FuNGI

S3BMD2

Protein Details

Accession

S3BMD2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
295-321	SAMSSKPSRPPKPSKPSKPSKPIPTGP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
298-320	SSKPSRPPKPSKPSKPSKPIPTG
556-588	RHSRDRSRSPGRHGHDKSSYRSRRSPSPHGRSR

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MASPEADAPSAPEHQVLPYASNADTPPLSDGEVPDDVEDMDGDDLYTDEPQESSAAGDASEAPDTKVQAETEAEDDASSSDIDDNVNDNNHEAVDADASNTEPTSPPAQLAAQHHTLPSEDAAPTPKETRADTDAGAEHAPKFPAADVPVPSTDGAVDGSANTGPVEGHDLFVEDVGSTATVAAISPVDPKSDADADDDEEEGEAKEDDNEDTGAHKPASASPSLPYIADIAMLDTGEPGEFQPDAPAVSAFSSMLGAASSSPRPGDGDIDVDKIFDAISASPKQKQRQPPTGPSAMSSKPSRPPKPSKPSKPSKPIPTGPAHPHVLPKPPTGPARMNGGATSSIAIHASSPVPNAAHGGAIPRGPAAASRQPNSHRDKASVERAYQAFLVEEKAYTAVGNWETNFPEGSRMFIGNLSQERVSKRDVFEKFHLYGRLAQVAIKSAYGFVQYHTADEARAAIKNLEGVEIRGRKIHLEITKRKGNEQNHDASPDMAKSRSGRGHERHDTSRDQQNGSARRSRDDRRDSSPRRDHGRGDDHYSSRDRGDRNGRDSYSRHSRDRSRSPGRHGHDKSSYRSRRSPSPHGRSRNERSSSIKYEDVKMRSGSSVPDIQFLVNPGLEREFVKWAQAPFQERGLRTDVLFRSPLTPPRDTLIQTHVVEGVIAVVDLNMAAQVAGKIPLQVFDRSAGASSVHFDGYQDLAPSVAADVASRAKAATLAQRHAVQQPYQPPAQYGGYAPSAPAAAPAAPAISASDLAALATQLDATTLAQVVAMLQGAPQQPQQPQQQQQHQPAAPVYGQQQSPPPYGVPQQPPQYPQQQQQQQLDLASVLGLLGGATPANNYGAAHPSAPVAYGQSAGYPGAPATAAPSAYQQAPGQAASDQALQAIMAQFGQFRQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.22
3	0.2
4	0.19
5	0.18
6	0.2
7	0.19
8	0.21
9	0.2
10	0.19
11	0.18
12	0.17
13	0.18
14	0.16
15	0.18
16	0.16
17	0.17
18	0.18
19	0.19
20	0.19
21	0.17
22	0.16
23	0.15
24	0.14
25	0.13
26	0.09
27	0.08
28	0.07
29	0.07
30	0.06
31	0.07
32	0.07
33	0.08
34	0.07
35	0.07
36	0.07
37	0.08
38	0.09
39	0.08
40	0.08
41	0.09
42	0.09
43	0.08
44	0.09
45	0.09
46	0.1
47	0.12
48	0.12
49	0.12
50	0.14
51	0.15
52	0.16
53	0.18
54	0.16
55	0.16
56	0.18
57	0.18
58	0.17
59	0.17
60	0.16
61	0.13
62	0.13
63	0.11
64	0.1
65	0.08
66	0.07
67	0.07
68	0.08
69	0.08
70	0.09
71	0.1
72	0.12
73	0.14
74	0.13
75	0.14
76	0.14
77	0.13
78	0.12
79	0.11
80	0.09
81	0.1
82	0.1
83	0.09
84	0.09
85	0.1
86	0.1
87	0.1
88	0.1
89	0.09
90	0.12
91	0.15
92	0.15
93	0.15
94	0.16
95	0.17
96	0.22
97	0.26
98	0.28
99	0.28
100	0.29
101	0.29
102	0.27
103	0.27
104	0.23
105	0.19
106	0.16
107	0.13
108	0.13
109	0.17
110	0.18
111	0.21
112	0.22
113	0.24
114	0.24
115	0.25
116	0.29
117	0.29
118	0.3
119	0.27
120	0.28
121	0.26
122	0.26
123	0.25
124	0.21
125	0.17
126	0.17
127	0.17
128	0.14
129	0.14
130	0.12
131	0.15
132	0.17
133	0.2
134	0.19
135	0.22
136	0.23
137	0.23
138	0.23
139	0.19
140	0.16
141	0.13
142	0.11
143	0.08
144	0.07
145	0.06
146	0.07
147	0.07
148	0.07
149	0.06
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.12
154	0.1
155	0.11
156	0.11
157	0.12
158	0.12
159	0.12
160	0.12
161	0.06
162	0.06
163	0.05
164	0.05
165	0.04
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.05
173	0.08
174	0.09
175	0.1
176	0.11
177	0.12
178	0.15
179	0.17
180	0.17
181	0.16
182	0.17
183	0.18
184	0.18
185	0.18
186	0.13
187	0.12
188	0.11
189	0.09
190	0.08
191	0.06
192	0.06
193	0.06
194	0.07
195	0.08
196	0.08
197	0.09
198	0.08
199	0.1
200	0.11
201	0.13
202	0.12
203	0.12
204	0.12
205	0.16
206	0.18
207	0.18
208	0.17
209	0.15
210	0.18
211	0.18
212	0.17
213	0.14
214	0.12
215	0.11
216	0.11
217	0.09
218	0.07
219	0.07
220	0.06
221	0.06
222	0.05
223	0.05
224	0.04
225	0.05
226	0.04
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.07
231	0.07
232	0.08
233	0.08
234	0.08
235	0.07
236	0.08
237	0.08
238	0.07
239	0.06
240	0.06
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.04
245	0.04
246	0.07
247	0.07
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.1
252	0.1
253	0.12
254	0.1
255	0.14
256	0.14
257	0.17
258	0.16
259	0.15
260	0.14
261	0.12
262	0.11
263	0.07
264	0.07
265	0.05
266	0.1
267	0.14
268	0.16
269	0.22
270	0.28
271	0.33
272	0.4
273	0.5
274	0.54
275	0.61
276	0.67
277	0.69
278	0.71
279	0.7
280	0.63
281	0.54
282	0.5
283	0.41
284	0.38
285	0.32
286	0.29
287	0.33
288	0.42
289	0.46
290	0.5
291	0.58
292	0.65
293	0.73
294	0.8
295	0.82
296	0.83
297	0.88
298	0.89
299	0.89
300	0.87
301	0.85
302	0.82
303	0.76
304	0.72
305	0.66
306	0.63
307	0.57
308	0.54
309	0.47
310	0.4
311	0.4
312	0.36
313	0.39
314	0.35
315	0.33
316	0.3
317	0.32
318	0.34
319	0.34
320	0.34
321	0.28
322	0.33
323	0.31
324	0.29
325	0.24
326	0.23
327	0.19
328	0.16
329	0.15
330	0.08
331	0.07
332	0.07
333	0.06
334	0.05
335	0.06
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.08
340	0.08
341	0.08
342	0.09
343	0.08
344	0.07
345	0.07
346	0.08
347	0.08
348	0.08
349	0.08
350	0.07
351	0.06
352	0.06
353	0.07
354	0.1
355	0.16
356	0.2
357	0.21
358	0.26
359	0.3
360	0.37
361	0.43
362	0.45
363	0.4
364	0.39
365	0.41
366	0.43
367	0.48
368	0.44
369	0.38
370	0.35
371	0.34
372	0.33
373	0.28
374	0.23
375	0.14
376	0.11
377	0.12
378	0.08
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.07
387	0.08
388	0.09
389	0.1
390	0.1
391	0.11
392	0.11
393	0.09
394	0.12
395	0.11
396	0.12
397	0.11
398	0.11
399	0.11
400	0.11
401	0.11
402	0.1
403	0.11
404	0.11
405	0.11
406	0.13
407	0.14
408	0.15
409	0.18
410	0.18
411	0.19
412	0.25
413	0.27
414	0.3
415	0.32
416	0.36
417	0.34
418	0.34
419	0.34
420	0.26
421	0.27
422	0.23
423	0.22
424	0.17
425	0.16
426	0.13
427	0.14
428	0.13
429	0.1
430	0.09
431	0.07
432	0.07
433	0.08
434	0.08
435	0.07
436	0.11
437	0.11
438	0.11
439	0.12
440	0.12
441	0.1
442	0.1
443	0.11
444	0.07
445	0.07
446	0.08
447	0.07
448	0.07
449	0.08
450	0.08
451	0.08
452	0.07
453	0.08
454	0.13
455	0.15
456	0.15
457	0.15
458	0.15
459	0.14
460	0.16
461	0.2
462	0.2
463	0.27
464	0.34
465	0.39
466	0.44
467	0.44
468	0.47
469	0.49
470	0.49
471	0.48
472	0.46
473	0.45
474	0.41
475	0.42
476	0.38
477	0.32
478	0.27
479	0.2
480	0.16
481	0.11
482	0.12
483	0.11
484	0.16
485	0.19
486	0.22
487	0.28
488	0.32
489	0.4
490	0.46
491	0.49
492	0.48
493	0.49
494	0.49
495	0.46
496	0.48
497	0.42
498	0.37
499	0.35
500	0.38
501	0.4
502	0.4
503	0.41
504	0.35
505	0.35
506	0.4
507	0.43
508	0.46
509	0.48
510	0.49
511	0.51
512	0.61
513	0.63
514	0.68
515	0.7
516	0.67
517	0.66
518	0.64
519	0.59
520	0.56
521	0.58
522	0.5
523	0.49
524	0.48
525	0.42
526	0.42
527	0.41
528	0.35
529	0.29
530	0.31
531	0.24
532	0.26
533	0.35
534	0.37
535	0.4
536	0.45
537	0.44
538	0.43
539	0.44
540	0.44
541	0.45
542	0.44
543	0.43
544	0.44
545	0.51
546	0.56
547	0.63
548	0.66
549	0.66
550	0.66
551	0.7
552	0.73
553	0.7
554	0.72
555	0.65
556	0.62
557	0.6
558	0.59
559	0.58
560	0.6
561	0.62
562	0.57
563	0.61
564	0.58
565	0.58
566	0.62
567	0.66
568	0.66
569	0.7
570	0.73
571	0.76
572	0.79
573	0.79
574	0.79
575	0.78
576	0.71
577	0.65
578	0.62
579	0.6
580	0.59
581	0.53
582	0.5
583	0.42
584	0.44
585	0.47
586	0.42
587	0.38
588	0.34
589	0.31
590	0.27
591	0.26
592	0.21
593	0.18
594	0.22
595	0.19
596	0.2
597	0.19
598	0.18
599	0.18
600	0.18
601	0.16
602	0.11
603	0.11
604	0.1
605	0.1
606	0.11
607	0.11
608	0.12
609	0.15
610	0.14
611	0.16
612	0.19
613	0.18
614	0.23
615	0.26
616	0.28
617	0.26
618	0.32
619	0.34
620	0.32
621	0.35
622	0.33
623	0.3
624	0.26
625	0.32
626	0.27
627	0.25
628	0.26
629	0.23
630	0.22
631	0.25
632	0.31
633	0.29
634	0.3
635	0.28
636	0.3
637	0.33
638	0.3
639	0.3
640	0.28
641	0.29
642	0.28
643	0.28
644	0.25
645	0.22
646	0.2
647	0.17
648	0.12
649	0.05
650	0.05
651	0.04
652	0.03
653	0.03
654	0.03
655	0.03
656	0.02
657	0.02
658	0.02
659	0.03
660	0.03
661	0.04
662	0.06
663	0.06
664	0.07
665	0.08
666	0.11
667	0.13
668	0.14
669	0.15
670	0.15
671	0.16
672	0.15
673	0.15
674	0.13
675	0.11
676	0.1
677	0.11
678	0.11
679	0.11
680	0.1
681	0.1
682	0.11
683	0.12
684	0.13
685	0.11
686	0.09
687	0.09
688	0.09
689	0.09
690	0.08
691	0.06
692	0.05
693	0.05
694	0.06
695	0.08
696	0.09
697	0.09
698	0.08
699	0.08
700	0.09
701	0.11
702	0.17
703	0.2
704	0.22
705	0.26
706	0.28
707	0.3
708	0.34
709	0.36
710	0.31
711	0.31
712	0.36
713	0.37
714	0.37
715	0.35
716	0.32
717	0.31
718	0.3
719	0.26
720	0.2
721	0.18
722	0.19
723	0.18
724	0.17
725	0.14
726	0.13
727	0.11
728	0.11
729	0.09
730	0.07
731	0.07
732	0.08
733	0.07
734	0.07
735	0.07
736	0.07
737	0.06
738	0.07
739	0.06
740	0.07
741	0.06
742	0.06
743	0.06
744	0.06
745	0.05
746	0.04
747	0.04
748	0.04
749	0.04
750	0.05
751	0.05
752	0.06
753	0.06
754	0.06
755	0.06
756	0.06
757	0.06
758	0.06
759	0.06
760	0.05
761	0.04
762	0.09
763	0.1
764	0.12
765	0.14
766	0.18
767	0.21
768	0.28
769	0.38
770	0.42
771	0.51
772	0.58
773	0.66
774	0.71
775	0.76
776	0.78
777	0.7
778	0.64
779	0.56
780	0.5
781	0.4
782	0.34
783	0.29
784	0.26
785	0.25
786	0.24
787	0.29
788	0.3
789	0.32
790	0.31
791	0.29
792	0.27
793	0.32
794	0.39
795	0.4
796	0.43
797	0.48
798	0.51
799	0.53
800	0.56
801	0.59
802	0.57
803	0.57
804	0.6
805	0.61
806	0.65
807	0.67
808	0.65
809	0.58
810	0.52
811	0.45
812	0.35
813	0.26
814	0.18
815	0.12
816	0.07
817	0.05
818	0.04
819	0.03
820	0.03
821	0.03
822	0.03
823	0.04
824	0.04
825	0.05
826	0.07
827	0.07
828	0.08
829	0.1
830	0.14
831	0.16
832	0.16
833	0.15
834	0.15
835	0.15
836	0.15
837	0.14
838	0.12
839	0.11
840	0.12
841	0.11
842	0.11
843	0.12
844	0.12
845	0.12
846	0.1
847	0.09
848	0.09
849	0.08
850	0.07
851	0.1
852	0.12
853	0.12
854	0.12
855	0.15
856	0.17
857	0.18
858	0.21
859	0.18
860	0.19
861	0.21
862	0.2
863	0.19
864	0.16
865	0.17
866	0.16
867	0.17
868	0.14
869	0.12
870	0.12
871	0.1
872	0.12
873	0.12
874	0.1
875	0.09
876	0.09

S3BMD2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer