Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3C430

Protein Details
Accession S3C430    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
176-200KEEEEERDRRRKKKRDLADKKRVADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-42REAKEREEGK
181-197ERDRRRKKKRDLADKKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR013957  SNRNP27  
IPR040107  Snu23  
IPR000608  UBQ-conjugat_E2  
IPR023313  UBQ-conjugating_AS  
IPR016135  UBQ-conjugating_enzyme/RWD  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
PF00179  UQ_con  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00183  UBC_1  
PS50127  UBC_2  
CDD cd00195  UBCc  
Amino Acid Sequences MSKQSSAYGTPAGDTDFRKTRNLDEYAAKAKEREAKEREEGKARYEAKMAGKRYYKPLEGNESLTSARAATLDLSSQVGKTQIIPAGSGVGRRGRGAGFYCEACDWTVKDNLQWVEHINSVSHLRNVGQTGEVRRATVDDVLARIGSAWERRLAEKDAERQVTSTDLKERLALREKEEEEERDRRRKKKRDLADKKRVADAEAAAALEASRKDYGEDVRVEGEHDEDDMMAMMGFSGFGTTKNLHDRTTRFIASSASHPPAARPQGKDSTTRRPSTPPPQPRSRFARALPHPSTSTASLCFTLIMTSAGSTTLLRRQLKQMQTSTDIPGISCGLVSDDNIYQWEVMLMISDDVKFYGGNCHFSLAPSIRSNTGIANTPGGNFRAFLTFPHEYPLLPPKLTFQDPVPYHPNVYENGDLCISILHPPEEDRYGYESAAERWSPVQSPETILLSVISLFAGPNDESPANVEAAREWRDQQAGVSKNFSRRVRQCVRASLGED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.26
3 0.3
4 0.32
5 0.37
6 0.38
7 0.42
8 0.46
9 0.48
10 0.45
11 0.44
12 0.48
13 0.51
14 0.52
15 0.46
16 0.39
17 0.4
18 0.44
19 0.43
20 0.47
21 0.44
22 0.48
23 0.56
24 0.63
25 0.63
26 0.64
27 0.6
28 0.55
29 0.59
30 0.54
31 0.47
32 0.43
33 0.43
34 0.43
35 0.49
36 0.48
37 0.47
38 0.51
39 0.52
40 0.59
41 0.6
42 0.55
43 0.54
44 0.57
45 0.58
46 0.54
47 0.54
48 0.46
49 0.42
50 0.37
51 0.32
52 0.26
53 0.17
54 0.14
55 0.1
56 0.09
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.12
68 0.14
69 0.15
70 0.15
71 0.16
72 0.15
73 0.18
74 0.18
75 0.18
76 0.17
77 0.18
78 0.19
79 0.19
80 0.2
81 0.16
82 0.2
83 0.22
84 0.23
85 0.22
86 0.22
87 0.23
88 0.22
89 0.22
90 0.19
91 0.18
92 0.14
93 0.15
94 0.19
95 0.18
96 0.19
97 0.24
98 0.25
99 0.24
100 0.24
101 0.23
102 0.21
103 0.23
104 0.22
105 0.16
106 0.16
107 0.19
108 0.2
109 0.18
110 0.16
111 0.15
112 0.17
113 0.18
114 0.17
115 0.16
116 0.18
117 0.19
118 0.25
119 0.25
120 0.22
121 0.21
122 0.22
123 0.2
124 0.18
125 0.17
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.09
132 0.08
133 0.09
134 0.1
135 0.11
136 0.14
137 0.16
138 0.17
139 0.21
140 0.23
141 0.26
142 0.29
143 0.35
144 0.38
145 0.39
146 0.38
147 0.35
148 0.32
149 0.31
150 0.28
151 0.23
152 0.21
153 0.2
154 0.2
155 0.23
156 0.24
157 0.25
158 0.33
159 0.32
160 0.31
161 0.37
162 0.38
163 0.38
164 0.39
165 0.37
166 0.34
167 0.41
168 0.43
169 0.46
170 0.52
171 0.58
172 0.66
173 0.73
174 0.78
175 0.79
176 0.83
177 0.85
178 0.89
179 0.91
180 0.91
181 0.88
182 0.8
183 0.74
184 0.64
185 0.54
186 0.44
187 0.33
188 0.24
189 0.17
190 0.14
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.09
201 0.11
202 0.14
203 0.15
204 0.14
205 0.14
206 0.14
207 0.15
208 0.13
209 0.12
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.03
218 0.03
219 0.02
220 0.02
221 0.02
222 0.02
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.06
227 0.07
228 0.09
229 0.15
230 0.17
231 0.18
232 0.22
233 0.23
234 0.27
235 0.3
236 0.29
237 0.23
238 0.22
239 0.22
240 0.2
241 0.21
242 0.19
243 0.16
244 0.17
245 0.17
246 0.17
247 0.21
248 0.26
249 0.28
250 0.26
251 0.29
252 0.34
253 0.36
254 0.43
255 0.42
256 0.46
257 0.48
258 0.48
259 0.46
260 0.43
261 0.48
262 0.5
263 0.56
264 0.55
265 0.56
266 0.64
267 0.66
268 0.69
269 0.7
270 0.67
271 0.61
272 0.54
273 0.57
274 0.51
275 0.57
276 0.52
277 0.47
278 0.42
279 0.39
280 0.38
281 0.29
282 0.26
283 0.18
284 0.17
285 0.14
286 0.13
287 0.12
288 0.1
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.1
300 0.18
301 0.19
302 0.21
303 0.27
304 0.35
305 0.4
306 0.45
307 0.44
308 0.41
309 0.44
310 0.44
311 0.4
312 0.35
313 0.29
314 0.23
315 0.2
316 0.17
317 0.12
318 0.1
319 0.07
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.1
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.14
344 0.15
345 0.19
346 0.19
347 0.2
348 0.2
349 0.21
350 0.26
351 0.19
352 0.22
353 0.21
354 0.22
355 0.22
356 0.23
357 0.23
358 0.19
359 0.19
360 0.19
361 0.17
362 0.18
363 0.17
364 0.17
365 0.18
366 0.18
367 0.16
368 0.13
369 0.13
370 0.14
371 0.14
372 0.14
373 0.19
374 0.2
375 0.2
376 0.23
377 0.22
378 0.19
379 0.23
380 0.31
381 0.27
382 0.25
383 0.25
384 0.26
385 0.31
386 0.33
387 0.31
388 0.25
389 0.31
390 0.32
391 0.37
392 0.38
393 0.34
394 0.33
395 0.33
396 0.32
397 0.25
398 0.28
399 0.27
400 0.22
401 0.23
402 0.22
403 0.2
404 0.18
405 0.16
406 0.12
407 0.12
408 0.13
409 0.12
410 0.12
411 0.14
412 0.18
413 0.2
414 0.2
415 0.19
416 0.21
417 0.22
418 0.21
419 0.23
420 0.21
421 0.21
422 0.25
423 0.22
424 0.19
425 0.19
426 0.22
427 0.21
428 0.22
429 0.22
430 0.19
431 0.22
432 0.24
433 0.25
434 0.22
435 0.21
436 0.18
437 0.15
438 0.14
439 0.11
440 0.08
441 0.06
442 0.05
443 0.06
444 0.08
445 0.08
446 0.09
447 0.14
448 0.14
449 0.14
450 0.17
451 0.18
452 0.17
453 0.17
454 0.16
455 0.14
456 0.2
457 0.25
458 0.24
459 0.24
460 0.27
461 0.29
462 0.29
463 0.31
464 0.34
465 0.35
466 0.36
467 0.4
468 0.41
469 0.46
470 0.54
471 0.55
472 0.56
473 0.57
474 0.65
475 0.68
476 0.73
477 0.73
478 0.74
479 0.75