Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3BU44

Protein Details
Accession S3BU44    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
189-210TTPSNSRRPARKDTKNEKDAKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
195-216RRPARKDTKNEKDAKSSKNSRS
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12, extr 3, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039723  Vps71/ZNHIT1  
IPR007529  Znf_HIT  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF04438  zf-HIT  
Amino Acid Sequences MNNFGVVELASQRRSVAPGWAYVPESRNNALLPPGFGGAAGGAGGIRQLDGSSAGGAAQDANKPRKRAARSQAAGAPGNSLALFSDLTSRQQTKLRKELDVLNRDMGAPAGSGAAARDAAIPIPQRAVKAQNKYTPNVRKILASQKTFANHLDDFNAFNALHQTTQGHLNHGIVNEAAAAAKTVSAAATTPSNSRRPARKDTKNEKDAKSSKNSRSQKSAASRRSISAATAAAAAATQPPTPAADTPMPDAEDGQAAPKKDAAAEAGPVSTILRPGGHNYPTRVFCEICGYWGRVKCTKCGTPVCALDCLELHRQDCITRYGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.23
4 0.21
5 0.24
6 0.26
7 0.27
8 0.28
9 0.3
10 0.32
11 0.29
12 0.32
13 0.3
14 0.29
15 0.27
16 0.26
17 0.27
18 0.25
19 0.21
20 0.19
21 0.18
22 0.16
23 0.15
24 0.14
25 0.09
26 0.08
27 0.06
28 0.04
29 0.03
30 0.03
31 0.04
32 0.03
33 0.03
34 0.03
35 0.04
36 0.04
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.11
47 0.17
48 0.26
49 0.31
50 0.33
51 0.39
52 0.47
53 0.51
54 0.58
55 0.61
56 0.63
57 0.61
58 0.64
59 0.62
60 0.58
61 0.53
62 0.43
63 0.35
64 0.23
65 0.21
66 0.16
67 0.12
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.1
73 0.1
74 0.13
75 0.18
76 0.19
77 0.21
78 0.27
79 0.34
80 0.37
81 0.45
82 0.46
83 0.43
84 0.45
85 0.51
86 0.54
87 0.53
88 0.48
89 0.4
90 0.37
91 0.35
92 0.32
93 0.24
94 0.14
95 0.08
96 0.06
97 0.05
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.07
108 0.09
109 0.08
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.22
115 0.25
116 0.32
117 0.37
118 0.42
119 0.44
120 0.46
121 0.53
122 0.53
123 0.5
124 0.46
125 0.41
126 0.35
127 0.36
128 0.43
129 0.41
130 0.35
131 0.33
132 0.33
133 0.33
134 0.33
135 0.3
136 0.25
137 0.18
138 0.17
139 0.17
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.14
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.14
156 0.15
157 0.16
158 0.15
159 0.15
160 0.09
161 0.08
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.04
175 0.05
176 0.06
177 0.1
178 0.13
179 0.17
180 0.2
181 0.25
182 0.33
183 0.38
184 0.47
185 0.55
186 0.61
187 0.69
188 0.76
189 0.81
190 0.82
191 0.84
192 0.76
193 0.76
194 0.73
195 0.67
196 0.66
197 0.64
198 0.62
199 0.65
200 0.7
201 0.64
202 0.65
203 0.62
204 0.61
205 0.62
206 0.65
207 0.61
208 0.59
209 0.57
210 0.51
211 0.51
212 0.43
213 0.33
214 0.26
215 0.2
216 0.14
217 0.13
218 0.11
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.1
229 0.1
230 0.13
231 0.15
232 0.16
233 0.19
234 0.21
235 0.2
236 0.19
237 0.19
238 0.15
239 0.13
240 0.12
241 0.14
242 0.15
243 0.15
244 0.16
245 0.17
246 0.16
247 0.15
248 0.16
249 0.15
250 0.13
251 0.14
252 0.15
253 0.13
254 0.13
255 0.12
256 0.13
257 0.1
258 0.09
259 0.08
260 0.09
261 0.1
262 0.15
263 0.21
264 0.26
265 0.3
266 0.33
267 0.39
268 0.41
269 0.43
270 0.41
271 0.35
272 0.31
273 0.35
274 0.3
275 0.27
276 0.28
277 0.28
278 0.31
279 0.35
280 0.4
281 0.39
282 0.4
283 0.43
284 0.48
285 0.5
286 0.52
287 0.54
288 0.53
289 0.55
290 0.59
291 0.55
292 0.51
293 0.46
294 0.4
295 0.34
296 0.34
297 0.33
298 0.31
299 0.28
300 0.27
301 0.28
302 0.28
303 0.3