FuNGI

S3C5L6

Protein Details

Accession

S3C5L6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1165-1189	NKTGAQTLRQRDRSRKLRDEYERIS	Hydrophilic
1236-1263	YCPQEQREWEAQRKKRGARKDKDEETIE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1248-1255	RKKRGARK

Subcellular Location(s)

nucl 10, cyto 9, pero 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MEVFLHGLPEQGSLSDRVIKMHLQPHMQTLGIDQITYDVEKAARKRYAFVTFLYPKDGSRFVEKFSVNTKTSPGLILLGARVTCKISDRNVHPLTVRLLEADVKNSKAAAAQAAAAAKLAPAAKAPSGTPSAQTAQTAQPPQLAQPSAPATTTAASKAADTTHAPSSTAISFTCTGMHCGYYKYDVTGKLLFVPEYTEPQGKNRGVVRFGKRMLSIERKGSGVSIYIPLMTVHEIVWSPGGTMAFTLTSVPIFVSTPGSTTSAPVDKRIRLTAINNDHAKIVGMCLVYCLELVPDEDLIRKISRLSKHIGGVAVTRYDLTFAWGSDIAHREKSLRDMMLQVSTSNSLPFALLLQLQALVNNGYLHPDTVWGLTRSLVAVHRKTPISNEAMKKLFQAINWPTPHYHDPTEFDVPALVEYLVETEREIKEGLMIREGINNPASNLTPVFRAVVTPTRMTLHGPELENRNRVLRKFPNHHDYFVRVQFCDEDGQGLRFNSRIDLAKVYDRFRRIMIEGINIAGRTYKFLGWSHSSLRAHSMWFVAPFLNEGSLQTHFTIISALGNFNDIQSPARCAARIGQAFSETPFAVPVERNGIAIYQIPDVTTPDKERVYSDGVGTISWEAVKVILSHLPAGKRKAYPTCFQIRYAGAKGMLSLDTSLNGKQIRLRPSMIKFESNEKANLEICDMASQPIPLYTNRQLIKIMEDMGVPESWFVKLQEAALKELKYITKDSYNMANFLKAQGVASAIKLHKVLLLADRLLLDYRNDPFLRRATDAIVLRELRLLKHKARMFVHLGITLFGVMDETGLLGEHEVYVTYTTKKGSKSQRYSPPPVHGAKLLVTRSPALHPGDIQMATNVIPPEGHPLYSLTNCIVFSKYGGGNASPEQLAQTGKDAPRDLPSKLSGGDLDGDIFNVIWDPEVIDVDPPLDTFYPADYPRQRPASIGRPVTQEDIADFFIDFIKTDHLGAIATRHMILADQLENGTLESKCIATAELHSTAVDFSKTGIPADLRNLPKVKYRPDFLSPGPIVHIYSKADINMDDFLVDNANEEDEGDGGFSAPAYKFYPSDKILGTLYRTIDERQVWVNDIQRPPEQFEGLDLYGAFLKWATYECANVRCYEWQHRRSEAQRIRSAYDDAIINTMHEFSEYPTQPLTELEVFIGTIINKTGAQTLRQRDRSRKLRDEYERISGWITTQIRPRTASDDETADGDDESRTGQETWYKQHLRVLELCLACAYCPQEQREWEAQRKKRGARKDKDEETIESFWLVAASALIRELEFIRHGLEVDVDLANSMQTLGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.21
3	0.21
4	0.22
5	0.24
6	0.26
7	0.3
8	0.35
9	0.38
10	0.37
11	0.38
12	0.41
13	0.41
14	0.38
15	0.32
16	0.27
17	0.29
18	0.24
19	0.22
20	0.17
21	0.16
22	0.17
23	0.18
24	0.16
25	0.1
26	0.13
27	0.19
28	0.23
29	0.3
30	0.35
31	0.35
32	0.39
33	0.44
34	0.49
35	0.46
36	0.44
37	0.46
38	0.45
39	0.45
40	0.47
41	0.41
42	0.34
43	0.37
44	0.38
45	0.31
46	0.35
47	0.35
48	0.33
49	0.4
50	0.39
51	0.38
52	0.41
53	0.45
54	0.38
55	0.38
56	0.38
57	0.32
58	0.33
59	0.31
60	0.25
61	0.19
62	0.18
63	0.17
64	0.15
65	0.15
66	0.15
67	0.14
68	0.14
69	0.14
70	0.15
71	0.18
72	0.21
73	0.25
74	0.34
75	0.38
76	0.48
77	0.48
78	0.5
79	0.46
80	0.46
81	0.43
82	0.37
83	0.32
84	0.23
85	0.22
86	0.25
87	0.25
88	0.27
89	0.26
90	0.25
91	0.25
92	0.24
93	0.23
94	0.2
95	0.2
96	0.16
97	0.14
98	0.13
99	0.15
100	0.15
101	0.15
102	0.13
103	0.11
104	0.09
105	0.1
106	0.1
107	0.08
108	0.09
109	0.12
110	0.13
111	0.15
112	0.15
113	0.17
114	0.21
115	0.21
116	0.21
117	0.23
118	0.25
119	0.25
120	0.25
121	0.24
122	0.25
123	0.31
124	0.31
125	0.28
126	0.29
127	0.28
128	0.29
129	0.32
130	0.29
131	0.22
132	0.25
133	0.28
134	0.25
135	0.25
136	0.23
137	0.18
138	0.19
139	0.2
140	0.16
141	0.14
142	0.13
143	0.14
144	0.14
145	0.13
146	0.15
147	0.16
148	0.18
149	0.22
150	0.22
151	0.22
152	0.21
153	0.24
154	0.22
155	0.21
156	0.18
157	0.16
158	0.16
159	0.16
160	0.19
161	0.16
162	0.18
163	0.18
164	0.2
165	0.17
166	0.18
167	0.19
168	0.2
169	0.2
170	0.2
171	0.23
172	0.23
173	0.27
174	0.27
175	0.26
176	0.25
177	0.26
178	0.23
179	0.19
180	0.21
181	0.18
182	0.21
183	0.24
184	0.24
185	0.23
186	0.28
187	0.36
188	0.33
189	0.37
190	0.38
191	0.39
192	0.4
193	0.48
194	0.51
195	0.5
196	0.52
197	0.51
198	0.47
199	0.46
200	0.48
201	0.49
202	0.46
203	0.44
204	0.43
205	0.4
206	0.38
207	0.35
208	0.28
209	0.2
210	0.17
211	0.14
212	0.12
213	0.12
214	0.12
215	0.11
216	0.12
217	0.11
218	0.1
219	0.08
220	0.09
221	0.09
222	0.09
223	0.11
224	0.1
225	0.09
226	0.1
227	0.1
228	0.08
229	0.08
230	0.09
231	0.08
232	0.08
233	0.08
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.07
240	0.07
241	0.1
242	0.1
243	0.11
244	0.12
245	0.15
246	0.14
247	0.15
248	0.18
249	0.2
250	0.21
251	0.27
252	0.3
253	0.31
254	0.34
255	0.36
256	0.35
257	0.33
258	0.36
259	0.39
260	0.41
261	0.46
262	0.44
263	0.42
264	0.4
265	0.36
266	0.33
267	0.23
268	0.16
269	0.12
270	0.11
271	0.1
272	0.1
273	0.11
274	0.1
275	0.1
276	0.09
277	0.06
278	0.06
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.09
284	0.1
285	0.12
286	0.13
287	0.12
288	0.15
289	0.21
290	0.25
291	0.27
292	0.32
293	0.34
294	0.36
295	0.38
296	0.35
297	0.3
298	0.27
299	0.25
300	0.2
301	0.16
302	0.14
303	0.11
304	0.11
305	0.1
306	0.11
307	0.1
308	0.1
309	0.12
310	0.13
311	0.13
312	0.16
313	0.2
314	0.19
315	0.2
316	0.2
317	0.19
318	0.19
319	0.24
320	0.24
321	0.21
322	0.2
323	0.21
324	0.22
325	0.24
326	0.23
327	0.19
328	0.15
329	0.16
330	0.15
331	0.13
332	0.11
333	0.08
334	0.08
335	0.08
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.08
350	0.09
351	0.09
352	0.08
353	0.09
354	0.09
355	0.1
356	0.13
357	0.12
358	0.12
359	0.12
360	0.12
361	0.11
362	0.12
363	0.16
364	0.19
365	0.21
366	0.23
367	0.27
368	0.28
369	0.28
370	0.3
371	0.3
372	0.29
373	0.34
374	0.35
375	0.37
376	0.38
377	0.37
378	0.35
379	0.35
380	0.31
381	0.23
382	0.29
383	0.28
384	0.34
385	0.35
386	0.36
387	0.31
388	0.34
389	0.38
390	0.33
391	0.3
392	0.25
393	0.27
394	0.31
395	0.34
396	0.29
397	0.26
398	0.22
399	0.2
400	0.17
401	0.15
402	0.09
403	0.05
404	0.05
405	0.07
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.09
410	0.09
411	0.1
412	0.11
413	0.09
414	0.13
415	0.17
416	0.17
417	0.16
418	0.16
419	0.16
420	0.2
421	0.21
422	0.19
423	0.17
424	0.16
425	0.15
426	0.16
427	0.15
428	0.12
429	0.12
430	0.1
431	0.09
432	0.1
433	0.1
434	0.09
435	0.09
436	0.11
437	0.16
438	0.18
439	0.17
440	0.18
441	0.19
442	0.19
443	0.2
444	0.19
445	0.17
446	0.19
447	0.19
448	0.21
449	0.27
450	0.3
451	0.31
452	0.3
453	0.33
454	0.31
455	0.31
456	0.36
457	0.37
458	0.43
459	0.48
460	0.55
461	0.59
462	0.58
463	0.6
464	0.54
465	0.51
466	0.47
467	0.45
468	0.4
469	0.29
470	0.28
471	0.25
472	0.24
473	0.21
474	0.15
475	0.12
476	0.11
477	0.12
478	0.14
479	0.13
480	0.12
481	0.11
482	0.12
483	0.1
484	0.12
485	0.12
486	0.12
487	0.14
488	0.16
489	0.21
490	0.24
491	0.26
492	0.28
493	0.28
494	0.28
495	0.26
496	0.27
497	0.22
498	0.24
499	0.22
500	0.19
501	0.18
502	0.17
503	0.17
504	0.14
505	0.13
506	0.1
507	0.09
508	0.09
509	0.1
510	0.1
511	0.12
512	0.13
513	0.17
514	0.2
515	0.22
516	0.23
517	0.28
518	0.28
519	0.26
520	0.29
521	0.25
522	0.21
523	0.2
524	0.18
525	0.12
526	0.12
527	0.13
528	0.09
529	0.08
530	0.09
531	0.08
532	0.08
533	0.07
534	0.07
535	0.08
536	0.09
537	0.1
538	0.09
539	0.09
540	0.08
541	0.09
542	0.08
543	0.07
544	0.07
545	0.06
546	0.06
547	0.06
548	0.07
549	0.07
550	0.07
551	0.07
552	0.06
553	0.08
554	0.08
555	0.1
556	0.11
557	0.11
558	0.11
559	0.11
560	0.14
561	0.19
562	0.2
563	0.19
564	0.18
565	0.19
566	0.19
567	0.2
568	0.19
569	0.11
570	0.1
571	0.09
572	0.08
573	0.08
574	0.08
575	0.08
576	0.1
577	0.1
578	0.11
579	0.1
580	0.1
581	0.1
582	0.11
583	0.12
584	0.08
585	0.08
586	0.08
587	0.08
588	0.09
589	0.1
590	0.1
591	0.1
592	0.13
593	0.13
594	0.14
595	0.14
596	0.16
597	0.18
598	0.17
599	0.16
600	0.15
601	0.15
602	0.14
603	0.14
604	0.11
605	0.07
606	0.06
607	0.06
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.05
613	0.06
614	0.07
615	0.08
616	0.1
617	0.13
618	0.15
619	0.18
620	0.2
621	0.2
622	0.23
623	0.29
624	0.31
625	0.31
626	0.34
627	0.4
628	0.38
629	0.38
630	0.37
631	0.32
632	0.32
633	0.3
634	0.25
635	0.17
636	0.15
637	0.15
638	0.12
639	0.11
640	0.07
641	0.07
642	0.06
643	0.06
644	0.07
645	0.07
646	0.09
647	0.09
648	0.09
649	0.13
650	0.18
651	0.23
652	0.24
653	0.26
654	0.29
655	0.32
656	0.4
657	0.37
658	0.34
659	0.31
660	0.34
661	0.36
662	0.32
663	0.3
664	0.23
665	0.23
666	0.21
667	0.2
668	0.15
669	0.11
670	0.1
671	0.09
672	0.09
673	0.08
674	0.07
675	0.07
676	0.06
677	0.06
678	0.08
679	0.07
680	0.12
681	0.15
682	0.21
683	0.22
684	0.23
685	0.23
686	0.22
687	0.24
688	0.2
689	0.18
690	0.12
691	0.11
692	0.11
693	0.11
694	0.1
695	0.08
696	0.07
697	0.06
698	0.06
699	0.07
700	0.07
701	0.07
702	0.07
703	0.08
704	0.12
705	0.12
706	0.15
707	0.17
708	0.16
709	0.15
710	0.17
711	0.17
712	0.15
713	0.16
714	0.15
715	0.16
716	0.17
717	0.18
718	0.23
719	0.22
720	0.23
721	0.22
722	0.21
723	0.18
724	0.17
725	0.17
726	0.1
727	0.09
728	0.07
729	0.09
730	0.08
731	0.08
732	0.12
733	0.11
734	0.12
735	0.12
736	0.12
737	0.11
738	0.12
739	0.12
740	0.1
741	0.12
742	0.11
743	0.11
744	0.11
745	0.1
746	0.1
747	0.1
748	0.08
749	0.09
750	0.1
751	0.14
752	0.14
753	0.15
754	0.18
755	0.21
756	0.23
757	0.22
758	0.22
759	0.19
760	0.24
761	0.24
762	0.23
763	0.23
764	0.2
765	0.19
766	0.21
767	0.19
768	0.15
769	0.2
770	0.23
771	0.23
772	0.31
773	0.33
774	0.37
775	0.38
776	0.42
777	0.4
778	0.39
779	0.37
780	0.31
781	0.29
782	0.23
783	0.21
784	0.16
785	0.11
786	0.07
787	0.06
788	0.04
789	0.03
790	0.03
791	0.03
792	0.03
793	0.03
794	0.03
795	0.03
796	0.03
797	0.03
798	0.03
799	0.03
800	0.03
801	0.05
802	0.06
803	0.07
804	0.09
805	0.1
806	0.14
807	0.16
808	0.24
809	0.33
810	0.42
811	0.48
812	0.56
813	0.65
814	0.7
815	0.75
816	0.72
817	0.67
818	0.63
819	0.58
820	0.5
821	0.41
822	0.34
823	0.3
824	0.3
825	0.25
826	0.2
827	0.19
828	0.19
829	0.19
830	0.19
831	0.2
832	0.17
833	0.17
834	0.16
835	0.16
836	0.18
837	0.17
838	0.16
839	0.12
840	0.1
841	0.1
842	0.12
843	0.11
844	0.08
845	0.07
846	0.08
847	0.14
848	0.14
849	0.14
850	0.12
851	0.13
852	0.16
853	0.17
854	0.18
855	0.11
856	0.12
857	0.12
858	0.13
859	0.12
860	0.1
861	0.1
862	0.13
863	0.13
864	0.13
865	0.13
866	0.13
867	0.14
868	0.14
869	0.15
870	0.11
871	0.11
872	0.1
873	0.11
874	0.11
875	0.09
876	0.11
877	0.14
878	0.15
879	0.19
880	0.19
881	0.19
882	0.25
883	0.27
884	0.26
885	0.24
886	0.24
887	0.23
888	0.22
889	0.22
890	0.16
891	0.14
892	0.14
893	0.11
894	0.1
895	0.09
896	0.08
897	0.07
898	0.07
899	0.06
900	0.05
901	0.05
902	0.04
903	0.04
904	0.04
905	0.04
906	0.05
907	0.06
908	0.06
909	0.06
910	0.06
911	0.06
912	0.06
913	0.07
914	0.07
915	0.07
916	0.07
917	0.08
918	0.12
919	0.13
920	0.21
921	0.25
922	0.29
923	0.35
924	0.4
925	0.38
926	0.36
927	0.42
928	0.44
929	0.45
930	0.45
931	0.41
932	0.4
933	0.41
934	0.42
935	0.36
936	0.27
937	0.2
938	0.19
939	0.16
940	0.13
941	0.11
942	0.09
943	0.1
944	0.1
945	0.09
946	0.07
947	0.09
948	0.09
949	0.1
950	0.1
951	0.09
952	0.09
953	0.09
954	0.1
955	0.08
956	0.09
957	0.08
958	0.08
959	0.08
960	0.08
961	0.08
962	0.09
963	0.09
964	0.09
965	0.09
966	0.09
967	0.09
968	0.09
969	0.11
970	0.08
971	0.08
972	0.08
973	0.08
974	0.08
975	0.08
976	0.09
977	0.07
978	0.1
979	0.14
980	0.15
981	0.15
982	0.15
983	0.15
984	0.15
985	0.15
986	0.12
987	0.08
988	0.08
989	0.11
990	0.12
991	0.12
992	0.13
993	0.14
994	0.15
995	0.2
996	0.26
997	0.24
998	0.29
999	0.31
1000	0.31
1001	0.38
1002	0.42
1003	0.47
1004	0.45
1005	0.47
1006	0.47
1007	0.5
1008	0.54
1009	0.47
1010	0.51
1011	0.42
1012	0.37
1013	0.35
1014	0.3
1015	0.26
1016	0.22
1017	0.24
1018	0.16
1019	0.17
1020	0.18
1021	0.16
1022	0.16
1023	0.15
1024	0.16
1025	0.14
1026	0.12
1027	0.1
1028	0.09
1029	0.09
1030	0.09
1031	0.09
1032	0.08
1033	0.07
1034	0.08
1035	0.07
1036	0.07
1037	0.07
1038	0.06
1039	0.06
1040	0.05
1041	0.05
1042	0.05
1043	0.05
1044	0.04
1045	0.07
1046	0.07
1047	0.09
1048	0.11
1049	0.12
1050	0.13
1051	0.16
1052	0.23
1053	0.22
1054	0.26
1055	0.24
1056	0.25
1057	0.25
1058	0.27
1059	0.27
1060	0.24
1061	0.24
1062	0.22
1063	0.23
1064	0.22
1065	0.25
1066	0.24
1067	0.23
1068	0.23
1069	0.24
1070	0.25
1071	0.27
1072	0.31
1073	0.33
1074	0.35
1075	0.36
1076	0.36
1077	0.37
1078	0.38
1079	0.38
1080	0.34
1081	0.26
1082	0.26
1083	0.27
1084	0.23
1085	0.21
1086	0.17
1087	0.15
1088	0.15
1089	0.14
1090	0.12
1091	0.07
1092	0.07
1093	0.07
1094	0.08
1095	0.1
1096	0.1
1097	0.15
1098	0.18
1099	0.24
1100	0.25
1101	0.25
1102	0.26
1103	0.28
1104	0.33
1105	0.4
1106	0.46
1107	0.49
1108	0.54
1109	0.58
1110	0.63
1111	0.63
1112	0.69
1113	0.66
1114	0.65
1115	0.65
1116	0.63
1117	0.6
1118	0.55
1119	0.52
1120	0.42
1121	0.37
1122	0.29
1123	0.22
1124	0.2
1125	0.18
1126	0.15
1127	0.13
1128	0.13
1129	0.1
1130	0.09
1131	0.09
1132	0.1
1133	0.19
1134	0.2
1135	0.21
1136	0.21
1137	0.22
1138	0.22
1139	0.22
1140	0.25
1141	0.17
1142	0.16
1143	0.15
1144	0.14
1145	0.14
1146	0.13
1147	0.14
1148	0.09
1149	0.08
1150	0.08
1151	0.09
1152	0.09
1153	0.1
1154	0.16
1155	0.16
1156	0.21
1157	0.28
1158	0.37
1159	0.46
1160	0.55
1161	0.62
1162	0.66
1163	0.75
1164	0.8
1165	0.82
1166	0.82
1167	0.8
1168	0.81
1169	0.83
1170	0.83
1171	0.77
1172	0.75
1173	0.66
1174	0.57
1175	0.51
1176	0.41
1177	0.32
1178	0.31
1179	0.29
1180	0.26
1181	0.33
1182	0.37
1183	0.39
1184	0.41
1185	0.43
1186	0.41
1187	0.41
1188	0.41
1189	0.36
1190	0.34
1191	0.32
1192	0.3
1193	0.28
1194	0.23
1195	0.19
1196	0.15
1197	0.12
1198	0.09
1199	0.09
1200	0.08
1201	0.1
1202	0.1
1203	0.12
1204	0.19
1205	0.23
1206	0.29
1207	0.39
1208	0.41
1209	0.41
1210	0.46
1211	0.47
1212	0.45
1213	0.45
1214	0.44
1215	0.41
1216	0.38
1217	0.37
1218	0.33
1219	0.3
1220	0.24
1221	0.23
1222	0.21
1223	0.19
1224	0.24
1225	0.28
1226	0.33
1227	0.35
1228	0.43
1229	0.49
1230	0.54
1231	0.59
1232	0.64
1233	0.68
1234	0.72
1235	0.79
1236	0.81
1237	0.79
1238	0.82
1239	0.83
1240	0.83
1241	0.86
1242	0.86
1243	0.85
1244	0.83
1245	0.79
1246	0.73
1247	0.68
1248	0.6
1249	0.5
1250	0.39
1251	0.31
1252	0.23
1253	0.19
1254	0.14
1255	0.08
1256	0.06
1257	0.06
1258	0.06
1259	0.07
1260	0.07
1261	0.07
1262	0.09
1263	0.1
1264	0.12
1265	0.12
1266	0.13
1267	0.14
1268	0.14
1269	0.15
1270	0.14
1271	0.14
1272	0.12
1273	0.13
1274	0.13
1275	0.11
1276	0.1
1277	0.1
1278	0.09
1279	0.08

S3C5L6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer