 0.36
7 0.29
8 0.2
9 0.13
10 0.08
11 0.07
12 0.06
13 0.04
14 0.05
15 0.05
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.07
20 0.09
21 0.14
22 0.17
23 0.25
24 0.31
25 0.38
26 0.43
27 0.49
28 0.55
29 0.58
30 0.64
31 0.65
32 0.66
33 0.6
34 0.56
35 0.52
36 0.44
37 0.37
38 0.29
39 0.21
40 0.14
41 0.14
42 0.12
43 0.1
44 0.09
45 0.09
46 0.07
47 0.09
48 0.09
49 0.1
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.11
54 0.13
55 0.12
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.14
60 0.16
61 0.21
62 0.24
63 0.25
64 0.28
65 0.29
66 0.31
67 0.36
68 0.37
69 0.35
70 0.37
71 0.36
72 0.33
73 0.33
74 0.29
75 0.2
76 0.17
77 0.14
78 0.07
79 0.05
80 0.05
81 0.03
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.04
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.11
92 0.12
93 0.14
94 0.15
95 0.17
96 0.24
97 0.33
98 0.41
99 0.42
100 0.42
101 0.41
102 0.41
103 0.39
104 0.34
105 0.29
106 0.21
107 0.16
108 0.16
109 0.17
110 0.17
111 0.19
112 0.22
113 0.24
114 0.25
115 0.26
116 0.26
117 0.26
118 0.28
119 0.27
120 0.24
121 0.17
122 0.16
123 0.16
124 0.15
125 0.14
126 0.12
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.06
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.11
150 0.12
151 0.14
152 0.15
153 0.16
154 0.19
155 0.24
156 0.29
157 0.28
158 0.28
159 0.31
160 0.39
161 0.47
162 0.53
163 0.55
164 0.55
165 0.61
166 0.65
167 0.7
168 0.7
169 0.69
170 0.69
171 0.71
172 0.76
173 0.75
174 0.72
175 0.7
176 0.7
177 0.66
178 0.67
179 0.6
180 0.54
181 0.49
182 0.46
183 0.4
184 0.32
185 0.31
186 0.23
187 0.23
188 0.2
189 0.19
190 0.18
191 0.17
192 0.16
193 0.12
194 0.09
195 0.07
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.11
202 0.15
203 0.16
204 0.19
205 0.28
206 0.32
207 0.34
208 0.36
209 0.38
210 0.39
211 0.39
212 0.4
213 0.34
214 0.32
215 0.29
216 0.27
217 0.22
218 0.19
219 0.17
220 0.14
221 0.1
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.11
228 0.19
229 0.27
230 0.37
231 0.44
232 0.53
233 0.62
234 0.72
235 0.78
236 0.81
237 0.82
238 0.84
239 0.88
240 0.88
241 0.84
242 0.82
243 0.81
244 0.75
245 0.75
246 0.69
247 0.64
248 0.58
249 0.56
250 0.52
251 0.51
252 0.49
253 0.46
254 0.48
255 0.51
256 0.52
257 0.54
258 0.51
259 0.48
260 0.49
261 0.46
262 0.46
263 0.39
264 0.36
265 0.4
266 0.43
267 0.39
268 0.38
269 0.4
270 0.37
271 0.38
272 0.35
273 0.29
274 0.32
275 0.35
276 0.36
277 0.38
278 0.45
279 0.52
280 0.59
281 0.66
282 0.69
283 0.75
284 0.75
285 0.74
286 0.71
287 0.69
288 0.65
289 0.57
290 0.48
291 0.38
292 0.35
293 0.29
294 0.21
295 0.15
296 0.15
297 0.17
298 0.17
299 0.17
300 0.21
301 0.26
302 0.27
303 0.29
304 0.34
305 0.32
306 0.34
307 0.39
308 0.43
309 0.45
310 0.44
311 0.43
312 0.37
313 0.35
314 0.32
315 0.28
316 0.19
317 0.13
318 0.13
319 0.11
320 0.1
321 0.09
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.07
331 0.08
332 0.16
333 0.2
334 0.22
335 0.25
336 0.27
337 0.31
338 0.3
339 0.28
340 0.23
341 0.2
342 0.18
343 0.15
344 0.13
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.11
349 0.13
350 0.14
351 0.14
352 0.15
353 0.16
354 0.17
355 0.18
356 0.14
357 0.11
358 0.1
359 0.11
360 0.1
361 0.12
362 0.12
363 0.14
364 0.15
365 0.15
366 0.17
367 0.21
368 0.23
369 0.25
370 0.33
371 0.35
372 0.42
373 0.51
374 0.59
375 0.64
376 0.72
377 0.76
378 0.75
379 0.79
380 0.74
381 0.65
382 0.58
383 0.52
384 0.46
385 0.41
386 0.33
387 0.27
388 0.26
389 0.26
390 0.22
391 0.18
392 0.16
393 0.13
394 0.13
395 0.09
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.11
400 0.1
401 0.1
402 0.12
403 0.14
404 0.16
405 0.16
406 0.19
407 0.25
408 0.27
409 0.27
410 0.24
411 0.23
412 0.2
413 0.2
414 0.17
415 0.09
416 0.07
417 0.06
418 0.06
419 0.05
420 0.05
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.05
427 0.05
428 0.07
429 0.09
430 0.11
431 0.13
432 0.13
433 0.13
434 0.12
435 0.13
436 0.12
437 0.1
438 0.16
439 0.16
440 0.18
441 0.2
442 0.25
443 0.29
444 0.31
445 0.34
446 0.31
447 0.38
448 0.41
449 0.43
450 0.43
451 0.46
452 0.47
453 0.51
454 0.48
455 0.46
456 0.48
457 0.51
458 0.48
459 0.45
460 0.42
461 0.37
462 0.37
463 0.32
464 0.26
465 0.19
466 0.17
467 0.13
468 0.13
469 0.11
470 0.09
471 0.08
472 0.07
473 0.06
474 0.06
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.04
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.02
484 0.02
485 0.02
486 0.02
487 0.02
488 0.03
489 0.04
490 0.04
491 0.05
492 0.05
493 0.06
494 0.06
495 0.07
496 0.06
497 0.06
498 0.07
499 0.06
500 0.07
501 0.07
502 0.06
503 0.06
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.03
509 0.03
510 0.03
511 0.03
512 0.03
513 0.03
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.07
518 0.07
519 0.08
520 0.08
521 0.09
522 0.08
523 0.09
524 0.1
525 0.09
526 0.09
527 0.09
528 0.1
529 0.1
530 0.1
531 0.14
532 0.15
533 0.2
534 0.21
535 0.21
536 0.2
537 0.21
538 0.2
539 0.16
540 0.15
541 0.1
542 0.09
543 0.09
544 0.09
545 0.09
546 0.09
547 0.08
548 0.08
549 0.07
550 0.07
551 0.09
552 0.09
553 0.08
554 0.09
555 0.08
556 0.09
557 0.09
558 0.09
559 0.07
560 0.06
561 0.05
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.04
574 0.04
575 0.05
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.04
580 0.03
581 0.03
582 0.03
583 0.03
584 0.03
585 0.03
586 0.03
587 0.03
588 0.04
589 0.04
590 0.05
591 0.05
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.06
596 0.05
597 0.06
598 0.06
599 0.06
600 0.05
601 0.05
602 0.05
603 0.05
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.08
608 0.08
609 0.09
610 0.09
611 0.15
612 0.17
613 0.16
614 0.16
615 0.15
616 0.15
617 0.15
618 0.16
619 0.11
620 0.11
621 0.12
622 0.12
623 0.12
624 0.11
625 0.11
626 0.11
627 0.11
628 0.08
629 0.09
630 0.09
631 0.09
632 0.09
633 0.09
634 0.08
635 0.06
636 0.06
637 0.05
638 0.07
639 0.14
640 0.15
641 0.2
642 0.24
643 0.24
644 0.26
645 0.3
646 0.32
647 0.3
648 0.4
649 0.45
650 0.48
651 0.54
652 0.55
653 0.56
654 0.53
655 0.54
656 0.51
657 0.45
658 0.41
659 0.35
660 0.33
661 0.29
662 0.26
663 0.22
664 0.18
665 0.16
666 0.14
667 0.19
668 0.19
669 0.18
670 0.19
671 0.17
672 0.14
673 0.13
674 0.14
675 0.09
676 0.1
677 0.11
678 0.11
679 0.12
680 0.13
681 0.12
682 0.1
683 0.1
684 0.09
685 0.07
686 0.07
687 0.06
688 0.05
689 0.07
690 0.07
691 0.07
692 0.06
693 0.06
694 0.06
695 0.06
696 0.06
697 0.04
698 0.05
699 0.08
700 0.12
701 0.15
702 0.16
703 0.19
704 0.2
705 0.2
706 0.24
707 0.24
708 0.24
709 0.27
710 0.3
711 0.29
712 0.28
713 0.28
714 0.26
715 0.27
716 0.24
717 0.19
718 0.2
719 0.18
720 0.2
721 0.25
722 0.24
723 0.19
724 0.25
725 0.25
726 0.25
727 0.27
728 0.28
729 0.23
730 0.23
731 0.25
732 0.24
733 0.25
734 0.21
735 0.22
736 0.19
737 0.2
738 0.2
739 0.18
740 0.12
741 0.1
742 0.11
743 0.08
744 0.08
745 0.06
746 0.07
747 0.11
748 0.11
749 0.12
750 0.11
751 0.15
752 0.17
753 0.22
754 0.23
755 0.29
756 0.37
757 0.42
758 0.42
759 0.41
760 0.39
761 0.36
762 0.35
763 0.27
764 0.19
765 0.15
766 0.15
767 0.13
768 0.13
769 0.11
770 0.12
771 0.13
772 0.14
773 0.13
774 0.13
775 0.13
776 0.16
777 0.16
778 0.15
779 0.13
780 0.11
781 0.11
782 0.1
783 0.09
784 0.05
785 0.05
786 0.05
787 0.05
788 0.05
789 0.05
790 0.06
791 0.06
792 0.07
793 0.1
794 0.1
795 0.15
796 0.15
797 0.16
798 0.17
799 0.18
800 0.16
801 0.15
802 0.18
803 0.15
804 0.17
805 0.15
806 0.19
807 0.19
808 0.2
809 0.19
810 0.18
811 0.16
812 0.14
813 0.16
814 0.12
815 0.11
816 0.11
817 0.11
818 0.09
819 0.09
820 0.08
821 0.06
822 0.04
823 0.04
824 0.04
825 0.04
826 0.04
827 0.04
828 0.04
829 0.04
830 0.04
831 0.06
832 0.07
833 0.07
834 0.08
835 0.09
836 0.09
837 0.09
838 0.09
839 0.08
840 0.07
841 0.08
842 0.07
843 0.08
844 0.09
845 0.09
846 0.09
847 0.09
848 0.09
849 0.1
850 0.16
851 0.17
852 0.2
853 0.22
854 0.25
855 0.27
856 0.29
857 0.29
858 0.28
859 0.3
860 0.27
861 0.25
862 0.21
863 0.19
864 0.17
865 0.15
866 0.1
867 0.05
868 0.04
869 0.03
870 0.03
871 0.02
872 0.02
873 0.02
874 0.02
875 0.02
876 0.01
877 0.01
878 0.01
879 0.01
880 0.02
881 0.02
882 0.02
883 0.03
884 0.03
885 0.04
886 0.05
887 0.06
888 0.07
889 0.11
890 0.14
891 0.16
892 0.22
893 0.26
894 0.28
895 0.29
896 0.28
897 0.25
898 0.24
899 0.23
900 0.17
901 0.12
902 0.12
903 0.1
904 0.09
905 0.09
906 0.06
907 0.05
908 0.05
909 0.04
910 0.04
911 0.06
912 0.12
913 0.13
914 0.15
915 0.16
916 0.16
917 0.17
918 0.19
919 0.22
920 0.17
921 0.19
922 0.18
923 0.22
924 0.22
925 0.21
926 0.19
927 0.14
928 0.16
929 0.2
930 0.2
931 0.17
932 0.18
933 0.19
934 0.2
935 0.24
936 0.27
937 0.24
938 0.23
939 0.24
940 0.23
941 0.23
942 0.22
943 0.19
944 0.13
945 0.11
946 0.11
947 0.09
948 0.08
949 0.08
950 0.09
951 0.1
952 0.14
953 0.2