Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3BPI6

Protein Details
Accession S3BPI6    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
95-114GVWVIRKQLRRKRNDGRPDDBasic
315-336AKTGTAAPTKPKRRKSKGPAAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
309-336KDAKAGAKTGTAAPTKPKRRKSKGPAAA
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 5, pero 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MAAIKLDELQWSDPMVADEMQGIHSNSVLFYFMRSPYFDKTSNNNTIYNQALHNHTMFPVLETRERFEEFLKSMSGVEYIVHQAPAEMAPGTGTGVWVIRKQLRRKRNDGRPDDITVYADYFVVGYNIYQAPNLADILSSRITSMAVALGKAFPAMDSMLTWSPAKGHVYETDDEEDDDDEDDGSDSEDEGGDAMDVDRPAKAATTAKNNDDDNDSESDDDDDGAAINPKLAEESFTIHQMFGHEYMDEMPISGRPGDFHFNLAGGGKRALGADPANPGAANNKNNAIAKDTGSGKGTPVSGAATKDGKDAKAGAKTGTAAPTKPKRRKSKGPAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.13
4 0.12
5 0.12
6 0.12
7 0.13
8 0.15
9 0.14
10 0.12
11 0.13
12 0.13
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.08
17 0.1
18 0.13
19 0.14
20 0.16
21 0.19
22 0.22
23 0.26
24 0.32
25 0.32
26 0.34
27 0.39
28 0.46
29 0.52
30 0.51
31 0.48
32 0.43
33 0.45
34 0.43
35 0.38
36 0.31
37 0.26
38 0.26
39 0.26
40 0.26
41 0.23
42 0.2
43 0.21
44 0.19
45 0.17
46 0.18
47 0.19
48 0.23
49 0.24
50 0.27
51 0.28
52 0.29
53 0.29
54 0.26
55 0.27
56 0.24
57 0.24
58 0.21
59 0.18
60 0.17
61 0.16
62 0.15
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.08
84 0.09
85 0.13
86 0.19
87 0.26
88 0.36
89 0.45
90 0.53
91 0.6
92 0.69
93 0.75
94 0.79
95 0.82
96 0.79
97 0.77
98 0.72
99 0.67
100 0.6
101 0.5
102 0.41
103 0.31
104 0.25
105 0.18
106 0.14
107 0.1
108 0.07
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.04
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.03
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.07
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.1
152 0.11
153 0.09
154 0.1
155 0.12
156 0.15
157 0.16
158 0.17
159 0.17
160 0.16
161 0.15
162 0.14
163 0.12
164 0.09
165 0.08
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.09
191 0.12
192 0.21
193 0.25
194 0.26
195 0.3
196 0.3
197 0.29
198 0.29
199 0.27
200 0.21
201 0.2
202 0.18
203 0.15
204 0.15
205 0.14
206 0.12
207 0.1
208 0.08
209 0.06
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.07
221 0.12
222 0.12
223 0.15
224 0.15
225 0.14
226 0.15
227 0.14
228 0.15
229 0.12
230 0.12
231 0.09
232 0.09
233 0.1
234 0.11
235 0.1
236 0.08
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.08
242 0.09
243 0.12
244 0.17
245 0.17
246 0.18
247 0.17
248 0.16
249 0.17
250 0.17
251 0.16
252 0.12
253 0.12
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.12
259 0.11
260 0.12
261 0.14
262 0.15
263 0.15
264 0.14
265 0.14
266 0.17
267 0.22
268 0.23
269 0.22
270 0.24
271 0.28
272 0.31
273 0.32
274 0.31
275 0.26
276 0.26
277 0.29
278 0.28
279 0.26
280 0.26
281 0.26
282 0.22
283 0.23
284 0.22
285 0.17
286 0.15
287 0.16
288 0.16
289 0.17
290 0.2
291 0.2
292 0.2
293 0.24
294 0.27
295 0.24
296 0.24
297 0.26
298 0.28
299 0.32
300 0.32
301 0.29
302 0.27
303 0.29
304 0.3
305 0.33
306 0.3
307 0.26
308 0.34
309 0.44
310 0.53
311 0.6
312 0.67
313 0.72
314 0.8
315 0.89
316 0.9