Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DB39

Protein Details
Accession S3DB39    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
329-349GATMPKPKKKEEPKKAPAEEDBasic
444-469SASSGGGRRRGKKRVMKKKMIEDENGBasic
499-523SAPSSQAKPKKAPPKKGQGNIMSFFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
306-344GKKPAAPAPAKKAAGGIMQAFAKGATMPKPKKKEEPKKA
449-462GGRRRGKKRVMKKK
504-515QAKPKKAPPKKG
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 11.333, mito_nucl 10.166, cyto 8, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019038  POLD3  
IPR041913  POLD3_sf  
Gene Ontology GO:0043625  C:delta DNA polymerase complex  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF09507  CDC27  
Amino Acid Sequences MTRGGISTRISRASTSSPATDTATYIALLFGMAEINEFLATEVLVEQKLITYRYLSRALKLNVNVAKKALFDFHTSQNAKKAGSLHATYLLYGTKPEVELGQPKTATAVKAEEEKNGGDEQDVDMDDEVPYYLQSDQVPSAVITLVSEANLEAALAKYETLEAIHVYSISPEPTTDLQLLADSARQLRELRAAVNPEEAPVSFGTIANSHVRRRQRKGQPPILAPPPTTAATPASVFGAKTAKSAPIKEDANAKTASKPASPTDAPGPKSIWNKVAAKPAAAASTPTSEASSAAASPAPPASVANGKKPAAPAPAKKAAGGIMQAFAKGATMPKPKKKEEPKKAPAEEDTAMALSDDGGDDDGDDDILPKAQQVTGGKSREERMQALRKMMEDDEDEDEDDEDVLGGKNEDDREDTPMEDIEEPAPEPAVAAPVKEAGPSEIISASSGGGRRRGKKRVMKKKMIEDENGYLVTIQEEGWESFSEDEAPPPKAAPAPAASAPSSQAKPKKAPPKKGQGNIMSFFGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.35
3 0.33
4 0.31
5 0.32
6 0.34
7 0.3
8 0.26
9 0.22
10 0.19
11 0.16
12 0.14
13 0.12
14 0.09
15 0.08
16 0.07
17 0.05
18 0.05
19 0.05
20 0.05
21 0.05
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.06
30 0.07
31 0.07
32 0.08
33 0.07
34 0.09
35 0.12
36 0.13
37 0.13
38 0.15
39 0.19
40 0.24
41 0.33
42 0.32
43 0.33
44 0.41
45 0.43
46 0.46
47 0.44
48 0.47
49 0.45
50 0.48
51 0.45
52 0.38
53 0.36
54 0.3
55 0.3
56 0.25
57 0.21
58 0.23
59 0.26
60 0.3
61 0.39
62 0.4
63 0.41
64 0.44
65 0.44
66 0.39
67 0.37
68 0.34
69 0.3
70 0.34
71 0.33
72 0.28
73 0.31
74 0.31
75 0.28
76 0.27
77 0.22
78 0.16
79 0.15
80 0.15
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.13
86 0.2
87 0.23
88 0.27
89 0.26
90 0.25
91 0.28
92 0.28
93 0.26
94 0.21
95 0.2
96 0.16
97 0.24
98 0.25
99 0.24
100 0.24
101 0.23
102 0.23
103 0.21
104 0.2
105 0.13
106 0.13
107 0.11
108 0.12
109 0.12
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.09
115 0.08
116 0.06
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.08
122 0.1
123 0.1
124 0.11
125 0.12
126 0.1
127 0.11
128 0.09
129 0.08
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.1
160 0.11
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.15
176 0.15
177 0.16
178 0.18
179 0.2
180 0.19
181 0.21
182 0.2
183 0.16
184 0.16
185 0.14
186 0.12
187 0.1
188 0.1
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.1
194 0.14
195 0.17
196 0.18
197 0.23
198 0.32
199 0.39
200 0.46
201 0.54
202 0.59
203 0.67
204 0.75
205 0.79
206 0.77
207 0.72
208 0.71
209 0.67
210 0.58
211 0.48
212 0.39
213 0.32
214 0.26
215 0.22
216 0.18
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.11
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.1
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.14
230 0.16
231 0.17
232 0.17
233 0.2
234 0.21
235 0.21
236 0.28
237 0.24
238 0.26
239 0.26
240 0.25
241 0.21
242 0.22
243 0.23
244 0.16
245 0.17
246 0.14
247 0.19
248 0.18
249 0.19
250 0.23
251 0.26
252 0.27
253 0.26
254 0.27
255 0.27
256 0.3
257 0.3
258 0.26
259 0.26
260 0.27
261 0.3
262 0.36
263 0.31
264 0.28
265 0.27
266 0.25
267 0.21
268 0.18
269 0.16
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.13
290 0.14
291 0.18
292 0.23
293 0.23
294 0.24
295 0.25
296 0.27
297 0.27
298 0.31
299 0.3
300 0.33
301 0.4
302 0.39
303 0.38
304 0.36
305 0.3
306 0.26
307 0.23
308 0.17
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.1
313 0.08
314 0.07
315 0.06
316 0.07
317 0.12
318 0.21
319 0.28
320 0.36
321 0.43
322 0.47
323 0.56
324 0.66
325 0.71
326 0.73
327 0.78
328 0.8
329 0.83
330 0.82
331 0.75
332 0.66
333 0.6
334 0.49
335 0.39
336 0.3
337 0.2
338 0.17
339 0.14
340 0.11
341 0.06
342 0.05
343 0.04
344 0.03
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.05
353 0.05
354 0.06
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.07
359 0.11
360 0.12
361 0.19
362 0.25
363 0.28
364 0.29
365 0.3
366 0.32
367 0.34
368 0.35
369 0.32
370 0.33
371 0.4
372 0.42
373 0.44
374 0.43
375 0.39
376 0.39
377 0.35
378 0.29
379 0.22
380 0.21
381 0.2
382 0.2
383 0.19
384 0.17
385 0.17
386 0.14
387 0.13
388 0.1
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.08
396 0.09
397 0.1
398 0.14
399 0.14
400 0.19
401 0.2
402 0.2
403 0.18
404 0.18
405 0.19
406 0.16
407 0.16
408 0.12
409 0.12
410 0.12
411 0.11
412 0.11
413 0.08
414 0.08
415 0.07
416 0.11
417 0.1
418 0.09
419 0.1
420 0.12
421 0.12
422 0.12
423 0.13
424 0.1
425 0.12
426 0.12
427 0.13
428 0.11
429 0.11
430 0.11
431 0.11
432 0.1
433 0.11
434 0.14
435 0.14
436 0.22
437 0.28
438 0.37
439 0.46
440 0.54
441 0.61
442 0.69
443 0.78
444 0.82
445 0.86
446 0.87
447 0.88
448 0.9
449 0.9
450 0.86
451 0.8
452 0.74
453 0.67
454 0.59
455 0.51
456 0.4
457 0.3
458 0.24
459 0.19
460 0.13
461 0.09
462 0.07
463 0.09
464 0.1
465 0.12
466 0.12
467 0.13
468 0.13
469 0.14
470 0.15
471 0.13
472 0.18
473 0.2
474 0.22
475 0.21
476 0.21
477 0.23
478 0.23
479 0.23
480 0.22
481 0.21
482 0.24
483 0.25
484 0.28
485 0.27
486 0.25
487 0.27
488 0.29
489 0.29
490 0.32
491 0.37
492 0.41
493 0.48
494 0.56
495 0.65
496 0.69
497 0.77
498 0.79
499 0.84
500 0.87
501 0.88
502 0.88
503 0.86
504 0.84
505 0.75
506 0.69