Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CHC6

Protein Details
Accession S3CHC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-71VSNSRRTTSPPSRIYRQRRWRCALHSNGHHRKNQRHSLFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
299-309ARKKRGGDSRR
Subcellular Location(s) nucl 13, extr 9, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025122  DUF4048  
Pfam View protein in Pfam  
PF13257  DUF4048  
Amino Acid Sequences MTGFLLQLCFASALSRQLPHDSRTVRRTRSLVVSNSRRTTSPPSRIYRQRRWRCALHSNGHHRKNQRHSLFLPPSFPPSSSVVSRSTNPNSLVTDTLISAAPCLHSAINQAVAQHLFGQPSDNMADSVSKPAPPPAARANSNSSEEDSSSDESSRPSTSSSDSESMPPPPQPRVSTPPSAPLAYIGAGIRTPGDRLDESIETRSSRSASTASRSNRLSLTLPIALPTSFPSRPIPASATLPSFPGTPVDISSAAAPEDPADLITAIAAQERHVLELREVLNRAENNLLGLKKQWANHEARKKRGGDSRRSEAMRGMPSRPGTASATDSPTASVEGSSSRRSSELDRRRALLQSQQPGTVEPNTPSQSRRRVFRGGHARTLSLLSPTKTVSDDFPVHEDQADDESLRSPVSSQDAESPFLQNLGRYAPNTATHLSKRSSWAPQTVHQVTGAGLRQVAGDLTTTLWTFVEDLRQATVGEELANGASAVPGLTNPRAAGAADDSQNTIRAPSTSSRPHAARAFGGDLQGTPTPSSRYVPSDQQASSKDKPVVNSKAKTGKVGKSTHGKANKHFSWTPLTVESYDDSDWTNWDSPTVKSPRWSGSTVNGEPSDASLEQADENTTPQKRDSILSSFSPTSPGNKNSELYAALNRLTPGNIKRTATDLMKEWEKSLSAPLDAQPGHNARVEERSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.21
3 0.22
4 0.3
5 0.34
6 0.35
7 0.42
8 0.42
9 0.47
10 0.54
11 0.61
12 0.58
13 0.62
14 0.63
15 0.6
16 0.63
17 0.63
18 0.61
19 0.63
20 0.67
21 0.69
22 0.7
23 0.66
24 0.58
25 0.55
26 0.57
27 0.57
28 0.57
29 0.58
30 0.61
31 0.68
32 0.78
33 0.83
34 0.84
35 0.85
36 0.86
37 0.87
38 0.87
39 0.85
40 0.83
41 0.83
42 0.82
43 0.8
44 0.8
45 0.81
46 0.83
47 0.82
48 0.81
49 0.79
50 0.79
51 0.79
52 0.8
53 0.74
54 0.72
55 0.68
56 0.72
57 0.73
58 0.66
59 0.59
60 0.5
61 0.51
62 0.45
63 0.42
64 0.35
65 0.29
66 0.31
67 0.29
68 0.31
69 0.29
70 0.31
71 0.33
72 0.37
73 0.38
74 0.39
75 0.39
76 0.38
77 0.36
78 0.35
79 0.34
80 0.27
81 0.23
82 0.18
83 0.18
84 0.16
85 0.13
86 0.11
87 0.1
88 0.1
89 0.09
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.12
94 0.13
95 0.17
96 0.17
97 0.16
98 0.17
99 0.17
100 0.17
101 0.16
102 0.16
103 0.13
104 0.12
105 0.15
106 0.12
107 0.14
108 0.15
109 0.13
110 0.12
111 0.12
112 0.14
113 0.12
114 0.18
115 0.17
116 0.17
117 0.17
118 0.2
119 0.26
120 0.25
121 0.29
122 0.32
123 0.38
124 0.39
125 0.42
126 0.46
127 0.43
128 0.46
129 0.42
130 0.36
131 0.31
132 0.29
133 0.26
134 0.23
135 0.21
136 0.19
137 0.18
138 0.16
139 0.16
140 0.18
141 0.17
142 0.15
143 0.14
144 0.15
145 0.18
146 0.2
147 0.23
148 0.23
149 0.23
150 0.25
151 0.26
152 0.27
153 0.26
154 0.27
155 0.25
156 0.28
157 0.31
158 0.32
159 0.36
160 0.4
161 0.43
162 0.45
163 0.43
164 0.46
165 0.44
166 0.41
167 0.34
168 0.28
169 0.24
170 0.18
171 0.18
172 0.11
173 0.09
174 0.08
175 0.09
176 0.08
177 0.07
178 0.08
179 0.07
180 0.1
181 0.1
182 0.12
183 0.16
184 0.17
185 0.18
186 0.21
187 0.22
188 0.19
189 0.2
190 0.2
191 0.17
192 0.15
193 0.15
194 0.16
195 0.16
196 0.2
197 0.27
198 0.28
199 0.33
200 0.34
201 0.34
202 0.31
203 0.31
204 0.29
205 0.23
206 0.24
207 0.2
208 0.19
209 0.18
210 0.18
211 0.15
212 0.14
213 0.14
214 0.16
215 0.14
216 0.16
217 0.17
218 0.19
219 0.2
220 0.22
221 0.22
222 0.19
223 0.22
224 0.22
225 0.22
226 0.2
227 0.2
228 0.18
229 0.16
230 0.14
231 0.12
232 0.11
233 0.09
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.05
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.08
257 0.09
258 0.1
259 0.11
260 0.12
261 0.11
262 0.16
263 0.17
264 0.16
265 0.16
266 0.15
267 0.18
268 0.17
269 0.19
270 0.15
271 0.13
272 0.12
273 0.14
274 0.14
275 0.11
276 0.12
277 0.14
278 0.17
279 0.19
280 0.22
281 0.24
282 0.31
283 0.38
284 0.48
285 0.5
286 0.53
287 0.57
288 0.55
289 0.55
290 0.56
291 0.56
292 0.55
293 0.57
294 0.57
295 0.57
296 0.56
297 0.51
298 0.45
299 0.42
300 0.38
301 0.33
302 0.28
303 0.26
304 0.26
305 0.26
306 0.24
307 0.21
308 0.16
309 0.16
310 0.17
311 0.15
312 0.17
313 0.17
314 0.17
315 0.14
316 0.13
317 0.12
318 0.09
319 0.07
320 0.05
321 0.07
322 0.09
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.12
327 0.13
328 0.18
329 0.26
330 0.33
331 0.39
332 0.4
333 0.42
334 0.43
335 0.43
336 0.39
337 0.37
338 0.33
339 0.31
340 0.31
341 0.29
342 0.28
343 0.27
344 0.28
345 0.22
346 0.18
347 0.13
348 0.17
349 0.18
350 0.19
351 0.21
352 0.24
353 0.31
354 0.33
355 0.36
356 0.37
357 0.42
358 0.42
359 0.49
360 0.54
361 0.49
362 0.52
363 0.49
364 0.44
365 0.37
366 0.37
367 0.28
368 0.21
369 0.19
370 0.13
371 0.14
372 0.14
373 0.14
374 0.13
375 0.14
376 0.12
377 0.14
378 0.15
379 0.15
380 0.18
381 0.18
382 0.17
383 0.17
384 0.15
385 0.12
386 0.12
387 0.11
388 0.08
389 0.07
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.07
394 0.06
395 0.07
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.17
400 0.18
401 0.2
402 0.21
403 0.2
404 0.17
405 0.18
406 0.17
407 0.1
408 0.1
409 0.11
410 0.12
411 0.11
412 0.13
413 0.13
414 0.15
415 0.17
416 0.18
417 0.18
418 0.19
419 0.22
420 0.22
421 0.23
422 0.25
423 0.27
424 0.31
425 0.3
426 0.35
427 0.34
428 0.37
429 0.44
430 0.41
431 0.38
432 0.32
433 0.3
434 0.23
435 0.24
436 0.21
437 0.12
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.09
442 0.09
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.07
453 0.07
454 0.1
455 0.1
456 0.11
457 0.11
458 0.12
459 0.12
460 0.11
461 0.12
462 0.08
463 0.07
464 0.07
465 0.06
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.04
470 0.04
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.04
475 0.07
476 0.07
477 0.08
478 0.08
479 0.09
480 0.1
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.13
485 0.13
486 0.14
487 0.15
488 0.15
489 0.16
490 0.15
491 0.13
492 0.1
493 0.09
494 0.12
495 0.14
496 0.21
497 0.26
498 0.29
499 0.34
500 0.35
501 0.39
502 0.4
503 0.39
504 0.33
505 0.3
506 0.3
507 0.25
508 0.25
509 0.2
510 0.16
511 0.17
512 0.17
513 0.14
514 0.12
515 0.13
516 0.15
517 0.16
518 0.18
519 0.18
520 0.22
521 0.25
522 0.3
523 0.32
524 0.35
525 0.34
526 0.36
527 0.38
528 0.4
529 0.4
530 0.39
531 0.42
532 0.38
533 0.42
534 0.46
535 0.51
536 0.53
537 0.52
538 0.53
539 0.56
540 0.55
541 0.58
542 0.56
543 0.53
544 0.52
545 0.53
546 0.52
547 0.53
548 0.57
549 0.59
550 0.61
551 0.58
552 0.57
553 0.64
554 0.61
555 0.59
556 0.55
557 0.5
558 0.49
559 0.46
560 0.43
561 0.36
562 0.35
563 0.28
564 0.28
565 0.27
566 0.22
567 0.2
568 0.17
569 0.16
570 0.14
571 0.15
572 0.17
573 0.18
574 0.15
575 0.17
576 0.19
577 0.18
578 0.27
579 0.32
580 0.3
581 0.32
582 0.37
583 0.41
584 0.43
585 0.44
586 0.38
587 0.41
588 0.48
589 0.45
590 0.46
591 0.4
592 0.36
593 0.33
594 0.31
595 0.27
596 0.18
597 0.17
598 0.12
599 0.13
600 0.13
601 0.13
602 0.14
603 0.1
604 0.12
605 0.19
606 0.21
607 0.22
608 0.22
609 0.25
610 0.26
611 0.28
612 0.31
613 0.3
614 0.31
615 0.33
616 0.37
617 0.36
618 0.34
619 0.35
620 0.31
621 0.31
622 0.34
623 0.36
624 0.36
625 0.37
626 0.38
627 0.35
628 0.37
629 0.34
630 0.29
631 0.3
632 0.26
633 0.24
634 0.25
635 0.24
636 0.22
637 0.21
638 0.25
639 0.25
640 0.3
641 0.35
642 0.34
643 0.35
644 0.38
645 0.43
646 0.4
647 0.38
648 0.35
649 0.37
650 0.41
651 0.41
652 0.38
653 0.35
654 0.32
655 0.3
656 0.31
657 0.27
658 0.22
659 0.24
660 0.24
661 0.29
662 0.29
663 0.29
664 0.31
665 0.31
666 0.32
667 0.33
668 0.32
669 0.27