Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3BP43

Protein Details
Accession S3BP43    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
162-189EEKASEKKRKGGRKVKGKRNSDARDHKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-70AKKRGRKSGGGKK
157-219RRQYEEEKASEKKRKGGRKVKGKRNSDARDHKEGSAKPSPTPEARRDSKGPSGTKRKTRADSE
222-227EGKKRK
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 8.5, cyto_nucl 8, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012921  SPOC_C  
IPR003618  TFIIS_cen_dom  
IPR036575  TFIIS_cen_dom_sf  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PF07744  SPOC  
PF07500  TFIIS_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51321  TFIIS_CENTRAL  
PS01359  ZF_PHD_1  
CDD cd21538  SPOC_TFIIS  
Amino Acid Sequences MSEPRRSVRSTKGQHKSLDQLDLPPAPATAVATHPRASPSAAPAAATPAAPATDAGNAKKRGRKSGGGKKYTDEPEDGSEEEIIRCVCGATEQDGDPGEPWIACDTCTAWQHNVCMGMSVYSEDLPKDYYCEKCRPENHTELLEGMARGEKPWEERRRQYEEEKASEKKRKGGRKVKGKRNSDARDHKEGSAKPSPTPEARRDSKGPSGTKRKTRADSEDQEGKKRKLSETKSLPVYDPPADLPKHITDLAETRQTPAKGLGRVITEVLGSLQRRGEFMPADGATLDSTSEQFAIQIERAVHDAHPTSKEYGAQIRTLRFNLKENHELCARLVHGSLVPPMLATMSSDQLASRELQQKTAKMKAQAERQSILETEDAGVPRLRRTHKGEEVVERDSGIAGIVEDKPSVLRRPGAREDASGESGSRRATLQGRGANLRVETKSENAGKKSFDLKRVFNSVRSPTAGAASAHLRRPSQAHLPPDGPGHDPDVDRMLQDDDENESPPYSPTEDFWEEDPDVVWRGEIDMVSVGGFQATARHVGGVNLNATIGLPWTTLLPKKLTVAGRIDEKLATEYLCSLRYSAPTDISVASLSPGTEAAKSDFLTLIDYFTQRHRYGVIGEKSVNNVRDTYLVPIPAGTSTHPEFMLNLEDNFIPTSRTAPMLLLVVVYRNDPAEMERLMGPNWAAQHTAPGVDTPAGADSSDGTNTNASASAAAAQRNASLESTPGQATPAATNGNSDGTKNENTLASGSRNRNEWLLVRSVFEQQPQTRDDLQLLKHELERYNDRHVHTQHTQQQHSQQHAQHQAQQHAQQHAQQHAQQQAQHYVAQQHLPSPAPAPPKPQVQTPVPIPRVPMQPAAAGTPSPSVVTPVQRAAAHPVTHPTAGAATPGSKPVSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.74
3 0.73
4 0.67
5 0.65
6 0.55
7 0.49
8 0.48
9 0.45
10 0.4
11 0.32
12 0.27
13 0.19
14 0.18
15 0.16
16 0.13
17 0.16
18 0.2
19 0.22
20 0.23
21 0.25
22 0.27
23 0.26
24 0.28
25 0.25
26 0.25
27 0.29
28 0.28
29 0.27
30 0.25
31 0.28
32 0.26
33 0.22
34 0.18
35 0.12
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.09
40 0.14
41 0.17
42 0.21
43 0.29
44 0.35
45 0.41
46 0.47
47 0.51
48 0.55
49 0.59
50 0.64
51 0.67
52 0.72
53 0.76
54 0.77
55 0.74
56 0.68
57 0.7
58 0.66
59 0.59
60 0.5
61 0.42
62 0.39
63 0.4
64 0.37
65 0.29
66 0.24
67 0.22
68 0.2
69 0.19
70 0.14
71 0.11
72 0.11
73 0.09
74 0.08
75 0.09
76 0.11
77 0.13
78 0.16
79 0.16
80 0.18
81 0.19
82 0.2
83 0.18
84 0.17
85 0.14
86 0.11
87 0.11
88 0.13
89 0.12
90 0.12
91 0.13
92 0.13
93 0.18
94 0.22
95 0.24
96 0.25
97 0.27
98 0.29
99 0.3
100 0.31
101 0.25
102 0.23
103 0.2
104 0.17
105 0.15
106 0.14
107 0.13
108 0.11
109 0.12
110 0.1
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.15
115 0.18
116 0.25
117 0.3
118 0.38
119 0.42
120 0.49
121 0.56
122 0.59
123 0.63
124 0.62
125 0.61
126 0.55
127 0.52
128 0.44
129 0.38
130 0.32
131 0.24
132 0.18
133 0.16
134 0.13
135 0.13
136 0.14
137 0.14
138 0.19
139 0.29
140 0.38
141 0.43
142 0.52
143 0.6
144 0.66
145 0.7
146 0.7
147 0.7
148 0.68
149 0.67
150 0.64
151 0.63
152 0.64
153 0.67
154 0.64
155 0.62
156 0.63
157 0.66
158 0.71
159 0.74
160 0.76
161 0.78
162 0.86
163 0.88
164 0.9
165 0.87
166 0.85
167 0.85
168 0.82
169 0.81
170 0.81
171 0.77
172 0.77
173 0.73
174 0.67
175 0.64
176 0.59
177 0.56
178 0.54
179 0.48
180 0.41
181 0.42
182 0.44
183 0.43
184 0.47
185 0.46
186 0.47
187 0.5
188 0.54
189 0.53
190 0.54
191 0.55
192 0.56
193 0.56
194 0.57
195 0.63
196 0.65
197 0.7
198 0.74
199 0.74
200 0.73
201 0.73
202 0.72
203 0.71
204 0.68
205 0.66
206 0.67
207 0.61
208 0.63
209 0.63
210 0.56
211 0.52
212 0.49
213 0.48
214 0.49
215 0.53
216 0.55
217 0.57
218 0.62
219 0.62
220 0.6
221 0.55
222 0.48
223 0.46
224 0.36
225 0.29
226 0.24
227 0.24
228 0.23
229 0.22
230 0.23
231 0.2
232 0.22
233 0.21
234 0.19
235 0.16
236 0.19
237 0.22
238 0.25
239 0.23
240 0.23
241 0.27
242 0.27
243 0.27
244 0.28
245 0.3
246 0.25
247 0.27
248 0.27
249 0.24
250 0.24
251 0.24
252 0.18
253 0.13
254 0.11
255 0.11
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.13
260 0.13
261 0.14
262 0.15
263 0.17
264 0.13
265 0.14
266 0.17
267 0.15
268 0.15
269 0.14
270 0.14
271 0.11
272 0.1
273 0.1
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.08
282 0.07
283 0.1
284 0.09
285 0.1
286 0.11
287 0.12
288 0.11
289 0.12
290 0.14
291 0.14
292 0.16
293 0.17
294 0.18
295 0.18
296 0.19
297 0.18
298 0.23
299 0.22
300 0.24
301 0.25
302 0.26
303 0.27
304 0.28
305 0.3
306 0.26
307 0.3
308 0.31
309 0.34
310 0.39
311 0.37
312 0.39
313 0.36
314 0.35
315 0.3
316 0.27
317 0.22
318 0.15
319 0.14
320 0.12
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.09
325 0.08
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.13
340 0.2
341 0.2
342 0.26
343 0.28
344 0.32
345 0.36
346 0.41
347 0.39
348 0.36
349 0.42
350 0.41
351 0.48
352 0.51
353 0.5
354 0.45
355 0.42
356 0.39
357 0.33
358 0.28
359 0.19
360 0.12
361 0.1
362 0.11
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.1
367 0.12
368 0.18
369 0.19
370 0.24
371 0.31
372 0.38
373 0.42
374 0.48
375 0.49
376 0.5
377 0.5
378 0.46
379 0.39
380 0.31
381 0.25
382 0.19
383 0.15
384 0.09
385 0.05
386 0.03
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.08
394 0.1
395 0.1
396 0.13
397 0.15
398 0.22
399 0.26
400 0.31
401 0.3
402 0.29
403 0.31
404 0.29
405 0.28
406 0.22
407 0.18
408 0.13
409 0.14
410 0.13
411 0.1
412 0.08
413 0.09
414 0.12
415 0.15
416 0.19
417 0.21
418 0.22
419 0.23
420 0.24
421 0.22
422 0.2
423 0.2
424 0.15
425 0.14
426 0.14
427 0.13
428 0.17
429 0.21
430 0.23
431 0.23
432 0.24
433 0.23
434 0.24
435 0.31
436 0.29
437 0.32
438 0.34
439 0.33
440 0.35
441 0.42
442 0.41
443 0.36
444 0.37
445 0.32
446 0.3
447 0.29
448 0.27
449 0.19
450 0.19
451 0.18
452 0.13
453 0.12
454 0.13
455 0.14
456 0.16
457 0.17
458 0.16
459 0.16
460 0.18
461 0.2
462 0.24
463 0.26
464 0.27
465 0.29
466 0.29
467 0.29
468 0.29
469 0.27
470 0.2
471 0.17
472 0.16
473 0.15
474 0.14
475 0.14
476 0.15
477 0.14
478 0.12
479 0.12
480 0.11
481 0.09
482 0.09
483 0.09
484 0.09
485 0.1
486 0.11
487 0.1
488 0.1
489 0.1
490 0.1
491 0.11
492 0.1
493 0.1
494 0.09
495 0.16
496 0.17
497 0.18
498 0.18
499 0.21
500 0.18
501 0.18
502 0.18
503 0.12
504 0.12
505 0.11
506 0.09
507 0.06
508 0.06
509 0.07
510 0.07
511 0.06
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.04
517 0.03
518 0.03
519 0.03
520 0.04
521 0.05
522 0.06
523 0.06
524 0.07
525 0.07
526 0.08
527 0.1
528 0.1
529 0.1
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.07
534 0.07
535 0.06
536 0.04
537 0.04
538 0.04
539 0.05
540 0.07
541 0.09
542 0.12
543 0.13
544 0.13
545 0.14
546 0.2
547 0.21
548 0.22
549 0.24
550 0.24
551 0.26
552 0.26
553 0.26
554 0.2
555 0.19
556 0.17
557 0.14
558 0.12
559 0.08
560 0.09
561 0.1
562 0.11
563 0.11
564 0.1
565 0.11
566 0.13
567 0.17
568 0.16
569 0.16
570 0.15
571 0.17
572 0.16
573 0.15
574 0.13
575 0.09
576 0.09
577 0.07
578 0.07
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.07
583 0.08
584 0.09
585 0.11
586 0.11
587 0.12
588 0.12
589 0.11
590 0.13
591 0.12
592 0.12
593 0.11
594 0.11
595 0.12
596 0.14
597 0.21
598 0.19
599 0.19
600 0.19
601 0.19
602 0.22
603 0.3
604 0.3
605 0.26
606 0.28
607 0.28
608 0.31
609 0.34
610 0.32
611 0.24
612 0.21
613 0.19
614 0.2
615 0.19
616 0.2
617 0.18
618 0.16
619 0.15
620 0.15
621 0.14
622 0.12
623 0.12
624 0.09
625 0.12
626 0.13
627 0.15
628 0.15
629 0.14
630 0.14
631 0.14
632 0.18
633 0.14
634 0.13
635 0.13
636 0.13
637 0.13
638 0.14
639 0.13
640 0.09
641 0.08
642 0.1
643 0.1
644 0.11
645 0.11
646 0.1
647 0.11
648 0.11
649 0.11
650 0.09
651 0.08
652 0.09
653 0.09
654 0.09
655 0.08
656 0.08
657 0.08
658 0.08
659 0.09
660 0.11
661 0.1
662 0.12
663 0.13
664 0.14
665 0.14
666 0.15
667 0.14
668 0.12
669 0.14
670 0.13
671 0.12
672 0.11
673 0.14
674 0.13
675 0.14
676 0.12
677 0.11
678 0.11
679 0.1
680 0.1
681 0.08
682 0.08
683 0.08
684 0.07
685 0.07
686 0.07
687 0.08
688 0.1
689 0.1
690 0.1
691 0.1
692 0.1
693 0.11
694 0.1
695 0.08
696 0.08
697 0.07
698 0.1
699 0.12
700 0.13
701 0.13
702 0.13
703 0.14
704 0.15
705 0.16
706 0.12
707 0.1
708 0.11
709 0.12
710 0.14
711 0.14
712 0.12
713 0.12
714 0.12
715 0.13
716 0.13
717 0.14
718 0.13
719 0.12
720 0.13
721 0.14
722 0.16
723 0.16
724 0.15
725 0.15
726 0.17
727 0.19
728 0.19
729 0.2
730 0.17
731 0.17
732 0.19
733 0.2
734 0.2
735 0.27
736 0.31
737 0.32
738 0.34
739 0.34
740 0.34
741 0.34
742 0.33
743 0.28
744 0.3
745 0.28
746 0.27
747 0.28
748 0.32
749 0.31
750 0.31
751 0.35
752 0.32
753 0.35
754 0.35
755 0.38
756 0.34
757 0.34
758 0.35
759 0.32
760 0.31
761 0.34
762 0.36
763 0.33
764 0.34
765 0.37
766 0.36
767 0.37
768 0.42
769 0.39
770 0.45
771 0.48
772 0.48
773 0.52
774 0.51
775 0.53
776 0.51
777 0.56
778 0.55
779 0.59
780 0.6
781 0.57
782 0.64
783 0.62
784 0.64
785 0.62
786 0.57
787 0.58
788 0.63
789 0.61
790 0.58
791 0.58
792 0.57
793 0.55
794 0.58
795 0.55
796 0.52
797 0.51
798 0.49
799 0.48
800 0.47
801 0.46
802 0.43
803 0.43
804 0.44
805 0.46
806 0.44
807 0.43
808 0.44
809 0.4
810 0.39
811 0.35
812 0.32
813 0.32
814 0.33
815 0.29
816 0.26
817 0.27
818 0.27
819 0.25
820 0.23
821 0.25
822 0.29
823 0.3
824 0.35
825 0.37
826 0.45
827 0.46
828 0.5
829 0.52
830 0.49
831 0.54
832 0.56
833 0.61
834 0.55
835 0.55
836 0.52
837 0.52
838 0.53
839 0.5
840 0.46
841 0.37
842 0.36
843 0.36
844 0.35
845 0.3
846 0.24
847 0.21
848 0.18
849 0.17
850 0.15
851 0.14
852 0.15
853 0.18
854 0.23
855 0.25
856 0.26
857 0.3
858 0.3
859 0.31
860 0.35
861 0.38
862 0.34
863 0.33
864 0.36
865 0.35
866 0.35
867 0.33
868 0.26
869 0.22
870 0.2
871 0.2
872 0.16
873 0.14
874 0.15
875 0.19