Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3BM29

Protein Details
Accession S3BM29    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-52VKASKKAVPEKESKKSKKSKKVESESESESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-43KEIKASKKAEKVAEPVAVKASKKAVPEKESKKSKKSKK
347-406PREGGGFGGGRGGGGGFGGGRGGGRGGGFGGGRGGGGGFGGGRGGGRGGGRGGFGGSRGG
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGSKSKEIKASKKAEKVAEPVAVKASKKAVPEKESKKSKKSKKVESESESESESEDSDSDDSASDSDSESEAEKEEPKKEAKKAAAKEESSDSESEEEEKKAEASDSDSDSDSDSESEKEETAAEEPSKKRKADDEEVAAEEPAKKAKTEESGEAPEGTTLFVGNLSWKVDDAMLYEEFKNCEDLVSARVITDREQQRSRGFGYVDFSSAAAAKAAFDKMQGYFVDGRELKLDFSTARPKNPNGTDASPANNRAKKYGDVISPESDTLFVGNLSFNADEDTVSAFFSEVANVKSLRLPTDQESGRPKGFGYVSFYSLEDSKKAFDTLNGQSCAGRNVRLDYSTPKPPREGGGFGGGRGGGGGFGGGRGGGRGGGFGGGRGGGGGFGGGRGGGRGGGRGGFGGSRGGGGFQGKKTTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.72
3 0.68
4 0.64
5 0.61
6 0.52
7 0.45
8 0.45
9 0.42
10 0.37
11 0.35
12 0.35
13 0.31
14 0.36
15 0.43
16 0.45
17 0.49
18 0.58
19 0.64
20 0.69
21 0.76
22 0.79
23 0.8
24 0.83
25 0.86
26 0.87
27 0.88
28 0.89
29 0.89
30 0.91
31 0.91
32 0.86
33 0.81
34 0.75
35 0.66
36 0.57
37 0.46
38 0.36
39 0.27
40 0.21
41 0.16
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.09
51 0.08
52 0.08
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.1
58 0.11
59 0.12
60 0.17
61 0.2
62 0.22
63 0.26
64 0.32
65 0.38
66 0.42
67 0.48
68 0.52
69 0.57
70 0.6
71 0.66
72 0.67
73 0.61
74 0.59
75 0.55
76 0.5
77 0.43
78 0.38
79 0.29
80 0.22
81 0.21
82 0.21
83 0.19
84 0.16
85 0.14
86 0.14
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.1
91 0.12
92 0.15
93 0.17
94 0.18
95 0.18
96 0.18
97 0.18
98 0.18
99 0.15
100 0.12
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.12
111 0.12
112 0.18
113 0.2
114 0.29
115 0.34
116 0.34
117 0.34
118 0.39
119 0.46
120 0.47
121 0.5
122 0.47
123 0.44
124 0.45
125 0.44
126 0.37
127 0.29
128 0.22
129 0.17
130 0.15
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.15
135 0.2
136 0.22
137 0.25
138 0.26
139 0.29
140 0.29
141 0.28
142 0.25
143 0.19
144 0.16
145 0.13
146 0.08
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.18
180 0.21
181 0.25
182 0.27
183 0.3
184 0.3
185 0.32
186 0.32
187 0.27
188 0.23
189 0.19
190 0.2
191 0.17
192 0.16
193 0.14
194 0.13
195 0.1
196 0.1
197 0.08
198 0.06
199 0.05
200 0.04
201 0.05
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.07
206 0.07
207 0.09
208 0.09
209 0.11
210 0.12
211 0.12
212 0.18
213 0.17
214 0.18
215 0.17
216 0.17
217 0.15
218 0.13
219 0.13
220 0.08
221 0.11
222 0.2
223 0.21
224 0.25
225 0.29
226 0.3
227 0.37
228 0.38
229 0.38
230 0.33
231 0.33
232 0.32
233 0.3
234 0.32
235 0.27
236 0.3
237 0.33
238 0.32
239 0.3
240 0.29
241 0.31
242 0.28
243 0.3
244 0.31
245 0.27
246 0.28
247 0.3
248 0.3
249 0.28
250 0.26
251 0.23
252 0.18
253 0.14
254 0.1
255 0.07
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.07
276 0.08
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.13
281 0.14
282 0.16
283 0.16
284 0.18
285 0.2
286 0.27
287 0.27
288 0.3
289 0.36
290 0.37
291 0.36
292 0.34
293 0.3
294 0.27
295 0.28
296 0.25
297 0.26
298 0.24
299 0.25
300 0.26
301 0.26
302 0.22
303 0.23
304 0.22
305 0.17
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.16
310 0.15
311 0.15
312 0.2
313 0.26
314 0.33
315 0.32
316 0.31
317 0.32
318 0.32
319 0.34
320 0.29
321 0.25
322 0.19
323 0.22
324 0.23
325 0.24
326 0.26
327 0.27
328 0.31
329 0.38
330 0.42
331 0.41
332 0.41
333 0.41
334 0.44
335 0.43
336 0.41
337 0.33
338 0.37
339 0.35
340 0.32
341 0.32
342 0.26
343 0.21
344 0.18
345 0.15
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.03
350 0.03
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.05
369 0.05
370 0.04
371 0.04
372 0.03
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.05
378 0.07
379 0.07
380 0.09
381 0.1
382 0.11
383 0.12
384 0.12
385 0.13
386 0.11
387 0.12
388 0.12
389 0.11
390 0.11
391 0.11
392 0.11
393 0.12
394 0.16
395 0.2
396 0.21