Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CMH8

Protein Details
Accession S3CMH8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-108HSHSRTSSRSHSPHRARNQRDLALHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
IPR001293  Znf_TRAF  
Gene Ontology GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13923  zf-C3HC4_2  
PF02176  zf-TRAF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
PS50145  ZF_TRAF  
Amino Acid Sequences MPPPNTPEEFFEEEYRQRRNSAVAHAARRQHFNLSPHDEDDAEDEFDIDFGVHLSGSQNEAAEGQQPAPSHHLRRRTSLEQSQTHSHSRTSSRSHSPHRARNQRDLALTRSISPSTAGPATATAHPQTQNGTHATQPIQLAIPNGFFLEHDVVEDFGRQNDIDETPTHTPGEAGQPLAHANADGLEDAAGEGEVPRRKTRVKIQKMDWGALEYVNPYDENLDCPICRSPLVKPHITTCFHIFCYKCLCKSLEHGNRCPIDRNPLQLFNTSRGRFPACPAPPIISNQLDNLQVRCPNRRCDHISARSLIEHHYKKECPFTKIVCPDPSCDKFVTRRESEDGSCLHKAVDCVYCSKLVELADLDDHYDNDCNQKELMCEHCLAAIPRHRHGAHVADCAERRLECKYKPSGCTFSSRKKDYGDHDRTCLYGMFMRLDRACRTDIGGLSTVVQDSQDRVRKLEDQLCSSQPASEGQPREQPLPMPVFTPLLENTTSDMGAGESLPLIGPLNAGDEAGAALRPSVPPSGGVWLSTDAQPAAASADASRALSAGSAESTTNAANGEDDDDRMDRIMAYIDVFDAKVENLERYLGEVDARQAQLFMNELSPLRDQMLEMHNTMCHMGMHVRWLMETFKQTAKRSVGLRTGVTPGTPGGDEDGSVPAATGAGASPSGAASPVATSSPNQRPPSASIPPRPGPSFPPSSLRGPPGRMNLPMRRMPDRENPPRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.5
3 0.44
4 0.41
5 0.4
6 0.41
7 0.41
8 0.42
9 0.46
10 0.48
11 0.53
12 0.58
13 0.64
14 0.62
15 0.64
16 0.58
17 0.55
18 0.53
19 0.51
20 0.54
21 0.54
22 0.53
23 0.49
24 0.49
25 0.41
26 0.36
27 0.35
28 0.28
29 0.2
30 0.16
31 0.15
32 0.13
33 0.13
34 0.12
35 0.08
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.07
42 0.08
43 0.1
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.11
48 0.11
49 0.13
50 0.14
51 0.13
52 0.14
53 0.15
54 0.17
55 0.22
56 0.28
57 0.33
58 0.38
59 0.47
60 0.48
61 0.55
62 0.61
63 0.62
64 0.65
65 0.65
66 0.68
67 0.64
68 0.66
69 0.66
70 0.62
71 0.61
72 0.53
73 0.47
74 0.43
75 0.43
76 0.44
77 0.44
78 0.47
79 0.51
80 0.58
81 0.65
82 0.7
83 0.74
84 0.77
85 0.81
86 0.84
87 0.81
88 0.83
89 0.82
90 0.77
91 0.74
92 0.68
93 0.61
94 0.57
95 0.51
96 0.43
97 0.38
98 0.33
99 0.27
100 0.24
101 0.21
102 0.18
103 0.18
104 0.15
105 0.12
106 0.14
107 0.16
108 0.17
109 0.19
110 0.16
111 0.2
112 0.21
113 0.21
114 0.23
115 0.22
116 0.24
117 0.24
118 0.24
119 0.22
120 0.24
121 0.25
122 0.25
123 0.23
124 0.21
125 0.19
126 0.18
127 0.18
128 0.15
129 0.15
130 0.11
131 0.11
132 0.1
133 0.09
134 0.11
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.14
142 0.11
143 0.09
144 0.11
145 0.1
146 0.1
147 0.12
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.19
152 0.2
153 0.22
154 0.21
155 0.18
156 0.17
157 0.17
158 0.23
159 0.18
160 0.16
161 0.15
162 0.16
163 0.16
164 0.16
165 0.15
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.03
178 0.04
179 0.09
180 0.13
181 0.15
182 0.18
183 0.21
184 0.24
185 0.31
186 0.41
187 0.47
188 0.54
189 0.6
190 0.63
191 0.68
192 0.69
193 0.64
194 0.54
195 0.45
196 0.35
197 0.27
198 0.22
199 0.14
200 0.12
201 0.1
202 0.1
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.1
207 0.11
208 0.12
209 0.11
210 0.14
211 0.15
212 0.14
213 0.15
214 0.15
215 0.17
216 0.24
217 0.3
218 0.32
219 0.32
220 0.36
221 0.42
222 0.43
223 0.41
224 0.38
225 0.34
226 0.32
227 0.36
228 0.31
229 0.26
230 0.33
231 0.33
232 0.3
233 0.31
234 0.31
235 0.27
236 0.32
237 0.41
238 0.41
239 0.44
240 0.46
241 0.49
242 0.51
243 0.5
244 0.49
245 0.4
246 0.39
247 0.35
248 0.38
249 0.35
250 0.37
251 0.37
252 0.38
253 0.38
254 0.35
255 0.41
256 0.35
257 0.32
258 0.3
259 0.33
260 0.28
261 0.3
262 0.34
263 0.27
264 0.28
265 0.28
266 0.28
267 0.25
268 0.28
269 0.29
270 0.21
271 0.2
272 0.19
273 0.2
274 0.21
275 0.2
276 0.18
277 0.16
278 0.19
279 0.21
280 0.28
281 0.3
282 0.35
283 0.37
284 0.43
285 0.46
286 0.5
287 0.58
288 0.56
289 0.56
290 0.51
291 0.49
292 0.43
293 0.38
294 0.32
295 0.31
296 0.26
297 0.26
298 0.28
299 0.29
300 0.3
301 0.39
302 0.4
303 0.36
304 0.38
305 0.38
306 0.41
307 0.44
308 0.47
309 0.43
310 0.4
311 0.38
312 0.41
313 0.41
314 0.35
315 0.31
316 0.29
317 0.29
318 0.35
319 0.39
320 0.33
321 0.33
322 0.34
323 0.36
324 0.34
325 0.31
326 0.26
327 0.23
328 0.22
329 0.19
330 0.16
331 0.15
332 0.14
333 0.14
334 0.16
335 0.12
336 0.14
337 0.15
338 0.15
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.1
343 0.1
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.1
355 0.11
356 0.1
357 0.1
358 0.11
359 0.11
360 0.12
361 0.15
362 0.13
363 0.13
364 0.12
365 0.13
366 0.13
367 0.14
368 0.16
369 0.18
370 0.19
371 0.2
372 0.25
373 0.25
374 0.25
375 0.26
376 0.29
377 0.26
378 0.27
379 0.27
380 0.24
381 0.24
382 0.24
383 0.23
384 0.16
385 0.14
386 0.16
387 0.2
388 0.19
389 0.25
390 0.32
391 0.36
392 0.4
393 0.43
394 0.43
395 0.4
396 0.47
397 0.46
398 0.48
399 0.51
400 0.51
401 0.48
402 0.46
403 0.49
404 0.48
405 0.53
406 0.53
407 0.47
408 0.46
409 0.44
410 0.41
411 0.38
412 0.31
413 0.21
414 0.14
415 0.12
416 0.13
417 0.13
418 0.15
419 0.15
420 0.17
421 0.17
422 0.17
423 0.17
424 0.15
425 0.17
426 0.17
427 0.17
428 0.17
429 0.17
430 0.14
431 0.14
432 0.14
433 0.12
434 0.09
435 0.09
436 0.06
437 0.07
438 0.14
439 0.19
440 0.19
441 0.21
442 0.23
443 0.26
444 0.31
445 0.36
446 0.32
447 0.31
448 0.34
449 0.34
450 0.34
451 0.3
452 0.26
453 0.2
454 0.19
455 0.18
456 0.2
457 0.21
458 0.21
459 0.27
460 0.28
461 0.29
462 0.28
463 0.25
464 0.24
465 0.25
466 0.23
467 0.19
468 0.18
469 0.17
470 0.16
471 0.18
472 0.14
473 0.13
474 0.13
475 0.12
476 0.13
477 0.12
478 0.12
479 0.1
480 0.09
481 0.07
482 0.07
483 0.06
484 0.05
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.05
498 0.05
499 0.06
500 0.06
501 0.04
502 0.04
503 0.05
504 0.05
505 0.07
506 0.08
507 0.07
508 0.09
509 0.1
510 0.14
511 0.14
512 0.14
513 0.13
514 0.14
515 0.16
516 0.15
517 0.15
518 0.11
519 0.11
520 0.1
521 0.09
522 0.08
523 0.06
524 0.06
525 0.05
526 0.07
527 0.07
528 0.08
529 0.08
530 0.07
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.05
535 0.05
536 0.06
537 0.06
538 0.07
539 0.08
540 0.08
541 0.08
542 0.08
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.09
547 0.09
548 0.09
549 0.11
550 0.11
551 0.11
552 0.11
553 0.11
554 0.08
555 0.08
556 0.09
557 0.08
558 0.08
559 0.07
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.08
564 0.07
565 0.06
566 0.09
567 0.09
568 0.1
569 0.1
570 0.11
571 0.11
572 0.12
573 0.13
574 0.11
575 0.11
576 0.11
577 0.13
578 0.17
579 0.17
580 0.15
581 0.14
582 0.14
583 0.14
584 0.15
585 0.14
586 0.1
587 0.11
588 0.11
589 0.14
590 0.15
591 0.15
592 0.14
593 0.14
594 0.13
595 0.17
596 0.22
597 0.22
598 0.22
599 0.22
600 0.21
601 0.21
602 0.21
603 0.17
604 0.11
605 0.1
606 0.12
607 0.11
608 0.15
609 0.16
610 0.16
611 0.16
612 0.17
613 0.18
614 0.19
615 0.22
616 0.21
617 0.26
618 0.33
619 0.36
620 0.42
621 0.43
622 0.45
623 0.45
624 0.48
625 0.48
626 0.44
627 0.43
628 0.38
629 0.38
630 0.33
631 0.3
632 0.25
633 0.18
634 0.17
635 0.15
636 0.13
637 0.12
638 0.12
639 0.12
640 0.12
641 0.14
642 0.12
643 0.11
644 0.11
645 0.08
646 0.08
647 0.07
648 0.06
649 0.04
650 0.05
651 0.05
652 0.05
653 0.05
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.08
661 0.08
662 0.09
663 0.11
664 0.19
665 0.29
666 0.37
667 0.39
668 0.41
669 0.44
670 0.49
671 0.55
672 0.56
673 0.55
674 0.55
675 0.6
676 0.64
677 0.66
678 0.63
679 0.58
680 0.54
681 0.53
682 0.52
683 0.47
684 0.47
685 0.45
686 0.48
687 0.5
688 0.51
689 0.49
690 0.47
691 0.51
692 0.53
693 0.53
694 0.54
695 0.57
696 0.59
697 0.61
698 0.62
699 0.61
700 0.6
701 0.6
702 0.6
703 0.62
704 0.64