Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3C1W1

Protein Details
Accession S3C1W1    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
329-355SDAEIKKALARKRRRRRERLAAAAKDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
333-359IKKALARKRRRRRERLAAAAKDGKDKA
Subcellular Location(s) mito 8, extr 7, cyto 6.5, cyto_nucl 4, plas 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR007148  SSU_processome_Utp12  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF04003  Utp12  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MVKSYLKFEQARSFGVVASSTSNLVWAPSSTTSYFANSTTATGAGHALVAANEDVLVWDIKKGEQLNRWHDEKNKAQVTAIAASQVDKDVVAVGYEDGSVRLWDARMATVMVSFNGHRSAVTYLAFDAAGVRLASGSKDTDVIIWDLVAETGLFKLRGHKDQITGLYFAEPTPQVEEGEDGEVVTAGAAGDGFLITTSKDALIKLWDLSSRHCIETHVAQTNGECWALGVSEDLSGCITAGNDGELQVWTIDAAGLAASAQQVDTVANGVVGTSANTDSTAATKSYLISRGTLHRQGKDRTVEILFHPKQDFFAVHGVEKAVEIWRIRSDAEIKKALARKRRRRRERLAAAAKDGKDKAKNGDTEMNEDEDESTIDTAQADVGEIFVQHVIVRTAGKVRSVDWASASAGKGKKDLHMLVGTTNNLLEMYTISTKKDRVSKQAKKDKEEPPEYGRSLAVELPGHRTDIRSISLSSDDKMLATAANGNLKIWNVRTQSCIRTFECGYALCCSFLPGDKVVLVGTKTGSLELFDVASAALLETVEGAHDAAIWSLHVHPDGRSVVTGSADKSVKFWDFRIVQEPVLGTTRTMPKLKLVQTKLLKVSDDVLSLRFSPDAKLLAVALLDNTVKVFFTDSLKLYLNLYGHKLPVLSMDISWDSKLIVTSSADKNVKIWGLDFGDCHKSLFAHQDSILQVAFVPHNQDGNGHHFFSCGKDRAVKYWDADKFEQIQRLDGHFGEIWALAVSHGGTFLVTASHDKSIRVWNETDEQIFLEEEREREIEALYESTLTTSLDRDEDADPEDRDADGQPGQVGAASKQTVETLMAGERIAEALELGLADLNLIKEYEEAKLRAAASAAAAAAEGGKDASTAVAAVIAPPQRHIVFMALGNISAEQYVMSVINKIPAAALHDALLVLPFVQVPALFIFLDRFAQKLMNMPLTCRVLFFMLKTHHRQIVANRTMRAMLDDLRASIRGALQSQKNQMGHNMAALRVVGAQVADMSVKTYVDESWEEEAAAEESSRRKRAFVHVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.31
3 0.27
4 0.19
5 0.19
6 0.17
7 0.14
8 0.13
9 0.13
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.1
14 0.13
15 0.14
16 0.19
17 0.18
18 0.21
19 0.21
20 0.23
21 0.24
22 0.21
23 0.21
24 0.17
25 0.18
26 0.17
27 0.16
28 0.13
29 0.12
30 0.12
31 0.1
32 0.09
33 0.08
34 0.07
35 0.07
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.07
43 0.08
44 0.07
45 0.09
46 0.1
47 0.11
48 0.16
49 0.2
50 0.25
51 0.32
52 0.41
53 0.48
54 0.54
55 0.57
56 0.57
57 0.6
58 0.62
59 0.63
60 0.64
61 0.61
62 0.55
63 0.52
64 0.5
65 0.47
66 0.41
67 0.33
68 0.24
69 0.19
70 0.19
71 0.19
72 0.17
73 0.13
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.08
86 0.07
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.12
96 0.13
97 0.13
98 0.12
99 0.13
100 0.12
101 0.13
102 0.15
103 0.15
104 0.12
105 0.13
106 0.15
107 0.15
108 0.16
109 0.15
110 0.13
111 0.14
112 0.14
113 0.12
114 0.11
115 0.08
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.1
123 0.11
124 0.09
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.13
129 0.13
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.05
137 0.04
138 0.05
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.17
143 0.23
144 0.28
145 0.34
146 0.37
147 0.38
148 0.43
149 0.48
150 0.42
151 0.38
152 0.33
153 0.28
154 0.25
155 0.21
156 0.2
157 0.15
158 0.13
159 0.15
160 0.16
161 0.14
162 0.14
163 0.16
164 0.13
165 0.14
166 0.13
167 0.1
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.06
172 0.05
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.08
188 0.09
189 0.12
190 0.13
191 0.14
192 0.15
193 0.17
194 0.18
195 0.21
196 0.27
197 0.27
198 0.27
199 0.27
200 0.26
201 0.26
202 0.31
203 0.34
204 0.32
205 0.3
206 0.29
207 0.29
208 0.28
209 0.26
210 0.2
211 0.13
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.05
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.09
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.13
273 0.17
274 0.16
275 0.16
276 0.18
277 0.24
278 0.29
279 0.37
280 0.38
281 0.39
282 0.45
283 0.47
284 0.52
285 0.5
286 0.45
287 0.41
288 0.38
289 0.34
290 0.3
291 0.38
292 0.32
293 0.31
294 0.31
295 0.28
296 0.27
297 0.27
298 0.25
299 0.16
300 0.2
301 0.17
302 0.16
303 0.17
304 0.16
305 0.15
306 0.14
307 0.12
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.11
312 0.13
313 0.14
314 0.14
315 0.15
316 0.21
317 0.24
318 0.28
319 0.3
320 0.29
321 0.34
322 0.39
323 0.43
324 0.45
325 0.51
326 0.57
327 0.65
328 0.76
329 0.81
330 0.86
331 0.91
332 0.92
333 0.91
334 0.91
335 0.9
336 0.81
337 0.75
338 0.71
339 0.61
340 0.54
341 0.46
342 0.39
343 0.33
344 0.32
345 0.32
346 0.32
347 0.33
348 0.32
349 0.38
350 0.35
351 0.36
352 0.35
353 0.31
354 0.25
355 0.24
356 0.2
357 0.13
358 0.12
359 0.08
360 0.07
361 0.05
362 0.06
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.1
382 0.11
383 0.13
384 0.13
385 0.13
386 0.19
387 0.2
388 0.2
389 0.17
390 0.18
391 0.17
392 0.19
393 0.18
394 0.17
395 0.18
396 0.18
397 0.2
398 0.19
399 0.21
400 0.22
401 0.23
402 0.2
403 0.19
404 0.19
405 0.19
406 0.2
407 0.18
408 0.14
409 0.13
410 0.1
411 0.08
412 0.07
413 0.06
414 0.04
415 0.06
416 0.09
417 0.1
418 0.11
419 0.13
420 0.14
421 0.17
422 0.25
423 0.25
424 0.33
425 0.43
426 0.51
427 0.6
428 0.68
429 0.7
430 0.68
431 0.74
432 0.72
433 0.7
434 0.66
435 0.59
436 0.55
437 0.55
438 0.5
439 0.42
440 0.35
441 0.25
442 0.22
443 0.19
444 0.15
445 0.1
446 0.1
447 0.14
448 0.14
449 0.15
450 0.14
451 0.14
452 0.14
453 0.15
454 0.16
455 0.13
456 0.13
457 0.13
458 0.16
459 0.16
460 0.15
461 0.14
462 0.12
463 0.11
464 0.11
465 0.09
466 0.06
467 0.05
468 0.07
469 0.07
470 0.09
471 0.09
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.1
476 0.1
477 0.15
478 0.15
479 0.16
480 0.2
481 0.23
482 0.27
483 0.3
484 0.33
485 0.28
486 0.29
487 0.29
488 0.26
489 0.24
490 0.2
491 0.17
492 0.15
493 0.15
494 0.11
495 0.11
496 0.1
497 0.09
498 0.09
499 0.1
500 0.08
501 0.08
502 0.08
503 0.08
504 0.07
505 0.08
506 0.07
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.05
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.03
522 0.03
523 0.03
524 0.02
525 0.02
526 0.02
527 0.02
528 0.02
529 0.02
530 0.03
531 0.02
532 0.03
533 0.03
534 0.03
535 0.03
536 0.03
537 0.04
538 0.04
539 0.05
540 0.05
541 0.06
542 0.06
543 0.09
544 0.1
545 0.1
546 0.1
547 0.1
548 0.1
549 0.1
550 0.11
551 0.09
552 0.12
553 0.13
554 0.12
555 0.12
556 0.14
557 0.15
558 0.15
559 0.15
560 0.18
561 0.19
562 0.2
563 0.25
564 0.24
565 0.22
566 0.22
567 0.22
568 0.16
569 0.16
570 0.15
571 0.1
572 0.12
573 0.16
574 0.18
575 0.2
576 0.19
577 0.2
578 0.27
579 0.33
580 0.38
581 0.36
582 0.41
583 0.44
584 0.48
585 0.47
586 0.42
587 0.36
588 0.28
589 0.28
590 0.21
591 0.19
592 0.15
593 0.12
594 0.12
595 0.12
596 0.12
597 0.1
598 0.09
599 0.09
600 0.1
601 0.1
602 0.1
603 0.1
604 0.09
605 0.08
606 0.08
607 0.07
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.04
612 0.05
613 0.04
614 0.04
615 0.05
616 0.06
617 0.06
618 0.09
619 0.12
620 0.13
621 0.15
622 0.16
623 0.17
624 0.16
625 0.18
626 0.16
627 0.14
628 0.17
629 0.15
630 0.14
631 0.14
632 0.13
633 0.11
634 0.12
635 0.13
636 0.1
637 0.09
638 0.11
639 0.12
640 0.12
641 0.12
642 0.1
643 0.08
644 0.08
645 0.09
646 0.07
647 0.07
648 0.07
649 0.13
650 0.14
651 0.21
652 0.21
653 0.21
654 0.21
655 0.22
656 0.22
657 0.17
658 0.16
659 0.13
660 0.15
661 0.15
662 0.15
663 0.16
664 0.19
665 0.19
666 0.19
667 0.16
668 0.14
669 0.15
670 0.22
671 0.2
672 0.18
673 0.18
674 0.22
675 0.22
676 0.22
677 0.21
678 0.13
679 0.12
680 0.11
681 0.11
682 0.08
683 0.11
684 0.1
685 0.11
686 0.11
687 0.12
688 0.14
689 0.2
690 0.22
691 0.2
692 0.19
693 0.19
694 0.19
695 0.22
696 0.26
697 0.21
698 0.2
699 0.26
700 0.27
701 0.32
702 0.35
703 0.34
704 0.3
705 0.36
706 0.38
707 0.37
708 0.37
709 0.35
710 0.37
711 0.38
712 0.41
713 0.33
714 0.33
715 0.29
716 0.3
717 0.29
718 0.24
719 0.23
720 0.17
721 0.17
722 0.14
723 0.12
724 0.1
725 0.08
726 0.08
727 0.05
728 0.05
729 0.05
730 0.04
731 0.04
732 0.04
733 0.04
734 0.04
735 0.04
736 0.04
737 0.04
738 0.06
739 0.08
740 0.12
741 0.13
742 0.13
743 0.16
744 0.23
745 0.26
746 0.27
747 0.26
748 0.26
749 0.29
750 0.31
751 0.29
752 0.22
753 0.19
754 0.17
755 0.16
756 0.13
757 0.11
758 0.11
759 0.1
760 0.13
761 0.13
762 0.12
763 0.12
764 0.12
765 0.11
766 0.11
767 0.11
768 0.09
769 0.09
770 0.08
771 0.08
772 0.08
773 0.08
774 0.07
775 0.07
776 0.08
777 0.08
778 0.09
779 0.11
780 0.11
781 0.12
782 0.14
783 0.17
784 0.16
785 0.16
786 0.17
787 0.14
788 0.14
789 0.14
790 0.14
791 0.11
792 0.12
793 0.11
794 0.1
795 0.1
796 0.1
797 0.1
798 0.08
799 0.12
800 0.11
801 0.11
802 0.12
803 0.12
804 0.11
805 0.11
806 0.11
807 0.08
808 0.09
809 0.1
810 0.09
811 0.09
812 0.08
813 0.07
814 0.07
815 0.05
816 0.04
817 0.04
818 0.04
819 0.04
820 0.03
821 0.04
822 0.03
823 0.04
824 0.05
825 0.05
826 0.05
827 0.05
828 0.06
829 0.07
830 0.08
831 0.11
832 0.15
833 0.15
834 0.16
835 0.2
836 0.2
837 0.19
838 0.18
839 0.16
840 0.12
841 0.12
842 0.1
843 0.07
844 0.06
845 0.06
846 0.05
847 0.05
848 0.04
849 0.04
850 0.04
851 0.04
852 0.04
853 0.04
854 0.04
855 0.04
856 0.04
857 0.05
858 0.05
859 0.05
860 0.1
861 0.13
862 0.13
863 0.14
864 0.18
865 0.17
866 0.18
867 0.19
868 0.17
869 0.16
870 0.17
871 0.2
872 0.16
873 0.16
874 0.15
875 0.14
876 0.12
877 0.1
878 0.08
879 0.05
880 0.05
881 0.06
882 0.06
883 0.06
884 0.08
885 0.09
886 0.12
887 0.12
888 0.12
889 0.12
890 0.12
891 0.16
892 0.16
893 0.16
894 0.13
895 0.13
896 0.13
897 0.12
898 0.12
899 0.07
900 0.06
901 0.05
902 0.05
903 0.05
904 0.05
905 0.05
906 0.06
907 0.07
908 0.08
909 0.08
910 0.09
911 0.1
912 0.11
913 0.14
914 0.13
915 0.13
916 0.13
917 0.14
918 0.15
919 0.2
920 0.24
921 0.29
922 0.29
923 0.31
924 0.36
925 0.39
926 0.39
927 0.32
928 0.29
929 0.23
930 0.24
931 0.23
932 0.24
933 0.27
934 0.34
935 0.41
936 0.45
937 0.46
938 0.47
939 0.51
940 0.52
941 0.56
942 0.58
943 0.57
944 0.52
945 0.49
946 0.48
947 0.44
948 0.38
949 0.3
950 0.24
951 0.23
952 0.23
953 0.22
954 0.23
955 0.23
956 0.21
957 0.2
958 0.19
959 0.17
960 0.19
961 0.25
962 0.3
963 0.36
964 0.43
965 0.49
966 0.48
967 0.47
968 0.49
969 0.46
970 0.4
971 0.39
972 0.34
973 0.26
974 0.25
975 0.24
976 0.2
977 0.15
978 0.14
979 0.09
980 0.07
981 0.07
982 0.06
983 0.07
984 0.07
985 0.06
986 0.08
987 0.08
988 0.08
989 0.09
990 0.1
991 0.09
992 0.13
993 0.14
994 0.17
995 0.19
996 0.2
997 0.19
998 0.18
999 0.19
1000 0.16
1001 0.15
1002 0.12
1003 0.11
1004 0.19
1005 0.26
1006 0.33
1007 0.32
1008 0.33
1009 0.38