FuNGI

S3C6K3

Protein Details

Accession

S3C6K3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
72-103	AEAKEKKEEAKESRRKRNKRRQRHWDDQDDVA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
75-94	KEKKEEAKESRRKRNKRRQR

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 10, cyto 7.5, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MATPAVDQTYGQRSVFGSLGHTATAPVDDDIECEDEQDALAYLMLVRSEANKIPHVMVAPRPGPQAFPPGYAEAKEKKEEAKESRRKRNKRRQRHWDDQDDVAPGDANEDGAKRRRTAELSYDEVSYDDLYDERAGDINNEEKEEKVGERNTAQKGTEEGEYDCKNEESDEEEPEDDNEASTYHRQALYETGVGDARGYYHDGAYVAAEETSSAESGGDDPASSESAFSTAYRERLLAHFTDMRAHLTALSGTADGGDDTEVGPLSVRSGVFKNWLHLLRTIDPRPAQVAAMDKVSVLRLLRIVQRGLEAGASTSSRSSRAGRFVRTLAGGPGQLDMSPRTIRWLWALFSRLPDRGELDYREVGYIRDVAKQAVMRLAHLSYDMSGVDASGGDEGDHNGEEAEYEYEGDEGDEEDGHADGEHAGNGLRPDSTHDAELDAEDIAMDIDSEQEEDKEEETTSANTAAVGKTAETQGKAGTIDSFADSSEDLEMQQRAALEMVLAVAGEFYGQRDLLAFRSPWTAAAN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.27
3	0.22
4	0.18
5	0.18
6	0.19
7	0.17
8	0.17
9	0.14
10	0.13
11	0.14
12	0.12
13	0.1
14	0.11
15	0.1
16	0.11
17	0.13
18	0.15
19	0.14
20	0.13
21	0.13
22	0.11
23	0.11
24	0.11
25	0.09
26	0.06
27	0.07
28	0.06
29	0.06
30	0.06
31	0.06
32	0.06
33	0.06
34	0.08
35	0.12
36	0.16
37	0.19
38	0.21
39	0.24
40	0.25
41	0.26
42	0.27
43	0.26
44	0.27
45	0.31
46	0.3
47	0.3
48	0.32
49	0.31
50	0.31
51	0.29
52	0.34
53	0.27
54	0.29
55	0.29
56	0.29
57	0.3
58	0.3
59	0.33
60	0.31
61	0.34
62	0.34
63	0.33
64	0.35
65	0.4
66	0.47
67	0.51
68	0.55
69	0.61
70	0.68
71	0.78
72	0.84
73	0.88
74	0.91
75	0.93
76	0.93
77	0.94
78	0.95
79	0.95
80	0.95
81	0.95
82	0.94
83	0.92
84	0.85
85	0.77
86	0.69
87	0.59
88	0.49
89	0.38
90	0.28
91	0.18
92	0.15
93	0.11
94	0.08
95	0.07
96	0.08
97	0.12
98	0.19
99	0.22
100	0.22
101	0.25
102	0.3
103	0.32
104	0.36
105	0.4
106	0.38
107	0.41
108	0.4
109	0.38
110	0.33
111	0.3
112	0.26
113	0.18
114	0.12
115	0.08
116	0.06
117	0.07
118	0.08
119	0.08
120	0.08
121	0.08
122	0.08
123	0.09
124	0.11
125	0.14
126	0.15
127	0.16
128	0.16
129	0.15
130	0.17
131	0.18
132	0.17
133	0.18
134	0.19
135	0.2
136	0.23
137	0.29
138	0.31
139	0.32
140	0.31
141	0.26
142	0.26
143	0.25
144	0.24
145	0.19
146	0.17
147	0.2
148	0.2
149	0.2
150	0.2
151	0.18
152	0.16
153	0.15
154	0.14
155	0.13
156	0.14
157	0.15
158	0.15
159	0.15
160	0.15
161	0.16
162	0.17
163	0.12
164	0.11
165	0.09
166	0.08
167	0.09
168	0.1
169	0.11
170	0.12
171	0.13
172	0.13
173	0.13
174	0.16
175	0.16
176	0.16
177	0.15
178	0.13
179	0.12
180	0.12
181	0.11
182	0.08
183	0.07
184	0.06
185	0.08
186	0.07
187	0.07
188	0.08
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.07
193	0.06
194	0.05
195	0.05
196	0.04
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.04
202	0.04
203	0.05
204	0.06
205	0.05
206	0.04
207	0.05
208	0.05
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.05
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.09
217	0.09
218	0.11
219	0.11
220	0.11
221	0.12
222	0.13
223	0.15
224	0.12
225	0.13
226	0.14
227	0.14
228	0.17
229	0.16
230	0.16
231	0.15
232	0.14
233	0.11
234	0.1
235	0.09
236	0.07
237	0.07
238	0.05
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.03
246	0.03
247	0.04
248	0.04
249	0.03
250	0.04
251	0.03
252	0.04
253	0.05
254	0.05
255	0.06
256	0.07
257	0.08
258	0.14
259	0.14
260	0.15
261	0.19
262	0.2
263	0.2
264	0.22
265	0.25
266	0.24
267	0.3
268	0.3
269	0.29
270	0.28
271	0.27
272	0.26
273	0.23
274	0.18
275	0.13
276	0.15
277	0.12
278	0.13
279	0.12
280	0.1
281	0.1
282	0.1
283	0.1
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.09
288	0.13
289	0.15
290	0.15
291	0.14
292	0.15
293	0.14
294	0.14
295	0.12
296	0.08
297	0.06
298	0.07
299	0.07
300	0.06
301	0.07
302	0.07
303	0.08
304	0.1
305	0.13
306	0.15
307	0.24
308	0.28
309	0.3
310	0.32
311	0.32
312	0.32
313	0.3
314	0.28
315	0.2
316	0.17
317	0.14
318	0.12
319	0.11
320	0.1
321	0.09
322	0.09
323	0.09
324	0.11
325	0.11
326	0.11
327	0.15
328	0.15
329	0.16
330	0.18
331	0.2
332	0.18
333	0.2
334	0.24
335	0.2
336	0.24
337	0.26
338	0.25
339	0.23
340	0.23
341	0.22
342	0.22
343	0.25
344	0.22
345	0.24
346	0.23
347	0.23
348	0.23
349	0.2
350	0.17
351	0.15
352	0.17
353	0.14
354	0.16
355	0.16
356	0.15
357	0.18
358	0.19
359	0.18
360	0.19
361	0.18
362	0.15
363	0.17
364	0.17
365	0.14
366	0.13
367	0.13
368	0.09
369	0.09
370	0.08
371	0.07
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.05
376	0.05
377	0.04
378	0.05
379	0.04
380	0.05
381	0.05
382	0.07
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.07
389	0.07
390	0.06
391	0.07
392	0.07
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.06
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.06
402	0.06
403	0.06
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.07
412	0.08
413	0.08
414	0.08
415	0.07
416	0.13
417	0.19
418	0.21
419	0.21
420	0.2
421	0.21
422	0.21
423	0.21
424	0.16
425	0.1
426	0.08
427	0.06
428	0.06
429	0.05
430	0.04
431	0.04
432	0.03
433	0.04
434	0.04
435	0.05
436	0.06
437	0.06
438	0.08
439	0.1
440	0.1
441	0.11
442	0.11
443	0.11
444	0.13
445	0.13
446	0.13
447	0.12
448	0.12
449	0.11
450	0.12
451	0.11
452	0.11
453	0.11
454	0.1
455	0.11
456	0.15
457	0.18
458	0.17
459	0.18
460	0.17
461	0.19
462	0.19
463	0.17
464	0.14
465	0.13
466	0.13
467	0.14
468	0.13
469	0.11
470	0.12
471	0.11
472	0.11
473	0.11
474	0.1
475	0.09
476	0.13
477	0.13
478	0.12
479	0.13
480	0.13
481	0.12
482	0.12
483	0.12
484	0.08
485	0.07
486	0.07
487	0.06
488	0.05
489	0.04
490	0.04
491	0.04
492	0.04
493	0.04
494	0.05
495	0.07
496	0.07
497	0.08
498	0.09
499	0.11
500	0.13
501	0.18
502	0.18
503	0.17
504	0.22
505	0.22

S3C6K3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer