FuNGI

S3C2B5

Protein Details

Accession

S3C2B5

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
264-292	DLKKLKQSNLHNKKSKKNAKRYGKAVDKV	Hydrophilic
512-533	QYKTEEKKRKREAARADKNGKN	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
268-301	LKQSNLHNKKSKKNAKRYGKAVDKVKKMERKKGA
518-534	KKRKREAARADKNGKNG
589-589	R
754-814	KAKKIEEGKSMTNQEKARKKNIFMTLGKARAKNRRSLVETKKALNAHVQRSKRGGRRGNRD

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, mito_nucl 12, mito 4.5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MGKRKVGALEKIDADFASLQYKIRRDPRSYEDEFQRQYEQYVSQRDLFLSAPANASIEQTRAFHDLVDLLAHVADCYPEALRTFPDDLAAVLTQHHAVLHPELRDKIVGSLGLLRRKDILDSPTFAQTLFPILVHTPSKTLRTLLFKRILSDLRNVNSRTKNHKLNRTVQTVLFNLVTSDRTSARPIWAVKLTRELWTRQVWTDGRPVEIMREACLGDNEKVVVSAVRFFLGGDKAREELEDDDSEDENKYGGVLGGGGGGPVDLKKLKQSNLHNKKSKKNAKRYGKAVDKVKKMERKKGAPHALNFSALHLLHAPQDFAEALFARHLQSAKCKFALESKLQILQLITRLHGLHKLIVLPLFSWFTKYLTPRQPSVTTILASLAQAVHDEVPPDALEPLVSKIANEFVSEASAAEVASAGLAAIREVALRQPLALNETLLQDLVLLRKSKDKSVMMAARGLMSLYRIVGAEMLAKKDRGKEASMGLRSGDMKLRKYGEQSAGGIDGIELLEQYKTEEKKRKREAARADKNGKNGKNGEADSDEEEDSDDDSEANSSEWDMSDNSDDSGGWINVSSDDEAEKLPPVKRQRKGGKLTKAVEGVEGAEGAEGVEGVEGEEAKSGDEDEDSGSEEDNEDDGSDDSEHDSDDEAEEVEDAAAAFSKLATTTVLTPADLAKLRELRMEASVDKILGKKVGINSSRYQQAVQNRHADDGLTAEQIELASTLRKSTKEERIAKALDGKPLRDSHQSTQAVRKAKKIEEGKSMTNQEKARKKNIFMTLGKARAKNRRSLVETKKALNAHVQRSKRGGRRGNRD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.24
3	0.19
4	0.17
5	0.15
6	0.17
7	0.22
8	0.26
9	0.32
10	0.4
11	0.48
12	0.5
13	0.57
14	0.61
15	0.65
16	0.67
17	0.67
18	0.67
19	0.68
20	0.66
21	0.62
22	0.59
23	0.5
24	0.46
25	0.41
26	0.37
27	0.35
28	0.39
29	0.39
30	0.37
31	0.38
32	0.36
33	0.35
34	0.3
35	0.26
36	0.22
37	0.2
38	0.18
39	0.17
40	0.18
41	0.16
42	0.18
43	0.17
44	0.16
45	0.16
46	0.15
47	0.18
48	0.2
49	0.2
50	0.17
51	0.17
52	0.16
53	0.14
54	0.14
55	0.11
56	0.08
57	0.09
58	0.08
59	0.07
60	0.07
61	0.06
62	0.06
63	0.07
64	0.07
65	0.08
66	0.1
67	0.11
68	0.12
69	0.17
70	0.19
71	0.18
72	0.19
73	0.17
74	0.17
75	0.18
76	0.17
77	0.12
78	0.1
79	0.12
80	0.11
81	0.11
82	0.11
83	0.09
84	0.1
85	0.15
86	0.19
87	0.2
88	0.24
89	0.25
90	0.26
91	0.27
92	0.25
93	0.22
94	0.2
95	0.17
96	0.14
97	0.21
98	0.24
99	0.3
100	0.3
101	0.29
102	0.29
103	0.3
104	0.31
105	0.28
106	0.29
107	0.27
108	0.3
109	0.31
110	0.33
111	0.32
112	0.3
113	0.25
114	0.19
115	0.18
116	0.15
117	0.13
118	0.11
119	0.11
120	0.16
121	0.17
122	0.17
123	0.18
124	0.2
125	0.23
126	0.23
127	0.24
128	0.25
129	0.33
130	0.38
131	0.43
132	0.47
133	0.45
134	0.46
135	0.5
136	0.49
137	0.42
138	0.43
139	0.41
140	0.37
141	0.43
142	0.43
143	0.45
144	0.49
145	0.52
146	0.55
147	0.57
148	0.63
149	0.65
150	0.73
151	0.73
152	0.75
153	0.77
154	0.74
155	0.69
156	0.61
157	0.57
158	0.48
159	0.43
160	0.33
161	0.25
162	0.19
163	0.17
164	0.16
165	0.12
166	0.13
167	0.13
168	0.14
169	0.17
170	0.19
171	0.2
172	0.24
173	0.25
174	0.27
175	0.32
176	0.33
177	0.32
178	0.37
179	0.36
180	0.37
181	0.38
182	0.36
183	0.34
184	0.36
185	0.38
186	0.31
187	0.37
188	0.32
189	0.32
190	0.37
191	0.33
192	0.29
193	0.27
194	0.27
195	0.22
196	0.25
197	0.23
198	0.17
199	0.18
200	0.16
201	0.16
202	0.17
203	0.18
204	0.14
205	0.15
206	0.14
207	0.12
208	0.12
209	0.11
210	0.1
211	0.08
212	0.09
213	0.09
214	0.09
215	0.09
216	0.09
217	0.11
218	0.15
219	0.17
220	0.16
221	0.17
222	0.17
223	0.18
224	0.18
225	0.17
226	0.15
227	0.16
228	0.15
229	0.14
230	0.15
231	0.16
232	0.16
233	0.15
234	0.13
235	0.09
236	0.08
237	0.07
238	0.05
239	0.05
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.03
248	0.04
249	0.03
250	0.05
251	0.06
252	0.06
253	0.13
254	0.17
255	0.21
256	0.28
257	0.39
258	0.49
259	0.59
260	0.68
261	0.71
262	0.73
263	0.78
264	0.82
265	0.82
266	0.81
267	0.81
268	0.82
269	0.84
270	0.86
271	0.84
272	0.82
273	0.81
274	0.77
275	0.76
276	0.73
277	0.68
278	0.66
279	0.68
280	0.67
281	0.63
282	0.66
283	0.65
284	0.65
285	0.67
286	0.72
287	0.73
288	0.69
289	0.67
290	0.64
291	0.57
292	0.51
293	0.43
294	0.33
295	0.27
296	0.21
297	0.19
298	0.13
299	0.12
300	0.12
301	0.12
302	0.11
303	0.08
304	0.09
305	0.08
306	0.08
307	0.09
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.09
314	0.1
315	0.1
316	0.19
317	0.23
318	0.25
319	0.26
320	0.26
321	0.24
322	0.3
323	0.34
324	0.29
325	0.28
326	0.27
327	0.29
328	0.29
329	0.29
330	0.23
331	0.18
332	0.19
333	0.15
334	0.14
335	0.12
336	0.13
337	0.13
338	0.16
339	0.15
340	0.12
341	0.12
342	0.12
343	0.11
344	0.12
345	0.11
346	0.08
347	0.09
348	0.1
349	0.09
350	0.1
351	0.1
352	0.11
353	0.14
354	0.16
355	0.23
356	0.29
357	0.32
358	0.32
359	0.36
360	0.36
361	0.34
362	0.35
363	0.29
364	0.21
365	0.18
366	0.17
367	0.13
368	0.12
369	0.11
370	0.07
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.05
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.05
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.06
386	0.07
387	0.07
388	0.06
389	0.06
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.08
394	0.07
395	0.07
396	0.07
397	0.07
398	0.05
399	0.05
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.03
404	0.03
405	0.03
406	0.02
407	0.02
408	0.02
409	0.02
410	0.02
411	0.03
412	0.03
413	0.03
414	0.04
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.06
419	0.06
420	0.08
421	0.09
422	0.08
423	0.08
424	0.09
425	0.09
426	0.08
427	0.07
428	0.05
429	0.06
430	0.07
431	0.08
432	0.08
433	0.09
434	0.16
435	0.17
436	0.19
437	0.25
438	0.24
439	0.24
440	0.31
441	0.35
442	0.29
443	0.29
444	0.27
445	0.22
446	0.21
447	0.19
448	0.1
449	0.07
450	0.06
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.09
458	0.09
459	0.12
460	0.12
461	0.13
462	0.14
463	0.17
464	0.2
465	0.18
466	0.19
467	0.19
468	0.23
469	0.29
470	0.29
471	0.27
472	0.24
473	0.23
474	0.21
475	0.21
476	0.21
477	0.17
478	0.17
479	0.21
480	0.23
481	0.23
482	0.26
483	0.3
484	0.28
485	0.28
486	0.27
487	0.24
488	0.22
489	0.2
490	0.17
491	0.11
492	0.08
493	0.05
494	0.04
495	0.03
496	0.03
497	0.04
498	0.04
499	0.05
500	0.1
501	0.13
502	0.21
503	0.31
504	0.38
505	0.48
506	0.58
507	0.66
508	0.68
509	0.74
510	0.78
511	0.8
512	0.83
513	0.82
514	0.81
515	0.74
516	0.75
517	0.74
518	0.65
519	0.59
520	0.51
521	0.46
522	0.43
523	0.4
524	0.35
525	0.29
526	0.28
527	0.25
528	0.25
529	0.2
530	0.15
531	0.15
532	0.12
533	0.11
534	0.1
535	0.08
536	0.05
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.05
545	0.07
546	0.07
547	0.08
548	0.09
549	0.1
550	0.1
551	0.1
552	0.09
553	0.09
554	0.12
555	0.1
556	0.08
557	0.08
558	0.08
559	0.09
560	0.1
561	0.09
562	0.07
563	0.07
564	0.08
565	0.08
566	0.09
567	0.1
568	0.13
569	0.14
570	0.21
571	0.31
572	0.4
573	0.45
574	0.55
575	0.62
576	0.68
577	0.76
578	0.79
579	0.79
580	0.78
581	0.76
582	0.7
583	0.63
584	0.53
585	0.44
586	0.34
587	0.25
588	0.17
589	0.14
590	0.09
591	0.06
592	0.05
593	0.05
594	0.04
595	0.03
596	0.03
597	0.03
598	0.03
599	0.03
600	0.03
601	0.04
602	0.04
603	0.05
604	0.05
605	0.06
606	0.06
607	0.06
608	0.06
609	0.06
610	0.07
611	0.07
612	0.07
613	0.09
614	0.09
615	0.09
616	0.09
617	0.09
618	0.09
619	0.09
620	0.08
621	0.06
622	0.07
623	0.07
624	0.08
625	0.08
626	0.08
627	0.09
628	0.09
629	0.09
630	0.08
631	0.09
632	0.08
633	0.08
634	0.08
635	0.07
636	0.07
637	0.07
638	0.07
639	0.06
640	0.05
641	0.05
642	0.04
643	0.04
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.05
650	0.06
651	0.07
652	0.09
653	0.13
654	0.14
655	0.14
656	0.14
657	0.14
658	0.18
659	0.19
660	0.18
661	0.19
662	0.22
663	0.23
664	0.26
665	0.26
666	0.24
667	0.24
668	0.26
669	0.21
670	0.21
671	0.22
672	0.19
673	0.2
674	0.2
675	0.19
676	0.17
677	0.17
678	0.17
679	0.21
680	0.3
681	0.31
682	0.35
683	0.37
684	0.4
685	0.45
686	0.42
687	0.38
688	0.35
689	0.41
690	0.45
691	0.47
692	0.5
693	0.46
694	0.47
695	0.46
696	0.4
697	0.31
698	0.27
699	0.23
700	0.15
701	0.14
702	0.12
703	0.12
704	0.12
705	0.12
706	0.08
707	0.07
708	0.09
709	0.09
710	0.13
711	0.16
712	0.17
713	0.23
714	0.32
715	0.41
716	0.48
717	0.56
718	0.59
719	0.63
720	0.64
721	0.6
722	0.61
723	0.54
724	0.53
725	0.48
726	0.44
727	0.42
728	0.43
729	0.44
730	0.43
731	0.46
732	0.43
733	0.5
734	0.53
735	0.52
736	0.58
737	0.6
738	0.61
739	0.57
740	0.59
741	0.56
742	0.55
743	0.61
744	0.6
745	0.6
746	0.61
747	0.64
748	0.62
749	0.63
750	0.66
751	0.6
752	0.59
753	0.57
754	0.57
755	0.6
756	0.61
757	0.64
758	0.64
759	0.65
760	0.67
761	0.71
762	0.7
763	0.64
764	0.65
765	0.63
766	0.64
767	0.65
768	0.62
769	0.6
770	0.62
771	0.64
772	0.65
773	0.64
774	0.65
775	0.67
776	0.72
777	0.74
778	0.74
779	0.75
780	0.7
781	0.69
782	0.61
783	0.56
784	0.55
785	0.54
786	0.53
787	0.57
788	0.57
789	0.56
790	0.63
791	0.71
792	0.69
793	0.71
794	0.71

S3C2B5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer