Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CC16

Protein Details
Accession S3CC16    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-71SIPMTRRDAPPRARRAPKNPKPKSAAPRTRYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-68RDAPPRARRAPKNPKPKSAAPR
Subcellular Location(s) plas 13, nucl 8, mito 2, cyto 1, extr 1, E.R. 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008217  Ccc1_fam  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005384  F:manganese ion transmembrane transporter activity  
GO:0030026  P:intracellular manganese ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF01988  VIT1  
Amino Acid Sequences MADSSRYSRLAPDNGSPYSLGALSTSSSNISHHDDNESEDSIPMTRRDAPPRARRAPKNPKPKSAAPRTRYLPTSRRFWADFTMGFADGLTVPFALTAGLSSLGQTDTVVYAGLAEVSAGCISMGIGGYLSARQSSPSTSSTRDDNVEDEDDDTSCKDLEAFRSSGEDHEKDATASPTAVHPSALASRYLAPLNLPADLQQLVMTHIAAKPDTIQALLAAESQTLSDPDYGHYSEQRALLDERESDADDDDDDYVWPVASGLSVALGYLIGGLLPLGPYFFVESVGNGLRWSFAVCIVALFLFGFLRDFALGSQAAADSGSARKTSARQLSWHKSQIPWRRLWKSTFEGLQMVILGAIAAIAAVLCVRMFESEKST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.43
3 0.37
4 0.31
5 0.27
6 0.23
7 0.16
8 0.11
9 0.1
10 0.1
11 0.1
12 0.11
13 0.1
14 0.11
15 0.11
16 0.15
17 0.2
18 0.22
19 0.22
20 0.26
21 0.25
22 0.29
23 0.32
24 0.3
25 0.24
26 0.22
27 0.21
28 0.19
29 0.21
30 0.17
31 0.17
32 0.22
33 0.28
34 0.35
35 0.43
36 0.51
37 0.59
38 0.68
39 0.75
40 0.78
41 0.81
42 0.84
43 0.87
44 0.87
45 0.88
46 0.86
47 0.86
48 0.84
49 0.84
50 0.83
51 0.83
52 0.84
53 0.77
54 0.77
55 0.73
56 0.71
57 0.66
58 0.63
59 0.61
60 0.55
61 0.57
62 0.52
63 0.53
64 0.49
65 0.46
66 0.43
67 0.38
68 0.34
69 0.31
70 0.29
71 0.24
72 0.23
73 0.2
74 0.16
75 0.12
76 0.12
77 0.08
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.03
85 0.04
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.06
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.04
111 0.04
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.07
122 0.09
123 0.12
124 0.15
125 0.17
126 0.2
127 0.21
128 0.22
129 0.24
130 0.24
131 0.21
132 0.2
133 0.2
134 0.18
135 0.17
136 0.15
137 0.13
138 0.12
139 0.11
140 0.1
141 0.08
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.1
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.15
151 0.15
152 0.17
153 0.2
154 0.17
155 0.15
156 0.16
157 0.16
158 0.15
159 0.16
160 0.14
161 0.1
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.08
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.1
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.1
217 0.11
218 0.12
219 0.13
220 0.14
221 0.15
222 0.16
223 0.16
224 0.15
225 0.15
226 0.16
227 0.16
228 0.15
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.12
233 0.11
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.02
258 0.02
259 0.02
260 0.02
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.04
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.11
272 0.12
273 0.12
274 0.11
275 0.1
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.08
280 0.07
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.09
298 0.09
299 0.08
300 0.09
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.06
306 0.08
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.13
311 0.16
312 0.25
313 0.32
314 0.34
315 0.39
316 0.49
317 0.57
318 0.63
319 0.67
320 0.62
321 0.59
322 0.65
323 0.69
324 0.66
325 0.66
326 0.68
327 0.69
328 0.71
329 0.7
330 0.68
331 0.63
332 0.63
333 0.58
334 0.51
335 0.45
336 0.39
337 0.36
338 0.28
339 0.22
340 0.14
341 0.1
342 0.07
343 0.05
344 0.04
345 0.03
346 0.02
347 0.02
348 0.02
349 0.02
350 0.02
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.04
355 0.07
356 0.1