Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CDA0

Protein Details
Accession S3CDA0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
196-257TRETKKFSKVLQKQARERERVTKAKNRERQKVARRTAEETREKQRIKAEHKKYWPRKCYTVRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
204-247KVLQKQARERERVTKAKNRERQKVARRTAEETREKQRIKAEHKK
Subcellular Location(s) cyto 11.5, nucl 10, cyto_mito 8, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011935  CHP02231  
IPR037291  DUF4139  
IPR025554  DUF4140  
Pfam View protein in Pfam  
PF13598  DUF4139  
PF13600  DUF4140  
Amino Acid Sequences MEVHKQEFRVRDLPTRSVTLFPTQAQIVRDIKDVALKPGTNQIVVVGFSPTVDENSIKVEGTGSAIISDIAVELLPNREIFQDFYPDDESDKSDTDDDDDDDETEEPAELKEVRNKIQLLQDGIQRASETITSADSRLKFLDAYGKMLDRKRGVEIDAGVETYRVERDKVFEDHMKGKVCLRDLNDKMAELQKEETRETKKFSKVLQKQARERERVTKAKNRERQKVARRTAEETREKQRIKAEHKKYWPRKCYTVRITLDAPSFFTPSSSRRSSISSVTELAKPAVSPGEDGAAVETGPATCDLAISYVTSSAFWSPTYDLQLSTTNNTASLCFDAQLTNTTSESWTSCKVVLSTSQTTFSGLNDNIPVLVPWRVKLGRGYGYEAILNSREEVSEKNKWRSEQKAHLNKQPARDTLFGVPNDYSGIQSHLHHQMAPQNKIMTAAYFGRNNNNNNNNNNNNVGGSLFGSSNNTNNATAGVFGQVRNMSAMPMQQQMAQQQMMQMQQAPAVAGVGSSSMPRPALASGPQPPPMPAAPMPRMAGMPSATPAVRFRIGANSNLDTENSGSEDEDNNSDDVDGHTMLPDGVPELEFQESSFEETGMTTTYDLPGLKTLVPGSTASKQRVARISFTGVIFSHTVVAKYKPVAYLKAKLRNASKLTLLKGPAGLTLDGSFMGRTTLPLCSAGDTFPLNLGVDPAIRVAYPKPDVKRATTGIFTKEDSSAYKRSVTISNTRAAAGKSITLWVLDQVPVSEDEKLRVELQQPRGLTLSGGAVATGVGMAAPGKAPSAAKDWGTATATLKKAGEIVWEVKLNAGKTVKLDLEYDVAAPTGEGVIQC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.52
3 0.47
4 0.44
5 0.43
6 0.4
7 0.38
8 0.33
9 0.32
10 0.3
11 0.31
12 0.29
13 0.33
14 0.3
15 0.29
16 0.3
17 0.28
18 0.27
19 0.31
20 0.31
21 0.3
22 0.32
23 0.31
24 0.3
25 0.37
26 0.38
27 0.31
28 0.3
29 0.26
30 0.21
31 0.22
32 0.21
33 0.13
34 0.11
35 0.11
36 0.12
37 0.11
38 0.11
39 0.12
40 0.12
41 0.11
42 0.15
43 0.17
44 0.15
45 0.14
46 0.14
47 0.12
48 0.14
49 0.14
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.1
54 0.08
55 0.08
56 0.05
57 0.05
58 0.04
59 0.04
60 0.05
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.12
66 0.13
67 0.16
68 0.17
69 0.22
70 0.21
71 0.24
72 0.26
73 0.25
74 0.26
75 0.24
76 0.25
77 0.2
78 0.22
79 0.2
80 0.18
81 0.18
82 0.19
83 0.2
84 0.18
85 0.18
86 0.17
87 0.16
88 0.16
89 0.16
90 0.13
91 0.12
92 0.1
93 0.09
94 0.08
95 0.1
96 0.1
97 0.13
98 0.2
99 0.24
100 0.27
101 0.33
102 0.34
103 0.35
104 0.41
105 0.42
106 0.4
107 0.4
108 0.4
109 0.37
110 0.37
111 0.33
112 0.27
113 0.23
114 0.18
115 0.15
116 0.12
117 0.1
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.18
122 0.18
123 0.19
124 0.19
125 0.19
126 0.17
127 0.17
128 0.25
129 0.2
130 0.23
131 0.24
132 0.26
133 0.3
134 0.34
135 0.39
136 0.33
137 0.34
138 0.35
139 0.35
140 0.33
141 0.32
142 0.29
143 0.26
144 0.24
145 0.22
146 0.18
147 0.15
148 0.14
149 0.11
150 0.13
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.15
155 0.2
156 0.23
157 0.27
158 0.3
159 0.33
160 0.38
161 0.42
162 0.41
163 0.37
164 0.39
165 0.38
166 0.35
167 0.35
168 0.34
169 0.39
170 0.38
171 0.44
172 0.41
173 0.37
174 0.37
175 0.38
176 0.35
177 0.26
178 0.28
179 0.23
180 0.25
181 0.26
182 0.3
183 0.31
184 0.33
185 0.37
186 0.41
187 0.44
188 0.46
189 0.5
190 0.55
191 0.57
192 0.66
193 0.7
194 0.71
195 0.74
196 0.8
197 0.82
198 0.77
199 0.72
200 0.7
201 0.7
202 0.69
203 0.69
204 0.67
205 0.69
206 0.74
207 0.78
208 0.78
209 0.78
210 0.79
211 0.82
212 0.83
213 0.84
214 0.81
215 0.82
216 0.76
217 0.72
218 0.71
219 0.7
220 0.68
221 0.63
222 0.62
223 0.62
224 0.59
225 0.57
226 0.56
227 0.55
228 0.57
229 0.62
230 0.64
231 0.64
232 0.73
233 0.81
234 0.84
235 0.86
236 0.85
237 0.8
238 0.81
239 0.79
240 0.8
241 0.75
242 0.75
243 0.67
244 0.62
245 0.58
246 0.52
247 0.47
248 0.37
249 0.32
250 0.23
251 0.21
252 0.17
253 0.17
254 0.15
255 0.15
256 0.21
257 0.22
258 0.22
259 0.22
260 0.26
261 0.28
262 0.3
263 0.31
264 0.27
265 0.26
266 0.27
267 0.27
268 0.24
269 0.22
270 0.17
271 0.14
272 0.12
273 0.11
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.09
304 0.09
305 0.11
306 0.14
307 0.14
308 0.13
309 0.15
310 0.18
311 0.17
312 0.17
313 0.17
314 0.14
315 0.14
316 0.14
317 0.12
318 0.1
319 0.11
320 0.09
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.11
326 0.12
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.12
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.14
341 0.18
342 0.2
343 0.2
344 0.21
345 0.2
346 0.21
347 0.2
348 0.17
349 0.16
350 0.12
351 0.12
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.1
356 0.09
357 0.06
358 0.1
359 0.09
360 0.09
361 0.14
362 0.14
363 0.15
364 0.17
365 0.19
366 0.21
367 0.22
368 0.25
369 0.22
370 0.22
371 0.22
372 0.2
373 0.17
374 0.13
375 0.12
376 0.09
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.09
381 0.14
382 0.21
383 0.26
384 0.32
385 0.34
386 0.36
387 0.41
388 0.46
389 0.48
390 0.49
391 0.54
392 0.59
393 0.6
394 0.64
395 0.67
396 0.63
397 0.63
398 0.58
399 0.5
400 0.43
401 0.4
402 0.36
403 0.32
404 0.33
405 0.26
406 0.23
407 0.21
408 0.17
409 0.17
410 0.15
411 0.11
412 0.07
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.12
417 0.16
418 0.16
419 0.16
420 0.16
421 0.2
422 0.25
423 0.27
424 0.25
425 0.21
426 0.21
427 0.22
428 0.21
429 0.16
430 0.12
431 0.12
432 0.13
433 0.15
434 0.16
435 0.2
436 0.25
437 0.27
438 0.33
439 0.38
440 0.41
441 0.42
442 0.48
443 0.43
444 0.41
445 0.39
446 0.32
447 0.24
448 0.19
449 0.16
450 0.1
451 0.08
452 0.07
453 0.06
454 0.06
455 0.08
456 0.08
457 0.1
458 0.11
459 0.12
460 0.11
461 0.11
462 0.11
463 0.09
464 0.09
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.07
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.1
473 0.09
474 0.08
475 0.08
476 0.09
477 0.09
478 0.11
479 0.11
480 0.12
481 0.13
482 0.14
483 0.16
484 0.15
485 0.13
486 0.13
487 0.15
488 0.13
489 0.13
490 0.13
491 0.1
492 0.11
493 0.11
494 0.09
495 0.07
496 0.06
497 0.06
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.05
505 0.05
506 0.06
507 0.07
508 0.07
509 0.08
510 0.1
511 0.14
512 0.19
513 0.21
514 0.24
515 0.23
516 0.23
517 0.24
518 0.22
519 0.22
520 0.19
521 0.23
522 0.23
523 0.25
524 0.25
525 0.23
526 0.23
527 0.2
528 0.19
529 0.13
530 0.11
531 0.09
532 0.1
533 0.1
534 0.1
535 0.11
536 0.13
537 0.13
538 0.13
539 0.13
540 0.2
541 0.22
542 0.25
543 0.27
544 0.25
545 0.26
546 0.26
547 0.25
548 0.17
549 0.16
550 0.13
551 0.1
552 0.09
553 0.08
554 0.09
555 0.1
556 0.1
557 0.11
558 0.12
559 0.11
560 0.11
561 0.1
562 0.09
563 0.09
564 0.09
565 0.08
566 0.07
567 0.07
568 0.08
569 0.07
570 0.07
571 0.06
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.05
576 0.07
577 0.07
578 0.07
579 0.07
580 0.09
581 0.09
582 0.11
583 0.11
584 0.1
585 0.09
586 0.1
587 0.1
588 0.09
589 0.09
590 0.07
591 0.07
592 0.08
593 0.09
594 0.09
595 0.09
596 0.1
597 0.11
598 0.11
599 0.11
600 0.11
601 0.1
602 0.11
603 0.12
604 0.14
605 0.2
606 0.24
607 0.25
608 0.31
609 0.33
610 0.37
611 0.43
612 0.42
613 0.38
614 0.37
615 0.38
616 0.35
617 0.33
618 0.3
619 0.23
620 0.23
621 0.2
622 0.17
623 0.16
624 0.13
625 0.14
626 0.14
627 0.16
628 0.16
629 0.17
630 0.19
631 0.21
632 0.23
633 0.28
634 0.31
635 0.38
636 0.44
637 0.52
638 0.53
639 0.54
640 0.56
641 0.58
642 0.57
643 0.51
644 0.49
645 0.44
646 0.44
647 0.43
648 0.4
649 0.33
650 0.31
651 0.28
652 0.23
653 0.21
654 0.18
655 0.14
656 0.13
657 0.12
658 0.11
659 0.11
660 0.09
661 0.07
662 0.08
663 0.07
664 0.07
665 0.08
666 0.09
667 0.1
668 0.12
669 0.12
670 0.13
671 0.14
672 0.14
673 0.14
674 0.14
675 0.13
676 0.12
677 0.13
678 0.11
679 0.1
680 0.11
681 0.09
682 0.09
683 0.09
684 0.09
685 0.08
686 0.07
687 0.09
688 0.1
689 0.16
690 0.2
691 0.26
692 0.3
693 0.38
694 0.41
695 0.45
696 0.5
697 0.47
698 0.46
699 0.45
700 0.45
701 0.41
702 0.4
703 0.37
704 0.32
705 0.29
706 0.27
707 0.25
708 0.27
709 0.27
710 0.27
711 0.28
712 0.27
713 0.29
714 0.33
715 0.34
716 0.37
717 0.37
718 0.39
719 0.37
720 0.37
721 0.37
722 0.31
723 0.3
724 0.22
725 0.2
726 0.16
727 0.17
728 0.16
729 0.14
730 0.14
731 0.12
732 0.13
733 0.12
734 0.12
735 0.11
736 0.12
737 0.14
738 0.15
739 0.17
740 0.16
741 0.18
742 0.21
743 0.22
744 0.22
745 0.23
746 0.28
747 0.32
748 0.39
749 0.41
750 0.39
751 0.39
752 0.4
753 0.37
754 0.3
755 0.23
756 0.18
757 0.13
758 0.13
759 0.1
760 0.08
761 0.08
762 0.07
763 0.06
764 0.04
765 0.02
766 0.03
767 0.03
768 0.04
769 0.05
770 0.05
771 0.06
772 0.08
773 0.08
774 0.11
775 0.16
776 0.19
777 0.19
778 0.22
779 0.23
780 0.26
781 0.27
782 0.27
783 0.26
784 0.3
785 0.31
786 0.31
787 0.3
788 0.26
789 0.25
790 0.24
791 0.24
792 0.21
793 0.23
794 0.25
795 0.27
796 0.26
797 0.28
798 0.32
799 0.28
800 0.29
801 0.28
802 0.25
803 0.25
804 0.3
805 0.29
806 0.27
807 0.27
808 0.23
809 0.24
810 0.23
811 0.21
812 0.16
813 0.14
814 0.12
815 0.11
816 0.09
817 0.07