FuNGI

S3CT67

Protein Details

Accession

S3CT67

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-61	GPSNGTPNARPRPLRRKPRPADPLVARKKPSQRPPSAPTTT	Hydrophilic
225-250	VTSKDAPKKPIQQQKKEKQKQFQLYY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
29-53	ARPRPLRRKPRPADPLVARKKPSQR
537-559	KSKTGSGPGASKKSKSLKRPGSP
570-576	SRKKVKK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPSGQPGQPGQPGQPGQPGPSNGTPNARPRPLRRKPRPADPLVARKKPSQRPPSAPTTTILSSTNRSGITALSLPSEARTLNTLNPVDEAKKLAVFNEQRKANGGWTDPTPPAGYRDFPVVTTKRALREGIRYHVMRFAKAKGGDDEAEIDPTNQDDFTRPVSLHRRDPRQPAPGRAAKEQAAAAAAPVAPATADEKEAEKAAQMKAEREAQRAIDMAQIAPVTSKDAPKKPIQQQKKEKQKQFQLYYPKSTPEQKKETEIRYEEALPWHLEDVDGKNVWVGSYISALSEANVALVIDGSAFRMVPLEKFYRFTPKPPFRAYSTEQAEEIMAKKMAAGRWAMRDDEKRKQREELEETRRTIGGHARVKLESSTFRSAPRSEKQDHNDIDMEGDEFQDDDENVGLEPDNDEDSKDTRDRQRRNHMGANLFGDADEHEVDKEEKEEKQDRVARNQGALGKQIRKALAKREDHLEYLEYRDSDTNSEKEDFLELSSDDDEEEEEKKEDDQSQSQQKGKDDKEKSATGTPKGSTTPQGKSKTGSGPGASKKSKSLKRPGSPNLSESSGNESSRKKVKKHANGTSIQPSRSGTPLSGQQRKAGKGSSSMAGGAQSDGEATAGEMSDGAGSKRRIKIVAKSARATPGGSRAGSPNPAQGPLSPGSNPGSPGRAGSPVSVSRAGSPTAAATAAVAAGSGPVDAEEIINALNKFPDGITVGGLLKVFGSRVGDQMKRKDWIKLVKENSIFGEDKMLRAKLPGSD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.35
3	0.4
4	0.37
5	0.36
6	0.4
7	0.4
8	0.38
9	0.42
10	0.44
11	0.4
12	0.45
13	0.46
14	0.5
15	0.56
16	0.58
17	0.59
18	0.65
19	0.73
20	0.77
21	0.83
22	0.85
23	0.87
24	0.87
25	0.9
26	0.9
27	0.86
28	0.85
29	0.83
30	0.83
31	0.82
32	0.82
33	0.74
34	0.73
35	0.76
36	0.76
37	0.77
38	0.77
39	0.76
40	0.78
41	0.81
42	0.82
43	0.77
44	0.69
45	0.6
46	0.55
47	0.47
48	0.4
49	0.36
50	0.29
51	0.27
52	0.28
53	0.3
54	0.24
55	0.23
56	0.21
57	0.19
58	0.2
59	0.19
60	0.17
61	0.15
62	0.16
63	0.15
64	0.16
65	0.17
66	0.13
67	0.11
68	0.14
69	0.14
70	0.17
71	0.24
72	0.24
73	0.23
74	0.25
75	0.26
76	0.25
77	0.24
78	0.24
79	0.18
80	0.21
81	0.2
82	0.19
83	0.26
84	0.32
85	0.38
86	0.44
87	0.44
88	0.42
89	0.46
90	0.46
91	0.41
92	0.38
93	0.33
94	0.28
95	0.28
96	0.32
97	0.28
98	0.29
99	0.26
100	0.23
101	0.24
102	0.23
103	0.23
104	0.2
105	0.25
106	0.23
107	0.23
108	0.3
109	0.29
110	0.29
111	0.33
112	0.35
113	0.34
114	0.36
115	0.38
116	0.33
117	0.41
118	0.43
119	0.43
120	0.47
121	0.44
122	0.42
123	0.47
124	0.44
125	0.38
126	0.36
127	0.32
128	0.33
129	0.33
130	0.35
131	0.3
132	0.33
133	0.3
134	0.28
135	0.29
136	0.22
137	0.22
138	0.19
139	0.17
140	0.13
141	0.13
142	0.13
143	0.09
144	0.09
145	0.09
146	0.12
147	0.15
148	0.17
149	0.16
150	0.23
151	0.32
152	0.37
153	0.45
154	0.51
155	0.56
156	0.61
157	0.69
158	0.7
159	0.71
160	0.71
161	0.67
162	0.68
163	0.65
164	0.62
165	0.57
166	0.53
167	0.44
168	0.41
169	0.35
170	0.26
171	0.21
172	0.16
173	0.13
174	0.1
175	0.09
176	0.06
177	0.06
178	0.05
179	0.04
180	0.05
181	0.07
182	0.07
183	0.08
184	0.08
185	0.1
186	0.11
187	0.12
188	0.12
189	0.11
190	0.14
191	0.14
192	0.18
193	0.17
194	0.18
195	0.21
196	0.29
197	0.3
198	0.29
199	0.31
200	0.27
201	0.27
202	0.26
203	0.23
204	0.17
205	0.15
206	0.12
207	0.12
208	0.11
209	0.09
210	0.09
211	0.09
212	0.1
213	0.11
214	0.16
215	0.21
216	0.26
217	0.31
218	0.37
219	0.46
220	0.52
221	0.61
222	0.66
223	0.7
224	0.77
225	0.83
226	0.88
227	0.89
228	0.87
229	0.86
230	0.86
231	0.85
232	0.79
233	0.76
234	0.75
235	0.7
236	0.69
237	0.62
238	0.55
239	0.48
240	0.52
241	0.53
242	0.5
243	0.52
244	0.47
245	0.54
246	0.57
247	0.58
248	0.57
249	0.51
250	0.44
251	0.4
252	0.39
253	0.33
254	0.28
255	0.26
256	0.18
257	0.16
258	0.15
259	0.12
260	0.11
261	0.11
262	0.11
263	0.13
264	0.13
265	0.12
266	0.12
267	0.12
268	0.12
269	0.11
270	0.09
271	0.06
272	0.07
273	0.07
274	0.06
275	0.07
276	0.07
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.03
284	0.04
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.05
293	0.05
294	0.06
295	0.1
296	0.13
297	0.14
298	0.16
299	0.17
300	0.26
301	0.26
302	0.31
303	0.38
304	0.43
305	0.48
306	0.51
307	0.53
308	0.47
309	0.52
310	0.5
311	0.48
312	0.45
313	0.39
314	0.35
315	0.32
316	0.29
317	0.23
318	0.21
319	0.13
320	0.09
321	0.08
322	0.08
323	0.1
324	0.11
325	0.11
326	0.12
327	0.12
328	0.16
329	0.17
330	0.18
331	0.19
332	0.26
333	0.3
334	0.37
335	0.43
336	0.44
337	0.45
338	0.48
339	0.49
340	0.49
341	0.52
342	0.52
343	0.53
344	0.53
345	0.53
346	0.5
347	0.46
348	0.38
349	0.32
350	0.27
351	0.26
352	0.25
353	0.26
354	0.27
355	0.27
356	0.27
357	0.26
358	0.23
359	0.18
360	0.19
361	0.2
362	0.19
363	0.21
364	0.23
365	0.24
366	0.28
367	0.3
368	0.31
369	0.31
370	0.37
371	0.39
372	0.45
373	0.44
374	0.41
375	0.37
376	0.31
377	0.28
378	0.21
379	0.18
380	0.1
381	0.09
382	0.06
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.07
400	0.08
401	0.12
402	0.13
403	0.16
404	0.24
405	0.33
406	0.4
407	0.47
408	0.57
409	0.62
410	0.67
411	0.69
412	0.65
413	0.58
414	0.54
415	0.47
416	0.37
417	0.28
418	0.22
419	0.16
420	0.11
421	0.1
422	0.08
423	0.06
424	0.06
425	0.07
426	0.08
427	0.08
428	0.09
429	0.1
430	0.11
431	0.17
432	0.22
433	0.22
434	0.3
435	0.36
436	0.37
437	0.42
438	0.47
439	0.42
440	0.38
441	0.39
442	0.35
443	0.29
444	0.31
445	0.29
446	0.26
447	0.28
448	0.3
449	0.29
450	0.3
451	0.32
452	0.37
453	0.41
454	0.41
455	0.4
456	0.43
457	0.42
458	0.39
459	0.37
460	0.3
461	0.22
462	0.21
463	0.21
464	0.16
465	0.15
466	0.15
467	0.15
468	0.16
469	0.18
470	0.17
471	0.18
472	0.19
473	0.18
474	0.17
475	0.18
476	0.15
477	0.12
478	0.12
479	0.09
480	0.09
481	0.09
482	0.09
483	0.07
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.09
488	0.08
489	0.09
490	0.09
491	0.1
492	0.12
493	0.15
494	0.17
495	0.2
496	0.25
497	0.34
498	0.39
499	0.42
500	0.44
501	0.45
502	0.5
503	0.51
504	0.54
505	0.48
506	0.49
507	0.51
508	0.5
509	0.49
510	0.48
511	0.48
512	0.41
513	0.41
514	0.35
515	0.31
516	0.31
517	0.29
518	0.29
519	0.29
520	0.33
521	0.37
522	0.42
523	0.41
524	0.42
525	0.44
526	0.43
527	0.43
528	0.39
529	0.32
530	0.34
531	0.39
532	0.44
533	0.42
534	0.38
535	0.41
536	0.48
537	0.53
538	0.55
539	0.6
540	0.62
541	0.68
542	0.76
543	0.77
544	0.77
545	0.72
546	0.66
547	0.59
548	0.51
549	0.44
550	0.35
551	0.35
552	0.29
553	0.27
554	0.29
555	0.28
556	0.3
557	0.39
558	0.44
559	0.4
560	0.46
561	0.56
562	0.62
563	0.71
564	0.75
565	0.73
566	0.71
567	0.73
568	0.74
569	0.67
570	0.57
571	0.48
572	0.4
573	0.34
574	0.33
575	0.28
576	0.18
577	0.17
578	0.25
579	0.33
580	0.39
581	0.38
582	0.42
583	0.47
584	0.49
585	0.49
586	0.44
587	0.37
588	0.34
589	0.35
590	0.31
591	0.26
592	0.24
593	0.21
594	0.18
595	0.16
596	0.12
597	0.09
598	0.07
599	0.06
600	0.06
601	0.05
602	0.04
603	0.04
604	0.04
605	0.04
606	0.04
607	0.04
608	0.04
609	0.05
610	0.06
611	0.07
612	0.12
613	0.15
614	0.22
615	0.26
616	0.29
617	0.33
618	0.37
619	0.45
620	0.5
621	0.57
622	0.57
623	0.56
624	0.56
625	0.57
626	0.54
627	0.46
628	0.38
629	0.36
630	0.33
631	0.31
632	0.29
633	0.27
634	0.3
635	0.32
636	0.31
637	0.29
638	0.27
639	0.28
640	0.27
641	0.25
642	0.26
643	0.24
644	0.25
645	0.19
646	0.2
647	0.22
648	0.22
649	0.24
650	0.21
651	0.23
652	0.2
653	0.22
654	0.21
655	0.22
656	0.21
657	0.2
658	0.24
659	0.23
660	0.27
661	0.28
662	0.26
663	0.26
664	0.27
665	0.26
666	0.21
667	0.19
668	0.16
669	0.14
670	0.14
671	0.1
672	0.08
673	0.07
674	0.07
675	0.06
676	0.05
677	0.04
678	0.04
679	0.04
680	0.04
681	0.03
682	0.03
683	0.04
684	0.05
685	0.05
686	0.05
687	0.05
688	0.06
689	0.1
690	0.1
691	0.1
692	0.11
693	0.1
694	0.11
695	0.11
696	0.13
697	0.11
698	0.12
699	0.12
700	0.13
701	0.14
702	0.15
703	0.15
704	0.12
705	0.1
706	0.1
707	0.1
708	0.09
709	0.13
710	0.13
711	0.19
712	0.26
713	0.32
714	0.38
715	0.46
716	0.51
717	0.53
718	0.54
719	0.56
720	0.57
721	0.62
722	0.63
723	0.65
724	0.64
725	0.67
726	0.67
727	0.62
728	0.57
729	0.52
730	0.45
731	0.35
732	0.39
733	0.3
734	0.32
735	0.35
736	0.33
737	0.27
738	0.28

S3CT67

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer