Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CQJ9

Protein Details
Accession B0CQJ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
132-152HLSEAKRRSNRQRSKSPVEEQHydrophilic
368-387SKVPLTSRKKQEACNRWNEGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_300794  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSTGNVVDATPTPLETPISGGNNDTTQGGNNGASDQQHPGTTSGEQGSGNRRSLSPESGQSRVRTLGNAPVSIAALAACNKPIEDFRASNISKATALSRIYTTLTDALPADPTGVEEAFARYIVILENHEHHLSEAKRRSNRQRSKSPVEEQFDEEELSRPTKRAKPDESQYPWVVSDFIHSVTLSPSPTASLDLLKLYSVDPKGTKRSLINSPTCPEFPDSEWTNILAGRAVNLDTVLTGYYSTSNNDERIESIGDLNIKFGTVAPTKIVSSAGEWTIAWNRASRATSMAFPHRAGELANYAEYIIALFAATDILFHDRVILFDKAVRRRVGSRRDLELTHFDKFADLRTAHMDSIGAAVVQRLPISKVPLTSRKKQEACNRWNEGLCLLDGSQCRRLHVCNKCSKGGHKGPECPSSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.14
3 0.16
4 0.18
5 0.21
6 0.21
7 0.21
8 0.22
9 0.22
10 0.22
11 0.2
12 0.15
13 0.14
14 0.15
15 0.15
16 0.13
17 0.13
18 0.14
19 0.15
20 0.16
21 0.16
22 0.19
23 0.18
24 0.19
25 0.2
26 0.2
27 0.2
28 0.2
29 0.21
30 0.19
31 0.19
32 0.19
33 0.21
34 0.27
35 0.3
36 0.32
37 0.3
38 0.29
39 0.33
40 0.36
41 0.38
42 0.35
43 0.38
44 0.4
45 0.43
46 0.46
47 0.42
48 0.41
49 0.39
50 0.36
51 0.29
52 0.27
53 0.3
54 0.29
55 0.28
56 0.25
57 0.22
58 0.22
59 0.2
60 0.18
61 0.09
62 0.08
63 0.09
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.13
70 0.16
71 0.19
72 0.2
73 0.22
74 0.31
75 0.31
76 0.32
77 0.31
78 0.28
79 0.23
80 0.23
81 0.22
82 0.17
83 0.17
84 0.17
85 0.17
86 0.17
87 0.18
88 0.17
89 0.17
90 0.15
91 0.14
92 0.14
93 0.13
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.1
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.09
114 0.11
115 0.14
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.19
120 0.19
121 0.27
122 0.31
123 0.36
124 0.42
125 0.5
126 0.61
127 0.66
128 0.74
129 0.74
130 0.78
131 0.79
132 0.82
133 0.82
134 0.78
135 0.75
136 0.7
137 0.63
138 0.56
139 0.49
140 0.41
141 0.34
142 0.27
143 0.21
144 0.17
145 0.17
146 0.15
147 0.14
148 0.18
149 0.23
150 0.29
151 0.35
152 0.4
153 0.45
154 0.5
155 0.59
156 0.59
157 0.59
158 0.53
159 0.47
160 0.41
161 0.34
162 0.28
163 0.18
164 0.14
165 0.1
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.1
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.15
191 0.2
192 0.2
193 0.22
194 0.2
195 0.24
196 0.3
197 0.35
198 0.36
199 0.35
200 0.36
201 0.36
202 0.34
203 0.31
204 0.25
205 0.2
206 0.17
207 0.2
208 0.21
209 0.2
210 0.2
211 0.19
212 0.18
213 0.16
214 0.15
215 0.1
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.1
233 0.11
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.14
239 0.14
240 0.12
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.12
254 0.13
255 0.13
256 0.14
257 0.14
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.14
266 0.16
267 0.15
268 0.15
269 0.15
270 0.19
271 0.2
272 0.19
273 0.18
274 0.18
275 0.2
276 0.23
277 0.28
278 0.26
279 0.25
280 0.25
281 0.23
282 0.21
283 0.19
284 0.16
285 0.13
286 0.12
287 0.12
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.09
292 0.07
293 0.05
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.04
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.16
309 0.15
310 0.13
311 0.17
312 0.24
313 0.28
314 0.34
315 0.35
316 0.33
317 0.41
318 0.49
319 0.56
320 0.58
321 0.57
322 0.57
323 0.59
324 0.58
325 0.54
326 0.54
327 0.47
328 0.4
329 0.35
330 0.29
331 0.27
332 0.26
333 0.25
334 0.23
335 0.2
336 0.19
337 0.24
338 0.26
339 0.24
340 0.24
341 0.21
342 0.14
343 0.15
344 0.13
345 0.08
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.11
353 0.14
354 0.19
355 0.21
356 0.25
357 0.31
358 0.41
359 0.47
360 0.54
361 0.61
362 0.66
363 0.69
364 0.73
365 0.77
366 0.78
367 0.8
368 0.8
369 0.77
370 0.72
371 0.69
372 0.61
373 0.52
374 0.43
375 0.34
376 0.26
377 0.2
378 0.2
379 0.21
380 0.25
381 0.31
382 0.3
383 0.33
384 0.34
385 0.4
386 0.44
387 0.52
388 0.57
389 0.59
390 0.64
391 0.68
392 0.71
393 0.7
394 0.71
395 0.71
396 0.71
397 0.69
398 0.72
399 0.71