FuNGI

S3BSN7

Protein Details

Accession

S3BSN7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
336-356	TDTNGGRKKKRKGALTQQSGF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
342-347	RKKKRK

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito 6, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRRKWIDKKTASHFTLVHRPQNDPRIHDEDAPAMVLNPTQLGNAAARNGSSIAGSSVAGGNRAKYLAELADQLGDEVENIRDNEGEAASHGVYYDDTEYDYMQHLREIGSGGGEAVFVESASALNNKPKPKQNLSDALKLMDLQDQSEDLLDEEILPSKNLRRVTYQNQQDVPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDDSGDNDDDLFQKLAKDGVELDDYEFEETYDDDGDFDDDDDEGWESDATEKPTGASPRVALPAGDEDQAPQLVDSTGAPLGAPTGVPVEGIEGAEGPSDDWMEDFKKFKKEQSSTTTRKKIVPAMSEIQSSIWTTDTNGGRKKKRKGALTQQSGFSMTSSSLVRTEQLTLLDARFDKFDEEYNNEDIDDMQSVSQFSSVSSVQGPLRNDFDGIMDEFLGGYTMQGKRHLKKGAKQSGLEQLEEIRRTLGPARFTTKKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.6
3	0.61
4	0.59
5	0.58
6	0.5
7	0.54
8	0.57
9	0.63
10	0.61
11	0.55
12	0.56
13	0.55
14	0.55
15	0.53
16	0.47
17	0.4
18	0.36
19	0.32
20	0.25
21	0.18
22	0.16
23	0.13
24	0.11
25	0.09
26	0.09
27	0.08
28	0.08
29	0.09
30	0.11
31	0.12
32	0.14
33	0.13
34	0.13
35	0.14
36	0.14
37	0.12
38	0.11
39	0.1
40	0.08
41	0.09
42	0.09
43	0.09
44	0.11
45	0.11
46	0.14
47	0.14
48	0.14
49	0.14
50	0.15
51	0.14
52	0.11
53	0.13
54	0.11
55	0.12
56	0.13
57	0.12
58	0.13
59	0.13
60	0.13
61	0.11
62	0.09
63	0.08
64	0.08
65	0.08
66	0.09
67	0.1
68	0.1
69	0.1
70	0.11
71	0.12
72	0.11
73	0.1
74	0.08
75	0.1
76	0.09
77	0.09
78	0.09
79	0.07
80	0.07
81	0.09
82	0.09
83	0.07
84	0.08
85	0.09
86	0.09
87	0.1
88	0.12
89	0.12
90	0.11
91	0.12
92	0.11
93	0.11
94	0.12
95	0.12
96	0.1
97	0.09
98	0.08
99	0.08
100	0.07
101	0.07
102	0.06
103	0.05
104	0.04
105	0.04
106	0.04
107	0.03
108	0.04
109	0.05
110	0.06
111	0.07
112	0.14
113	0.2
114	0.24
115	0.31
116	0.39
117	0.47
118	0.53
119	0.58
120	0.59
121	0.65
122	0.65
123	0.66
124	0.59
125	0.52
126	0.44
127	0.38
128	0.31
129	0.24
130	0.19
131	0.12
132	0.11
133	0.1
134	0.1
135	0.1
136	0.09
137	0.06
138	0.06
139	0.05
140	0.05
141	0.05
142	0.08
143	0.08
144	0.08
145	0.09
146	0.12
147	0.16
148	0.19
149	0.21
150	0.24
151	0.3
152	0.38
153	0.46
154	0.5
155	0.52
156	0.52
157	0.51
158	0.47
159	0.41
160	0.34
161	0.26
162	0.18
163	0.12
164	0.11
165	0.09
166	0.08
167	0.07
168	0.07
169	0.06
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.09
174	0.13
175	0.13
176	0.12
177	0.12
178	0.11
179	0.12
180	0.11
181	0.11
182	0.07
183	0.07
184	0.07
185	0.06
186	0.06
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.05
192	0.05
193	0.04
194	0.04
195	0.05
196	0.05
197	0.07
198	0.07
199	0.06
200	0.06
201	0.07
202	0.08
203	0.07
204	0.07
205	0.06
206	0.08
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.09
211	0.09
212	0.09
213	0.08
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.05
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.06
235	0.08
236	0.1
237	0.1
238	0.1
239	0.1
240	0.14
241	0.15
242	0.15
243	0.14
244	0.13
245	0.15
246	0.17
247	0.16
248	0.12
249	0.12
250	0.14
251	0.14
252	0.14
253	0.11
254	0.1
255	0.11
256	0.11
257	0.1
258	0.07
259	0.06
260	0.05
261	0.06
262	0.05
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.03
272	0.04
273	0.04
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.06
278	0.06
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.06
290	0.07
291	0.1
292	0.13
293	0.17
294	0.25
295	0.27
296	0.32
297	0.4
298	0.43
299	0.48
300	0.54
301	0.6
302	0.61
303	0.69
304	0.72
305	0.65
306	0.64
307	0.6
308	0.58
309	0.54
310	0.49
311	0.45
312	0.42
313	0.41
314	0.38
315	0.34
316	0.28
317	0.23
318	0.19
319	0.14
320	0.1
321	0.08
322	0.09
323	0.15
324	0.2
325	0.25
326	0.32
327	0.39
328	0.48
329	0.57
330	0.65
331	0.68
332	0.71
333	0.73
334	0.76
335	0.79
336	0.81
337	0.82
338	0.76
339	0.69
340	0.62
341	0.55
342	0.45
343	0.34
344	0.24
345	0.14
346	0.13
347	0.11
348	0.11
349	0.11
350	0.11
351	0.12
352	0.12
353	0.14
354	0.14
355	0.14
356	0.15
357	0.15
358	0.15
359	0.17
360	0.17
361	0.16
362	0.15
363	0.15
364	0.15
365	0.14
366	0.18
367	0.19
368	0.23
369	0.26
370	0.28
371	0.27
372	0.25
373	0.24
374	0.21
375	0.17
376	0.14
377	0.11
378	0.09
379	0.09
380	0.1
381	0.1
382	0.1
383	0.09
384	0.07
385	0.1
386	0.1
387	0.11
388	0.12
389	0.15
390	0.17
391	0.22
392	0.24
393	0.24
394	0.27
395	0.26
396	0.25
397	0.23
398	0.21
399	0.19
400	0.18
401	0.15
402	0.12
403	0.11
404	0.11
405	0.1
406	0.1
407	0.07
408	0.06
409	0.11
410	0.13
411	0.15
412	0.24
413	0.32
414	0.36
415	0.45
416	0.54
417	0.56
418	0.61
419	0.71
420	0.73
421	0.72
422	0.7
423	0.67
424	0.68
425	0.63
426	0.55
427	0.45
428	0.41
429	0.4
430	0.39
431	0.35
432	0.26
433	0.24
434	0.26
435	0.32
436	0.31
437	0.3
438	0.34
439	0.42

S3BSN7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer