Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3D0I2

Protein Details
Accession S3D0I2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-32DAVVKRKRSVKTDAPRKRTRPEAGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-26KRKRSVKTDAPRKRT
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 10, cyto_nucl 9.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MPSTTKADAVVKRKRSVKTDAPRKRTRPEAGDETSVEEHILLLESQILESRKHYNNIVELIEIAKRIQAEESGKAGADDDDDDEDESHGPAMTAAVSLGRVFLRLFAAGTLSVTRQTSEKDQVIVRWLKDRLAEYQQVLATFFSVSGDAASTALTLSMRLLQAEGDELRKKYAAEAKASGKEISGNAFVFPQALLNAVVRGLLLASKDLGDDEVAEGLADEFAEKYAGAFCDVQFYTFKAVSTVLAETASQDAETAAAAASSALYLLSLLDDVPTSSEEFETFFLNPPPPKRTHVLYSVSKHRKQAQDAWLIILHRAAAASTAGDRDLRKKALGVTSTVIAPWFSQPEMMLDFLTDCYDAGGSTSLLALSGLYYLIRERNVDYPAFYTKLYSLLDADLLHSKHRSRFFRLMDTFLASTHLPVQMVASFIKRLARLCLNATPSAVVSVVPWIYNMLKAHPLCTFMIHRVPRTKEERALLGDEGMADPFRADESNPMETQAIDSCLWEVVQLQSHYHPNVATIAKIISEQFTKQNYNVEDFLDHSYQSMFEAEIGKDVRRAPVVEFHIPKRVLLPQGPGAETQDKLLVKLWDFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.68
3 0.69
4 0.7
5 0.72
6 0.76
7 0.78
8 0.81
9 0.85
10 0.86
11 0.85
12 0.84
13 0.81
14 0.77
15 0.75
16 0.74
17 0.69
18 0.67
19 0.59
20 0.54
21 0.47
22 0.4
23 0.31
24 0.22
25 0.17
26 0.12
27 0.13
28 0.07
29 0.06
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.13
34 0.14
35 0.14
36 0.17
37 0.24
38 0.28
39 0.31
40 0.34
41 0.35
42 0.38
43 0.41
44 0.39
45 0.32
46 0.27
47 0.25
48 0.23
49 0.19
50 0.14
51 0.12
52 0.11
53 0.12
54 0.12
55 0.15
56 0.18
57 0.2
58 0.23
59 0.22
60 0.22
61 0.21
62 0.21
63 0.16
64 0.13
65 0.11
66 0.1
67 0.11
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.13
72 0.12
73 0.11
74 0.1
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.09
94 0.1
95 0.09
96 0.1
97 0.1
98 0.09
99 0.11
100 0.11
101 0.12
102 0.12
103 0.15
104 0.2
105 0.25
106 0.26
107 0.27
108 0.29
109 0.3
110 0.36
111 0.38
112 0.34
113 0.34
114 0.33
115 0.31
116 0.33
117 0.33
118 0.31
119 0.33
120 0.35
121 0.3
122 0.33
123 0.32
124 0.29
125 0.27
126 0.22
127 0.16
128 0.12
129 0.11
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.05
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.16
154 0.16
155 0.17
156 0.18
157 0.18
158 0.2
159 0.27
160 0.26
161 0.27
162 0.31
163 0.35
164 0.38
165 0.4
166 0.35
167 0.28
168 0.26
169 0.22
170 0.2
171 0.18
172 0.14
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.11
177 0.1
178 0.08
179 0.05
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.03
212 0.04
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.13
219 0.13
220 0.14
221 0.13
222 0.14
223 0.15
224 0.15
225 0.15
226 0.11
227 0.11
228 0.1
229 0.11
230 0.11
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.02
249 0.02
250 0.02
251 0.02
252 0.02
253 0.02
254 0.02
255 0.02
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.12
273 0.15
274 0.17
275 0.2
276 0.22
277 0.24
278 0.26
279 0.28
280 0.29
281 0.33
282 0.36
283 0.38
284 0.39
285 0.47
286 0.51
287 0.51
288 0.51
289 0.51
290 0.5
291 0.48
292 0.52
293 0.48
294 0.48
295 0.45
296 0.43
297 0.38
298 0.34
299 0.3
300 0.22
301 0.14
302 0.07
303 0.07
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.05
311 0.07
312 0.07
313 0.11
314 0.14
315 0.15
316 0.15
317 0.16
318 0.19
319 0.22
320 0.22
321 0.2
322 0.18
323 0.17
324 0.17
325 0.16
326 0.13
327 0.09
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.05
344 0.04
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.05
349 0.04
350 0.05
351 0.05
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.04
361 0.05
362 0.06
363 0.07
364 0.08
365 0.1
366 0.14
367 0.16
368 0.16
369 0.16
370 0.17
371 0.19
372 0.2
373 0.18
374 0.15
375 0.13
376 0.16
377 0.16
378 0.14
379 0.12
380 0.11
381 0.12
382 0.11
383 0.12
384 0.13
385 0.13
386 0.14
387 0.16
388 0.18
389 0.23
390 0.31
391 0.34
392 0.38
393 0.46
394 0.48
395 0.55
396 0.55
397 0.53
398 0.46
399 0.45
400 0.37
401 0.28
402 0.27
403 0.17
404 0.15
405 0.14
406 0.13
407 0.1
408 0.1
409 0.11
410 0.09
411 0.11
412 0.11
413 0.1
414 0.1
415 0.11
416 0.14
417 0.14
418 0.15
419 0.18
420 0.22
421 0.23
422 0.26
423 0.3
424 0.3
425 0.3
426 0.29
427 0.25
428 0.21
429 0.19
430 0.15
431 0.1
432 0.07
433 0.09
434 0.09
435 0.08
436 0.08
437 0.09
438 0.1
439 0.13
440 0.13
441 0.13
442 0.2
443 0.2
444 0.22
445 0.21
446 0.24
447 0.2
448 0.24
449 0.24
450 0.21
451 0.29
452 0.31
453 0.35
454 0.4
455 0.44
456 0.48
457 0.53
458 0.55
459 0.52
460 0.52
461 0.51
462 0.46
463 0.45
464 0.38
465 0.31
466 0.26
467 0.2
468 0.17
469 0.13
470 0.1
471 0.07
472 0.06
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.12
478 0.17
479 0.21
480 0.22
481 0.23
482 0.22
483 0.22
484 0.23
485 0.19
486 0.17
487 0.13
488 0.13
489 0.12
490 0.12
491 0.12
492 0.11
493 0.1
494 0.09
495 0.15
496 0.15
497 0.17
498 0.2
499 0.25
500 0.26
501 0.26
502 0.24
503 0.19
504 0.24
505 0.23
506 0.19
507 0.16
508 0.16
509 0.15
510 0.16
511 0.15
512 0.13
513 0.14
514 0.16
515 0.21
516 0.26
517 0.29
518 0.3
519 0.36
520 0.36
521 0.38
522 0.37
523 0.32
524 0.28
525 0.27
526 0.3
527 0.24
528 0.22
529 0.18
530 0.17
531 0.15
532 0.15
533 0.14
534 0.09
535 0.1
536 0.13
537 0.13
538 0.17
539 0.19
540 0.19
541 0.21
542 0.23
543 0.25
544 0.24
545 0.26
546 0.23
547 0.3
548 0.36
549 0.41
550 0.45
551 0.44
552 0.5
553 0.49
554 0.47
555 0.42
556 0.42
557 0.39
558 0.38
559 0.4
560 0.38
561 0.43
562 0.44
563 0.41
564 0.4
565 0.37
566 0.34
567 0.3
568 0.29
569 0.25
570 0.24
571 0.28
572 0.27