FuNGI

S3BYZ8

Protein Details

Accession

S3BYZ8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
55-82	DMRARESNSMHRRRSKAKRDMRVKMGHG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
66-74	RRRSKAKRD
277-299	KPAKRRRGPGGSPLEDSHKGRRK

Subcellular Location(s)

cyto 9.5, cyto_mito 9.5, mito 8.5, nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR002501 PsdUridine_synth_N IPR014780 tRNA_psdUridine_synth_TruB IPR032819 TruB_C
Gene Ontology	GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF16198 TruB_C_2 PF01509 TruB_N
CDD	cd02867 PseudoU_synth_TruB_4

Amino Acid Sequences

MLFGRLAKMARENVLEGVFAINKPMGMSSAQVIRDCQTFFNPSDFFRPLIQKELDMRARESNSMHRRRSKAKRDMRVKMGHGGTLDPLATGVLILGIGRGTKELNKFLTCTKTYETVVLFGASTDTYDRVGRVLARKAYDEITKEKVEKAIEDFRGKFRQMPPLYSALKMNGKPLYEYAREGLSIPREIETREVDVTEIELVEWYEPGTHNHRWPEQEAGVAEQNLAEKVWRMEKEQEQGGKKRTPEEEQSDLEAHAAHEDFKRKAEEKQDELVFDKPAKRRRGPGGSPLEDSHKGRRKSGDELLMSGALGDLPASPYHDNKISKSSEEKAAEDCKAAPQDGRDSKMQVPGKHGANLIPPPPSADTPPPWKGKGPPACRVRMTVSSGFYVRSFCHDLGEKVGSVAMMAELARTRQSDFRVGTANMLEYEDISKGEAVWSPKLERLLRLWEDNEVAKGAVLETAEETGAASEAAAPEPADAAPTAEAKEDDKKEDDKVEAGESEWNGFDEKEEAEEKTTSKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.26
3	0.2
4	0.19
5	0.17
6	0.15
7	0.15
8	0.13
9	0.12
10	0.13
11	0.13
12	0.11
13	0.1
14	0.12
15	0.13
16	0.18
17	0.2
18	0.21
19	0.22
20	0.23
21	0.26
22	0.25
23	0.24
24	0.23
25	0.25
26	0.26
27	0.3
28	0.29
29	0.28
30	0.34
31	0.33
32	0.31
33	0.32
34	0.37
35	0.34
36	0.4
37	0.39
38	0.36
39	0.39
40	0.46
41	0.47
42	0.43
43	0.44
44	0.43
45	0.44
46	0.42
47	0.4
48	0.42
49	0.47
50	0.53
51	0.58
52	0.6
53	0.65
54	0.73
55	0.81
56	0.82
57	0.82
58	0.83
59	0.86
60	0.87
61	0.89
62	0.88
63	0.85
64	0.77
65	0.74
66	0.65
67	0.57
68	0.47
69	0.39
70	0.31
71	0.24
72	0.2
73	0.12
74	0.1
75	0.08
76	0.07
77	0.06
78	0.04
79	0.03
80	0.03
81	0.03
82	0.03
83	0.03
84	0.04
85	0.04
86	0.05
87	0.06
88	0.11
89	0.15
90	0.2
91	0.24
92	0.25
93	0.27
94	0.3
95	0.37
96	0.34
97	0.33
98	0.32
99	0.32
100	0.32
101	0.34
102	0.3
103	0.24
104	0.23
105	0.2
106	0.16
107	0.12
108	0.12
109	0.08
110	0.08
111	0.07
112	0.07
113	0.08
114	0.09
115	0.09
116	0.09
117	0.11
118	0.14
119	0.18
120	0.24
121	0.26
122	0.27
123	0.28
124	0.3
125	0.31
126	0.31
127	0.29
128	0.27
129	0.28
130	0.29
131	0.29
132	0.28
133	0.29
134	0.26
135	0.25
136	0.26
137	0.29
138	0.31
139	0.35
140	0.35
141	0.37
142	0.42
143	0.41
144	0.41
145	0.36
146	0.42
147	0.39
148	0.4
149	0.38
150	0.4
151	0.41
152	0.36
153	0.34
154	0.28
155	0.32
156	0.29
157	0.3
158	0.26
159	0.25
160	0.24
161	0.25
162	0.27
163	0.23
164	0.23
165	0.2
166	0.18
167	0.18
168	0.18
169	0.19
170	0.15
171	0.15
172	0.14
173	0.14
174	0.14
175	0.14
176	0.16
177	0.15
178	0.15
179	0.14
180	0.13
181	0.12
182	0.12
183	0.12
184	0.09
185	0.07
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.04
192	0.05
193	0.05
194	0.08
195	0.14
196	0.16
197	0.2
198	0.24
199	0.27
200	0.29
201	0.3
202	0.32
203	0.27
204	0.26
205	0.22
206	0.2
207	0.19
208	0.16
209	0.15
210	0.11
211	0.1
212	0.08
213	0.08
214	0.06
215	0.05
216	0.06
217	0.12
218	0.12
219	0.14
220	0.2
221	0.24
222	0.27
223	0.3
224	0.35
225	0.34
226	0.39
227	0.41
228	0.39
229	0.37
230	0.38
231	0.36
232	0.35
233	0.36
234	0.37
235	0.36
236	0.34
237	0.35
238	0.31
239	0.28
240	0.24
241	0.18
242	0.12
243	0.09
244	0.08
245	0.07
246	0.08
247	0.12
248	0.12
249	0.14
250	0.17
251	0.18
252	0.21
253	0.29
254	0.32
255	0.33
256	0.37
257	0.37
258	0.34
259	0.35
260	0.32
261	0.25
262	0.22
263	0.23
264	0.24
265	0.31
266	0.36
267	0.37
268	0.42
269	0.49
270	0.56
271	0.53
272	0.57
273	0.58
274	0.54
275	0.53
276	0.48
277	0.45
278	0.38
279	0.38
280	0.37
281	0.36
282	0.35
283	0.36
284	0.41
285	0.39
286	0.42
287	0.46
288	0.43
289	0.36
290	0.36
291	0.34
292	0.29
293	0.25
294	0.19
295	0.13
296	0.06
297	0.05
298	0.04
299	0.03
300	0.03
301	0.04
302	0.06
303	0.08
304	0.09
305	0.11
306	0.17
307	0.18
308	0.19
309	0.25
310	0.24
311	0.26
312	0.29
313	0.3
314	0.32
315	0.32
316	0.32
317	0.29
318	0.31
319	0.3
320	0.27
321	0.24
322	0.2
323	0.19
324	0.18
325	0.16
326	0.14
327	0.22
328	0.25
329	0.27
330	0.25
331	0.28
332	0.29
333	0.37
334	0.39
335	0.32
336	0.35
337	0.37
338	0.38
339	0.37
340	0.35
341	0.29
342	0.28
343	0.3
344	0.26
345	0.22
346	0.2
347	0.19
348	0.21
349	0.21
350	0.2
351	0.21
352	0.24
353	0.3
354	0.37
355	0.38
356	0.38
357	0.4
358	0.41
359	0.46
360	0.51
361	0.51
362	0.53
363	0.56
364	0.59
365	0.58
366	0.56
367	0.51
368	0.46
369	0.46
370	0.4
371	0.36
372	0.33
373	0.32
374	0.3
375	0.25
376	0.22
377	0.17
378	0.18
379	0.21
380	0.18
381	0.21
382	0.23
383	0.23
384	0.26
385	0.27
386	0.22
387	0.18
388	0.18
389	0.14
390	0.11
391	0.11
392	0.06
393	0.05
394	0.04
395	0.05
396	0.05
397	0.07
398	0.09
399	0.09
400	0.12
401	0.15
402	0.18
403	0.25
404	0.25
405	0.27
406	0.31
407	0.3
408	0.3
409	0.27
410	0.25
411	0.19
412	0.18
413	0.16
414	0.11
415	0.12
416	0.1
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.08
421	0.09
422	0.12
423	0.14
424	0.17
425	0.2
426	0.21
427	0.24
428	0.31
429	0.31
430	0.31
431	0.32
432	0.37
433	0.38
434	0.4
435	0.38
436	0.34
437	0.35
438	0.33
439	0.3
440	0.22
441	0.19
442	0.14
443	0.13
444	0.11
445	0.1
446	0.08
447	0.08
448	0.08
449	0.08
450	0.08
451	0.08
452	0.08
453	0.06
454	0.07
455	0.06
456	0.05
457	0.05
458	0.06
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.07
463	0.08
464	0.08
465	0.08
466	0.07
467	0.08
468	0.09
469	0.11
470	0.11
471	0.12
472	0.13
473	0.15
474	0.24
475	0.26
476	0.29
477	0.32
478	0.33
479	0.36
480	0.39
481	0.38
482	0.33
483	0.32
484	0.3
485	0.26
486	0.25
487	0.26
488	0.22
489	0.22
490	0.2
491	0.18
492	0.16
493	0.16
494	0.16
495	0.13
496	0.13
497	0.15
498	0.16
499	0.17
500	0.19
501	0.21

S3BYZ8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer